Linux是一套免费使用和自由传播的类Unix操作系统，是一个基于POSIX和UNIX的多用户、多任务、支持多线程和多CPU的操作系统。它能运行主要的UNIX工具软件、应用程序和网络协议。...Linux继承了Unix以网络为核心的设计思想，是一个性能稳定的多用户网络操作系统。linux中.sh文件是什么？linux中.sh文件是脚本文件，一般都是bash脚本。...想运行的话就用sh命令运行sh xxx.sh。注：sh或是执行脚本，或是切换到sh这个bash里，默认的shell是bash。...当然，linux中sh是链接到bash上的，所以sh与bash在功能上是没有区别的。...还有就是在执行脚本的时候是用sh + 脚本名的方式来执行，其实，大部分的时候，简单脚本只要权限设置正确，可以直接执行，不需要sh命令的。
/加上文件名.sh，如运行hello.sh为..../hello.sh【hello.sh必须有x权限】 二、直接sh 加上文件名.sh，如运行hello.sh为sh hello.sh【hello.sh可以没有x权限】 方法一：绝对路径执行.sh文件.../home/test/shell/hello.sh /home/test/shell/hello.sh sh /home/test/shell/hello.sh 方法二：当前目录执行.sh文件 1、cd...到.sh文件所在目录 比如以hello.sh文件为例，如下 2、给.sh文件添加x执行权限 比如以hello.sh文件为例，chmod u+x hello.sh，如下图 3、..../hello.sh 即可执行hello.sh文件，如下图 4、sh 执行.sh文件 以hello.sh文件为例，sh hello.sh即可执行hello.sh文件，如下图 注：用“./”加文件名.sh
/bin/sh或者#!/bin/bash 符号#!用来告诉系统它后面的参数是用来执行该文件的程序。在这个例子中我们使用/bin/sh来执行程序。.../filename 来运行（如:chmod +x 123.sh，./123.sh） 二、注释 在进行shell编程时，以#开头的句子表示注释，直到这一行的结束。...1，自动执行jar项目运行的脚本 a，创建脚本文件（test-a.sh） [root@docker_t tools]# touch test-a.sh b，编辑文件 [root@docker_t.../test-a.sh ?.../test-b.sh ?
常用命令 yhrun -N 1 -n 1 -c 24 -p paratera job.sh，由于天河服务器采用任务独占节点形式，所以每节点的任务最好设置为24 yhbatch(sbatch):...批处理作业提交 后台提交任务，功能与yhrun相同，命令yhbatch -N 1 -n 1 -c 24 job.sh yhcancel(scancel): 取消已提交的作业 命令用法yhcancel JOBID...Xeon(R) CPU E5-2680 v3 @ 2.50GHz CPU，共24物理核，内存为128G 调度系统不明，可能是自研的， 以下为常用指令 qload -w: 显示可用队列资源使用情况 bsub...: 提交作业 常用参数 bsub -q q_x86_share -N 1 -o job.out /path/job.sh, 注意投递任务脚本路径必须填写绝对路径 bjobs: 显示作业状态 bkill...： 提交作业 简单任务参数，bsub -q queue -J name -n 36 -R span[hosts=1] -o name.out -e name.err /path/job.sh bjobs
最近做了一点和Linux有关的工作，刚刚学习，做一点和shell脚本有关的笔记。...1、创建test.sh文件 touch test.sh 2、编辑sh文件 vi test.sh 3、保存退出 敲击esc， 然后输入 :wq ，回车退出 4、添加可执行权限，当然默认就是可执行的。...chmod +x test.sh 5、运行文件 (1)./test.sh (2)sh test.sh 6、删除文件 rm test.sh
shell中使用source xxx.sh ，是直接运行xxx.sh的命令，不创建子shell，而sh则创建子shell，子shell里面 的变量父shell无法使用，对环境变量的修改也不影响父shell...sh 创建了子shell和当前的shell并行执行，子shell中执行，脚本设置的变量不会影响当前shell。...sh执行脚本 source执行脚本 还有个办法可以在父shell和子shell中分别加上 echo $SHLVL ，显示当前运行层级，可以明显的看出来： 两种执行层级不同 [root@bogon home...]# cat father.sh #!..."source son shell" echo "sh son shell" sh son.sh echo "sh son shell" [root@bogon home]# cat son.sh #
1.提交代码到本地仓库 [root@yoyo git_code]$ git add * #*是提交当前文件夹下全部的，也可以指定提交一个文件如：test.py 2.代码提交到缓存区...[root@yoyo git_code]$ git commit -m "add test.py" 3.提交到远程仓库 [root@yoyo git_code]$ git remote add origin
