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R-ggplot2 绘制带颜色相关性散点图

本期推文就介绍一篇关于使用ggplot2 绘制带有颜色映射相关性散点图,本期涉及知识点如下: stat_bin_2d()绘制密度颜色映射 geom_smooth() 绘制拟合线 颜色映射相关性散点图绘制...这里大部分和推文R-ggplot2 学术散点图绘制 中绘图技巧一样,下面我直接给出代码,如下: #绘图 + 颜色 library(tidyverse) library(RColorBrewer) library...", title = "The scatter chart of Train data and Tset data", subtitle = "scatter R-ggplot2...最终,得到可视化结果如下: ? 这里提一下,由于绘制数据较少,可能导致绘制结果不太美观,当然,在数据足够多情况下,你也可以绘制出如下相关性散点图: ?...(图中colorbar位置、字体都是可以自由设置啊) 总结 使用R-ggplot2绘制学术图表确实可以避免Python-matplotlib需要自定义设置问题,提高绘图效率。

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    Python教程:如何获取颜色RGB

    简介 在许多计算机图形和图像处理应用中,颜色RGB是至关重要信息。Python作为一种多功能编程语言,提供了丰富工具和库,可以轻松地获取颜色RGB。...本文将介绍如何使用Python获取颜色RGB,以及一些实际应用示例。...该库不需要额外安装,我们可以直接导入使用,下面是一个简单示例代码,演示如何使用PIL库获取图像中特定位置颜色RGB: from PIL import Image # 打开图像文件 image.../image/031301.png') # 获取指定位置像素颜色 (b, g, r) = image[100, 100] print("RGB为: ({}, {}, {})".format(r,...实际应用示例 图像处理 获取颜色RGB可以用于图像处理任务,例如图像分割、颜色识别等。 网页设计 在网页设计中,获取颜色RGB可以帮助设计师选择合适配色方案。

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    R-ggplot2 和rasterVis 实现空间栅格(Raster)数据可视化绘制教程

    本期将推出一篇关于栅格(Raster)数据R语言可视化绘制教程,其目的也是为大家提供绘图思路。本期绘制数据为30m土地利用(land use)数据,具体区域为广州市。...主要内容如下: R-ggplot2 可视化绘制 R-rasterVis 可视化绘制 Arcgis 可视化结果展示 R-ggplot2 可视化绘制 由于对ggplot2绘图体系还不是很了解,所以这一步花费很长时间...,但也对ggplot2绘图语法有了更深理解。...话不多说,我们直接上代码,如下: # Raster_data_Vis.R library(ggplot2) library(raster) library(viridis) library(ggthemes...:将栅格数据转成可供ggplot2绘制数据格式 test_spdf <- as(test, "SpatialPixelsDataFrame") test_df <- as.data.frame(test_spdf

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    这样地图一键绘制!这个工具绘制地图太方便了~~

    「tidyterra」-像tidyverse一样操纵空间栅格数据~~ 在收集我们R语言数据可视化课程学员问题时,发现咨询比较多就是如何使用R语言便捷处理地理数据?...最好能像tidyverse一样具有多个便捷处理函数。 今天就给大家介绍一个超好用地理数据处理、可视化绘制工具-「tidyterra」,它提供了一种基于tidyverse哲学方式来处理栅格数据。...tidyterra工具简介 tiderterra是 R 语言中用于处理地理空间数据工具包,它提供了一种基于tidyverse哲学方式来处理栅格数据。...使用tidyterra可以在 R 中更加方便地处理和分析栅格数据,使得地理空间数据分析过程更加流畅和高效。...大家可阅读:tidyterra*渐变颜色板样例[1] tidyterra可视化功能 既然集成了ggplot2绘图功能, tidyterra包可视化功能也是非常完善,且再也不用之前大量数据处理过程啦

