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R和Matlab结构
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我对R知之甚少，但我需要将matlab中的层次聚类所产生的树状图转换为R树状图结构。下表显示了matlab函数中分层聚类产生的树状图；其中第一列和第二列是对象或分支的is，第三列是距离。
有没有办法把这个表(或matlab的树状图)映射成R树状图？
浏览 1提问于2016-01-18得票数 0
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在Python中，如何将树状图绘制在值矩阵的顶部，并适当地重新排序以反映聚类？下面是一个示例：
我使用scipy.cluster.dendrogram制作树状图，并对数据矩阵执行分层聚类。那么，我如何将数据绘制为矩阵，其中行已被重新排序，以反映在特定阈值下切割树状图所导致的聚类，并使树状图与矩阵一起绘制？我知道如何在scipy中绘制树状
浏览 5提问于2010-06-06得票数 51
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现在，我知道凝聚是自下而上的方法，而分裂是自上而下的方法。但是，我不知道他们在具体的过程中有什么不同。例如，它们是否都使用邻近矩阵来计算样本之间的任何成对距离？此外，如果设置所有相同的参数，像相同的连接准则，相同的cluster...do目标数，它们最终得到的结果是完全相同的？
浏览 1提问于2021-02-21得票数 1
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使用python的层次聚类树形图
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我被要求绘制一个层次聚类图的树状图。我得到的输入如下:这个图的所有边的列表。下一步是对图进行聚类，然后根据聚类后的图绘制树状图。(聚类，获取树状图)到目前为止，我一直在使用图形工具来绘制图形，我还运行了我在互联网上从Scip
浏览 0提问于2014-10-19得票数 1
我正在创建一个闪亮的应用程序，它以谷类数据集为例展示了不同的聚类技术，例如分层聚类和k-means聚类。我使用"factoextra“包中的fviz_dend函数来创建我的树状图。然而，当我这样做时，树状图不会将谷物的名称显示为标签，而是显示数字表示。有没有办法把数值改成标签？我在下面附加了一张使用fviz_dend函数的当前树状图的图片和一张我使用base R中的plo
浏览 709提问于2019-10-16得票数 0
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我希望任何关于R的热图功能的dendogram (Colv，Rowv)的信息资料。例如聚类是如何工作的(这是欧几里得距离吗？)如果Rowv或Colv是树状图，则它们将得到尊重(而不是重新排序)。
浏览 5提问于2013-03-13得票数 2
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我如何在Python中进行分层聚类(在本例中是针对基因表达数据)，以显示基因表达值矩阵和树状图？我的意思是像下面这样的例子：
如何在Python中使用numpy/scipy或其他工具执行此操作？编辑:很多人建议使用聚类包，但我仍然不确定如何绘制上面在Python中链接的图像。例如，我如何使用M
浏览 0提问于2010-06-05得票数 3
你好,我已经搜索了代码，但是对于面向对象的编程，特别是Matlab的版本，我非常无知。因此，我所知道的只是函数调用行'obj =obj.get群集‘，但是不知道如何编辑它，因此我使用自己的聚
浏览 7提问于2010-10-20得票数 0
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我想写代码来绘制一个树状图在python。有没有一种简单的方法。我已经编写了标识点数据集中的聚类的代码，并希望生成一个树状图，以显示每次迭代产生的聚类的数量
并在第二次迭代中进行2个聚类
那么，如果我使用scipy树状图，我将如何将其转换为链接格式？
浏览 0提问于2012-03-11得票数 9
假设我们有一个树状图(分层聚类树)，我们是否可以在K簇中定义一个数据分区，方法是在树根节点下面的某个层次上切割该树的分支？
浏览 0提问于2020-12-19得票数 1
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树状图使用什么数据结构？
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我一直在寻找如何高效地实现树状图，用于描述层次聚类。目前，我使用一个正则表达式来解析和显示它，就像树结构一样，如下所示。因为我们在特定级别上剪切树状图后得到了簇。剪切所示的正则表达式是困难的，并且并不总是给出适当的聚类。
我们应该使用什么数据结构和表示，以便从树状图中获得聚类相对容易。
浏览 1提问于2014-03-05得票数 1
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我正在尝试将R中的分层聚类的结果绘制为树状图，用矩形来标识聚类。
以下代码适用于垂直树状图，但对于水平树状图(horiz=TRUE)，不会绘制矩形。有没有办法对水平树状图也做同样的事情。
浏览 4提问于2014-06-10得票数 8
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我试图估计一个聚类树状图在R中的结构主题模型，我产生了98个主题。我首先运行了以下程序，运行得很好：然后，我尝试使用以下语法来可视化树状图：谢谢!
浏览 8提问于2022-04-01得票数 0
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我正在从事一个开源Java项目，在该项目中，我们需要对热图进行聚类并绘制树状图。是否有任何2D层次聚类库可供随时使用？
提前谢谢。
浏览 2提问于2021-11-08得票数 0
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在scipy的分级聚类中，可以从链接矩阵Z开始构建聚类。例如，会截断树状图，这样最终会有6个簇。中心的位置将根据用于构建树状图的度量和方法而有所不同，但我希望获得与用于构建Z的特定方法相对应的中心。
浏览 2提问于2017-05-31得票数 0
我想在for city的数据集之间创建一个层次聚类。我已经尝试了以下代码在R中创建一个层次聚类：hcd <- as.dendrogram(hc)
但是这段代码生成了一个数据帧的树状图。我想做的是做一个不同城市之间的树状图，所以我想聚类不同城市之间的行。我在互联网上搜索了很多，我找不到任何关于它的东西。有人知道如何解决这个问题吗？我已经尝试了以下代码在R中创建
浏览 1提问于2016-05-24得票数 0
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我可以做dendrogram来获得聚类的树状图。我可以使用fcluster(Z, sqrt(D.max()), 'distance')来对我的数据进行很好的聚类。如果我想手动检查树状图中的一个区域，比如k=3 (集群)，然后我想检查k=6 (集群)，该怎么办？如何在树状图的特定级别上获得聚类？
我看到所有这些函数都有公差，但我不明白如何从公差转换为簇的数量。
浏览 2提问于2013-07-12得票数 8
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我正在使用Sklearn的KNN构建一个分类器，并想知道是否有任何方法可以可视化该算法构建的决策树。也许是这种时尚
📷
浏览 0提问于2018-04-03得票数 0
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