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    30道练习题带你玩转统计学的R语言版

    分位数和平均数` Q3:对数据集 iris的所有定性数据列计算水平及频次 Q4:对数据集 iris的所有定量数据列计算离散趋势指标:方差和标准差等 Q5:计算数据集 iris的前两列变量的相关性,提示cor函数可以选择...的前两列变量的相关性 Q8: 根据数据集 iris的第五列拆分数据集后重复上面的Q2到Q7问题 Q9:载入R中自带的数据集 mtcars,重复上面的Q1到Q7个问题 Q10: 载入r包airway并且通过assay函数拿到其表达矩阵后计算每列之间的相关性...',length(y)))) ggboxplot(df, y = "value", x = "group") Q5: 取RNAseq_expr行之和最大的那一行根据分组矩阵进行T检验 pos=which.max...rowSums(RNAseq_expr)) t.test(RNAseq_expr[pos,]~RNAseq_gl) pos Q6: 取RNAseq_expr的MAD最大的那一行根据分组矩阵进行T检验 pos=which.max...(rowSums(RNAseq_expr)) pos t.test(RNAseq_expr[pos,]~RNAseq_gl) pos=which.max(apply(RNAseq_expr,1,mad)

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    临床预测模型—C指数(C-index)和时间ROC(timeROC)曲线绘制学习

    logrank) test = 9.18 on 3 df, p=0.03# 这里的Concordance就是C指数,为0.565# 验证集c-index和95%CI# 这里中间的环节是使用predict函数去预测...test数据集中每个样本的风险值# 然后将得到的每个样本的风险值再进行coxph拟合成一个新的函数# 最后使用predict(Ctrain, newdata = test)计算的风险评分作为一个新的自变量来拟合...))})可视化(timeROC)# C-index--绘制library(timeROC)# 计算时间依赖性ROC曲线和AUC(使用第一个验证数据集作为示例)# 命名g 函数来根据名称查找数据集在列表中的位置...timeROC不能直接添加标题,要额外添加 col= "#f5695e", #print.thres.col="black", #identity.col="grey", timeROC函数中这个没用...font.axis = 1) # 刻度字体样式# 添加一条灰色的对角线abline(a = 0, b = 1, col = "grey", lty = 2, lwd = 2)# 使用 title() 函数添加额外的图形标题

    1.1K00

    分组计算描述性统计量函数—by()函数

    《R语言实战》这本书上是这样描述by()函数的: 使用by()分组计算描述性统计量,它可以一次返回若干个统计量。...简单点说by(data, INDICES, FUN)函数的典型用法: 是将data数据框或矩阵按照INDICES因子水平进行分组,然后对每组应用FUN函数。 是不是没懂?...熟悉split()函数的可以看出,按照gender列分组那步,split()函数可以到达同样的效果:split(biotrainee,biotrainee$gender) > split(biotrainee...: tmp = by(exp, ids$symbol, function(x) rownames(x)[which.max(rowMeans(x))]) probes...第三个参数是我们自己定义的函数:计算每个小矩阵中每行探针表达量的平均值(也就是每个探针在6个样本中表达量的均值rowMeans(x)),再取平均值最大的那个探针作为该symbol所对应的唯一探针which.max

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    数据分析中非常实用的自编函数和代码模块整理

    通俗的说,在数据分析工作中,我们经常会通过调用自编函数来实现某些高级的功能。...1、centralImputation( ) 根据样本间的相似性填补缺失值方法,把实现代码封装在如下函数中,并将该函数命名为centralImputation 根据样本之间的相似性填补缺失值是指用这些缺失值最可能的值来填补它们...我们将上述分析放在一个统一的函数centralImputation( )中,对于数值型变量,我们用中位数填补,对于名义变量,我们用众数填补,函数代码如下: centralImputation<-function...else { x<-as.factor(x) if(is.null(ws)) { levels(x)[which.max...(table(x))] } else { levels(x)[which.max(aggregate(ws,list(x),sum)[

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    【Kotlin】标准库函数总结 ( apply 函数 | let 函数 | run 函数 | with 函数 | also 函数 | takeIf 函数 | takeUnless 函数 )

    文章目录 一、apply 标准库函数 二、let 标准库函数 三、run 标准库函数 1、run 函数传入 Lambda 表达式作为参数 2、run 函数传入函数引用作为参数 四、with 标准库函数...五、also 标准库函数 六、takeIf 标准库函数 七、takeUnless 标准库函数 Kotlin 语言中 , 在 Standard.kt 源码中 , 为所有类型定义了一批标准库函数 , 所有的...Kotlin 类型都可以调用这些函数 ; 一、apply 标准库函数 ---- Kotlin 标准库函数 中的 apply 函数 , 该函数可以看作 实例对象 的 配置函数 , 传入 T.() ->...apply 函数与 let 函数的区别 : apply 函数的 返回值是 调用者 ; let 函数的 返回值是 Lambda 表达式的最后一行 ; let 函数原型 : /** * 调用以' this..., 在 let 函数中 , 将首字母变为大写 , 并返回 , let 函数返回的是 匿名函数 的最后一行 , 因此将 “Tom” 字符串 返回了 ; 如果将 let 函数换成 apply 函数 ,

