SimpleITK有广播吗？
SimpleITK是一个用于医学图像处理的开源软件库，它提供了简单且高效的接口，用于处理和分析医学图像数据。SimpleITK库本身并不具备广播功能。
广播（Broadcasting）是指在进行数组运算时，自动对不同形状的数组进行适当的扩展，使它们具有相同的形状，从而进行元素级别的操作。广播功能可以简化代码，提高效率。
在SimpleITK中，如果需要进行广播操作，可以借助NumPy库来实现。NumPy是一个强大的数值计算库，提供了广播功能以及丰富的数组操作函数。
以下是一个使用SimpleITK和NumPy进行广播操作的示例：
import SimpleITK as sitk
import numpy as np
# 创建一个SimpleITK图像
image = sitk.Image([512, 512], sitk.sitkUInt8)
# 将SimpleITK图像转换为NumPy数组
array = sitk.GetArrayFromImage(image)
# 创建一个形状为(1, 512)的NumPy数组
broadcast_array = np.ones((1, 512))
# 对NumPy数组进行广播操作
result = array * broadcast_array
# 将广播后的NumPy数组转换为SimpleITK图像
result_image = sitk.GetImageFromArray(result)在上述示例中，我们首先将SimpleITK图像转换为NumPy数组，然后创建一个形状为(1, 512)的NumPy数组作为广播数组。通过将SimpleITK图像数组与广播数组相乘，实现了广播操作。最后，将广播后的NumPy数组转换回SimpleITK图像。
需要注意的是，SimpleITK和NumPy是两个独立的库，使用时需要进行相应的数据转换。另外，SimpleITK和NumPy都有丰富的文档和示例代码，可以进一步了解它们的功能和用法。
推荐的腾讯云相关产品和产品介绍链接地址：
- 腾讯云云服务器（CVM）：https://cloud.tencent.com/product/cvm
- 腾讯云云数据库MySQL版：https://cloud.tencent.com/product/cdb_mysql
- 腾讯云对象存储（COS）：https://cloud.tencent.com/product/cos
- 腾讯云人工智能：https://cloud.tencent.com/product/ai
- 腾讯云物联网通信（IoT Hub）：https://cloud.tencent.com/product/iothub
- 腾讯云移动推送（TPNS）：https://cloud.tencent.com/product/tpns
- 腾讯云区块链服务（BCS）：https://cloud.tencent.com/product/bcs
- 腾讯云游戏多媒体引擎（GME）：https://cloud.tencent.com/product/gme
- 腾讯云音视频处理（VOD）：https://cloud.tencent.com/product/vod
- 腾讯云云原生应用引擎（TKE）：https://cloud.tencent.com/product/tke
请注意，以上链接仅供参考，具体的产品选择应根据实际需求进行评估和决策。
相关·内容
语言:爪哇
paltform:eclipse
套餐: simpleITK 0.9.0
我想创建一个窗口来显示dicom图像，所以我使用函数：
SimpleITK.show(image);
但是，结果是：
Exception thrown in SimpleITK show: ..\..\..\..\..\SimpleITK\Code\IO\src\sitkShow.cxx:463:
sitk::ERROR: Error in administrating child process: [参数错误]
中文的意思是参数错误
我可以得到图像的大小和病人的名字，但我不能显示图像。我的代码有什么问题吗？
浏览 1提问于2016-04-27得票数 1
我需要在我的Python代码中使用一个库，我在Google上运行它。MyOS Windows 10
我安装了那个软件包
!pip install SimpleITK==1.1.0
但是，它仍然显示了错误：
AttributeError:模块“SimpleITK”没有属性“ElastixImageFilter”
有解决这个问题的指南吗？
浏览 17提问于2022-02-20得票数 1
我知道如何在C++中实现itk图像和SimpleITK图像之间的转换，这是SimpleITK (Examples/ITKIntegration.cxx)中的一个示例。
//
// Extract the itk image from the SimpleITK image
//
InternalImageType::Pointer itkImage =
dynamic_cast <InternalImageType*>( image.GetITKBase() );
...
