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【R语言】根据映射关系来替换数据框中的内容

前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub,还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。...例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。...假设我们手上有这个一个转录本ID和基因名字之间的对应关系,第一列是转录本ID,第二列是基因名字 然后我们手上还有一个这样的bed文件,里面是对应的5个基因的CDs区域在基因组上的坐标信息。...首先我们做准备工作,读入这两个文件,会用到前面讲过的☞正则表达式 #读入转录本和基因名之间的映射关系 mapping=read.table("id_mapping.txt",sep="\t",row.names...参考资料: ☞R中的替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA的反向互补序列

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用过Excel,就会获取pandas数据框架中的值、行和列

在Excel中,我们可以看到行、列和单元格,可以使用“=”号或在公式中引用这些值。...在Python中,数据存储在计算机内存中(即,用户不能直接看到),幸运的是pandas库提供了获取值、行和列的简单方法。 先准备一个数据框架,这样我们就有一些要处理的东西了。...每种方法都有其优点和缺点,因此应根据具体情况使用不同的方法。 点符号 可以键入“df.国家”以获得“国家”列,这是一种快速而简单的获取列的方法。但是,如果列名包含空格,那么这种方法行不通。...要获取前三行,可以执行以下操作: 图8 使用pandas获取单元格值 要获取单个单元格值,我们需要使用行和列的交集。...接着,.loc[[1,3]]返回该数据框架的第1行和第4行。 .loc[]方法 正如前面所述,.loc的语法是df.loc[行,列],需要提醒行(索引)和列的可能值是什么?

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    R in action读书笔记(2)-第五章:高级数据管理

    5.4 控制流  语句(statement)是一条单独的R语句或一组复合语句(包含在花括号{ } 中的一组R语 句,使用分号分隔);  条件(cond)是一条最终被解析为真(TRUE)或假(FALSE...5.6整合与重组 (aggregate & reshape) 5.6.1转置 使用函数t()即可对一个矩阵或数据框进行转置。对于后者,行名将成为变量(列)名。...5.6.2整合数据 在R中使用一个或多个by变量和一个预先定义好的函数来折叠(collapse)数据是比较容易的。...调用格式为:aggregate(x,by,FUN) 其中x是待折叠的数据对象,by是一个变量名组成的列表,这些变量将被去掉以形成新的观测, 而FUN则是用来计算描述性统计量的标量函数,它将被用来计算新观测中的值...1、 融合 数据集的融合是将它重构为这样一种格式:每个测量变量独占一行,行中带有要唯一确定这个测量所需的标识符变量。

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    142. 分组列表组件实战:打造分类设置菜单 进阶篇

    在本篇教程中,我们将深入探讨ListItemGroup组件的进阶特性,包括交互功能、样式定制和状态管理等方面。...ListItemGroup可以与List组件的多种事件结合使用,实现更丰富的交互效果:事件说明onScrollIndex监听列表滚动时的索引变化,可用于更新当前分组索引onGroupCollapse监听分组折叠事件...(需自行实现折叠逻辑)onGroupExpand监听分组展开事件(需自行实现展开逻辑)二、设置菜单的交互增强2.1 添加分组折叠展开功能我们可以为设置菜单添加分组折叠展开功能,让用户可以根据需要展开或折叠某个分组...// 这里可以根据不同设置项显示不同的对话框 }}// 处理开关状态变化private handleToggleChange(item: ItemsType, isOn: boolean) {...4.1 设置项状态管理我们可以使用@State装饰器管理设置项的状态,实现数据的响应式更新:@State settingsData: SettingType[] = [...] // 初始数据// 更新设置项值

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    生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