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    strlen函数,strcat函数,strcpy函数,strncpy函数,strcmp函数

    strcpy函数: char *strcpy(char *Dest , const char *Src)   {       assert((Dest != NULL) && (Src !...= '\0')           NULL;   return address;   }   strncpy函数: 利用标准库函数strncpy(),可以将一字符串的一部分拷贝到另一个字符串中...strncpy()函数有3个参数:第一个参数是目录字符串;第二个参数是源字符串;第三个参数是一个整数,代表要从源字符串拷贝到目标字符串中的字符数。...: strcmp函数是C/C++中基本的函数,它对两个字符串进行比较,然后返回比较结果,函数形式如下:     int strcmp(constchar*str1,constchar*str2);...无论两个字符串是什么样,strcmp函数最多比较到其中一个字符串遇到结束符'/0'为止,就能得出结果。

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    swift 函数(函数定义、函数调用、函数类型、嵌套函数)

    函数的类型由函数的参数类型和返回类型组成 func add(_ a:Int, _ b:Int) -> Int { return a + b } 这个函数的类型是(Int, Int) -> Int...,返回Void类型的函数” 函数类型的使用 定义一个类型为函数的常量或变量,并将适当的函数赋值给它 func add(_ a:Int, _ b:Int) -> Int { return a +...函数类型作为返回值 定义了两个简单函数,分别是 sayHI(_:) 和 sayHello(_:),这两个函数的类型都是 (String) -> String。...之后在定义一个showResult(:) 的函数,它的返回类型是(String) -> String 类型的函数。...sayHI : sayHello } let show = showResult(true) print(show("world")) //HI world 嵌套函数 把函数定义在别的函数体中

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    【JavaScript】函数 ① ( 函数引入 | 函数声明 | 函数调用 )

    中 ; JavaScript 函数 是一段可以重复使用的代码块 , " 函数 " 可以 接受 若干输入参数 , 在 函数体 中进行 计算 或 执行操作,并返回 返回值 ; 借助 函数 可以 组织和重用代码..., 使代码更加清晰和易于维护 ; 函数 的 目的 就是 重复使用代码 ; 使用函数 就是 声明函数 和 调用函数 ; 2、函数声明 在 JavaScript 中 , 使用 function 关键字 声明函数...字符串 ; 3、函数调用 函数声明后 , 本身不会自动执行 函数体中的代码 , 只有 调用函数后 , 才会执行 函数体代码 ; 函数调用 语法格式 : functionName(argument1, argument2...是传递给函数的 实参列表 , 该 实参列表 与 函数定义的 形参列表一一对应 , 这些实际参数值值将替换函数定义中的形式参数 , 并在函数执行时 作为 函数体的 局部变量 使用 ; 4、代码示例 - 函数声明调用...在下面的代码中 , 定义了 hello 函数 , 传入 name 形参 , 在 函数体中 , 该形参可以作为局部变量使用 ; 调用 hello() 函数时 , 传入 实参 'Tom' 字符串 , 在函数体中会向

    1.5K10

    函数|匿名函数|偏函数|装饰器函数

    文章目录 1、 函数递归 2、 函数变量赋值 3、 参数中的函数 4、 匿名函数 5、 返回值中的函数:闭包 6、 偏函数 7、装饰器函数处理 1、 函数递归 函数的递归,就是让在函数的内部调用函数自身的情况...,这个函数就是递归函数。...2、 函数变量赋值 函数,是一种操作行为 函数名称,其实是这种操作行为赋值的变量 调用函数,其实是通过这个赋值的变量加上一堆圆括号来进行函数的执行 # 定义了一个函数,函数命名为printMsg def...3、 参数中的函数 函数作为一个对象,我们同样可以将函数当成一个实际参数传递给另一个函数进行处理 # 系统内置求绝对值函数abs(),赋值给变量f f = abs; # 定义一个函数,用于获取两个数据绝对值的和...5、 返回值中的函数:闭包 函数作为对象,同样也可以出现在返回值中,其实就是在函数中又定义了另外的函数 在一个函数中定义并使用其他的函数,这样的方式在不同的编程语言中有不同的管理方式,在Python中

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