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    【R】蜜蜂图beeswarm

    蜜蜂图或蜂群图(beeswarm)这个名字,大家可能比较陌生,但是大家肯定都见过他的尊容。下面这张图就是一个典型的蜜蜂图。因为看上去像一群飞舞的蜜蜂而得名。...可能大家觉得蜜蜂图跟散点图或者jitter图差不多,但实际上他们之间还是有很大区别的。 上面三张图,从上至下分别为jitter图,蜜蜂图(beeswarm)和散点图。...而jitter图和散点图,难以快速获取信息,point图中点过于密集,jitter中分布过于散乱。...而beeswarm图在大样本的情况下也比较适用。不仅可以体现每一个样本具体情况,而且能够查看整体的情况。...后面小编会详细给大家介绍beeswarm这个R包的使用,绘制更多不同类型的蜜蜂图。

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    「R」R传统图形绘制多图

    布局函数 layout() 上面的方法创建的子图大小是相同的,而 layout() 就要高级不少。...layout() 将图片内部区域分割为一组行和列,但行高和列宽度可以分别控制,并且每个子图可以占据超过一行或一列的位置。 layout() 用矩阵作为参数来表示上述的思想,矩阵的值就是子图的序号。...如果某子图序号多次出现,那么该子图就会占据多个区域。 layout(matrix(1:4, byrow=TRUE, ncol=2)) layout.show(4) ?...巧妙地设定矩阵,就可以自由实现多种组图方式了。不过显然到这里,还感觉差一些东西:默认情况下,所有的行高和列宽尺寸都是相同的, 而且内部也是以这种方式分割。怎么实现自定义的行高或列宽?...这里 heights 设定的是一个相对占比,比如子图 1 占 5/(5+3)。同样的操作可以应用到 widths上。

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    R可视乎|饼图

    饼图(pie chart)被广泛地应用于各个领域,用于表示不同分类的占比情况,通过弧度大小来对比各种分类。...饼图通过将一个圆饼按照分类的占比划分成多个切片,整个圆饼代表数据的总量,每个切片(圆弧)表示该分类占总体的比例,所有切片(圆弧)的加和等于100%。 下面会介绍两种在R中实现饼图的方法。...graphics包绘制饼图 library(RColorBrewer) library(dplyr) library(graphics) library(ggplot2) init.angle可设定饼图的初始角度...ggplot2 包绘制饼图 使用R中ggplot2包的geom_bar()函数绘制堆积柱形图,然后将直角坐标系转换成极坐标系,就可以显示为饼图,但还是需要使用geom_text()函数添加数据标签。...但是可以看到:由于缺乏饼图与数据标签之间的引导线,总感觉美观度不够,所以推荐使用graphics包的pie()函数绘制饼图。 代码以及资料存在我的github上,可见文末原文链接。

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    R可视乎|瀑布图

    R中plot3D包的polygon3D()函数和segments3D()函数可以绘制三维面积图,lines3D()函数可以绘制三维曲线图,所以,综合这几个函数可以绘制三维瀑布图,该代码,数据来源R语言书可视化之美...在此,就完成这个三维瀑布图了,美观度极佳,可解释性也不错。 添加第四个变量 如果想加入第四变量也是没问题的,具体不再重复。完整代码可见R语言书可视化之美或者我的github中。 ?...行分面的带填充的曲线图 使用分面图的可视化方法也可以展示瀑布图的数据信息,关于分面图可视化方法我已经在R可视乎|分面一页多图介绍过。...本篇视为《R语言数据可视化之美》学习笔记,并进行函数详细介绍与解释,版权归原作者所有。其他可视化图可在菜单命令[可视化]中搜索得到。...参考资料 [1] R语言书可视化之美: https://github.com/EasyChart/Beautiful-Visualization-with-R

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    R语言绘制Circos图

    Circos图加拿大的生物信息科学家 Martin Krzywinski 开发的,最初主要用于基因组序列相关数据的可视化。现在越来越多的领域把Circos图引入其中。...今天我们介绍在R语言中如何绘制Circos图。 首先我们看下Circos的官网(http://circos.ca/),其实他们提供了自己的绘制工具包,为了更加方便绘制Circos。...我们利用了R语言中的circlizeR包进行Circos的绘制。 ? 1. Install.packages(“circlize”)#安装R包。 2. R包的载入之后的状态 ? 3....我们看下R包中可以实现的功能函数列表。...circos.genomicInitialize 基因染色体分布图形绘制不带条图 circos.genomicHeatmap 绘制热图 circos.genomicDensity 基因密度图绘制 circos.genomicLabels

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