(特定于方法的步骤,依方法的不同而有变化):格式化读取,分离样本,映射和量化 原始计数的质量控制:过滤质量差的细胞 过滤计数后的聚类:基于转录活性的相似性将细胞聚类(细胞类型=不同聚类) 标记鉴定:识别每个聚类的基因标记...计数矩阵的生成 我们将首先讨论此工作流的第一部分,即从原始测序数据生成计数矩阵。我们将重点介绍基于液滴的方法所使用的3‘端测序,如inDrops、10X Genomics和Drop-Seq。 ?...测序后,测序工具将以BCL或FASTQ格式输出原始测序数据,或生成计数矩阵。如果读取的是BCL格式,则我们将需要转换为FASTQ格式。有一个有用的命令行工具bcl2fastq,可以轻松地执行此转换。...对于许多scRNA-seq方法,从原始测序数据到生成计数矩阵都将经历相似的步骤。 ?...结果输出是一个按基因计数的细胞矩阵: ? 图片来源:extracted from Lafzi et al.
1-背景 顺着上周与大家分享的nanostring芯片原始数据的提取, 我看到了曾老师于20年布置的学徒作业~ 链接如下:《Nanostring的表达矩阵分析也是大同小异》 Nanostring的表达矩阵分析也是大同小异...- 知乎 (zhihu.com) 就是要复现上图~ 草草一看应该是提取原始数据,取差异基因然后绘图吧。...文章的最后看到了老师的期望,就决定从原始数据开始分析。 那我们就开始吧 2- 找原始数据 在补充材料里面看到的了GSE编号 GSE134129,虽然老师在知乎上也说了.....下载原始数据 3- 获取总表达矩阵 这次的初始文件是txt格式的,之前是RCC格式的(这可能就是问题所在????)...关于目标图文章中为数不多的描述 那就从作者提供的矩阵开始复现吧。
问题如下 矩阵成积.jpg 我采用的是3重循环,先计算的列的结果,应该还可以先计算行的结果,然后求出矩阵的乘法。没有过多的技巧,就是循环的使用。...相关的code package day20180728; import java.util.Scanner; class Matrix{ private int m,n;...int i=0; i<m; i++) for(int j=0; j<n; j++) { System.out.print("请输入矩阵中的数字...Matrix.chenfaMat(mx1.getArr(), mx2.getArr()); print(arry); } } 结果 矩阵的乘法
-----Winston Leonard Spencer Churchill 文末附上详细代码 思路: 矩阵乘法的前提是:前一矩阵的行数 == 后一矩阵的列数(rows == cols) 在满足前提的情况下...:前一矩阵的第一行 与 第二个矩阵的第一列 逐个相乘。...将乘积求和 作为 结果矩阵的第一个元素 类推刻得到:结果矩阵的 第 [row][col] 个元素 = 前一矩阵的第 row 行 与 后一矩阵的 col列上的元素 逐一相乘 后的乘积之和 代码及解析: 一...、算法剖析: 1.设置两个for循环用来控制结果(输出)矩阵的 待赋值元素位置 (即 matrix[i][j] ) 2.在这两个循环环中再嵌套上一个循环 这个循环起到关键作用 它用来控制 前一矩阵第 i...行元素的列数 以及 后一矩阵 第 j 列的行数 二、算法代码: /* * 计算两个矩阵相乘的方法 */ public Matrix mutiply(Matrix m){ Matrix result
描述: 蛇形矩阵是由1开始的自然数依次排列成的一个矩阵上三角形。 输入正整数n(n不大于100)输出,输出一个n行n列的蛇形矩阵。...例如5行5列蛇形矩阵输出为: 类似于前面的输出螺旋矩阵的方法,每一次在数组中填写新的数字都有一个方向,与输出螺旋数组不同的是不是简单的上下左右四个方向,这里涉及到右,下,右上,左下四个方向,针对每步操作都需要想好对应的处理方法
* * 0-0 0-1 0-2 0-3 * 1-0 1-1 1-2 * 2-0 2-1 * 3-0 */ 题目要求是输出 如上 的数字矩阵
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//矩阵转置 class ArrayUtil { //输入矩阵和其列大小 public static int[][] transpose(int[][] arr, int column)...int[][] arr = new int[][] { { 1, 2, 3 }, { 4, 5, 6 }}; System.out.println("转置前的矩阵...ArrayUtil.printArray(arr); int[][] arr2 = ArrayUtil.transpose(arr, 3); System.out.println("转置后的矩阵
Strassen矩阵乘法问题(Java) 1、前置介绍 2、代码实现 3、复杂度分析 4、参考资料 ---- ---- 1、前置介绍 矩阵乘法是线性代数中最常见的问题之一 ,它在数值计算中有广泛的应用...设A和B是2个nXn矩阵, 它们的乘积AB同样是一个nXn矩阵。...因此,得到矩阵C的n2 个元素所需的计算时间为 O(n3) 。...使用与上例类似的技术,将矩阵A,B和C中每一矩阵都分块成4个大小相等的子矩阵。由此可将方程C=AB重写为: 2个n阶方阵的乘积转换为7个n/2 阶方阵的乘积和18个n/2阶方阵的加减法。...: * 例子:将 4 * 4 的矩阵,变为 2 * 2 的矩阵, * 那么原矩阵左上、右上、左下、右下的四个元素分别归为新矩阵
