首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    python读取xml格式的文件

    xml是一种可扩展的标记语言, 是互联网中数据存储和传输的一种常用格式,遵循树状结构的方式,在各个节点中存储用户自定义的数据,一个xml文件示例如下 xml version="1.0"?...在标签之间的值,比如上述例子中第一个rank标签的内容为1 标签,属性,内容都可以根据用户的需求来自定义,所以xml文件非常的灵活。...在python中,有多个模块都支持xml文件的处理,列表如下 xml.etree.ElementTree xml.dom xml.dom.minidom xml.dom.pulldom xml.parsers.expat...其中,第一个模块更加轻便简介,对于简单的xml文档,推荐使用。...本公众号深耕耘生信领域多年,具有丰富的数据分析经验,致力于提供真正有价值的数据分析服务,擅长个性化分析,欢迎有需要的老师和同学前来咨询。

    2.4K10

    如何将VOC XML文件转化成COCO数据格式

    在一个项目中,我需要将已有的VOC的xml标注文件转化成COCO的数据格式,为了方便理解,文章按如下顺序介绍: XML文件内容长什么样 COCO的数据格式长什么样 XML如何转化成COCO格式 VOC...不同于VOC,一张图片对应一个xml文件,coco是直接将所有图片以及对应的box信息写在了一个json文件里。...(散装英语说的好爽) info: 这个记录的是你的数据集信息,例如 "info": { # 数据集信息描述 "description": "COCO 2017 Dataset", # 数据集描述...转化为COCO格式 下面直接搬运别人已经写好的代码,亲测有效。...使用注意事项:须先安装lxml库,另外你要确保你的xml文件里类别不要出错,例如我自己的数据集因为有的类别名称多了个下划线或者其他手贱误敲的字母,导致这些类别就被当成新的类别了。祝好运。 #!

    1.8K20

    HDFS——读写文件的数据传输格式

    hdfs中很重要的一个流程就是数据的读写,但在此之前,需要先了解数据是如何传输的,数据包的具体的传输格式是怎样的,本文就此进行总结说明。...【数据包格式】 ---- 要了解客户端写hdfs是如何组织数据的,需要先了解三个概念:block,packet,chunk。...datanode写完后执行sync动作,将数据刷到磁盘中 以上是一个正常数据包的格式说明。...: 结合前面的描述,可以清楚的了解到packet数据包的组成格式。...这样在datanode在处理客户端发送的packet时,不需要额外再对数据进行切割补齐,大大减少了相应的处理逻辑。 【总结】 ---- 本文对hdfs数据传输的格式进行了详细说明。

    56930

    Excel格式的SNP数据怎么变为plink格式

    有时候,我们会遇到Excel格式的基因型数据,这篇博文介绍一下如何手动转为plink格式。 可以在Excel中整理,也可以在R语言中整理。...数据量少的话,就在Excel中整理,数据量大的话,就在R语言中整理就行。 主要思路是根据plink的格式特点,针对性的满足,然后导出,就可以了。 1....2. plink的格式 「.map格式」 格式说明链接: http://zzz.bwh.harvard.edu/plink/data.shtml#map ❝map格式的文件, 主要是图谱文件信息, 主要包括染色体名称...「.ped格式」格式说明链接:http://zzz.bwh.harvard.edu/plink/data.shtml#ped ❝bed格式的文件, 主要包括SNP的信息, 包括个体ID, 系谱信息,...这里有个坑:默认plink的缺失为0,如果AT连写的格式,是00,但是如果一列都是00的时候,就变为了一个0,就会map和ped不匹配。

    1.7K50

    7.JSON格式数据的格式化

    值得继续分享: 200个生信工程师面试考题 JSON格式简介 JSON(JavaScript Object Notation),是一种数据交互格式。 在JSON格式出现之前,大家都用XML传递数据。...XML是一种纯文本格式,所以适合在网络上交换数据,但是XML格式比较复杂,知道拉格斯.克罗克福特发明了JSON这种超轻量级的数据交换格式。...其中key必须作为字符串而且是双引号,value可以是多种数据类型 数组 :用中括号表示,每个元素之间用逗号分隔开 JSON格式与python格式的对应 Python JSON dict object...= json.loads(json_data) JSON 文件下载 这使用的是TCGA的metadata 以下面的JSON数据为例https://portal.gdc.cancer.gov/auth/...在使用脚本处理之前,先观察整个JSON文件的结构,确定哪些内容是自己需要的,大致了解文件 结构之后 #!

    1.9K40

    Parquet存储的数据模型以及文件格式

    Aapche Parquet是一种能有效存储嵌套数据的列式存储格式,在Spark中应用较多。 列式存储格式在文件大小和查询性能上表现优秀,在列式存储格式下,同一列的数据连续保存。...一般来说,这种做法可以允许更高效的编码方式,从而使列式存储格式的文件常常比行式存储格式的同等文件占用更少的空间。...Parquet的突出贡献在于能够以真正的列式存储格式来保存具有深度嵌套结构的数据。在显示世界中,具有多级嵌套模式的系统比较普通,所以这种能力非常重要。...文件头中仅包含一个称为 PAR1 的 4 字节数字(Magic Number),它用来识别整个 Parquet 文件格式。文件的所有元数据都被保存在文件尾中。...文件尾中的元数据包括文件格式的版本信息、模式信息、额外的健值对以及所有块的元数据信息。

    28310

    生信中常见的数据文件格式

    而BAM就是SAM的二进制文件,也就是压缩格式的sam文件。 SAM格式文件包括头部注释部分和比对结果部分,头部分为’’可选部分’’。头部分位于比对部分之前,以“@”开头。...由于sam格式的文件通常都非常大,所以为了节省存储空间而将sam转换为二进制格式以便于存储,也就是bam文件。...我之前在TCGA数据库差异分析的文章中,也是通过gtf文件进行ID转换的。 ? ? GFF全称为general feature format,这种格式主要是用来注释基因组。...如果此注释数据集的轨迹线useScore属性设置为1,则得分值将确定显示此要素的灰度级别(较高的数字=较深的灰色)。...如果轨道行 itemRgb属性设置为“On”,则此RBG值将确定此BED行中包含的数据的显示颜色。

    2.8K33

    IP 数据报的格式解读

    ​ IP数据报由首部和数据两部分组成。IP数据报的首部首部的前一部分为固定长度(20字节),这是所有IP数据报必须具有的。首部固定部分的后面是选项和填充字段(长度可变) 。...总长度——16位,指整个数据报(包括首部和数据)的长度,单位为字节。数据报的最大长度为65535字节(64KB)。总长度必须不超过数据链路层的最大传送单元MTU。...当数据报长度超过MTU时,需对其分片,此时的总长度是指分片后的每一分片(包括首部与数据) 的长度标识(identification) ——16位,它用于数据报各分片最终被重装成来原来的数据报。...IP数据报分片举例:一数据报的总长度为 3820 字节,其数据部分的长度为 3800 字节(使用固定首部),需要分片为长度不超过 1420 字节的数据报片。...原始数据报首部被复制为各数据报片的首部,但必须修改有关字段的值。

    1.9K00
    领券