purrr中有多个迭代函数，可以用于快速解决循环迭代的问题，purrr中常用的迭代函数有map、map2、walk、reduce等等。...# 公式：用于简化R的匿名函数格式 # 例如如下两种方式是等价的 iris %>% map(function(x) mean(x, na.omit=T)) iris %>% map(~mean(., na.omit...=T)) # 字符：用于快速提取内容 # 例如如下两种方式是等价的 iris %>% dplyr::select(-Species) %>% map(summary) %>%map_dbl(~....str_c(.x, .y[[1]], collapse="")) #[[1]] #[1] "mean1" # #[[2]] #[1] "sd4" pmap pmap(.l, .f, ...) pmap代表对多个列表进行迭代...，将多个列表包装为一个列表传给.f可。
ggplot2是基于grid的绘图工具，它绘制的图像其实是由多个grob（grid graph object）组成的，比如一张点图，它的标题是titleGrob，点图的基本单元包括pointsGrob。...align参数用于对齐多个图的元素，可以对水平、垂直方向进行对齐。...# 将待拼图转换为gtable对象（grob table) # 以下两种方式都可以，函数来源于ggplot2 g1 <- ggplotGrob(p1) g2 ggplot_gtable(ggplot_build...= g1_panel_layout$r) plot(fig_embed) ?...= g1_panel_layout$r) plot(fig_embed) ?
今天尝试解决使用ggplot2画图时的一个问题，图例不按规矩出牌。 ggplot2的作者们在测试时发现更新版本也出这问题了，正好可以用于简单说明。 本来是一个这样的图形 ? 新版本变成了 ?...下面是一个例子： dat <- data.frame(x = LETTERS[1:3], y = 1) p ggplot(dat, aes(x, y, fill = x, colour = 1:3
比如下面这种： 其实简单的R 拼图，我喜欢patchwork 的加减乘除。但这种4x4 布局的图片，对象又多，一个个创建不现实；代码写起来，也非常不优雅。 如果可以批量作图 + 批量拼图就好了。...be found here[3]. ” pbmc.data R/...也就是说，我们可以使用lapply 等循环操作，把一个个绘图对象保存到一个列表。再传递给对应的绘图函数。...关于包含ggplot 对象的列表，通过参数plotList 传入： ★(optional) List of plots to display....20-R的几种基于ggplot的拼图解决方案]] 如果是cowplot 用户，可以参考：Aligning plots • cowplot (wilkelab.org)[4] 参考资料 [1] Single-cell
本文受光流[37]领域的启发，我们引入了循环多尺度特征调制(RMSFM)，这是一种新的有效的轻量级深度学习体系结构，以扩展单目深度估计的体系结构选择。...R-MSFM最大的三个最显著的优势如下： 轻量级架构：R-MSFM将Monodepth2的参数减少了73%，从14.3M减少到3.8M，适用于内存有限的场景。...MSFM模块的优点：将我们的MSFM模块应用于R-MSFM-A模型总是能提高性能。如表2所示,R-MSFM3-C, 它在深度解码器的开始嵌入MSFM模块，以最低的计算成本提供最大增量的性能增益。...最后，参数经济、计算高效和准确的架构使我们的 R-MSFM 适合在嵌入式平台上部署。 05总结 我们提出了R-MSFM-循环多尺度特征调制-一种新的端到端可训练的自监督单目深度估计模型。...高精度和轻量级的特性表明，我们的R-MSFM适用于实际应用。 参考文献
======================= ggplot2包中的主要功能是ggplot（），它可用于使用数据和x / y变量初始化绘图系统。...分面板 您还可以根据分组变量将绘图拆分为多个面板。 R函数：facet_wrap（）。 ggplot2的另一个有趣特性是可以在同一个图上组合多个图层。...按小组将图片分成多个面板 使用scale_color_manual（）和scale_fill_manual（）函数手动更改颜色和填充 ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length,...ggpubr用于发布准备好的图 ggpubr R软件包有助于为具有非高级编程背景的研究人员创建基于ggplot2的漂亮图形（Kassambara 2017）。...保存ggplot很容易。 它从文件扩展名中猜出图形设备的类型。 ggexport（）[在ggpubr中]。 一次安排和导出多个ggplots。
#MOESM8 没有找到论文里的作图的代码，但是找到了部分组图数据，我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图 今天的推文重复一下论文中的Figure1c image.png 今天主要的知识点是多个图例的时候如何分开放...，目前想到的办法是使用ggpubr这个R包把图例单独挑出来，然后使用annotation_custom()函数再把图例加回去。..."SNP"="#b6e0f0", "SV"="#ea6743"))+ labs(y=TeX(r"...b6e0f0", "SV"="#ea6743"), name="")+ labs(y=TeX(r"...b6e0f0", "SV"="#ea6743"), name="")+ labs(y=TeX(r"
"Oscillospiraceae", "Lachnospiraceae"))) -> df04 作图代码 ggplot
