首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

双端测序的转录组需要两个fastq文件独立定量吗

所以我们这个时候有两个解决方案,第一个是直接把每个样品的4个fq文件的定量在每个基因层面表达量加和即可,另外一个办法就是先无需理会,就把这4个值当做是4个技术重复即可,但是它不能是生物学重复,不过反正绝大部分分析也不需要区分这一点...我这里就选择了把这4个值当做是4个技术重复,如下所示的代码: rm(list = ls()) fs = list.files(path = "....如下所示,我们读取表达量矩阵文件,进行质量控制,并且绘制基本图: cor_top500 可以很清楚的看到, 我们虽然是把一个样品的4个fq文件都给了表达量,但是它们的信息是非常一致的,毕竟仅仅是技术重复...,并不是生物学重复,很难有生物学异质性,而且测序技术的稳定性超级好。....fastq.gz fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR100/060/SRR10090660/SRR10090660.fastq.gz fasp.sra.ebi.ac.uk

1K20
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到
    领券