前言 上一节我们说了那些JS的基本概念相关的..今天我们接着来扯扯作用域对象这些基础知识; 变量 JS的变量是相当松散的,这个特性让人又爱又恨,因为我们可以在它的生命周期内进行各种各样的改变[比如值,数据类型....name = "flksjf"; //打印输出:"flksjf" obj.name //打印输出:"flksjf" 值传递及作用域...//我重新定义对象 obj.name = "我是局部对象中的二次赋值"; //外部我改不动. } a(t) console.log(t.name) // 打印输出:我是设置对象的 延迟作用域链...在作用域链的前端添加一个变量对象,会延长作用域的的执行流,其中try..catch的catch和with语句都会代表/ /*finally是最终会执行,不用catch是否有错*/ try...在ES6之前不存在官方定义] 在ES5前,一般都是用匿名函数来实现块级作用域 而ES6,出现了let和箭头函数,块级作用域算是正式出现了 对象 对象声明有两种 //第一种,声明式
需要明确,在置信度(检验水准为0.05)确定的情况下置信区间的计算需要Estimate(系数样本估计值)和Std.err(标准误) 即upr=Estimate+1.96Std.err lwr=Estimate
蜜蜂图或蜂群图(beeswarm)这个名字,大家可能比较陌生,但是大家肯定都见过他的尊容。下面这张图就是一个典型的蜜蜂图。因为看上去像一群飞舞的蜜蜂而得名。...可能大家觉得蜜蜂图跟散点图或者jitter图差不多,但实际上他们之间还是有很大区别的。 上面三张图,从上至下分别为jitter图,蜜蜂图(beeswarm)和散点图。...而jitter图和散点图,难以快速获取信息,point图中点过于密集,jitter中分布过于散乱。...而beeswarm图在大样本的情况下也比较适用。不仅可以体现每一个样本具体情况,而且能够查看整体的情况。...后面小编会详细给大家介绍beeswarm这个R包的使用,绘制更多不同类型的蜜蜂图。
布局函数 layout() 上面的方法创建的子图大小是相同的,而 layout() 就要高级不少。...layout() 将图片内部区域分割为一组行和列,但行高和列宽度可以分别控制,并且每个子图可以占据超过一行或一列的位置。 layout() 用矩阵作为参数来表示上述的思想,矩阵的值就是子图的序号。...如果某子图序号多次出现,那么该子图就会占据多个区域。 layout(matrix(1:4, byrow=TRUE, ncol=2)) layout.show(4) ?...巧妙地设定矩阵,就可以自由实现多种组图方式了。不过显然到这里,还感觉差一些东西:默认情况下,所有的行高和列宽尺寸都是相同的, 而且内部也是以这种方式分割。怎么实现自定义的行高或列宽?...这里 heights 设定的是一个相对占比,比如子图 1 占 5/(5+3)。同样的操作可以应用到 widths上。
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍一个简单实用的功能,使用stat_ellipse为散点图添加置信区间;并且还可通过geomtextpath的结合来进行文本标签的添加。...❞ 安装R包 install.packages("geomtextpath") # 安装 geomtextpath install.packages("ggplot2") library(geomtextpath...) library(tidyverse) 软件配置 R4.3.3 other attached packages: [1] geomtextpath_0.1.1 lubridate_1.9.3...使用stat_ellipse函数即可轻松实现置信区间的添加,默认是95% ggplot(iris,aes(Petal.Length,Petal.Width,color=Species)) + geom_point...() + stat_ellipse() 添加标签文本 通过level参数可以调整置信区间的范围 ggplot(iris,aes(Petal.Length,Petal.Width,color=
survminer包应该是目前最常见的用来做生存分析可视化的包了。之前在公众号也分享过相关的函数使用方法。也有粉丝发邮件向我咨询过一些问题。读者需要记住的是,该...