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    R语言ggplot2画热图添加分组信息颜色

    之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现,下面的B图是折线图加柱形图,相对比较容易实现,上面的A图稍微有点复杂,我想到办法是拼图,图A可以看成三个热图,然后加一个堆积柱形图,最后将四个图组合到一起...最初想法是左侧颜色条用堆积柱形图来实现,又看了一遍Y叔公众号关于aplot这个包推文,发现他是用geom_tile()函数实现,仔细想想还是geom_tile()函数实现起来比较方便。...首先解决昨天遗留问题:ggplot2画图添加文字内容时候如何添加下划线 非常感谢下面这位留言 文本添加下划线小例子 df<-data.frame(A=1:10, B...首先是准备热图数据 如何画这个热图昨天推文已经介绍过了,点击下方蓝色字可以直达昨天推文 R语言ggplot2画带有空白格热图简单小例子 接下来是准备分组颜色数据 下面是画这个颜色条...用代码如何实现我暂时还不知道,出图以后手动编辑吧!

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    跟着Nature学作图:R语言ggplot2散点图并给指定点添加颜色

    ,争取把有原始数据图都用R语言来复现一下 41586_2023_5710_MOESM4_ESM (1).xlsx 今天推文复现一下论文中Fig1a image.png 部分示例数据 image.png...shape=21, fill="#f1f1f1", color="black")+ theme_bw() image.png 给指定点映射颜色...这里我处理方式是把想要映射颜色点单独挑出来,然后再叠加一层 geneSelected<-c("ZBP1","IFNB1","CGAS","IFNAR1","STING","IFNAR2") match...(geneSelected,fig1a %>% pull(Gene)) 本来是想用上面的代码把图例基因数据匹配出来,但是有些基因名没有找到,这里我就随机选择几个了 fig1a %>% sample_n...:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己学习笔记!

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    R语言ggplot2作图如何去掉图例中NA

    遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树时候,我想给进化树枝分组映射颜色,对应推文是跟着Nature Genetics学画图:R语言ggtree给进化树枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree.../questions/45493163/ggplot-remove-na-factor-level-in-legend ggtree(tree_1)+ geom_tree(aes(color=group...))+ geom_tiplab(offset = 0.1)+ scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 这样就把图例去掉了 自定义颜色 colors<-...image.png 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python

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    R语言ggplot2作图时好玩配色包~使用泰勒斯威夫特专辑封面颜色

    名字是 tayloRswift 对应github链接是 https://github.com/asteves/tayloRswift 安装方式 install.packages(c("tayloRswift...")) 总共涉及到11个专辑封面 离散型变量或者连续型变量都可以使用 下面用鸢尾花数据集演示 library(ggplot2) library(tayloRswift) colnames(iris...) p1<-ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width))+ geom_point(aes(color=Species),size=5)+ theme_bw...()+ scale_color_taylor(palette = "lover") p2<-ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width))+ geom_point...scale_color_taylor()或者scale_fill_taylor() 默认是离散型配色,如果是连续型数据可以指定参数discrete=F 这个配色风格用到科研上也未尝不可,哈哈哈,大家感兴趣可以自己试试这个代码

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    万能转换:R图和统计表转成发表级Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等

    你和PPT高手之间,就只差一个iSlide Excel改变了你基因名,30% 相关Nature文章受影响,NCBI也受波及 特点 可以用命令将交互式R图或ggplot2、Lattice或base R...使用半透明颜色可以有效减少图形元素重叠现象,要创建半透明颜色,可以使用alpha图形属性,其从0(完全透明)到1(完全不透明)。...paper: 纸张尺寸——“A5”至“A1”用于Powerpoint导出,或“A5”至“A3”用于Word输出;默认“auto”自动选择适合您图形纸张大小。...如果设置为FALSE,则将该图以300 dpi分辨率栅格化为PNG位图格式。(栅(shān)格化,是PS中一个专业术语,栅格即像素,栅格化即将矢量图形转化为位图。)...digits:除具有p列外,要显示所有列有效位数数目。 digitspvals:具有p列要显示有效位数数目。

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    地图可视化绘制 | R-tanakametR包 绘制3D阴影效果地图

