1.函数与参数 （1）形式参数与实际参数 （2）写函数的函数 2.R包（R package）介绍 R包可以理解为是多个函数的打包存放，包含函数、数据、帮助文件、描述文件等。...3.R包都在哪里 （1）CRAN网站 （2）Bioconductor （3）github 4.xxR包怎么安装 从哪里来/怎么安装 不知道从哪里来的？...安装后需要加载 运行 library（） #检查是否安装成功 运行 require（） #也可以检查是否安装成功，与library有区别 每次打开新的session都需要加载 5.怎样实现快速下载 6.R包安装和使用的逻辑...安装包——加载包——使用包里的函数 ## library（）没有error 是检查是否安装成功的标准 （2）已经安装的 R包，可以用：：快速调用里面的函数 7.常见疑问 （1）提示信息 检查是否有...+函数名称 （2）找R包介绍界面（直接搜） （3）Vignettes ls("package:lima") #列出一个包里都有哪些函数数据 R语言中的符号 解决问题的思维（报错时）
R语言是统计语言，概率又是统计的基础，所以可以想到，R语言必然要从底层API上提供完整、方便、易用的概率计算的函数。让R语言帮我们学好概率的基础课。 1. 随机变量 · 什么是随机变量？...R程序：计算S(1,2,3,4,5)的二阶中心矩(方差) > S<-c(1,2,3,4,5) > var(S) [1] 2.5 距是广泛应用的一类数学特征，均值和方差分别就是一阶原点矩和二阶中心矩。...R语言：假设投硬币，正面概率是0.5，投4次时，计算得到2次正面的概率？根据大数定律，如果投是10000次，计算5000次正面的概率？...R语言：中心极限定理模拟，从指数分布到正态分布 if (!...掌握R语言，就可以快速的把概率的知识，用R语言进行现实，非常有利于帮助我们解决生活中遇到的问题。
Python和R是统计学中两种最流行的的编程语言，关于R做数据分析的优势已经不言而喻了，众多和全面的统计方法使得从方法上来说，R的数据分析能力（模型方法众多且可视化功能强大）是其它语言不能比拟的。...通俗点说，R是用来做统计和画图的。R拥有自己的脚本语言和大量的统计、图形库（得益于开源社区），这让她看起来既美又实用。...Ross Ihaka和Robert Gentleman于1995年在S语言中创造了开源语言R，目的是专注于提供更好和更人性化的方式做数据分析、统计和图形模型的语言。...起初R主要是在学术和研究使用，但近来企业界发现R也很不错。这使得中的R成为企业中使用的全球发展最快的统计语言之一。 ...R虽说有一套自己的语言，还挺完备，但她最专业的还是做统计和画图，而像连接数据库、文本处理、文件操作等这些脏活可不能委屈R来干哪，这些得有其 他语言来负责，我的选择是咱最熟悉的、做这些脏活最棒的Python
因子和表因子（factor）是R语言中许多强大运算的基础，因子的设计思想来着统计学中的名义变量（分类变量），因子可以简单的看做一个附加了更多信息的向量。...,levels,labels=levels,exclude = NA,ordered = is.ordered(x),nmax=NA)因子的创建不像向量、矩阵与数据框比较直观，很好理解，因子不太好使用语言描述...","T") #向量> myfactor myfactor[1] T F T TLevels: F T注意返回值第二行有一个水平，值得是myvector只有F和T...list(data1$性别),mean)#按照性别聚合后，对age与hight进行求期望 Group.1 age hight1 男 22.0 1722 女 18.5 174表R中表指的是列联表...第n个元素是1加到n的和pmax（a，b）函数返回一个向量，第i个元素是ai与bi中的最大值、pmin（a，b）函数返回一个向量，第i个元素是ai与bi中的最小值match（x，y）函数，返回一个和x的长度相同的向量
安装R和Rstuido软件 R语言是用于统计分析，图形表示和报告的编程语言和软件环境；Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。...1、官网下载R安装包 下载地址为：https://cran.r-project.org 进入链接，如下图所示，在页面顶部提供了三个下载链接，分别对应三种操作系统：Windows、Mac和Linux...（要想知道R语言的32位和64位区别请查看改博客：http://blog.csdn.net/to_baidu/article/details/52904681） step3、启动选项 step4、正在安装...最大的面板是控制台窗口，这是运行R代码和查看输出结果的地方。也就是运行原生R时看到的控制台窗口。其他面板则是RStudio所独有的。...最大的面板是控制台窗口，这是运行R代码和查看输出结果的地方。也就是运行原生R时看到的控制台窗口。其他面板则是RStudio所独有的。
