ggplot和pgfSweave的问题 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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ggplot的aes和aes_string的差异

交流群有一个昵称是“今西”的小伙伴说他做了一个常规的转录组分析，实验和对照两个组，各三个样本。...但是循环的时候就报错了，他求助了他的师兄，发现问题就出在aes() 上，搜索到： https://stackoverflow.com/questions/29425892/how-do-i-loop-through-column-names-and-make-a-ggplot-scatteplot-for-each-one...让我们来演示一下“今西”小伙伴遇到的问题：首先构造模拟数据 df = as.data.frame(rbind(matrix(rnorm(260),nrow = 10),...ggplot的aes和aes_string的差异： # 成功的绘图 ggplot(gencounts, aes_string (x='condition', y= colnames(gencounts)...✦ 主题（theme）控制细节显示，例如字体大小和图形的背景色。

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ggplot_QQ图和ECDF

QQ图和ECDF sunqi 2020/8/3 QQ图用来描述数据正态性的问题，配合正态性检验进行分析主要的函数和参数 stat_qq() color, shape and size：和之前一样代码...rm(list = ls()) # 导入需要的包 library(ggplot2) # 用于绘图拼接 library(patchwork) # 用于数据处理分析 library(tidyverse)...# 设置ggplot的主题 theme_set(theme_minimal() + theme(legend.position = "top")) #自定义数据get函数 get_data...结束语此次为ggplot2系列的最后一次内容，基本的图形已经介绍完毕，总体来说，ggplot语法结构大同小异，用的时候查函数就行。...其实ggplot还可以实现很多绘图的功能，暂时就更新到这里，其他绘图后面有时间再更新，希望能够完善。 love&peace

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ggplot2 核密度图和直方图

颜色、大小和线的类型 fill：填充 alpha：透明度绘图 # 需要的包 library(ggplot2) theme_set( theme_classic() + theme(legend.position...= c("#868686FF", "#EFC000FF")) # 更改线的颜色和填充颜色和垂直线 p4 <- p + geom_density(aes(fill = sex), alpha = 0.4...Histogram 直方图为令一种展示分布的方式主要的函数和参数 geom_histgram color, size, linetype: 同上 fill: 填充 alpha: 透明度代码 rm(list...=ls()) # 需要的包 library(ggplot2) theme_set( theme_classic() + theme(legend.position = "top") )...结束语核密度图和直方图一般在论文中使用的很少，这也就注定是一个数据探索阶段的绘图，所以修的再漂亮也没什么用 love&peace

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「R」ggplot结合点图与箱线图的问题与解决

最近在使用ggplot2对箱线图叠加点图是发现奇怪的现象，只要我改变点的形状，绘图就出问题了。下面我通过一个简单的示例展示这个问题。...来解决点也需要分配到不同的fill组中的问题。...= shape), position=position_jitterdodge()) 如果我们对比上面这个图和第一个图，很容易发现点的坐标变化了！...而我们代码的唯一修改就是增加了shape映射以修改点的形状。我百思不得其解，ggplot完全没有干好它该干的事情嘛。...最后我把问题抛到了stack overflow，很快Jon Spring 进行了解惑：在这种情况下，我们希望位置抖动“意识到”存在填充美学映射的两个分类。

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ggthemr|为ggplot图形添加主题和颜色

ggthemr包提供了一种快速简便的方法来完全更改ggplot2图形的外观，并根据自己的调色板快速创建主题。...ggthemr做了一个初始化函数，当初始化函数设定主题方案以后，之后的图表不需要重复更改主题就会默认使用ggthemr的主题。...这是因为初始化主题的时候，该主题就已经替换到了ggplot使用的默认标度和主题方案，极大提升作图效率。...#install devtools :: install_github（'cttobin / ggthemr' ）如使用ggplot画三种不同的图。...当导入ggthemr的主题时，全部替代了之前的主题。

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R语言之 ggplot 2 和其他图形

标度函数是图形细节的调节函数，好比电视机的遥控器，可以调节电视机的音量、画面、色彩等属性。ggplot2 中有种类繁多的以 scale 开头的标度函数，可用于控制图形的颜色、点的大小和形状等。...以上介绍了 ggplot2 包中的映射（mapping）、图形元素（geom）、标度（scale）、分面（facet）和主题（theme）等概念，并展示了它们的基本用法。...= position_jitter(0.1), alpha = 0.5) + theme_bw() p6 3.比例的构成许多数据会涉及比例的问题，提取比例信息能使我们了解各个组成部分对于整体的重要性...对于一组问题，可以使用 sjPlot 包里的函数 plot_stackfrq( ) 对不同选项的比例进行可视化。...head(efc) qdata <- dplyr::select(efc, c82cop1:c90cop9) plot_stackfrq(qdata) 绘图结果如上图所示，我们可以从图中获取每个问题的表述