    R语言基础学习笔记-Day71. 复习R包stringr字符串操作的几个函数-长度、拆分、提取、字符检测、替换和删除。...生信实战中R语言的几个重点函数【小洁老师语录】编程能力,就是解决问题的能力,也是变优秀的能力R语言基础入门课程-到此结束7. 数据挖掘生信技能树小洁老师7.1 为什么数据挖掘?...广义基因6w+个;哪些和自己感兴趣点有关?数据分析筛选。表达矩阵:一行是一个基因在所有样品里的表达,一列是一个样本里所有基因的表达。在表达矩阵中,寻找在不同组有表达差异的基因。...富集分析-找功能PPI网络:蛋白互作-相关文献7.5 常见图表7.5.1 热图输入数据是数值型矩阵/数据框颜色变化表示数值大小7.5.2 散点图和箱线图散点图向量即可画图可以帮助理解箱线图箱线图输入数据是一个连续型向量...(大小变化关系)和一个有重复值的离散型向量五条线:箱体越扁,数据重复性好,箱体越大,数据越分散。

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    浅析CSS里的 BFC 和 IFC

    只要元素满足下面任一条件即可触发 BFC 特性: body 根元素; 浮动元素:float 不为none的属性值; 绝对定位元素:position (absolute、fixed) display为:...,这一部分 在解释原因时,会用到上文的布局规则和触发条件,所以需要注意一下。...1、两个相邻的普通流中的块元素垂直方向上的 margin会折叠 ? 效果图是: ?...但如果我们 触发外部容器的BFC,根据BFC规范中的第4条:计算BFC的高度时,浮动元素也参与计算,那么外部div容器就可以包裹着浮动元素,所以只要把代码修改如下: ? 就可以完成以下效果: ?...不能指定宽高; 3 行框的宽度是由包含块和存在的浮动来决定;  行框的高度由行高来决定。

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    外边距合并规则

    /border margin负值 margin合并 盒模型是视觉格式化模型中的基础单元,是CSS布局模型中必不可少的一部分 CSS盒模型描述了一个为文档树中的元素生成的并根据视觉格式化模型进行布局的矩形框...从常规流中脱离出去,根据其包含块确定自身位置 元素既没有浮动(float属性的应用值为none),也没有绝对定位(position属性的应用值不为absolute),并且不是根元素,那就按常规流来布局,...行框 包含来自同一行的盒的矩形区域叫做行框 一个行框总是足够高,能够容纳它包含的所有盒。 行框是CSS对行的抽象表示,每行元素都处于同一个行框里。...另一方面,行框不是纯粹的抽象定义,它具有宽度和高度,用于决定行布局 相邻外边距之间“没有行框”可以简单理解为没有行内元素把它们隔开 垂直相邻框边界 下列4种场景满足外边距都属于垂直相邻框边界的情况: 盒的上外边距与其第一个流内...两个margin正值取最大值,两个负值取绝对值的最大值 对于递归特性,“相邻”的定义扩展出一条递归公式: 折叠外边距也能与另一个外边距相邻,只要其外边距的任意一部分与那个外边距相邻就算 贪婪与外边距合并结果计算方式有关

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    秒杀官方实现,python界面库,去掉90%事件代码的nicegui

    界面有一个输入框和标签,希望用户输入内容后,下方的标签同步显示: 用 nicegui 官方做法,使用事件: 行12:ui.input 第一个参数只是输入框的标题 行10:通过控件对象的属性,获取或赋值...---- 现在改一下需求,输入框内容如果是一个颜色值,那么下方的标签字体颜色也会同步变化,演示如下: 代码非常简单: 行13:输入内容与标签的颜色绑定,简单直观吧 ---- 再次升级需求。...仍然按照之前总结的思路,用户选择文件路径,显然我们需要一个文件路径的响应式数据: 行11:定义响应式变量,我希望用 r_ 前缀表示可读性响应式对象 行17-19:官方没有内置的本地文件选择组件,github...我们一次性把用户能交互的变量给定义出来: 然后定义衍生的数据: 1. 数据表的列名(字符串列名) 2. 图表的数据。因为我们需要根据选择的x和y轴字段做汇总统计 3....) 行25:字典中,可以随意放入响应式变量 行59:使用 lazy_input 得到的输入框,在修改内容后,只有按回车键或焦点离开输入框,才会触发值变化 此时就能得到这种效果: ---- 界面代码

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    2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

