(1-cor(dataTable, method = "pearson"))
#计算相关性,并且将矩阵转化为聚类分析用的距离
col_hc <- hclust(col_dist, method = "...),
d_row = rev(row_d), d_col = col_d,
#rev将向量或矩阵进行翻转
#d_row是行的系统树数据,d_col是列的系统树数据...指数间隙模式)下,间隙映射的比例
#label_size 标签文字大小
v_ratio= c(0.1,0.8,0.1), h_ratio=c(0.1,0.8,0.1)
)
3.更改颜色绘制热图...",
mapping="exponential",
col=RdYlBu, #更换颜色
ratio = 0.3, verbose=FALSE,...axis.tick.margin设置为负值,使文本标签更接近树状图
小编总结:
R语言中绘制聚类热图的方法有很多,比如pheatmap、heatmap还有我们今天介绍的gapmap等,小伙伴们可以比较优势,选择适合自己作图的