各位小伙伴,大家好,我是邓飞,今天介绍一下,如何使用R语言进行logistic分析,并且计算OR值和置信区间。...plink的Logisitic模型的GWAS分析计算结果如下: R语言的解决方案: m1 = glm(phe.V3 ~ rs3131972_A,family = "binomial",data=dd...) summary(m1) # 计算OR值 exp(coef(mod)) ## 置信区间 exp(confint(mod)) # 一步到位:OR值和置信区间 library(questionr) odds.ratio...(mod) 结果: 手动计算OR值: 一步到位的OR值和置信区间:
文档中Term的位置信息 .pos 保存此段中每个文档对应的Term位置信息。...文档的有效载荷和部分位置信息 .pay 保存此段中每个文档的有效载体(payload) 和 Term的位置信息(offsets)。 其中有一部分的Term位置信息存储在.pos文件中。...= 10][t][e][r][m][a][g][a][n][c][y],[VInt = 9][t][e][r][m][a][g][a][n][t],[VInt = 8][t][e][r][m][i][...跳跃是有间隔的(Interval),也即每次跳跃的元素数,间隔是事先配置好的,如图跳跃表的间隔为3。...跳跃表是由层次的(level),每一层的每隔指定间隔的元素构成上一层,如图跳跃表共有2层。
R.package heatmap():用于绘制简单热图的函数 heatmap.2():绘制增强热图的函数 d3heatmap:用于绘制交互式热图的R包 ComplexHeatmap:用于绘制、注释和排列复杂热图的...R&bioconductor包(非常适用于基因组数据分析) 首先使用ggplot2画简单热图 data <- as.data.frame(matrix(rnorm(9*10),9,10)) rownames...scale_fill_gradient2('legend name', low = 'blue', high = 'red', mid = 'white') #修改图例名字以及图中颜色 大神Y叔也有画热图的
饼图(pie chart)被广泛地应用于各个领域,用于表示不同分类的占比情况,通过弧度大小来对比各种分类。...饼图通过将一个圆饼按照分类的占比划分成多个切片,整个圆饼代表数据的总量,每个切片(圆弧)表示该分类占总体的比例,所有切片(圆弧)的加和等于100%。 下面会介绍两种在R中实现饼图的方法。...graphics包绘制饼图 library(RColorBrewer) library(dplyr) library(graphics) library(ggplot2) init.angle可设定饼图的初始角度...ggplot2 包绘制饼图 使用R中ggplot2包的geom_bar()函数绘制堆积柱形图,然后将直角坐标系转换成极坐标系,就可以显示为饼图,但还是需要使用geom_text()函数添加数据标签。...但是可以看到:由于缺乏饼图与数据标签之间的引导线,总感觉美观度不够,所以推荐使用graphics包的pie()函数绘制饼图。 代码以及资料存在我的github上,可见文末原文链接。
metagenomics reveals role of iron metabolism in drought-induced rhizosphere microbiome dynamics 中有这么一张补充图,...这种图通常被称为时间热图或时间线图,结合了颜色块、标签和标记,我们按照以下步骤进行绘图: 数据准备:整理你的数据,确保每个时间点的数据都在正确的位置。...下面我们尝试用R复现此图 1生成示例数据 data <- data.frame( Category = c(rep("Control", 18), rep("Drought", 18)), TimePoint
Circos图加拿大的生物信息科学家 Martin Krzywinski 开发的,最初主要用于基因组序列相关数据的可视化。现在越来越多的领域把Circos图引入其中。...今天我们介绍在R语言中如何绘制Circos图。 首先我们看下Circos的官网(http://circos.ca/),其实他们提供了自己的绘制工具包,为了更加方便绘制Circos。...我们利用了R语言中的circlizeR包进行Circos的绘制。 ? 1. Install.packages(“circlize”)#安装R包。 2. R包的载入之后的状态 ? 3....我们看下R包中可以实现的功能函数列表。...circos.genomicInitialize 基因染色体分布图形绘制不带条图 circos.genomicHeatmap 绘制热图 circos.genomicDensity 基因密度图绘制 circos.genomicLabels
气泡图 气泡图是一种多变量图表,是散点图的变体,也可以认为是散点图和百分比区域图的组合[1]。气泡图最基本的用法是使用三个值来确定每个数据序列,和散点图一样。...气泡图通过气泡的位置及面积大小,可分析数据之间的相关性。 本文可以看作是《R语言数据可视化之美》[1]的学习笔记。...后面是图表美化的过程,参考thr R Graph Gallery: Bubble plot with ggplot2[3]。...参考资料 [1] R语言数据可视化之美: https://github.com/EasyChart/Beautiful-Visualization-with-R [2] data-to-viz: https...://www.data-to-viz.com/graph/bubble.html [3] thr R Graph Gallery: https://www.r-graph-gallery.com/320