//
// Return to the simpleITK setting
浏览 2提问于2014-01-27得票数 3
这不是副本，请花几秒钟阅读我的问题，我会很高兴的。
我目前使用的是的RegistrationMethodClass。由于固定图像中有许多噪声(然后可以在度量中选择比较点，从固定图像中选择点)，我想尝试以另一种方式注册，使用干净的蒙版图像作为固定图像，然后使用transform类中的方法将返回的变换的逆变换应用到这个非常相同的蒙版上。
有点像：
Resample(
img_mv, img,
Reg.Execute(img, img_mv).GetInverseTransform(), Linear, 0.0, img.GetPixelIDValue()
)
然而，当我遇到这一行时
浏览 1提问于2017-08-07得票数 0
回答已采纳
在Python或任何其他语言中是否有一种方法可以将. .raw/mhd图像数据转换为Nifti/nii？
我可以通过SimpleITK在python中加载. .raw/mhd文件，如下文所示：
import skimage.io as io
img = io.imread('file.mhd', plugin='simpleitk')
我很难出口有合适尺寸的nii .在理想情况下使用原始mhd文件中的头信息..。
谢谢
浏览 0提问于2019-01-19得票数 0
回答已采纳
刚刚安装了最新版本的SimpleITK，我试图以以下方式运行一个简单的代码：
im = sitk.ReadImage('img.nii.gz')
im_bin = sitk.ReadImage('img_bin.nii.gz')
im_bfc = sitk.N4BiasFieldCorrection(im, im_bin)
错误是
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK N4BiasFieldCorrection: /scratch/dashboards/SimpleITK-OSX10.7-intel-pkg/Si
浏览 7提问于2016-10-12得票数 3
回答已采纳
我的Python代码是：
import SimpleITK as sitk
resultImage = sitk.Elastix(sitk.ReadImage("fixedImage.nii"), \
sitk.ReadImage("movingImage.nii"), \
"translation")
sitk.Show(resultImage, 'test', debugOn=True)
我知道这个错误：
回溯(最近一次调用)：
文件
浏览 6提问于2017-10-09得票数 1
多亏了SimpleITK in Python，我已经开始与SimpleITK合作一周了。尽管目前我对SimpleITK很满意，但我注意到Powell optimization scheme或OnePlusEvolutionary one这样的特性在SimpleITK中是不可用的。以地标为基础的注册方法似乎也是如此。
因此，我想知道是否有一种方法可以检索ITK (在C++中)在SimpleITK中可用的所有功能，还是有必要执行自己的包装？
如果不是，我以后将学习C++这样做！
谢谢!
浏览 6提问于2015-07-08得票数 2
回答已采纳
我目前正在开发一个医学图像跟踪系统，它需要使用SimpleElastix版本的SimpleITK (修改的SimpleITK 2.0.0)中提供的注册功能，但是，我也只需要在SimpleITK 2.2.0中使用一些功能。
SimpleElastix：
是否有任何方法可以将SimpleElastix版本构建为不同的名称，以便导入两个版本？
浏览 7提问于2022-10-03得票数 0
2回答
SimpleITK提供了易于使用的Python接口。我可以从那里继续上课吗？
我需要解决一个注册问题，它要求我编写我的定制注册类，特别是相似度度量。如何在Python中扩展SimpleITK以供我使用？
浏览 9提问于2016-02-24得票数 0
回答已采纳
我正在尝试使用SimpleITK 0.5.1 C#版本加载MINC 2.0镜像
我得到以下错误：
System.ApplicationException : Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: ..\..\..\..\..\ITK\Modules\IO\HDF5\src\itkHDF5ImageIO.cxx:883:
itk::ERROR: HDF5ImageIO(000000001DBE7AE0): H5Dopen2 failed
我的代码如下：
String fileName = @"d:\Temp\MRI\
浏览 1提问于2012-10-28得票数 0
回答已采纳
1回答
如何进行脱粒？
、、、
当我应用阈值处理时，我得到了一个错误：
import SimpleITK as sitk
img = sitk.ReadImage("Sub1.png")
img=img>20
错误是：
RuntimeError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-48-a1d4494dca15> in <module>()
