作为一只大学僧，平常难免要写写作业或者paper啥的，难免要和公式打交道。对于一些简单的小作业，用Markdown也能应付些许公式的编写。比如之前我写过一篇文章：
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R语言是主要在学术界用的编程语言，写作是其内涵之义，于是有了 RMarkdown。基于RMarkdown语法yihui进一步扩张了RMarkdown的应用，于是有了bookdown及其plus，以及blogdown。字面意思，前者是用来写书的后者是用来写博客的。每一个喜欢R语言不巧又同时喜欢写作的人，遇到这两个包都会有抑制不住的好奇心。余，概莫能外。
在别人的电子书，你的电子书，都在bookdown中我们讲述了bookdown用于自动化文档生成。里面涉及到一个文件Rproj用于项目管理。
使用 pgf 后端，matplotlib 可以将图形导出为可以使用 pdflatex，xelatex 或 lualatex 处理的 pgf 绘图命令。 XeLaTeX 和 LuaLaTeX 具有完整的 unicode 支持，可以使用安装在操作系统中的任何字体，利用 OpenType，AAT 和 Graphite 的高级排版功能。 由plt.savefig('figure.pgf')创建的 Pgf 图片可以作为原始命令嵌入到 LaTeX 文档中。 图形也可以通过切换到该后端，直接编译并使用plt.savefig('figure.pdf')保存到 PDF。
rticles包提供了适用于各类场景的rmd模板，安装以后便可以选择支持中文的模板，在rstudio菜单栏中依次选择file->new file->R Markdown，然后选择下图所示的模板。
基于 overleaf 在线写 latex 太麻烦了，每次都需要重新编译一下要等很久，本地的话就很快。之前在 windows 上有试过 vscode 插件加上 texlive 进行本地编译，现在主要用的是 MacBook，所以记录一下在 MacBook 上通过 vscode 插件加上 latex 编译器实现本地的编译。
最近需要在服务器上用Rstuido，奈何课题组的服务器尚未开通Rstudio server，经过曾老师和永和的指点，最终实现在Windows和MacOS双系统下打开基于服务器的Rstudio。
R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多处理数据的函数，能够提供强大的功能
学习生信时，最常用的可视化软件就是R，可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio，究竟什么是R和Rstudio？
但是我们常规的的教程都是基于Linux的conda的教程，比如各个用户里面安装自己的conda，每个用户独立操作，安装方法代码如下：
在前面我们介绍了R和RStudio的安装教程，也简单介绍R的GUI的使用，包括包的安装，加载等进行简单的介绍，然而并不详细，对于初学者来说，可能很难理解，原因在于我们实际分析数据或者开发的时候，一般不用GUI，而是RStudio。对RStudio怎么使用却没有介绍，今天RStudio的使用教程。
图 1 R软件下载页面 下载之后是.exe执行文件，不是zip压缩格式文件，可以直接点击安装。
Date : [[2022-07-09_Sat]] 微信公众号 : 北野茶缸子 Tags : #好物分享/效率工具/win 前言 在[[40-超级右键——你的mac右键]]，我们介绍了mac 中的超级右键。 win 的右键，能不能也个性化新建的文件内容的。 我找到了：BluePointLilac/ContextMenuManager: 🖱️ 纯粹的Windows右键菜单管理程序 (github.com)[1] 简单配置 直接在新建菜单栏目下，设置开启或关闭的文件。 另外也可以自行添加如md 在内的文件
在执行export PATH=pwd/flutter/bin:$PATH命令的时候踩了一会儿坑，按教程执行完之后，在命令行输入 flutter doctor之后仍然会提示找不到flutter这个命令。
Tensorflow2.2.0安装成功 引用时显示DLL load failed:找不到指定模块 解决方法
在写一些学术演示文档时，经常有可能用到Beamer——一种Latex的学术风PPT模板，比如下图所示的这种：
在使用Python时，有时可能遇到ImportError: DLL load failed: 找不到指定的模块错误。这个错误通常是由于无法找到依赖的动态链接库(DLL)文件引起的。本篇文章将介绍一些解决这个问题的方法。
2.服务器可以配置自己的Rstudio，供大家远程登陆，用浏览器打开后面加上：8787就可以登录，但是阿里云并没有自带，用自己电脑完全可以。
在学习使用flutter的过程中，遇到一些工程上的问题。比如flutter的配置，IDE的设置等等。
如果压根就下载不了，可能是网络的问题，或者是下载设置的问题，包括http和https的区别，下载协议的区别。