    本节课程大纲 六个专题—— 1.玩转字符串★★★ 2.玩转数据框★★★ 3.条件和循环★★★★★ 4.表达矩阵画箱线图★★★★ 5.隐式循环★★★ 6.两个数据框的连接★★ 课前提示: 六个专题互不干扰互相独立...),不可以是多个逻辑值组成的向量; -(2)当逻辑值为TRUE时执行大括号内的代码,如果为FALSE就不执行; -(3)如果要执行的代码只有一行可以不加大于号; -(4)实例:安装R包的满分操作——根据一个包是否已安装来决定要不要安装这个包...:不符合大于零的条件,就再进行一步判断; 练习7-2 # 1.加载deg.Rdata,根据a、b两列的值,按照以下条件生成向量x: #a的值为down; #a>1 且b...转换数据:把表格转换成两列数据 -(1) 第一步:转置 -(2) 第二步:把行名作为一列添加到数据中(因为ggplot2容易把行名丢掉,所以倾向于把行名作为一列) -(3) 第三步:新增一列“group...(1)apply() 处理矩阵或数据框 apply(X, MARGIN, FUN, …) 其中X是数据框/矩阵名; MARGIN为1表示行,为2表示列,FUN是函数; rm(list = ls())

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    如何在交叉验证中使用SHAP?

    简而言之,SHAP值通过计算每个特征的边际贡献来工作,方法是在许多有和没有该特征的模型中查看(每个观察值的)预测,根据每个这些减少特征集模型中的权重计算这种贡献,然后总结所有这些实例的加权贡献。...现在,我们可以使用此方法从原始数据帧中自己选择训练和测试数据,从而提取所需的信息。 我们通过创建新的循环来完成此操作,获取每个折叠的训练和测试索引,然后像通常一样执行回归和 SHAP 过程。...接下来,我们在现有代码中添加一些新行,使我们能够重复交叉验证过程CV_repeats次,并将每次重复的SHAP值添加到我们的字典中。...因此,虽然我们正在取平均值,但我们还将获得其他统计数据,例如最小值,最大值和标准偏差: 以上代码表示:对于原始数据框中的每个样本索引,从每个 SHAP 值列表(即每个交叉验证重复)中制作数据框。...该数据框将每个交叉验证重复作为行,每个 X 变量作为列。我们现在使用相应的函数和使用 axis = 1 以列为单位执行计算,对每列取平均值、标准差、最小值和最大值。然后我们将每个转换为数据框。

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    jQuery EasyUI 详解

    目前官方最新版本是:jQuery EasyUI 1.5,官方提供了两个版本供下载,GPL 版本和商业版本,你根据自己的需要下载 GPL 版本 GPL 版本在 GPl 协议下有效,你能在任何遵循 GPl...你可以把原始数据变成标准数据格式,此函数必须返回标准数据对象,含有total和 rows特性。 null editors object 定义编辑行时的 editor 。...undefined formatter function 单元格的格式化函数,需要三个参数:value: 字段的值。rowData: 行的记录数据。 rowIndex: 行的索引。...rowData: 行的记录数据。 rowIndex: 行的索引。 undefined sorter function 自定义字段的排序函数,需要两个参数: a: 第一个字段值。 b: 第二个字段值。...({ loadMsg: '正在加载数据中

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    Learn R 专题1-3

    a、b两列的值,按照以下条件生成向量x: #a的值为down; #a>1 且b的值为up; #其他情况,x对应的值为no #统计up、down、no...;cbind是按列拼接起来(向量长度得是相同的) 长脚本管理方式 if(T){} #运行{}中的代码;可折叠 if(F){} #跳过{}中的代码 专题四 表达矩阵画箱线图 表达矩阵 set.seed(10086...rownames_to_column() %>% #把行名变成数据框里的一列 mutate(group = rep(c("control","treat"),each = 3)) #加上分组...scales = “free” x和y的标度在每个版面都可以变化 scales = “free_x 固定y轴,x轴自由变化 scales = “free_y” 类似,同上 图片 5....#X 是数据框/矩阵名;MARGING为1表示行;为2表示列,FUN是函数 ;对x的每一行/列进行FUN这个函数;...用于写函数的参数 > test<- iris[1:6,1:4] > apply(test