一、linux中.sh文件是什么？ linux中.sh文件是脚本文件，一般都是bash脚本。 二、linux中的.sh文件怎么执行？ 1、直接..../加上文件名.sh，如运行hello.sh为 ..../hello.sh 【绝对路径下也可以，但hello.sh必须有x权限】 使用绝对路径执行： 对于文件是否具有x权限，可以目录文件夹下（存放当前文件的文件夹）输入 ll...命令查看，没有可使用 chmod u+x hello.sh 2、直接sh 加上文件名.sh，如运行hello.sh为 sh hello.sh【hello.sh可以没有x权限】 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献
目前我发现想要用bsub命令指定在特定的conda虚拟环境中运行脚本有两种办法：1. 在运行目标命令前使用source命令加载虚拟环境。...例如下面要运行base环境中的spades.py命令：#BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq#BSUB -o spades_hq.out#BSUB -...提交作业就可以了。...要实现同上的效果，如下：#BSUB -q 722080tiib#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_clean#BSUB -o spades_clean.out#BSUB -e spades_clean.errconda...run -n base spades.py --careful -1 8456_clean1.fq.gz -2 8456_clean2.fq.gz -o spades_clean.result最后再提交作业即可
问题 linux系统是centos 7.x 发现将windows自动打的包发到centos后执行.sh文件出现如下: ?...查询.sh文件的格式，通过vim 打开.sh然后执行如下: :set ff 结果： ? 发现是dos格式是有问题，需要转换成unix。...idea解决方案： 1.打开.sh文件，然后点击右下角CRLF修改为UNIX of OS就OK了 ? 2.在配置文件中，统一添加以下配置 unix ?
crontab是Linux一个定时执行特定任务的程序，网上也有很多使用教程，在这里举一个例子，抛砖引玉。 为了运行.py，建议使用.sh脚本批量运行，并且在.sh内输出日志。...Ubuntu系统crontab设置请参考： https://www.linuxidc.com/Linux/2013-05/84770.htm 建立.sh文件 在目录下新建xxx.sh文件，内容为：.../bin/sh . ~/.bash_profile python /home/price-monitor-server/conn_sql.py ---- 第一行是输出标准日志到crawl_log...第二行是输出标准错误日志到crawl_log_err 第三与第四行是为了实行.sh而设置的环境 第四行及之后就可以执行.py啦 设置crontab 在/var/spool/cron/(你的用户名)文件中添加一行...： */15 * * * * cd /home/xxxxx && sh crawl_item.sh 代表每15分钟去往/home/xxxxxx目录执行一次crawl_item.sh 由于日志在.sh中已经输出
在Linux系统下运行.sh文件有两种方法，比如我在root目录下有个datelog.sh文件 第一种（这种办法需要用chmod使得文件具备执行条件(x): chmod u+x datelog.sh）：...2、cd到datelog.sh文件的目录下，然后执行./datelog.sh ?...第二种（这种办法不需要文件具备可执行的权限也可运行）： 1、在该文件路径下sh加上文件名字即可，sh datelog.sh ?...2、在任意路径下，sh 加上文件路径及文件名称：sh /root/ datelog.sh ?...桌面环境双击运行sh文件： Mac： 1、修改后缀sh变成command：hello.sh->hello.command 2、修改可执行权限：chmod u+x hello.command Ubuntu
Dspring.profiles.active=pro 指的是激活application-pro.properties配置文件 # -Dserver.port=18083 可指定运行端口 # 此变量会获取到当前路径 等价于 Linux.../你的文件名.sh start # 停止你的服务 ./你的文件名.sh stop # 查看你的服务状态 ./你的文件名.sh status # 重启你的服务 ..../你的文件名.sh restart 演示 image.png 重启脚本，同时展示脚本运行时间 # 说明 我有4个sh文件，同时运行，并追加参数restart！..../1login.sh restart; echo echo ./2room.sh restart; echo echo ./3friendcricle.sh restart; echo echo ....status; echo ./2room.sh status; echo ./3friendcricle.sh status; echo ./4pay.sh status; echo -e "\033