1 #img = sitk.Image(img.GetSize(), sitk.sitkUInt8)
----
浏览 2提问于2018-06-28得票数 0
回答已采纳
1回答
对于在SimpleITK程序中使用C++的任何人来说，这都是一个问题。
我下载了SimpleITK代码，并按照SimpleITK指令(Superbuild)使用CMake生成了VS2008 .sln文件。
在SimpleITK-build\lib\Debug中，我得到了一些SimpleITK库，例如：SimpleITKCommon-0.8.lib。在SimpleITK-build\ITK-build\lib\Debug中，我得到了许多ITK库，例如：ITKCommon-4.5.lib
在代码中，我使用：#include "SimpleITK.h"
问:我要链接到什么？
我可以一
浏览 2提问于2014-09-18得票数 0
回答已采纳
我想在Python中处理*.mha文件。但是它需要依赖于ITK包的MedPy包。我目前在安装ITK包时遇到问题。我在想是否有一种方法可以将*.mha文件转换为*.nii文件(使用其他方法，可能是C++)，因为这样我就可以使用Python读取*.nii文件。任何相关的指针都是受欢迎的。
浏览 10提问于2015-04-20得票数 4
为了运行代码，我正在使用PyCharm最新版本的Windows764位与16 on的内存和... Python version: 3.7.7 (default, May 6 2020, 11:45:54) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] 我正在尝试从BraTS 2019 dataset中使用SimplyITK和Numpy加载大量的NIFTI图像。 这是我用来将图像加载到numpy数组中的代码。 import SimpleITK as sitk
def read_nifti_images(images_full_path):
"""
浏览 27提问于2020-08-11得票数 0
import setuptools
easy_install SimpleITK-0.8.0.post48-py2.7-macosx-10.5-x86_64.egg
我下载了.egg文件并尝试使用easy_install，但它似乎不起作用。这就是我得到的错误。
easy_install SimpleITK-0.8.0.post48-py2.7-macosx-10.5-x86_64.egg
^
SyntaxError: invalid syntax
对于如何解决这个问题，有什么建议吗？
浏览 15提问于2017-06-02得票数 0
回答已采纳
1回答
我是ITK的新手。我写了一个小程序，用sitk读取图像，用imageJ显示图像。
import os
import SimpleITK as sitk
pathDicom = 'C://Users//clouds.png'
input = sitk.ReadImage(pathDicom)
sitk.Show( input , debugOn=True)
要将simpleITK链接到imageJ，我设置了环境变量。但是对于sitk.Show()，我得到了以下错误：
return _SimpleITK.Show(*args, **kwargs)
RuntimeError: Ex
浏览 3提问于2018-10-06得票数 1
我正在尝试使用sitk.LabelIntensityStatisticsImageFilter来计算图像中标签的一阶统计量。 我的代码是 import SimpleITK as sitk
ADC600 = '/Users/omarkamal/PycharmProjects/DWI/Pt1/ADC600.nii'
ADC600_r = sitk.ReadImage(ADC600)
label = '/Users/omarkamal/PycharmProjects/DWI/Pt1/seg.nii.gz'
label = sitk.ReadImage(label
浏览 48提问于2019-12-16得票数 0
回答已采纳
我已经成功地安装了SimpleITK并使用ctest进行了测试。然后，我将该库作为export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/softwares/vtk-itk/SimpleITK-build/lib包含在.bashrc中。为了进行安装，我在~/softwares/vtk-itk/SimpleITK-build/SimpleITK-build中运行了make install，并成功安装了它。但是，当我尝试包含#include <SimpleITK.h>时，似乎确实知道安装路径。 ? 我正在尝试在Clion IDE中编写代码，即使它没
浏览 26提问于2019-08-22得票数 0
我正在使用Python3.7.7。
我正在尝试使用SimplyITK和Numpy从BraTS 2019年数据集加载大量的NIFTI图像。
这是我用来将图像加载到numpy数组中的代码。
import SimpleITK as sitk
def read_nifti_images(images_full_path):
"""
Read nifti files from a gziped file.