R 语言简单实例 主要工作已经完成，让我们动动小手，优雅的单击（或双击）R Studio 图标，来感受一下R 语言的魅力。...打开 RStudio，会在 Consule 面板看到 R 语言的版本、版权信息和一些有用的提示。...小结 到此为止，R 语言就已经顺利的收入囊中了，恭喜你，又掌握了一门语言（的 Hello world）了。...【此处应有掌声】 接下来，会继续介绍 R 语言的基本用法和其中比较重要的函数使用方法，目标是能使用 R 语言对数据进行初步分析，以便能在生活和工作之中有所应用。...，自己先有头绪和初步验证后也许会更有效率。
基于这样的研究目的，需要提供生存数据，它是一种由不同的开始时间和结束时间组成的事件-时间的数据，比如在癌症研究领域，研究手术到死亡的过程、治疗到疾病进展等等。...生存数据组成生存数据是有事件状态和对应时间组成，事件状态可以分成发生和删失。事件时间：$T_i$删失时间：$C_i$事件状态：如果观察到事件则是1；否则是删失0。事件时间要小于删失时间。...通过密度分布图可以观察到事件发生和删失状态在时间上的区别，如果不考虑删失则会导致评估结果偏高。...某个对象在某个时间点的生存概率公式为：$S(t) = Pr(T > t) = 1- F(t)$$S(t)$是生存函数$F(t) = 1- Pr(T > t)$是累积分布函数生存分析应用案例加载R包导入本教程分析所需要的...，包括Surv和surfit函数；survminer R包提供了ggsurvplot函数允许基于ggplot2定制Kaplan-Meier图 ；组间比较可采用log-rank检验，采用survival:
R语言的优势 正如Tiobe、PyPL以及Redmonk等编程语言人气排名所指出，R语言所受到的关注程度正在快速提升。作为一款诞生于上世纪九十年代的语言，R已经成为S统计编程语言的一类实现方式。...而R语言随时间推移正呈现出愈发迅猛的发展态势，并成为能够将不同数据集、工具乃至软件包结合在一起的胶水型语言，Peng解释道。 “R语言是创建可重复性及高质量分析的最佳途径。...“我用R语言编写的大部分程序实际上都是在将各类脚本整理到项目当中。” R语言拥有强大的软件包生态系统与图表优势 R语言的优势主要体现在其软件包生态系统上。...Peng进一步补充称，目前已经有众多主流机器学习算法以R语言作为实现手段。 R语言的缺点 R的短板在于安全性与内存管理 说了这么多优势，R语言当然也存在着一定不足。...此外，从其它语言转投R怀抱的开发人员也会发现后者在某些设定上确实有些古怪。” R语言的基本原理来自上世纪六十年代出现的各类编程语言，Peng解释道。
R语言软件简介：R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。...QR语言软件下载：[软件全称]：R语言 3.6.2[软件大小]：82MB[软件语言]：中文[安装环境]：Win7/Win8/Win10/Win11[下载地址①]：百度网盘：https://pan.baidu.com...pwd=mph7R语言安装教程：1.打开安装包，运行R-3.5.2安装包2.选择中文，点击确定3.点击下一步4.点击浏览，更改安装位置5.我这里选择D盘，点击下一步6.下拉箭头，根据自己的电脑选择32位或者
R语言中提供了三种日期和时间处理： Date类：存储了从1970年1月1日以来计算的天数，更早的日期表示为负数，以天为单位计算日期，Date适合计算日期； POSIXct类：记录了以时间标准时间时区（...()可以返回当天的日期 date()可以返回当天的日期和时间 Sys.time() 可以返回当天的时间 注意：R还有一个函数date()，用于返回当前时间对应的文本 > Sys.Date() [1] "...Wed Nov 04 19:56:49 2020" > > #Sys.time() 可以返回当天的时间 > Sys.time() [1] "2020-11-04 19:56:49 CST" > > #R还有一个函数...R中，这时需要转化为以数值形式存储的日期变量。...strptime(x,format="",tz="")，参数tz是时区(time zone)，默认是空，在解析时，如果不指定时区，R会调用Sys.timezone( ) 。
❞ xlsx文件，是2007,2013,2016版本的Excel文件，R语言中可以通过openxlsx包进行读取。 1. 读取xlsx文件 > dd = read.xlsx("..