c(105, 64, 128,66), type1 = c(rep("NK",2), rep("TC",2)), type2 = rep(c("OM", "OF"), 2) ) 直接画起： ggplot...label = counts), position = position_dodge(0.9), vjust = -0.8) 本来想颜色让你们自己调的发现，还有一个技术点：重叠的颜色ggplot...这里需要手动替换一下，最终代码如下： ggplot() + geom_col(data = a1, aes(type1, counts, fill = type2...原因在于，这个图层的映射，不应该是矮的在高的下面，而应该是高的在矮的下面（先画a2 再画a1）： ggplot() + geom_col(data = a2, aes(type1, counts,
TGG 这里有eQTL和WGCNA的代码 (明明记得之前是看到过eQTL的代码，但是这次再翻还找不到了) 今天的推文我们试着复现一下论文中的Figure1b 分组折线图 image.png 如果要展示多个基因组的...MOESM5_ESM.xlsx", sheet = "Fig1b", skip = 1) head(dat) 作图代码 library(ggplot2...) ggplot(data=dat,aes(x=Nx,y=Contig,group=Name))+ geom_line(aes(color=Tech))+ theme_classic()+
image.png 今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8b，很多个饼状图放到一起 ?...image.png 最基本的想法就是单独画好多个饼状图，然后通过拼图实现，但是因为之前重复地图的时候新遇到了一个包是 scattermore可以直接指定输入数据，然后一次性将所有饼状图画好，这样就省去了拼图的步骤...) ggplot()+ geom_scatterpie(data=df, aes(x,y,group=region,r=0.9),...()+ geom_scatterpie(data=df, aes(x,y,group=region,r=0.9), cols...暂时还不知道如何设置 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学
frame = FALSE删除绘图面板边框。 main，xlab，ylab。 分别指定主标题和x / y轴标签 las：对于垂直x轴文本，使用las = 2。...根据分组绘制多个面板图：y ~ x | group. xyplot( Sepal.Length ~ Petal.Length | Species, layout = c(3, 1),...ggplot2图形 GGPlot2是一个功能强大且灵活的R软件包，由Hadley Wickham实现，用于逐件生成优雅的图形。...根据ggplot2概念，绘图可以分为不同的基本部分：Plot = data + Aesthetics + Geometry data：数据框 Aesthetics ：用于表示x和y变量。...ggplot2包中的主要功能是ggplot（），它可用于使用数据和x / y变量初始化绘图系统。
)等；还提供了更加高级的图形系统lattice和ggplot2. base基本图形系统相关内容可参照：《R语言 图形初阶：hist、plot和图形布局layout | 第6讲》，作为R语言图形绘制的入门一节...目录 引言 1 Lattice绘图系统 1.1 lattice常见函数集表达式对照表 1.2 lattice绘图系统相关参数对照表 1.3 面板函数 1.4 图形参数 1.5 页面布局 2 ggplot2...两个分类变量的可视化：关联表，相对频率表，分段条形图 一个分类变量一个数值变量： 分类箱图、条形图 1 Lattice绘图系统 特点：一次成图；适用于关系变量间的交互：在变量z的不同水平，变量y如何随变量...常见lattice包函数有xyplot、barplot、histogram等，格式 xyplot(y~x | f *g ,data)；panel函数，用于控制每个面板内的绘图。...Split/position 数值型向量，在一页上绘制多幅图形 Type 字符型向量，设定一个或多个散点图的绘图参数，（如p=点，l=线，r=回归，smooth=平滑曲线，g=格点） xlab/ylab
编程语言通常有办法允许多次执行代码，或者在“循环”中执行。虽然R语言也有“循环”，但有些函数更直接，例如apply()函数map()族和函数族。...ggplot2默认输入是数据框。 加载ggplot2，它是tidyverse包的一部分。 library(ggplot2) ggplot()函数用于初始化基本图形结构。...映射使用aes（）函数设置，并且可以在geom_point()内部设置以专门应用于该层。如果我们在ggplot()中提供映射，它们将被用作每个图层的默认值。....pdf)用于使用ggplot2绘图。...第一种（也是最简单的）是直接从RStudio“Plots”面板导出，点击绘图面板上方的Export。R提供选择png或pdf等格式，选择要存放图片的目录。还提供了决定输出图像大小和分辨率的选项。
概述：本文介绍如何轻松地为ggplot图形添加P值和显著性水平： 比较两组或多组的均值 自动地将P值和显著性水平添加到ggplot图形中，如箱形图，点图，条形图和折线图等 使用工具： R语言中的ggplot2...非参数检验) ANOVA aov()或anova() 比较多组(参数检验) Kruskal-Wallis kruskal.test() 比较多组(非参数检验) 用于添加P值的R函数 介绍两个ggpubr...包中的函数 compare_means()：用于执行均值比较 stat_compare_means()：用于在ggplot图形中自动添加P值和显著性水平 compare_means() 两样本间的比较...p.signif", method = "t.test", ref.group = "0.5") #设置参考组，每一个组和和ref组比较 image.png 多个分组变量...p.signif..") pare_means(len ~ supp,data=df,method="t.test",paired=F) #hide.na=T可以隐藏ns image.png 也可以在一个面板中展示