Read nifti files from a gziped file using SimpleITK library.
Pa
浏览 0提问于2020-08-11得票数 2
回答已采纳
我在这里再次提出另一个关于python中的SimpleITK的问题。我想绘制一个.mhd图像，但是我不知道怎么做。我正在尝试这里描述的函数
load_itk('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd')
但它并没有读取图像：
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ReadImage: /tmp/SimpleITK-build/ITK/Modules/IO/Meta/src/itkMetaImageIO.cxx:483:
itk::ERROR: MetaIma
浏览 100提问于2017-07-25得票数 2
1回答
当我使用Python3( SimpleITK 3)中的SimpleITK 0.10.0 ()运行DCM文件中更新标记的代码时，代码正在按照解释工作。
当我在代码中引入烧瓶组件来创建API时，我得到
AttributeError:类型对象' object‘没有属性'__getattr__'
错误。我使用的代码如下
from __future__ import print_function
import SimpleITK
from flask import Flask
import time
app = Flask(__name__)
@app.route('
浏览 7提问于2016-10-05得票数 0
回答已采纳
2回答
我已经把CT扫描加载到SimpleITK了。我想做一些在NumPy中非常简单的事情，但还没有想好如何在SimpleITK中做到这一点。为了提高速度，我想用SimpleITK来完成它们。
# NumPy: Changes all values of 100 to now become 500
nparr = nparr[nparr == 100] = 500
# SimpleITK:
???
SimpleITK image==100将生成相同尺寸的二进制图像，其中所有intensities==100都为1/True。这是我们想要的。但不幸的是，我不相信SimpleITK支持布尔索引。实现这一目
浏览 25提问于2017-03-07得票数 1
回答已采纳
我有一个从NIfTI文件读取到SimpleITK (使用python)的3D图像，取每个轴向切片，对其做一些操作，并将新的2D切片重新插入到具有(希望)适当尺寸的3D体积中。例如,
output = sitk.Image(original.GetSize(), sitk.sitkFloat32)
output.CopyInformation(original)
for z in numpy.arange(original.GetDepth()):
image = original[:,:,z]
<< Do Something in SimpleITK>>
浏览 1提问于2015-05-14得票数 3
我想从源代码构建SimpleITK，并为Python3.4安装它(在Ubuntu14.04上)。
我跟踪了。
git clone http://itk.org/SimpleITK.git
mkdir SimpleITK-build
cd SimpleITK-build
cmake ../SimpleITK/SuperBuild
而且效果很好。我能够使用SimpleITK为Python2.7安装sudo python setup.py install。然后，我尝试使用sudo python3.4 setup.py install为Python3.4安装它，尽管它的安装似乎是正确的，但是当我试图在
浏览 11提问于2014-06-14得票数 3
回答已采纳
1回答
在SimpleITK中向索引数组分配值或切片的最佳方法是什么？
示例(1)：在3D卷中将2D片分配给索引的2D片
在NumPy中，我们可以对索引数组执行以下赋值：
import numpy as np
nda = np.ones((64, 256,256))
nda[0,:,:] = 2*nda[0,:,:]
在SimpleITK中同样的操作，
import SimpleITK as sitk
image = sitk.GetImageFromArray(nda)
image[:,:,0] = 2*image[:,:,0]
给出以下错误：
IndexError
浏览 3提问于2020-04-22得票数 1
回答已采纳
我正在使用macOS sera10.12.6，试图安装SimpleITK的SimpleElastix扩展。我一直在遵循的指示。当我使用Python2.7时，我发现这个扩展似乎只包含在SimpleITK中，但当我使用Python3.6时，就不是这样了
import SimpleITK as sitk
resultImage = sitk.Elastix(sitk.ReadImage("fixedImage.nii"), sitk.ReadImage("movingImage.nii"))
我得到了错误
AttributeError: module 'Sim
浏览 4提问于2017-11-14得票数 2
我正在做N4偏差校正在.nii文件中的python(视窗).For这我是使用SimpleITK.While的图像输入，我有问题在读取文件。 代码： print("N4 bias correction runs.")