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    Java基础知识及细节之流程控制语句

    执行流程: 首先计算表达式的值 依次和case后面的值进行比较,如果有相同的值,就会执行相应的语句,在执行过程中,遇到break就会结束。...,简单说就是判断循环是否能一直执行下去 循环体语句: 用于表示循环反复执行的内容,简单说就是循环反复执行的事情 条件控制语句:用于表示循环执行中每次变化的内容,简单说就是控制循环是否能执行下去 执行流程...; //因为要反复折叠,所以要使用循环,但是不知道折叠多少次,这种情况下更适合使用while循环 //折叠的过程中当纸张厚度大于珠峰就停止了,因此继续执行的要求是纸张厚度小于珠峰高度...先执行后判断) for循环和while的区别 条件控制语句所控制的自增变量,因为归属for循环的语法结构中,在for循环结束后,就不能再次被访问到了 条件控制语句所控制的自增变量,对于while循环来说不归属其语法结构中...当猜错的时候根据不同情况给出相应的提示 A. 如果猜的数字比真实数字大,提示你猜的数据大了 B. 如果猜的数字比真实数字小,提示你猜的数据小了 C.

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    由position属性引申的关于css的进阶讨论(包含块、BFC、margin collapse)

    并且在一个BFC中,块盒与行盒(行盒由一行中所有的内联元素所组成)都会垂直的沿着其父元素的边框排列。...创建了BFC的元素会按照如下的方式对其子元素进行排列: 在BFC中,盒子从顶端开始垂直地一个接一个地排列,两个盒子之间的垂直的间隙是由他们的margin 值所决定的。...在一个BFC中,两个相邻的块级盒子的垂直外边距会产生折叠。即是在BFC中相邻的块级元素的垂直边距会折叠(collapse)。...折叠的结果: 两个相邻的外边距都是正数时,折叠结果是它们两者之间较大的值。 两个相邻的外边距都是负数时,折叠结果是两者绝对值的较大值。 两个外边距一正一负时,折叠结果是两者的相加的和。...产生折叠的必备条件:margin必须是邻接的,且需要满足如下条件: 必须是处于常规文档流(非float和绝对定位)的块级盒子,并且处于同一个BFC当中。

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    ClickHouse(14)ClickHouse合并树MergeTree家族表引擎之VersionedCollapsingMergeTree详细解析

    TOC VersionedCollapsingMergeTree引擎继承自MergeTree并将折叠行的逻辑添加到合并数据部分的算法中。...使用场景 考虑一种情况,您需要为某个对象保存不断变化的数据。对于一个对象有一行,并在发生更改时更新该行是合理的。但是,对于数据库管理系统来说,更新操作非常昂贵且速度很慢,因为它需要重写存储中的数据。...当ClickHouse合并数据部分时,它会删除具有相同主键和版本但Sign值不同的一对行.行的顺序并不重要。 当ClickHouse插入数据时,它会按主键对行进行排序。...ClickHouse不保证具有相同主键的所有行都将位于相同的结果数据部分中,甚至位于相同的物理服务器上。对于写入数据和随后合并数据部分都是如此。...如果您需要手动折叠合并,但是,如果没有聚合(例如,要检查是否存在其最新值与某些条件匹配的行),则可以使用FINAL修饰FROM条件这种方法效率低下,不应与大型表一起使用。

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    详谈如何使用ggplot2绘制火山图

    欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近VIP群内有朋友询问火山图的绘制方法,那么本节就来详细介绍在R中如何使用「ggplot2绘制火山图」,小编添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢。...= 2^log_fc) %>% # 计算折叠变化值 fold_change = 2 的 log_fc 次幂 select(entrezid, symbol, fold_change, adj_p_val...= 0.6, shape = 16, size = 1) + # 从 up_genes 数据框中绘制特定形状的散点图,填充颜色为红色,边框颜色为黑色,大小为 2 geom_point(data...= up_genes, shape = 21, size = 2, fill = "red", colour = "black") + # 从 down_genes 数据框中绘制特定形状的散点图,...在图中显示 sig_genes 数据框中基因符号的标签 geom_label_repel(data = sig_genes, aes(label = symbol), force = 2, nudge_y

