载入软件包 这里使用R语言的data.table和ggplot2 library(ggplot2)library(data.table) 2....生成模拟数据 生成示例数据 library(data.table)library(ggplot2)dat 分组箱线图 要点 data=dat1 # 定义数据 aes(x = variable, y = value) # 定义x轴和y轴 geom_boxplot() #定义箱线图 ?
上一篇教程介绍了绘制完整地图的方法：R 语言绘制十段线地图，给特定省份填色，今天我们将继续探索分省市地图的绘制。 本文的所有代码以及数据可以在公众号后台回复 [中国地图绘制] 免费获得。...library(rgdal) library(ggplot2) library(maptools) library(mapproj) library(ggsn) library(readxl) library...element_rect(fill = "white",color = "black"), panel.grid = element_line(color = "grey")) 绘制多个省份地图...有时候需要绘制一个区域的地图，比如：长三角、京津冀等，绘图方法和单个省份一样，只是需要将多个省份的数据存储在一个文件中。...合并数据 小编使用的是 xlsx 格式的数据，因为可以创建多个 sheet，调用起来比较方便。
今天尝试解决使用ggplot2画图时的一个问题，图例不按规矩出牌。 ggplot2的作者们在测试时发现更新版本也出这问题了，正好可以用于简单说明。 本来是一个这样的图形 ? 新版本变成了 ?...而我是画两个相似的图形时出现这问题，数据结构一样，然后画图后图例的顺序变了~ 根据文档，默认使用了某种“秘密魔法”？！
data<-data[,-1] sampleID<-colnames(data) data<-apply(data, 1, as.numeric) rownames(data)<-sampleID ##分组信息构造...www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/ library(ggpubr) ## Loading required package: ggplot2...#my_comparisons 分组设定 e% #dplyr::filter(group...IBC/N library(ggpubr) my_comparisons 分组设定 e%...IBCS/NS library(ggpubr) my_comparisons 分组设定 e%
s41467-022-31724-3.pdf 论文中公布了大部分图的数据，但是没有公布对应的作图代码，没有关系，我们可以自己写代码试着模仿，今天的推文重复一下论文中的Figure 2A 带有条纹的分组柱形图...https://github.com/coolbutuseless/ggpattern 安装 remotes::install_github("coolbutuseless/ggpattern") 因为是ggplot2...的扩展包，除了把作图函数替换，其余的细节都可以用ggplot2的语法来调节 读取数据 library(readxl) dffig2a<-read_excel("data/20220806/41467_...library(tidyverse) dffig2a %>% pivot_longer(-'Super-population') -> new.dffig2a 作图代码 library(ggplot2
empowers tomato breeding https://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8 没有找到论文里的作图的代码，但是找到了部分组图数据...，我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图 今天的推文重复一下论文中的Figure1c image.png 今天主要的知识点是多个图例的时候如何分开放，目前想到的办法是使用ggpubr这个R包把图例单独挑出来...variants,name) %>% summarise(mean_value=mean(value)) %>% ungroup() -> new.data 最基本的图 library(ggplot2
github.com/YaoZhou89/TGG 这里有eQTL和WGCNA的代码 (明明记得之前是看到过eQTL的代码，但是这次再翻还找不到了) 今天的推文我们试着复现一下论文中的Figure1b 分组折线图...image.png 如果要展示多个基因组的N50，用这个图还挺方便的，现在泛基因组相关的论文大部分都会放这个图，比如人类泛基因组的论文里。...MOESM5_ESM.xlsx", sheet = "Fig1b", skip = 1) head(dat) 作图代码 library(ggplot2