inputImage =sitk.ReadImage("C/Users/LENOVO/Desktop/Brats18_2013_1_1_t1.nii")
maskImage = sitk.OtsuThreshold(inputImage,0,1,200)
sitk.WriteImage(maskImage,"C/Users/LEN
浏览 172提问于2019-01-16得票数 0
回答已采纳
1回答
如果我想在numpy中用2D切片逐平面乘一个3D体积平面，我可以使用广播： import numpy as np
vol = np.random.rand(10, 20, 30)
slc = np.random.rand(10, 30)
new_vol = vol * slc[:, None] 如果我在SimpleITK中尝试类似的操作，我会得到一个错误 import SimpleITK as sitk
vol_img = sitk.GetImageFromArray(vol)
slc_img = sitk.GetImageFromArray(slc[:, None])
new_vol_im
浏览 39提问于2019-02-06得票数 0
回答已采纳
我正在尝试用imshow显示一个图像，它是用simpleItk读取的。镜像详情如下： size = fusedImage.GetSize()
(120, 120, 155)
type(fusedImage)
SimpleITK.SimpleITK.Image
im = fusedImage[:,:,76]
im.GetSize()
(120,120)
plt.imshow(im) 但是我得到了以下错误：TypeError: Invalid shape (14400,) for image data 有人能告诉我我哪里做错了吗？
浏览 84提问于2021-08-24得票数 0
回答已采纳
我遵循了中的SimpleElastix安装。当我运行以下命令来安装SimpleElastix的python包装器时，它运行成功，并且可以导入包：
sudo python Packaging/setup.py install
我可以导入这些包并使用下面的函数：
user@user-XPS-8920:~/softwares/SimpleElastix/build/SimpleITK-build/Wrapping/Python$ python
Python 2.7.12 (default, Nov 12 2018, 14:36:49)
[GCC 5.4.0 20160609] on linux2
浏览 1提问于2018-12-17得票数 0
我正在处理一组DICOM文件，其中一些包含图像信息，而另一些则没有。 file_reader = sitk.ImageFileReader()
file_reader.SetFileName(fileName)
file_reader.ReadImageInformation() 但是，如果文件没有图像信息，我会得到以下错误。 Traceback (most recent call last):
File "<ipython-input-61-d187aed107ed>", line 5, in <module>
file_reader.
浏览 378提问于2020-06-12得票数 1
回答已采纳
我有一个代表上传图片(.nii)的io.ByteIO对象，有没有办法从它获取simpleITK对象？一种糟糕的解决方法是先写入文件，然后使用simpleITK读取它
浏览 30提问于2020-06-25得票数 1
回答已采纳
如何使用适用于C#的SimpleITK读取原始文件？
我在Windows (64位)上使用SimpleITK C# 0.5.1版
我的代码是：
String fileName = @"d:\Temp\MRI\t1_icbm_normal_1mm_pn3_rf20.rawb";
ImageFileReader reader = new ImageFileReader();
reader.SetFileName(fileName);
Image image = reader.Execute();
例如，它适用于.png或分析图像，但不适用于原始图像。
我得到以下错误：
System
浏览 9提问于2012-10-27得票数 1
回答已采纳
我正在尝试让一些python代码在基于Amazon Linux的EC2服务器上运行。代码在我运行ubuntu的本地机器上运行得很好。
其中一个依赖项是SimpleITK模块。我将其安装为
easy_install -U SimpleITK
并且它安装成功，我可以导入REPL中的模块。但是，它的所有函数都是不可访问的，我得到
AttributeError: 'module' object has no attribute 'ReadImage'
我需要的所有函数都有类似的错误。经过调查，easy_install似乎以某种方式搞乱了设置。在我的本地机器上，当我执行h
浏览 7提问于2015-06-08得票数 1
1回答
我最近开始尝试从ipython笔记本转向冠层，我从MATLAB转到了它。我正致力于获得类似matlab的开发和研究经验。