dialog是个linux命令行的ui显示工具，可以在命令行显示更加友好的用户界面，系统如果没有安装需要手工安装: sudo apt-get install dialog 以下是在命令显示表单的示例：..."/home/hello" # Store data to $VALUES variable VALUES=$(dialog --ok-label "Submit" \ --backtitle "Linux
这不得不找到了一个Linux命令：nohup （二）基本用法 nohup command [arg … ] [ & ] 拿python test.py 为例子 一般我们运行命令是直接：python test.py.../start.sh >> /usr/local/node/output.log 2>&1 & 该命令是把nohup的log输出到/usr/local/node/output.log 这个文件中 2).../start.sh 该命令是把nohup的log直接输出到当前目录下并保存为nohup.log （四）查看运行的后台进程 1）当我们把进程运行到后台后，我们再找回的时候，就需要用到： ps -aux|...grep start.sh a:显示所有程序 u:以用户为主的格式来显示 x:显示所有程序，不以终端机来区分 用ps -def | grep查找进程很方便，最后一行总是会grep自己 用grep...-v参数可以将grep命令排除掉 ps -aux|grep start.sh| grep -v grep 2）查看使用某端口的进程 netstat -ap|grep 8090 3）查看到进程id之后，
目录 一、Anaconda包安装 1、先通过Xshell链接到Linux服务器上 3、上传Anaconda安装包 4、通过bash/sh来安装Anaconda安装包 二、系统环境设置 1、查看安装位置...python3.9的最新版 1、创建pytorch名字的python3.9环境 2、进入自创建环境 3、测试python环境 4、查看环境内容 ---- 一、Anaconda包安装 1、先通过Xshell链接到Linux...服务器上 2、上传下载好的Anaconda的sh包 Index of /anaconda/archive/ | 清华大学开源软件镜像站 | Tsinghua Open Source Mirror 这个地址下载的比较快...4、通过bash/sh来安装Anaconda安装包 为了不出现缺东西的异常我们提前安装一下： yum install -y bzip2 这里sh 包名的方式安装 sh Anaconda3-2022.10...-Linux-x86_64.sh 直接输入回车： 看到More就一直回车就行 出现yes/no的提示输入【yes】 这里直接回车 这里需要下载一会 这里最后输入yes 完成 二、系统环境设置
对核酸聚类 echo "time cd-hit-est -i mg.ffn -o mg.filter.ffn -aS 0.9 -T 12 1>cdhit.log 2>cdhit.err" >cdhit.sh...bsub -q fat -n 12 -o %J.log -e %J.err sh cdhit.sh seqkit stat mg.ffn mg.filter.ffn file...time cd-hit-est -i mg.ffn -o mg.filter.ffn -aS 0.85 -T 12 -c 0.85 1>cdhit1.log 2>cdhit1.err" >cdhit1.sh...bsub -q fat -n 12 -o %J.log -e %J.err sh cdhit1.sh seqkit stat mg.ffn mg.filter.ffn file...# bsub -q fat -n 12 -o %J.log -e %J.err sh cdhit1.sh # 使用transeq翻译，transeq来自emboss软件包 transeq -sequence
python3.7/site-packages/metaphlan/metaphlan_databases/mpa_vJan21_CHOCOPhlAnSGB_202103 #加上刚才下载的数据库索引 #bsub...-q fat -n 12 -o %J.log -e %J.err sh meta.sh 三、结果解读 默认输出的结果分为两列，用制表符分割，第一列为物种分类 clades，按照物种很累层级进行排列...-reorder --bowtie2-options '--very-sensitive --dovetail' --run-fastqc-start --run-fastqc-end" >>kne.sh...;done; #echo "parallel -j 4 -a kne.sh" >para.sh #集群使用32线程 #bsub -q fat -n 48 -o %J.log -e %J.err sh para.sh...;done; #集群使用12线程 #bsub -q fat -n 12 -o %J.log -e %J.err sh met.sh #结果就是20个txt #合并 merge_metaphlan_tables.py
第８章 进程和程序：编写命令解释器sh Unix通过将可执行代码装入进程并执行它来运行一个程序．进程是 一个程序所需的内存空间和其他资源的集合 每个运行中的程序在自己的进程中运行．每个进程都有一个唯一的
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