qplot(carat ,price, data=data, alpha=I(1/20)) 2.2 更多几何图像 上述的散点图只是qplot中的参数geom的默认参数point（当x与y都有传入值时的默认值...通过传入geom='boxplot'，可以绘制出分组箱线图，例如下面绘制钻石颜色color与每颗钻石每克拉价格price/carat的分组箱线图： qplot(color, price/carat,...geom='line'可绘制线型图，当传入x为时间型数据时，即绘制出时间序列图： data("economics") data <- economics qplot(date, unemploy/pop...geom='path'： qplot(unemploy/pop, uempmed,data=data, geom=c('point','path')) 2.2.9 分面 有时候，我们希望绘制的不是同样样式的不同分组图像在一幅图上反复绘制的情况...有一个特性，当传入的属性值非正常输入时，譬如colour中输入的是data中某列类别型变量时，整个绘图过程不会有异常，因为ggplot2内部非常“宽容”地对类别型变量进行了标度转换，如下例： qplot
这里，变量wt的值映射到沿x轴的距离，变量mpg的值映射到沿y轴的距离。...ggplot2包在定义组或面时使用因子(factor)（主要涉及函数facet_grid()）。 ggplot2很强大，能够创建各种各样的信息图。可惜，强大也带来了复杂性。...讲到这里，必须要强调使用ggplot2的最终目的还是为了更好的理解数据。而为了理解数据，在一个图中画出两个或更多组的观察值通常是很有帮助的。在R中，组通常用分类变量的水平(因子)来定义。...分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如形状、颜色、填充、尺寸和线类型的视觉特征的分组变量来完成的。...下面通过数据集Salaries中的性别和学术等级分组，绘制获得博士学位年数与薪水的关系图（图7）。 图7，博士毕业年数和薪水的散点图 ? 代码中还提供了条形图的分组绘图，留给大家自己尝试。
之前录制视频介绍过如何绘制堆积柱形图展示密码子偏向性的内容，但是之前的内容只能画一组堆积柱形图，如果你有好几个物种想要画到一起，可能比较麻烦，我记录一些我自己的画图代码 ?...最终效果就是这个样子的，柱子上的形状用来表示分组，可以在右侧添加一个图例写上具体的物种名 aa.csv文件的内容 ?...RSCU值文件的内容 V2是氨基酸 V3是密码子 V5是RSUC值 V6是密码子在下方的位置 V7是x轴的位置，取值是1到20 代码应该还有很多需要完善的地方，先在这里记录一下 #rm(list=ls(...)) library(readr) library(dplyr) library(ggplot2) library(ggstar) library(aplot) help(package="ggstar
数控编程、车铣复合、普车加工、Mastercam、行业前沿、机械视频，生产工艺、加工中心、模具、数控等前沿资讯在这里等你哦 步骤1:首先您可绘制一相近尺寸的多边形，点选选项卡中的绘图→矩形→多边形即可完成绘制
在这里，变量wt的值映射到x轴，mpg的值映射到y轴。 ggplot函数设置图形但没有自己的视觉输出。使用一个或多个几何函数向图中添加了几何对象(简写为geom)，包括点、线、条、箱线图和阴影区域。...ggplot2包提供了分组和小面化的方法。分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意，ggplot2包在定义组或面时使用因子。...让我们从分组开始吧——在一个图中展示多个分组观察值。 分组 在R中，组通常用分类变量的水平（因子）来定义。...分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。ggplot()声明中的aes()函数负责分配变量（图形的视觉特征）。...坐标轴 ggplot2包会自动生成基本所需要的图形参数。当我们需要更大程度定制时，需要了解相应函数的用法。
使用ggplot2进行数据可视化② 添加其他变量的一种方法是aesthetics。 另一种对分类变量特别有用的方法是将绘图分割为多个子图，每个子图显示一个数据子集。...geom_smooth（）将为您映射到linetype的变量的每个唯一值绘制一个不同的线型，具有不同的线型。...我们将很快学会如何在同一个地块中放置多个geoms。ggplot2提供超过30个geoms，扩展包提供更多（请参阅https://www.ggplot2-exts.org）。...对于这些geoms，您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。 ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。...实际上，每当您将美学映射到离散变量时，ggplot2都会自动将这些geoms的数据分组（如线型示例中所示）。依靠这个特征很方便，因为群体aesthetic本身并没有增加传说或区别特征与geoms。