我正在做这些跨平台的设置，但我是从OS开始的。
我一直在尝试安装用于天篷的软件包，其中有些需要编译，如SimpleITK和VTK6.0。我已经在我的常规python2.7安装中成功地安装了这些，但是我在安装天篷时遇到了一些困难。现在，我正在用CMAKE重新编译SimpleITK/Superbuild，以便重新创建python包装器。它要求您的python可执行文件，包括dir和python位置。我从冠层内部的sys.executable中找到了可执行的python，包含di
浏览 2提问于2013-09-13得票数 0
回答已采纳
我试着用simpleITK在蟒蛇身上剥头骨。我使用的StripTsImageFilter函数如下：
#upload data
# Path of nii img
path = r'C:\Users\Kate\Jupyter\DataThesis\PROGRESSION\0003\fet.nii.gz'
# Read the .nii image with SimpleITK:
img = sitk.ReadImage(path)
#read atlas and atlasmap
#Obtained from 3DSlicer documentation: https://w
浏览 12提问于2022-02-23得票数 1
回答已采纳
我需要从2张标有标签的3d图像中提取一组度量，具有相同尺寸、数据类型的--一切都是相同的，除了一个是我的银色标准，另一个是管道的结果。
我的代码是：
reader = sitk.ImageFileReader()
reader.SetImageIO("NiftiImageIO")
reader.SetFileName(file1)
image1 = reader.Execute()
reader.SetFileName(file2)
image2 = reader.Execute()
labelstats = sitk.LabelOverlapMeasuresImageFil
浏览 5提问于2020-05-19得票数 1
我正在使用simpleitk和ipython笔记本进行图像处理，正如我们所知，imagej是SImpleITK中的默认图像查看器。但是我使用的图像类型是.mha，而.mha不受imagej的支持。为此，我必须使用斐济或imagej2。
我曾试图按照simpleitk常见问题中提到的指示，将斐济作为默认图像查看器，但没有成功，并显示了以下信息：
我想知道我犯了什么错误。
如何使斐济或imagej2成为所有类型图像的默认图像查看器，当我使用simpleitk和IPython记事本时
谢谢。
浏览 8提问于2016-03-07得票数 1
当我尝试用SimpleITK读取DICOM图像时，我得到以下错误：
RuntimeError:在Notlar ImageFileReader_Execute中抛出异常: SimpleITK ImageFileReader_Execute：：ERROR: Unable to open“C:/Users/egeoz/OneDrive/Masaüstü/Text/ Ders Notları/İmaging Ders notu/el.dcm”。
请帮帮我！
浏览 2提问于2020-11-18得票数 0
我正在使用SimpleITK库与C#进行MRI图像处理。我想在程序执行的各个阶段显示预处理过的图像。要显示图像，我使用以下代码
SimpleITK.Show(image);
看起来，在用ImageJ显示图像之后，执行过程就停止了。我想在一个接一个的运行中显示连续的图像。
系统SITK_SHOW_COMMAND变量设置为%a %f
我正在Windows 10上运行我的代码
这是一个与SimpleITK显示函数相关的错误，还是在我的环境中设置的错误？
浏览 2提问于2016-05-26得票数 1
回答已采纳
我正在尝试使用.nii.gz在python中使用SimpleITK加载PyCharm文件。理想情况下，ITK有一个，我遵循这些，所以我假设SimpleITK在ITK中有一个NIFTI类的包装器。问题是我得到了一个奇怪的退出代码，它没有像google这样的文档
过程用出口代码-1073741819 (0xC0000005)完成
代码非常简单：
import numpy as np
import SimpleITK as sitk
image = sitk.ReadImage(filename)
imageSize = image.GetSize()
我也尝试过使用nibabel库来加载相同的图
浏览 0提问于2016-10-07得票数 0
回答已采纳
2回答
SimpleITK调整图像大小
、、、、
我有一套使用SimpleITK阅读的3D卷
import SimpleITK as sitk
for filename in filenames:
image = sitk.ReadImage(filename)
每个体积都有不同的大小、间距、原点和方向。此代码为不同的图像生成不同的值：
print(image.GetSize())
print(image.GetOrigin())
print(image.GetSpacing())
print(image.GetDirection())