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    Java—程序流程控制(第三天)

    if它的作用,是用于对条件进行判断,判断的结果只可能有两个值true或者false,然后根据条件判断的结果来决定执行那段代码。1. if分支的应用场景有哪些呢?...(1~100之间的所有整数) 3)让需要求和的数据和sum累加, 结果:所有数据累加完之后最终sum就是所有数据的和//2.需求:求1~100中所有整数的和int sum = 0;//定义一个循环...代码写法一求奇数和的思路(只是求和的数据变成了奇数,思路和前面没有变化) 1)首先需要定义一个求和变量,这里命名为sum1 2)再遍历得到所有需要求和的数据(1~100之间的所有奇数)...代码写法二求奇数和的思路(只是求和的数据变成了奇数,思路和前面没有变化) 1)首先需要定义一个求和变量,这里命名为sum2 2)再遍历得到所有需要求和的数据(1~100之间的所有整数)...* 打印出4行5列的矩形 **** **** **** ****//1)先写一个循环用来在一行中打印5个"*"for (int j = 1; j <= 5; j++) {

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    ClickHouse(13)ClickHouse合并树MergeTree家族表引擎之CollapsingMergeTree详细解析

    该引擎继承于MergeTree,并在数据块合并算法中添加了折叠行的逻辑。...CollapsingMergeTree会异步的删除(折叠)这些除了特定列Sign有1和-1的值以外,其余所有字段的值都相等的成对的行。没有成对的行会被保留。...似乎为一个对象保存一行记录并在其发生任何变化时更新记录是合乎逻辑的,但是更新操作对DBMS来说是昂贵且缓慢的,因为它需要重写存储中的数据。...变化逐渐地被折叠,因此最终几乎每个对象都只剩下了最后的状态。 Sign是必须的因为合并算法不保证所有有相同主键的行都会在同一个结果数据片段中,甚至是在同一台物理服务器上。...如果你需要在不进行聚合的情况下获取数据(例如,要检查是否存在最新值与特定条件匹配的行),你可以在 FROM 从句中使用 FINAL 修饰符。这种方法显然是更低效的。

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    sparksql源码系列 | 最全的logical plan优化规则整理(spark2.3)

    ,因为它们不返回任何数据行。...【常量折叠和强度消减】ConstantPropagation Operator Optimization after Inferring Filters fixedPoint 用连接表达式中的相应值替换可以静态计算的属性...】InferFiltersFromGenerate Infer Filters Once 从Generate推断Filter,这样就可以在join之前和数据源中更早地通过这个Generate删除数据行。...这个类是这些算法的入口,并选择要使用的算法。由于AQP中的连接成本可能在多次运行之间发生变化,因此我们没有理由强制这个规则批上面的幂等性。...如果有SELECT * from R, S where R.r = S.s,则R和S之间的连接不是笛卡尔积,因此应该允许。谓词R.r=S.s在ReorderJoin规则之前不会被识别为join条件。

    3.1K10

    Android Studio中快捷键(持续更新)

    Alt(Option)+ 打开设置对话框 Alt(Option)+Home 跳转到导航栏 Esc 光标返回编辑框 Shift+Esc 光标返回编辑框,关闭无用的窗口 Shift+Click...折叠/展开当前花括号中的代码 Ctrl(Command)+ ] / [ 跳转到代码块结束/开始处 F2 或 Shift+F2 高亮错误或警告快速定位 Ctrl(Command)+Shift+...Ctrl(Command)+E 最近打开的文件 Alt(Option)+F3 快速查找,效果和Ctrl(Command)+F相同 F4 跳转至定义变量的位置 Alt(Option)+F7...查询当前元素在工程中的引用 Ctrl(Command)+F7 查询当前元素在当前文件中的引用,然后按 F3 可以选择 Ctrl(Command)+Alt(Option)+F7 选中查询当前元素在工程中的引用...Option)+M 提取代码组成方法 Ctrl(Command)+Alt(Option)+C 将变量更改为常量 Ctrl(Command)+Alt(Option)+V 定义变量引用当前对象或者方法的返回值

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