差异分析|DESeq2完成配对样本的差异分析 ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来 R|clusterProfiler-富集分析 ggplot2| 绘制KEGG气泡图 ggplot2|绘制...使用ROC 曲线可以比较直观的展示模型的好坏，处于ROC 曲线下方的那部分面积的大小越大越好，也就是Area Under roc Curve(AUC)值。...|让你的火山图“活”过来 R|clusterProfiler-富集分析 ggplot2| 绘制KEGG气泡图 ggplot2|绘制GO富集柱形图 clusterProfiler|GSEA富集分析及可视化...-filter 筛选行 盘一盘Tidyverse| 筛行选列之select，玩转列操作 R-rbind.fill|列数不一致的多个数据集“智能”合并，Get！...ggforce|绘制区域轮廓-区域放大-寻找你的“onepiece” ggplot2|ggpubr进行“paper”组图合并 ggstatsplot绘图|统计+可视化，学术科研神器
导语 GUIDE ╲ ggplot2是一个神奇的R包，可以可视化各种各样的统计数据。 背景介绍 ggplot2是一个神奇的R包，可以将自己的统计数据绘制成想要的图案。...从今天起小编计划为各位观众老爷们带来一个ggplot2的系列教程。那么首先呢，大家在可视化自己的科研数据时，最最最常用的就是绘制一个带误差或者显著值的柱状图。...)等等好多个常用的R包。...ggplot(frame,aes(group,num,fill=group)) + geom_col() 03 修改一些参数 我们发现柱状图有一丢丢粗糙，那就修改一下高度宽度，加上误差线、每组的数字或显著值。...由于数据比较复杂不方便自己创建，我们这里使用ggplot2自带的汽车数据集mpg为例绘制叠加柱状图。 如果我们直接绘制原始数据的柱状图，显示的是每种汽车种类及其个数。
这期我们就一起来使用一下这些参数，绘制更好看的小提琴图叭！ 分析数据简介 因为分析中需要用到分组信息，而pbmc3k的数据集是单个样品，没有包含分组信息。...分组小提琴图 分组小提琴图是一种用于展示不同组别中数据分布情况的可视化图表，当有两个组别时可以很好的展示基因在两个组间的差异 使用split.by参数可选择按照某一分组变量（这里是 'stim'）来分割数据...分组分半小提琴图 也可以在同一个图形中绘制多个分组的分布，可以直观地比较不同组之间的数据分布情况，以便进行统计分析和推断。...或者提取需要的数据，使用ggplot2直接绘制小提琴图 1....那就ggplot2 堆叠 各种元素 小结 这期使用VlnPlot函数的相关参数，绘制堆叠小提琴图，以及对小提琴图进行了分组分半的展示 基于ggplot2在VlnPlot结果的基础上进行调整，如果想提取需要的数据
相反，当您按年计算平均预期寿命时，首先按“大陆”分组。...1992 53.6 ## 10 Africa 1997 53.6 ## # … with 50 more rows 但是，如果您尝试使用与上面相同的代码在国家/地区年份分组数据框架上绘制一条线...发生这种情况是因为您现在每年都有多个平均预期寿命值，但您没有指定哪些值一起使用。...对于上面的线图示例，我们绘制了每个大陆的平均预期寿命时间线，而不是指定“group”参数，您可以将colour参数指定为continent。 这将由continent自动分组和着色。...自定义ggplot2 虽然我们在这里保留了默认的ggplot2功能，但是你可以用ggplot2来做很多事情。 例如，通过练习，您将学习如何通过将多个层组合在一起来生成高度自定义的绘图。
, character.only = TRUE) # 加载ggplot2包为什么不加引号当你直接传递包的名称时，R会把它视为一个标识符，而不是一个字符串。...为什么需要character.only = TRUE当包名称存储在一个变量中时，比如package_name ggplot2"，变量package_name包含的是一个字符串。...默认情况下，R的timeout值可能设置得较低（如60秒），这意味着如果网络操作在该时间内未完成，R会抛出一个超时错误。通过设置一个较大的timeout值，可以避免网络操作因超时而失败。...它是一个数值，用于影响R在打印数值时选择是否使用科学计数法的倾向。scipen 的值越大，R越倾向于使用普通的定点数表示法而不是科学计数法。...只要物种正确，失败都没事。
前面我们在人工智能大模型不会告诉你的热图绘制技巧 演示了如何使用ggplot2热图扩展包（ggalign），可以快速替代之前的 pheatmap： 比如我们可以先去geo数据库里面下载 GSE104171...你可以无缝使用任何 ggplot2 geoms、stats 和 scales 来构建复杂布局，包括垂直或水平排列的多个热图。...原始矩阵的行和列名（仅在名称存在时出现） .row_index 和 .column_index: 原始矩阵的行和列索引。...value: 实际的矩阵值。 我们可以像处理普通的 ggplot2 对象一样处理 ggheatmap() 对象，例如添加 ggplot2 geoms, stats, scales以及theme。...align_dendro 中的 ggplot2 specification。此外，edge 数据直接添加到 ggplote::geom_segment()图层中，用于绘制树状图。
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