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ggplot2绘图添加文本注释上下标问题

问题描述 ggplot2绘图添加注释文本如果想要将其中的数字改为上下标该如何实现？...参考资料 https://stackoverflow.com/questions/7182247/ggplot2-annotate-text-with-superscript 上标代码 library(...ggplot2) df<-data.frame(A=1:5,B=6:10,D=letters[1:5]) ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(size...image.png 下标代码 ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(size=5)+ annotate("text",x=3,y=8.5,label

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ggplot2扩展功能包：ggpmisc和gginnards

ggpmisc和gginnards两个包包含了ggplot2很多扩展的功能。介绍其中几个实用函数。...gginnards") #install.packages("ggpmisc") library(gginnards) library(ggpmisc) stat_poly_eq 可以直接获得曲线拟合的方程...，p值，决定系数(R^2)， AIC和BIC等指标，不需要自己计算和标注了。...不过只能做多项式拟合lm()的结果。...sqrt(x)) # give a name to a formula formula <- y ~ poly(x, 3, raw = TRUE) # user specified label ggplot

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「R」ggplot2 修改x和y轴刻度

这个R tutorial描述如何使用ggplot2包修改x和y轴刻度。同样，该文包含如何执行轴转换（对数化，开方等）和日期转换。...改变x和y轴刻度下面是一些设置刻度的函数： xlim() 和 ylim() expand_limits() scale_x_continuous() 和scale_y_continuous() 使用xlim...ylim(min, max) min和max是每个轴的最小值和最大值。...使用scale_xx()函数也可以使用函数 scale_x_continuous() 和 scale_y_continuous() 分别改变x和y轴的刻度范围。...进一步请阅读函数 scale_x_datetime() 和 scale_y_datetime() 的说明。

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ggplot2的主题设置

ggplot2画图的时候有几个默认主题，画图的时候我们可以自己挑选一个喜欢的内置主题，也可以自己设置。...其中内置主题有以下几个，我们用iris数据集看一下效果： theme_bw data(iris) ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length...image 如果要全局设置某一种主题的话，那么在开头写上theme_set()即可： # 比如设置theme_bw theme_set(theme_bw()) 如果不用内置的主题设置，或者我们想自己进行一些微调也是可以的...，只要修改theme()函数即可，如下所示： ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length, color = Species))...image 删掉网格线并且背景颜色设置为白色： ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length, color = Species))

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ggplot2：分类变量在y-axis和legend的顺序调整

= carat, y = cut, color = cut)) + geom_point() + labs(title = "修改levels后") p1 + p2 图片但是这样会导致一个问题...：因为在y-axis中，数值从小到大是从下向上排序的，在我的levels中，"Premium"排在前面（序号最小），所以它排在最下面。...但如果我们想要让需要最小的排在最上面（从小到大对应从上往下），我们可以把levels的顺序反过来。...labs(title = "修改levels后+levels反序") p2 + p3 图片将levels反序后，虽然确实如我们所愿，在y-axis中序号从小到大对应变量从上到下排列，但是同时产生了一个新的问题...：在legend中变量的排列也反了过来。

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R语言ggplot2漂亮的热图和配色简单小例子

偶然间在github 上发现的这个链接，示例数据和代码都有，很好的R语言学习素材链接是 https://github.com/blmoore/blogR ，主要内容有 image.png 光看这个可能有些枯燥...大家感兴趣的话可以自己研究研究我们直接运行画图代码加载ggplot2 library(ggplot2) 最基本的热图 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c...)) + geom_tile() image.png 调整热图方块的一些内容 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile(colour...white", #linewidth=2, width=.9, height=.9) image.png 这里原来热图对应的小单元格高和宽是都可以调整的...调整热图的颜色和图例 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile(colour="white", #linewidth

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ggplot2~一幅漂亮的散点图和新学到的配色方案

今天在找R shiny的教程的时候发现了一幅比较漂亮的散点图，配色很好看，代码记录在这里。先贴出结果图，就是这样式的！ ?...library(ggplot2) library(ggrepel) #install.packages("tidyquant") library(tidyquant) 画图 ggplot(data_apps...对于我来说可能是会用到这里的主题和配色方案！...= "2016-12-31") AAPL write.csv(AAPL,file="AAPL.csv",row.names = F,quote = F) AAPL %>% ggplot(aes(x...这三个函数产生的颜色好像是一样的，只是顺序不一样！

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ggplot2中ylim的坑

在ggplot2中很容易出现一个修改坐标轴范围的问题，喜欢用ggplot2画图的需要注意一下。...ylim和coord_cartesian都是调整坐标轴范围，但是它们的结果是有可能不一样的，看下面的一个例子： data(diamonds) p ggplot(data = diamonds, aes...image 截取0到60的部分： ? image 可以看到第二张图跟原图是不一样的，比如Fair的第一个box原数据最高是超过60的，但是截取之后不到60了。这是一个不太容易注意到的坑。...这里是因为ylim是直接处理的数据导致的，比如例子中不在范围的数据就直接被移除。同等操作应该用coord_cartesian来实现。...内部参数xlim 和 ylim 各接一个二元数值向量，控制显示的区域范围，原理不是截取，而是放大该区域，原有图形不变。 p + + coord_cartesian(ylim = c(0,60)) ?