    今天我们再给大家介绍一个优秀地图可视化绘制包-R-tanaka包(用于绘制具有3d阴影效果地图可视化作品),主要涉及内容如下: R-tanaka包简介及样例样式 R-ggplot2绘制3d阴影地图...(栅格数据或sf轮廓图层(例如tanaka_contour()结果) nclass :a number of class....(刻度) col :a color palette (a vector of colors)....(是否将将图层添加到已存在图上) R-ggplot2绘制3d阴影地图 tanaka 包毕竟是一个小众地图可视化包,如何能使用ggplot2以及拓展包绘制类似地图效果呢?...总结 本期推文,我们继续介绍了优秀R可视化绘制包-tanaka包以及metR包结合ggplot2实现更加自由定制化可视化作品绘制,希望大家可以从中获取获取绘图灵感。

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    Opencv图像处理:如何判断图片里某个颜色比例

    一、功能 这里需求是,判断摄像头有没有被物体遮挡。这里只考虑用手遮挡—- 判断黑色颜色范围。...将图片加载进来 int num = 0;//记录颜色像素点 float rate;//要计算百分率 //遍历图片每一个像素点 for(int i = 0; i < image.rows...(i, j)[2]; 对于三通道图像,每个像素存储了三个,分别为蓝色、绿色、红色通道上数值。...,况且我已知道每一种颜色具体rgb,我将它们作为我判断条件 如不你不知道可以在网上查找自己想查看比例rgb或者范围 ''' if mat[i][j][0]==0 and mat[i][j][1...-A)) print("A2:%s"%A2) plt.plot(per) plt.ylabel('the percentage of road') plt.show() 以上这篇Opencv图像处理:如何判断图片里某个颜色比例就是小编分享给大家全部内容了

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    【Android初级】如何实现一个具有选择功能对话框效果

    我们去餐厅吃饭时,服务员都会拿菜单给我们选择点什么菜。今天就分享一个具有选择功能简易对话框,给用户展示一个选择列表。...实现思路如下: 既然有选择列表,那么这个列表内容肯定保存在某个地方 用户选择某一项后,给用户做出提示,刚才选择是什么 该功能主要用是 AlertDialog,源码如下: 1、主Activity(...AlertDialog.Builder(AlertDialogDemo.this) // 再次弹框,向用户提示 用户刚才选择内容...分享这个极为简单功能,主要是为后面学习AlertDialog中高级用法以及实现具备复杂选择功能需求打下坚实基础。...往期推荐 【Android初级】如何实现一个“模拟后台下载”加载效果 【Android初级】如何动态添加菜单项(附源码+避坑) 分享一个口语中可以替代“deceive”地道表达 使用TypeFace

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    stata如何处理结构方程模型(SEM)中具有缺失协变量

    p=6349 本周我正和一位朋友讨论如何在结构方程模型(SEM)软件中处理具有缺失协变量。我朋友认为某些包中某些SEM实现能够使用所谓“完全信息最大可能性”自动适应协变量中缺失。...在下文中,我将描述我后来探索Statasem命令如何处理协变量中缺失。 为了研究如何处理丢失协变量,我将考虑最简单情况,其中我们有一个结果Y和一个协变量X,Y遵循给定X简单线性回归模型。...具体来说,我们将根据逻辑回归模型计算观察X概率,其中Y作为唯一协变量进入: gen rxb = -2 + 2 * y gen r =(runiform()<rpr) 现在我们可以应用Statasem...在没有缺失情况下,sem命令默认使用最大似然来估计模型参数。 但是sem还有另一个选项,它将使我们能够使用来自所有10,000条记录观察数据来拟合模型。...(() rpr) x=. if r==0 使用缺少选项运行sem,我们获得: *output cut Structural equation model

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    妹子如何运用R语言数据分析选择心仪对象?