ggplot和plotnine 对于R迁移过来的人来说，ggplot和plotnine简直是福音，基本克隆了ggplot2所有语法。 ggplot是基于R的ggplot2和Python的绘图系统。...唯一不足的是它是一个底层构建工具，所有的多边形映射都需要手动构造循环（目前还没有发现比较好用的基于basemap的扩展工具），作图效率与速度上自然无法媲美R语言的ggplot2(缺少一套健全的顶层语法支撑...数据通过数据转换映射到使用组的视觉属性(位置、颜色、大小、形状、面板等)。 通过Altair，可以将更多的时间花在理解数据及其含义上。...主要用于创造、操作复杂网络，以及学习复杂网络的结构、动力学及其功能。用于分析网络结构，建立网络模型，设计新的网络算法，绘制网络等等。...它带有数据集、颜色面板和主题，就像 Plotly.py 一样。 Plotly Express 完全免费：凭借其宽松的开源 MIT 许可证，您可以随意使用它（是的，甚至在商业产品中！）。
欢迎关注R语言数据分析指南 论文 原图 加载R包 library(tidyverse) library(cowplot) 导入数据 df <- read_tsv("group.xls")...将数据从宽格式转换为长格式，除了"cluster"列 separate(`name`, into = "name", sep = "-") %>% # 将"name"列根据"-"分隔成新的列 ggplot...(aes(name, cluster, fill = value)) + # 使用ggplot绘图，设置映射 geom_tile() + # 添加瓷砖图层，用于绘制热图 scale_y_discrete...:brewer.pal(11, "RdBu"))) + # 设置颜色渐变 theme( # 设置主题 panel.background = element_blank(), # 设置面板背景为空...设置绘图边距 plot.background = element_blank(), # 设置绘图背景为空 panel.background = element_blank(), # 设置面板背景为空
作者：严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源 简介 R语言基本绘图函数中可以利用par()以及layout()来进行图形排列，但是这两个函数对于ggplot图则不太适用...绘图面板对齐 绘制生存曲线 library(survival) head(colon[, c(1:4)]) #Fit survival curves fit R包cowplot cowplot::ggdraw()可以将图形置于特定位置, ggdraw()首先会初始化一个绘图面板， 接下来draw_plot()则是将图形绘制于初始化的绘图面板中，通过参数设置可以将图形置于特定位置...其中： label:标签 x,y:控制标签位置 size:标签字体大小 下面通过一个例子来讲解如何将多个图形放置在特定的位置。...R包grid R包grid中的grid.layout()可以设置复杂的图形布局，viewport()可以定义一个区域用来安置图形排列，print()则用来将图形置于特定区域。
可先阅读文章：R绘图笔记 | R语言绘图系统与常见绘图函数及参数 1.利用plot()绘制散点图 R语言中plot()函数的基本格式如下： plot(x,y,...) plot函数中，x和y分别表示所绘图形的横坐标和纵坐标...（2）main参数 字符串，给出图形的标题； （3）sub参数 字符串，给出图形的子标题； （4）xlab 和 ylab参数 字符串，用于给出x轴和y轴的标签。...## 部分参数解释 data, x, y # data指数据框，x、y为数据框中用来绘制图形的变量 combine # 逻辑词，默认FALSE，仅当y是包含多个变量的向量时使用；如为TRUE，则创建组合面板图...merge # 逻辑词或字符；默认FALSE，仅当y是包含多个变量的向量时使用；如为TRUE，则在同一绘图区域合并多个y变量； # 字符为"asis"或"flip"，如为"flip"，则y变量翻转为x...参考资料： 1.R语言数据可视化之美，张杰/著 2.scatterplot()函数帮助文件 3.ggscatter()函数帮助文件
geomnet是一个基于ggplot2可视化图形和网络的R包，它使用sna包计算网络布局，并且包含了使用ggplot2绘制圆的geom_circle函数。...#arrowgap 箭头到节点的距离 selfloops = TRUE, ecolour = "grey40") + #selfloops，是否显示循环...ggplot(data=hp.all, aes(from_id = from, to_id = to_id)) + geom_net(fiteach=T, directed = T, size =...3, linewidth =0.5, #网络图是否分别安装在每个面板中 ealpha =0 .5, labelon = T, fontsize = 3, repel = T,...linetype = FALSE) #guides,是否移除图例 ggplotly(gg) 小编总结： 除了Cytoscape软件以外，我们也可使用geomnet包来绘制网络图，而且这种交互式展示方法可用于数据库的设计中
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
云直播
对象存储
腾讯会议
