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    R tips:使用最近邻算法进行空间浸润带的计算

    本文使用最近邻算法进行浸润带的计算。 空间组学中,有的时候需要对免疫浸润带进行特定距离的划分,形成一层一层的浸润区域。...圈选ROI并计算浸润边界 下载的数据使用Xenium explorer打开,然后找到需要进行计算浸润带的位置,并根据方向将相应的全部选中。...如下图所示,假设中间的位置是需要进行浸润带计算的位置,而需要计算浸润带的方向是向下,则在Xenium explorer中选择套索工具仔细的圈画浸润边界,并将浸润带计算方向上的所有细胞选中。...500um浸润带就是500-750um浸润带,以此类推: # 当前浸润带减去上一层的浸润带 coords_tumor_infiltration_ls2 <- list() for(i in rev...: 全图展示的浸润带:

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