---- 概述 最近团队在使用R语言作为算法的实践语言，通过人工策略和xgboost算法进行一些价格算法的控制和输出，发现一些代码中对于内存、CPU、程序设计思想以及现代统计算法并不是很熟悉，于是特写此篇普及一下知识...，也算是我对R语言的入门文章吧。...比如C++和C等语言是需要程序员手动释放堆区内存，但是Python、R等都有自己实现了内存回收机制，让coder专注于自己的业务和问题域，但这不代表你可以不关心，这是大错特错。...R会在内存不够用（要去读C代码）时自动调用gc释放内存。这一点和JAVA类似。这一点和编译语言C/Cpp有非常大的区别，后者要用户手动free或者析构(~Class())。...路漫漫其修远兮，吾将上下而求索 参考文献 1.R语言垃圾回收机制 2.R memory 3.ParallelR
过去一个月实验比较忙，很久没有写点东西了，今天要给amina画图，因此学习了一下R语言的基础画图。...col=2,pch=24,cex=1.5, yaxs=”i”,xaxs=”i”, xlab=”Sample Ration(%)”,ylab=”Accuracy”)学习 x,y : 要画图的x轴内容和y...轴内容spa xlim,ylim: x轴和y轴的范围orm type: 表示图的形状，是点、线、点线、阶梯线等等。...blog col: 颜色get pch: 点的形状it cex: 点的大小 yaxs,xaxa: plot默认画图时会在预留一部分坐标空间，设置为“i”后，就能够去掉预留空间 xlab,ylab:x轴和y...(LPPLPP~LPPx,col = “blue”,type = “o”,lwd = 2,pch=5) 3.grid 对图添加栅格 grid(nx=NA,ny=6,lwd=2) nx,ny：分别表示x和y
详情点击：R语言系列五：②R语言与逻辑回归建立 但是模型建立起来之后，是用来做什么的？...整体来看，这个图还是有意义的，尽管12-13岁年龄段和13-14年龄段原始数据和预测数据略有差池。 但是这样的偏差是否有统计学意义呢？...另外，R里也有专门的ROC绘制包，比如ROCR包（不做详细解释，直接套用就可以了，这个包会直接给出来AUC值，即曲线下面积的大小。...关于逻辑回归的建立，预测和诊断我们都已经介绍完了，下面就是关于生存分析的部分了。敬请期待。 参考资料： 1.《R语言统计入门（第二版）》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2....《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著 3.Vicky的小笔记本《blooming for you》by Vicky
今天要推荐的项目 Xonsh 就非常巧妙的解决了我的问题，它通过集合 Python 和 Shell 的优点，比如看下图。 看到上面的语法，真的让我极度舒适。...Xonsh 可以直接当 Shell 命令行使用 2、Xonsh 可以直接按 Python 的语法使用 3、Xonsh 可以在 Shell 中使用 Python 语法 看完是不是有点 Python 和
Docker的默认启动方式中，会产生一块虚拟网卡，然后容器内自行分配单独的网卡和IP。可以在宿主机上通过ipconfig命令看到这个虚拟网卡。...此时通过Windows宿主机是无法Ping通容器的 通过配置路由表实现ip互通 暴露给宿主机的为10.0.75.1 添加路由 route -p add 172.17.0.0 MASK 255.255.255.0
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...group_by(test, Species) #按照Species分组 # 先按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差 summarise(group_by(...其核心包有ggplot、readr、tibble、purrr、 tidyr 、dplyr、ggplot、forcats 和stringr8个. 我们这里用的是dplyr包，因此可以使用管道。...经过这几期的R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ?...+命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！ 应该没问题了！！！！吧？
(4>5) TRUE 数据类型的判断和转换 is族函数，判断，返回值为TRUE或FALSE as族函数实现数据类型之间的转换 多个数据如何组织 数据结构 向量 数据框 矩阵 列表 1.数据框约等于“表格...sort(x,decreasing=F) #不降序 sort(x,decreasing=T) #降序 2.3对两个向量的操作 (1)比较运算，生成等长的逻辑向量 (2)数学计算 (3)连接 paste和paste0...paste默认间隔是空格，可以设置sep() paste0默认无空格，不可以设置sep() x和y不一样长：发生循环补齐(短向量向长向量补齐) 等位运算：比较运算、数学计算、连接 利用循环补齐简化代码...#并集 (自动去重复) setdiff(x,y) #在x中有，在y中没有的 setdiff(y,x) #在y中有，在x中没有的 重点：%in% x%in%y #x的每个元素在y中存在吗 x==y和x
1. 图片说明 2. 例子 示例数据： set.seed(123) dat = data.frame(ID = paste0("ID_",1:10),y1 = ...
学习生信时，最常用的可视化软件就是R，可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio，究竟什么是R和Rstudio？ R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。...01 安装R 进入R的官网https://www.r-project.org/ 第一步 点击红框中的download R 第二步 在镜像这里中选择第一个 第三步 接下来按照红框点点点就能完成R的安装...第四步 第五步 R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。...Linux系统下的ls list.files() #同上 示例 2.加减乘除 和其他编程语言相同，直接输入即可 示例 3.赋值 赋值符号 <- 或 ALT - x <- 2+3 #将2+3的结果赋值给...赋值结束后即可在右上角environment栏中看到现在赋值过的变量 4.删除变量 x <- 2+3 #将2+3的结果赋值给x y <- 5/6 #将5/6的结果赋值给y rm(x,y) #删除x和y
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