我的问题是:如何将图像转换为相同的大小和间距，以便它们在转换为numpy数组时都具有相同的分辨率和
浏览 1提问于2018-01-03得票数 4
回答已采纳
我有两个SimpleITK图像，我想使用他们软件包的ExpandImageFilter对其中一个图像进行上采样，以匹配另一个图像。 有没有人知道怎么用这个？ 我看过他们的文档(https://simpleitk.org/doxygen/latest/html/classitk_1_1simple_1_1ExpandImageFilter.html)，但我真的不太理解它……我也找不到任何这样的例子。
浏览 67提问于2020-07-25得票数 1
回答已采纳
编辑注意:这个问题最初的措辞是
如何在linux中将SimpleITK.Show()链接到imageJ？
通过将SimpleITK 1.0.0升级到1.0.1，我能够从SimpleITK.Show()启动ImageJ。然而，ImageJ无法打开"sample_mri.hdr“。ImageJ生成以下错误消息。
文件不是支持的格式，而是读取器。
插件是不可用的，或者没有找到。
root/local/linux/ImageJ/open("/temp/TempFile-7131-2.nii")；
root/local/linux/ImageJ/rename("/tem
浏览 3提问于2017-08-14得票数 5
1回答
我想在python中解压大量的nii.gz文件，以便以后可以在sitk中处理它们。当我通过右键单击文件并选择“提取..”手动解压缩单个文件时，这个文件就会被sitk正确地解释(我做了sitk.ReadImage(解压缩))。但是，当我试图使用以下代码在python中解压缩它时：
with gzip.open(segmentation_zipped, "rb") as f:
bindata = f.read()
segmentation_unzipped = os.path.join(segmentation_zipped.replace(".gz", &
浏览 0提问于2020-06-05得票数 1
1回答
重新排序Nifti文件轴
、、、、
我有一些维度(50,100，50)的3D nifti文件。我想反转y轴和z轴，这样尺寸就是(50，50,100)。执行此操作的最佳方法是什么，以及如何修改与文件关联的仿射？ 目前，我正在将nifti文件转换为numpy数组，并像这样交换坐标轴 array = np.asanyarray(niiobj.dataobj)
img_after_resample_swapped_array = np.swapaxes(img_after_reample_array, 1, 2) 我对下一步感到困惑。我知道我可以使用函数nib.Nifti1Image将numpy数组转换为nifti对象，但是我如何修改
浏览 24提问于2020-06-25得票数 1
我正在尝试使用VS代码调试一些python代码。我收到以下关于我确信已安装的模块的错误信息。
Exception has occurred: ModuleNotFoundError
No module named 'SimpleITK'
File "C:\Users\Mido\Desktop\ProstateX-project\src\01-preprocessing\03_resample_nifti.py", line 8, in <module>
import SimpleITK as sitk
我使用以下命令安装了该模块
sudo
浏览 303提问于2019-06-19得票数 15
1回答
我想要分割一幅图像。我使用简单的阈值化method.For来读取图像并将其转换为数组，然后将img转换为
import SimpleITK as sitk
import numpy as np
header = sitk.ReadImage("Sub1.png")
img = sitk.GetArrayFromImage(header)
a=img
img = ((img > 20) * 255).astype(np.uint8)
# To visualize the labels image in RGB with needs a image with 0-255 ra
浏览 0提问于2018-06-28得票数 0
回答已采纳
我正在尝试使用通过GitHub提供的以下脚本：。我安装了python 3.9.10，pip版本22.0.4。但是，当我运行py script.py时，我会收到以下错误消息："ImportError: DLL加载在导入_SimpleITK时失败。找不到给定的模块“
首先，我在下载SimpleITK时遇到了问题，因为CMake无法构建它，也无法识别建筑车轮。但是现在这似乎很好，我尝试过使用不同版本的SimpleITK (2.0.2和2.1.0)，但两者都给出了相同的错误。
我还确保删除任何其他版本的python，因为我以前安装了3.10，但这也解决不了任何问题。
浏览 7提问于2022-03-21得票数 0
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
腾讯会议
实时音视频活动推荐
腾讯云开发者