    那么,问题来了 男神这么多,当遇到选择困难症时,如何选择才能获得最优结果?...然后,当遇到新追求者时候,将追求者优秀程度与y进行比较,优于y则选择接受,否则继续等待新追求者;若新追求者优秀程度始终小于y,则选择做剩女。 如何求出最优样本量k?...如果最优秀追求者出现在第i个位置(k < i ≤n),其中k、n为大于0固定。...,并令这个导数为0,可以解出x最优,它就是欧拉研究神秘常数倒数e−1e−1,则样本k=n⋅x=e−1k=n⋅x=e−1。...综上所诉,可以得出如下结论: 样本人数最优为样本总量37%; 比较优秀追求者成功追到妹子概率在60%左右; 优秀者最佳出现时机为中间偏后位置。 ----

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    如何提取图片中某个位置颜色RGB,RGB十进制与十六进制转换

    【内容拓展一】:RGB 十进制与十六进制转换 当我们从 RGB 十进制转换为十六进制时,我们需要将每个颜色通道十进制转换为两位十六进制。每个颜色通道范围是 0 到 255 。...RGB 十进制 假设我们有一个 RGB 颜色,红色通道为 125 ,绿色通道为 200 ,蓝色通道为 50 。 2....【内容拓展二】:RGB 颜色概念 RGB 是一种表示颜色常用方法,它是由红色( R )、绿色( G )和蓝色( B )三种颜色通道组成。...例如,红色十进制 255 在 HEX 中表示为 FF 。 3. 颜色混合 通过调节 RGB 通道组合,可以创建出各种颜色。...这些颜色是使用 HEX 表示法表示 RGB 颜色,在网页设计和开发中广泛应用。

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    ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

    然而,图形语法翻译在ggplot2中没有对应关系(它作用是由内置R功能发挥)。...例如,对于位置,用线性比例变换连续,并将分类映射到整数;对于颜色,将连续变量映射到HCL颜色空间中平滑路径,将离散变量映射到具有相等亮度和色度均匀间隔色调,例如,对于位置,连续被映射到整数;...对于颜色,连续变量被映射到HCL颜色空间中平滑路径,离散变量被映射到具有相等亮度和色度均匀分布色调。...因为即使我们使用了许多缺省ggplot2显式语法语法也相当冗长,这使得快速尝试不同绘图变得困难。它还模仿plot()函数语法,使ggplot2对于熟悉Base R图形用户更容易使用。...对象p是类ggPlotR S3对象,由数据和其他包含关于该图信息组件组成。我们可以使用Summary()函数访问信息详细信息,以跟踪确切使用了哪些数据以及变量是如何映射

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    R语言ggplot2做箱线图时候如何添加表示平均值线

    箱线图展示就是分位数,中间线表示是中位数,也就是50%分位数,如果非要在箱线图上画上表示平均值线段也是可以实现,今天介绍一下实现代码 示例数据集我们用R语言内置数据集PlantGrowth...image.png 首先是画一个最普通箱线图 df<-read.csv("PlantGrowth.csv") library(ggplot2) library(tidyverse) p1<-ggplot...()函数可以获取画箱线图用到数据 ggplot_build(p1)$data[[1]] image.png 我们利用原始数据计算一下平均值,然后将数据集平均值添加到这组数据中 df %>%...不知道有没有比较好办法 (猜测geom_boxplot函数里应该是有一个步骤计算中位数,试着看看源代码,看能不能把中位数代码改为平均值) 还有一个问题是如果是分组箱线图那么应该如何来实现呢?...欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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    R-gstat-ggplot2 IDW计算及空间插可视化绘制

    进行IDW插计算和使用ggplot2进行可视化绘制,主要涉及知识点如下: R-gstat包IDW插计算 R-ggplot2 IDW插结果可视化绘制 R-gstat包IDW插计算 得益于优秀且丰富...R语言第三方包,我们可以直接使用空间统计计算R-gstat包实现包括IDW在内多种插方法,使用R-sf包完美绘制空间可视化绘制。...注意:小伙伴们可能也发现了,这样裁剪结果不是完全按照地图文件进行裁剪,会有部分“溢出”,特别是在绘制较大范围空间图表时候,这里可以转换成栅格数据,然后再使用mask()方法也是可以操作,具体其他...总结 继上期我们推出Python 版本IDW 空间插之后,本期我们又推出了R版本,大家可以对比下两种插结果(可能会存在些许不同)。...还是那句话,在绘制空间图表时,R因其完整绘图体系及优秀第三方包,可以较好完成绘图需求(各种空间绘图元素添加),但Python因其简单好学,也具有一定优势,大家可以选择适合自己方法进行学习,至于对比两种语言绘图不同

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