我读了很多关于在ggplot2中对热图的y轴进行排序的问答，因此我觉得写另一个热图很糟糕，但我似乎无法实现我想要的。(这可能是因为我是R的新手，刚刚开始掌握R的术语和工作原理。)提前感谢您的帮助！我正在尝试生成一个用于基因富集分析的热图。我的数据以以下形式导入为.csv文件：Gene Category Description Variable1 Variable2 Variable3。我想要做的是按类别对y轴进行排序，同时按基因绘制值。(如果能给它贴上标签，那就太棒了！)下面是我到目前为
浏览 0提问于2013-06-08得票数 0
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基因集富集分析
、、、
这使用了Jensen-Shannon距离，并产生了一个排列有序的基因列表，我现在想要测试的是GO的富集。0.0453928603025379 "XLOC_010786" 0.0469577467848723
我首先手动搜索每一个最相似的基因的GO术语，但我想做一个更可靠的分析。
浏览 3提问于2013-07-11得票数 1
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我有一个3D散射图，想用Plotly在python中绘制。问题是数据的大小太大了，我想使用webgl来绘制图形。据我所知，go.Scatter3d函数可以巧妙地绘制散图器。此外，还有一个go.Scattergl来绘制大型数据集。然而，你找不到像go.Scatter3Dgl这样的东西。我该怎么办？
浏览 2提问于2018-09-30得票数 11
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我目前正在分析和分析具有大量数据大小的快速排序。我已经从分析器收集了所需的数据。我还绘制了平均运行时间与数据大小的关系图。现在我也想绘制N log N图表，这样我就可以将理论数据与我拥有的数据进行比较。然而，我不能使用excel来绘制N log N图。但是，我不能完全确定使用此功能绘制N log N。我需要这个来分析快速排序和其他一些排序算法。
浏览 10提问于2017-01-30得票数 2
我正在尝试使用plotly绘制条形图，并且我想添加标题和副标题。(在这里，您可以选择任何示例来添加标题和副标题)。我绘制条形图的代码如下：
fig.add_trace(go.Bar(x=["
浏览 0提问于2019-09-30得票数 8
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我有一个在窗口中绘制的线条图(用绘图(x，y)函数绘制)，那么，是否可以在同一个窗口中/在同一窗口上绘制条形图，以便对所绘制的数据进行可视化分析？
浏览 0提问于2018-04-23得票数 0
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我试图选择4种不同的产品价格从我的数据，并绘制他们的移动平均值作为一个子图(2,2)使用巧妙的袖扣。如果有人能在这方面提供指导，我将不胜感激。trace2= go.Scatter(name='soap'
浏览 0提问于2019-04-04得票数 2
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我正在使用Jupyter notebook，它在脱机模式下绘制条形图，没有问题。import plotly as pyimport pandas as pd
from plotly.offlin
浏览 46提问于2018-08-21得票数 1
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我知道，在语言学中，这些术语可以互换使用，但在Dash Plotly中是否有具体的定义，还是在数据科学中有具体的定义？
浏览 2提问于2021-01-05得票数 1
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我正在用gseapy富集酶对一系列基因进行浓缩分析。:5000], gene_sets = ['GO_Biological_Process我添加了一些更正，以有一个列表，然后我可以进一步使用的分析。x = 'fatty acid beta-oxidation (GO:0006635)'
g_list
浏览 4提问于2022-06-29得票数 0
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我最近在R中使用prcomp()函数运行PCA，现在我需要(客观地)确定我的两个不同组中的哪些样本是异常值，应该从进一步的分析中删除。我以前见过PCA图，其中置信度/方差椭圆(不确定术语)放在样本周围，而不是那些被认为是异常值的(例如，假设距离集群质心超过3个标准差)。我如何在R中实现这样的东西呢？注意:我看了一下，但仍然不清楚data.ellipse将如何用于PC1与PC2的投影图。感谢任何帮助/相关资源！countsTable &
浏览 1提问于2013-01-11得票数 5
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我在R中绘制抖动框图。plotly框图允许交互分析四分位数和异常值的值。(示例如下：)然而，在实现其他方法之前，我想确认，不可能绘制这些信息。
浏览 5提问于2016-10-26得票数 0
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我试图分析以前的市场修正，并找到一个数据集的日期格式year.month (这个月的ex: 2021.11 )和其他数据，包括在给定日期的价格。当我使用下面的代码来绘制数据时，我得到了一个结果，在这个结果中，图顺向上升，随机缩进，而不应该有一个。import plotly.graph_objects as gofig = go.Figure([go.Scatter(x=analysedata['Date
浏览 7提问于2021-12-08得票数 0
我有一个x和y的散点图，我想给那些至少有2倍富集的点着色，即x/y>=2。由于我的值表示为log2值，因此转换后的值需要x/y>=4。我现在用来绘制散点图其中counts是.csv导入的文件，40和41是我感兴趣的列。我还为fold change创建了一个列，使用我不知道如何整合这两条信息...最终，我想要一个看起来像这里的示例的图：，
浏览 0提问于2014-09-25得票数 0
我使用go js通过拖放绘制图表，我想绘制一个网络图，因为我使用了ForceDirectedLayout和GO js，但问题是我的节点是相互重叠的，但我不想这样做。
浏览 0提问于2019-03-28得票数 0
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我有以下数据：我在试着画x=long，y=short，z=balancefig.add(go.Scatter3d(x=results['long'], y=results[results['long'], y=results['short'], z=results['balance'], row=2, col=1)
它不仅不显示任何数据，而且似乎完全忽略了子图布局，并绘制了所有的东西。：
fig = make_su
浏览 0提问于2019-07-28得票数 5
我正尝试在plot中绘制一个数据帧的箱形图，数据帧如下： ? 我尝试过以下几种方法： data = [go.Box(y = Y.iloc[:,i].values) for i, j in enumerate(Y.columns)]fig = go.Figure(data=data, layout=layout)
fig.show() 我已经成功地绘制了所需的箱线图，但无法在箱线图的X
浏览 142提问于2020-08-12得票数 2
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