之前做题目喷到一题,自己通过递归求解也能做出来,但是数据量一大超过10000,就基本上凉凉了,所以自己之后一直看了别人的解法,认识到了矩阵快速幂的好处,自己之前也碰到过,但是只是简单了解了一下,所以什么东西最好还是精一点的好...同理我们也可以将这种运算方式运用到矩阵上。...下面就是详细的代码: import java.util.Scanner; public class Main { public static int [][] figure(int [][]num1...,int [][]num2)//矩阵乘法函数 { int [][]num3=new int [num1.length][num2[0].length]; for(int i=0;i<num1....,一般都是与动态规划一同使用,毕竟矩阵快速幂中的矩阵就类似于状态方程。
文章目录 1、算法思想 2、代码实现 1、算法思想 最近老是碰到迭代问题,小数太多手算又算不过来,写个矩阵乘法辅助一下吧。 有两个矩阵A和B,计算矩阵A与B相乘之后的结果C。...A的列数必须等于B的行数 用矩阵A的第i行的值分别乘以矩阵B的第J列,然后将结果相加,就得到C[i][j]。...矩阵A的行等于C的行,矩阵B的列等于C的列,这两个数值用来控制循环的次数,但是每一步中需要把行和列中对应的乘机求和,所以再加一个内循环控制乘法求和就行。...x1[][],int x2[][]){ //前提条件:第一个矩阵的列必须等于第二个矩阵的行 if(x1[0].length!...3*3的单位矩阵相乘,方便我们观察结果。
前言 今天给大家演示一下Java经典算法:螺旋矩阵。给定一个正整数 n,生成一个包含 1 到 n2 所有元素,且元素按顺时针顺序螺旋排列的正方形矩阵,该算法的时间复杂度是O(n^2)。...例如:输入:n = 3,输出:[1, 2, 3] [8, 9, 4] [7, 6, 5] 思路 螺旋矩阵其实就是使用一个二维数组来存入数字,按照"右->下->左->上"的方向对二维数组进行填充,只要控制好边界即可
特殊说明: 解决问题的光鲜,藏着磕Bug的痛苦。 万物皆入轮回,谁也躲不掉! 以上文章,均是我实际操作,写出来的笔记资料,不会出现全文盗用别人文章...
原始套接字简介 普通 socket 的权力和原始 socket 权力对比。 1.原始 socket 可以和内核一样直接对所有层进行操作(除了物理层)。可以更改 mac 更改 ip 更改端口。...so dos 攻击就可以通过原始 socket 编程来伪造 ip 进行。 2.也可以访问经过网卡的所有数据.普通的 socket 只能访问发送给自己端口的数据。 ?...有两种原始套接字。另一种是处理数据链路层即其上的数据,通过指定socket第一个参数为AF_PACKET来创建这种套接字。...type: 这个参数指定一个套接口的类型,套接口可能的类型有:SOCK_STREAM、SOCK_DGRAM、SOCK_SEQPACKET、SOCK_RAW等等,它们分别表明字节流、数据报、有序分组、原始套接口
Iterator 是 Java 中用于遍历集合的强大工具。它提供了灵活的迭代方式,并支持元素的删除。...Java 包装类Java 包装类为原始数据类型(如 int、boolean 等)提供了对象表示形式。这使得将原始数据类型与需要对象的 API 一起使用成为可能。...原始类型与包装类下表列出了 Java 中的原始类型及其对应的包装类:原始类型包装类byteByteshortShortintIntegerlongLongfloatFloatdoubleDoublebooleanBooleancharCharacter...5 开始,自动装箱和拆箱允许将原始类型隐式转换为包装类,反之亦然。...它们在许多场景下都很有用,例如:将原始数据类型与需要对象的 API 一起使用将原始数据类型存储在集合中使用包装类提供的额外方法建议:在需要将原始数据类型用作对象时使用包装类。
邻接矩阵的存储结构是用两个数组来表示,一个一维数组存储顶点,一个二维数据(矩阵)存储边的关系 代码表示如下: /** * 图论-邻接矩阵 */ public static...System.out.println(graph.getOutDegree(1)); graph.bfs(); 结果: 2 2 0231 类的完整代码: /** * 图论-邻接矩阵
' author: kzb time: 2018-12-10 ''' import pandas as pd import os,csv dataPath = os.path.join("音译原始数据
发送原始UDP封包时: 1 以IPPROTO_UDP 为协议类型创建一个原始套接字,打开原始套接字上的IP_HDRINCL选项 2 构建UDP封包,要先设置IP头,设置UDP头,最后UDP净荷数据。...++; } // 计算这个校验和,将结果填充到UDP头 pUdphdr->checksum = checksum((USHORT*)buff, chksumlen); } 发送原始...nSourcePort = 8888; char szMsg[] = "This is a test \r\n"; int nMsgLen = strlen(szMsg); // 创建原始套节字...destAddr.sin_port = htons(nDestPort); destAddr.sin_addr.S_un.S_addr = ::inet_addr(szDestIp); // 发送原始
ThreadPoolExecutor作用 ThreadPoolTaskExecutor是Spring框架提供的一个线程池实现,它是基于Java的ThreadPoolExecutor实现的。...ThreadPoolTaskExecutor配合Future使用 import org.springframework.scheduling.concurrent.ThreadPoolTaskExecutor; import java.util.concurrent.Callable...; import java.util.concurrent.Future; public class ThreadPoolTaskExecutorWithFutureExample { public
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