一般来说，拿到全新电脑，就按照我五年前写的生物信息学办公电脑环境配置教程安装好R和rstudio，以及对应的R包，详见：http://www.bio-info-trainee.com/3727.html
如果你的用户名不幸是中文的，那就必须改为英文，否则无法安装Rstudio,中文处理方法，参考
由于R语言生态系统内容繁复并在不断发展，人们往往容易忽视一些切实有用的知识。这些技巧往往非常简单，但对于完成工作有很大的帮助。
boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
SCP的完整安装分为两个部分，一个是R包安装，另一个是内部的python环境构建。
plot() 是Matplotlib库中用于绘制二维图像的主要函数之一。它的作用是将一组数据点连接起来，以可视化数据的趋势、关系或模式。
那么这种常见的问题其实原因很好分析，大概率是环境变量性质类的，我们处理起来很简单。
(1)R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。
flask命令在Flask库安装后可使用，使用前需要正确配置FLASK_APP环境变量以告知用户程序所在位置。不同平台设置方式有所不同。
刚学Java的时候，很多jdk配置教程都要求设置JAVA_HOME、Path、CLASSPATH3个变量。而Java官网有这么一句话：jdk1.5之后的版本在安装时不用设置CLASSPATH变量。今天我就以jdk1.5为例，总结下三者的区别。
陶哲轩本人在Mastodon上透露了这一消息，顺便介绍了一波自己用的LaTex工具。
Java也好, Tomcat也好, 都是很实用的啦, 早点掌握还是有必要的. 喜欢记得点赞哦, 有意见或者建议评论区哦, 当然暗中关注我也是可以的.
tomcat 的真正启动是在 catalina.bat 设置并启动的。startup.bat 只是找到catalina.bat 然后执行catalina.bat 来启动tomat的。下面我们来分析下c
今日学习任务：1、安装R和Rstudio；2、认识R和Rstudio；3、学会外观设置和基本操作；4、完成第一个R做的图
运行最后library代码，报错提示缺啥就安装啥，安装方法有 BiocManager::install('xx') 或 install.packages('xx')，逐一尝试，没有明显的 ERROR 关键词就不要管。
下载地址为：https://cran.r-project.org 进入链接，如下图所示，在页面顶部提供了三个下载链接，分别对应三种操作系统：Windows、Mac和Linux。请选择自己操作系统对应的链接。
本文主要给大家详细解析了关于Tomcat中catalina.bat原理的相关内容，分享出来供大家参考学习，下面话不多说了，来一起看看详细的介绍吧。
最近因为工作需要，开始学习vue，于是在github上找了一个star数比较高的项目 ant-design-vue-pro 准备练手。项目克隆下来后，用 vscode 打开工程，并且使用了 vscode 自带的终端安装了依赖包，但是准备执行 yarn serve 启动工程的时候却意外的抛出了一个错误：
当MiFlash提示“未指定的错误”时，我们可以根据其后的错误代码来寻求问题的解决方法。 当MiFlash提示“错误代码”为“0xffffff01”时，表明“MiFlash找不到指定的文件”。
多版本安装需要(单独下载qtcreator安装版本)，安装目录默认在Qt目录下（qt的sdk也在qt目录下）
这篇博文主要探索安装SNAP工具包并且使用Python接口进行开发过程中搭建开发环境所踩的坑。不得不说欧空局SANP官方提供的资料太少，而且不全面。当然有问题你可以去Forum提问，可是回不回答就是另外一回事了！
在通过 sudo 运行命令时，系统会默认重置环境变量为安全的环境变量，也就是说，先前设置的变量都会失效，只有少数配置文件中指定的环境变量能够保存下来。
Linux是一个多用户的操作系统。每个用户登录系统后，都会有一个专用的运行环境。通常每个用户默认的环境都是相同的，这个默认环境实际上就是一组环境变量的定义。用户可以对自己的运行环境进行定制，其方法就是修改相应的环境变量。
NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step)）、批次效应处理等内容。
tensorboard --logdir=/tmp/tensorflow/mnist/logs/mnist_with_summaries/
如何解决selenium webdriver.Firefox()找不到geckodriver文件 先声明：python IDLE我找不到能使用环境变量的设置，如你有更好的方法，请留言，多谢了。 平台：macOS 软件 python自带IDLE 版本python3.6 原材料：先在搜索引擎自行搜索geckodriver的最新版本下载，解压后将文件放在/usr/local/bin/中 以下：
所以，一般情况下我们引用标准函数库中的头文件时，用#include<>能有更高的效率，但是其实它的查找顺序非常严格：
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