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ggplot2 中 scale 的使用

ggplot 中 scale 的使用 ggplot画图是画图中的战斗机，但是往往在我们用ggplot2画图时候，需要根据需求更改坐标，图例等，最常见的就是更改x，y坐标系的名称。...在ggplot2中，坐标系与比例尺和参考线是自动生成的，并且生成得很好。...我们会使用scale_color_和scale_fill_来更改调色板，今天我们就来介绍如何在ggplot中调整比例尺，调整中断和标签，修改轴和图例等。...强大的 Scale包，可以实现在ggplot基础上，对图形进行微调及更改。...1.基础底图 Scale包为ggplot底图提供了四种样式的比例尺： demo_continuous() and demo_log10() for numerical axes demo_discrete

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R语言ggplot2画带有置信区间的折线图和分组求均值遇到的一个问题

今天遇到一个分组求均值的问题，愣是看不出问题出在哪了，大家帮我看看文末的代码是哪里出问题了，或者留言说一下自己分组求均值在R语言里是如何实现的。...ci_lower = rnorm(length(LakeHuron),0,1), ci_upper = rnorm(length(LakeHuron),0,1)) R语言ggplot2...画图 library(ggplot2) ggplot(huron,aes(year, value)) + geom_ribbon(aes(ymin = value - ci_lower,...Defaulting to continuous.暂时还不知道是啥意思今天的笔记主要的记录内容是geom_ribbon()函数，主要作用是可以给折线周围添加一定的阴影区间今天还遇到一个问题是 R语言里分组计算均值方差等...或者说大家平时做分组求均值方差这类的数据是如何实现的呢？欢迎大家留言帮我解决问题！

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老鼠和毒药的问题

这是无量测试之道的第203篇原创今天分享一道很有意思的问题。题目：有1000只一模一样的瓶子，编号1-1000。其中999瓶是水，一瓶是看起来像水的毒药。...现在，你有7只老鼠和一天的时间，如何检验出哪个号码瓶子里是毒药？答案：根据2^10=1024，所以10个老鼠可以确定1000个瓶子具体哪个瓶子有毒。...上图表中列代表的是瓶子的数量，行代表老鼠。看每一行的时候，编号为1表示该行对应的老鼠喝了。...举例，比如编号为3的瓶子，0 1 1，表示老鼠B和老鼠C都喝了；编号为7的表示，老鼠A、B、C都喝了。...，我们直到只需要3只老鼠【 2^3=8 】即可判断出哪一瓶是毒药，那么1000瓶我们只需要10只老鼠即可判断，因为原理是一样的；比如10只老鼠通过二进制的方式为1的时候喝了，最后是第5只和第6只老鼠死了

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首页的显示和问题

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。首页的最终结果 ---- 老师提供的思路：查询当前学期，找到开始时间。计算现在是第几周。查询本周的课程。...---- 遇到的问题 ---- 这个错误的原因是因为where方法里的条件不够所导致的，且不可连续使用两个where方法。...google了一个临时的解决方法，方法如下：最后查看thinkphp5.1官方文档找到解决方法：直接使用where方法里面写入两个数组就可以解决这个问题了。其他问题英语词汇量过少。...听取组长的建议将不懂得单词写在便签纸上每天都看一遍。解决思路不够清晰和明确。对model的使用不够了解。

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ggplot2优雅的绘制轨道图

❝本节来绘制一个简单的绘图案例；暂且称之为轨道图；下面小编就通过一个详细的案例介绍如何绘制此图；关于此图的实践应用以后在做介绍加载R包 library(tidyverse) library(systemfonts..., "Nob Hill", "San Francisco", "Inner Sunset", "Outer Sunset", "Inner Richmond") 数据可视化 ggplot

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答公众号读者的问题~ggplot2气泡图的又一个小例子

首先是读入数据 df<-read.csv("bubble_plot.csv", header=T,stringsAsFactors = F) 最基本的散点图 library(ggplot2...) ggplot(df,aes(x=ID,y=log2FC))+ geom_point() ?...image.png 更改点的大小 ggplot(df,aes(x=ID,y=log2FC, color=Class,size=pvalue))+ geom_point()...image.png 将x轴和y轴的标签转换成自己想要的 ggplot(df,aes(x=ID,y=log2FC,size=pvalue, color=Class,shape=...最终图反映的信息是，圆点代表p值小于0.05，圆点越大，p值越小。叶色映射的是不同的分类欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本

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