R中plot3D包的polygon3D()函数和segments3D()函数可以绘制三维面积图,lines3D()函数可以绘制三维曲线图,所以,综合这几个函数可以绘制三维瀑布图,该代码,数据来源R语言书可视化之美...在此,就完成这个三维瀑布图了,美观度极佳,可解释性也不错。 添加第四个变量 如果想加入第四变量也是没问题的,具体不再重复。完整代码可见R语言书可视化之美或者我的github中。 ?...行分面的带填充的曲线图 使用分面图的可视化方法也可以展示瀑布图的数据信息,关于分面图可视化方法我已经在R可视乎|分面一页多图介绍过。...本篇视为《R语言数据可视化之美》学习笔记,并进行函数详细介绍与解释,版权归原作者所有。其他可视化图可在菜单命令[可视化]中搜索得到。...参考资料 [1] R语言书可视化之美: https://github.com/EasyChart/Beautiful-Visualization-with-R
火山图是用于差异表达分析结果可视化的一种有效方法。...今天,我们来介绍一个用于增强火山图绘制的强大 R 包:EnhancedVolcano ,该包拥有强大的绘图功能,用户可以简单的通过设置颜色、形状、大小和阴影等参数定义不同的绘图属性,此外通过可以通过添加连线的方式有效避免数据点之间的重叠现象...使用 EnhancedVocalno 包绘制的火山图基本可以直接用于文献发表,可以说非常简单又实用的一款神器了。 1. 下载与安装 R 版本:3.6.1。...c('Spp1','S100a11','Mgp','LOC498555','Sh3bgrl', 'Ring1','Apoe','Tcn2','Ager','Mc1r'...EnhancedVolcano 包绘制火山图就先介绍到这里。
极树状图类似于系统发育图或者环形的聚类图,其效果如下图所示: 查了一下相关资料,可以通过以下两种方法实现。以下用mtcars数据为例。
在Meta分析中森林图比较常见,其主要是是以统计指标和统计分析方法为基础,用数值运算结果绘制出的图型。...森林图的类型主要包括以下两种: 1. 二值变量的森林图 当研究对象为二值变量(如发生与不发生)时,采用RR和OR作为统计学指标。...连续性变量的森林图 分析指标是连续变量,也称数值变量,可选择加权均数差(WMD)或标准化均数差(SMD)为合并统计量。...以上就是森林图的理论知识。接下来我们介绍其是如何在R语言中实现的。 首先我们需要导入R包forestplot。具体的安装载入不再赘述。 下面我们看下其主要的函数forestplot。 ?...Graph.pos主要是定位森林图所在的位置。通过数字来确定为第几列。 hrzl_lines以list形式设置表中线的类型以及长度。
使用pheatmap包绘制热图 一般而言,pheatmap较heatmap.2等更为简洁以及易于理解,对于初学者而言是一款不错的热图绘制软件。...cluster_row = FALSE, cluster_col = FALSE treeheight_row=0, treeheight_col=0 # 在热图格子里展示文本 pheatmap(test...cluster_row = FALSE, cluster_col = FALSE是否聚类,#可设置参数display_numbers将数值显示在热图的格子中,可通过number_format设置数值的格式...#pheatmap还能够根据特定的条件将热图分隔开; # cutree_rows, cutree_cols:根据行列的聚类数将热图分隔开; pheatmap(test,cutree_rows=2,cutree_cols
对于饼图,上一次学习《R语言数据可视化之美》的时候主要利用graphics包和ggplot包(可见R可视乎|饼图)。这几天的学习中发现还有一个更加简便的方法——ggpie包。...ggpie包绘制饼图 ?...接下来介绍圆环图的各种方式绘制(圆环图和饼图的意义其实差不多,都是给出各数据的比重,只不过,圆环图中间少了一块,变成环状)。主要有两个包:ggpubr包(推荐使用)与ggplot2包。...ggplot2包绘制圆环图 在[R可视乎|饼图]中ggplot2包绘制饼图的基础上,只要再加一条代码即可完成:xlim(c(0, 5)),即将x轴范围控制在0-5。...可以看到:ggpubr包绘制圆环图十分方便,而ggplot2绘制则需要很多代码,这里不建议使用。 这是今天R可视化的学习笔记,我们下次再见。
箱图 简单点数就是像一个箱子的图,用于表征数据的分布。 百度定义:箱形图(Box-plot)又称为盒须图、盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。因形状如箱子而得名。...数据 使用R自带的数据 代码 导入数据,不想解释各行各列没什么意义,分为两类,一个单一箱图,一个并列的箱图 input1<- mtcars[,c('mpg')] input2 <- mtcars ?...做一个单一的箱图,就是只是一个mpg boxplot(input1, main = "Box plot", ylab = "mpg",xlab='x')!...imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240) 然后制作一个表示mpg与vs的关系的并列的箱图 boxplot(mpg~vs, data = input2...imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240) 箱图修改每个箱子的标签 boxplot( mpg ~ vs, input2, names = c(