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    文献解读-多组学-第十八期|《整合 WES 和 RNA-Seq 数据以进行短变异发现》

    组学的整合具有巨大的潜力,可用于变异发现。已经开发了几种算法来以整合方式检测体细胞变异,但仍然没有胚系突变检测的策略。在此基础上,研究者开发了一种通过整合WES和RNA-seq数据来识别胚系突变的策略。这种整合策略从原始序列数据中识别短变异(SNP和插入缺失),将其分为六组以改善变异解释:强证据,仅DNA,仅RNA,等位基因特异性表达(ASE),RNA编辑和RNA挽救变异。研究者基于整合流程分析了四个样本,与仅使用 WES 数据相比,发现已识别变体的数量有所增加,但对性能没有太大影响,从而可以验证由两种类型的数据(强证据变体)识别的变体,并鉴定 RNA 编辑和 ASE。这种整合策略提供了一种从WES和RNA-seq数据中鉴定胚系SNP和插入缺失的方法,充分利用这两种组学可以扩大已识别变异的范围并进行变异验证。

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    弄它!!!深入研究OSPF的内部传输过程(LSA类型及详解 )

    对于想深入学好数通的朋友,这几类LSA就不用我我说了,很重要!!!一定要理解 可以结合小编上一篇的OSPF协议的介绍来理解 还有,我想如果真的想深入学习ospf一定要细心的,静下心来慢慢的一步步的去琢磨,也是作为一个过来人的体验,你会发现这个协议真的很高级,很聪明,可能我已经爱上它了-.- 1 、路由器LSA(Router LSA ) 每台OSPF路由器都会产生,描述了路由器所有OSPF直连接 口的状态和Cost值等信息。只能在所属区域内泛洪。 2 、网络LSA(Network LSA ) 由DR产生,描述在MA网络中DR连接的所有路由器的 RouterID,其中包含DR自己的RouterID。该类LSA只能在所 属区域内泛洪。 3 、网络汇总LSA(Network Summary LSA ) 由ABR产生,描述一个区域内特定网段的路由。该类LSA将用 于OSPF区域间路由的计算。 4 、ASBR汇总LSA(ASBR summary LSA ) 由ABR产生,是一条主机LSA,用于描述ASBR。 5 、AS外部LSA(AS External LSA ) 由ASBR产生,用于描述本AS之外的外部路由。 7 、NSSA LSA (这里的七类就是起到优化的作用) 由ASBR产生,内容几乎和LSA5是相同的,但NSSA LSA仅仅 在始发这个LSA的NSSA内泛洪,不能直接进入骨干区域。 NSSA的ABR会将7类LSA转换成5类LSA注入到骨干区域。

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