首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

1.使用Java的DICOM基础-理解DICOM文件-DICOM Basics using Java - Making Sense of the DICOM File

正如您在我的入门DICOM教程中所回忆的那样,DICOM文件通常使用标签的概念(将在后面进行解释)像其他图像格式(例如TIFF)一样,在同一文件中包含图像数据和有关患者的数据。...大多数DICOM文件(有时带有'.dcm'扩展名-参见本文的脚注)通常包含图像数据,有时甚至可能包含多个图像(或在DICOM中通常称为“帧”)以启用以下功能:称为电影循环,使DICOM观看者可以将整个图像序列可视化为电影...本节紧随文件头之后,由一个数据集组成,该数据集由一系列标记信息(称为“ Dicom元素”)组成,该序列指定诸如传输语法(如上所解释)之类的详细信息以及有关设备或实现的其他信息创建此文件的对象以及为谁创建此信息的对象...本节之后的内容是DICOM文件的第三部分也是最后一部分,它是数据对象。DICOM文件的此部分也以数据集的形式指定,该数据集由一系列标签组成,这些标签又可以嵌套并自身携带其他子标签。...这就是对DICOM文件进行一些基本处理的全部。希望本入门教程可以帮助您了解DICOM文件中包含的内容。我没有涉及如何提取存储在我们处理过的DICOM文件中的图像像素数据。

3.4K30
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    R语言实现DICOM文件的操作

    这些是您可以在扫描仪或医院PACS(图片存档和通信系统)之外预期的文件格式。它包括文件格式和网络通信协议,该协议使用TCP / IP在能够以DICOM格式接收图像和患者数据的实体之间进行通信。...DICOM文件由标题和同一文件(* .dcm)中的图像数据组成。标题的大小取决于提供的标题信息量。标题包含诸如患者ID,患者姓名,模态和其他信息的信息。它还定义了包含多少帧以及哪些分辨率。 ?...今天给大家介绍在R语言中可以读取 dicom 数据的 R 语言包oro.dicom。...DICOM数据的读取,我们直接看下实例: #单个DICOM数据的读取 fname dcm", "Abdo.dcm"),package="oro.dicom...通过这些数据我们就可以对多期的DICOM文件进行校准,对应起来。

    1.9K10

    DICOM医学影像文件格式解析

    DICOM医学影像文件格式解析 dicom协议中文文档可去csdn下载 1.DICOM DICOM(DigitalImaging andCommunications inMedicine)是指医疗数字影像传输协定...两个能接受DICOM格式的医疗仪器间,可通过DICOM格式的文件,来接收与交换影像及病人资料。...2.DICOM存储格式 DICOM文件的整体结构如下表所示,先是128字节的导言部分(没有实际信息),接着是四个字节组成的"DICM"字符串,然后是若干DataElement元素依次排列直至文件结束。...Dicom文件数据中所有dataElement从前到后 2.2.1 按tag格式又可简单分段 文件元Tag(组号+0000) 不受传输语法影响,总是以显示VR方式表示,用于定义了传输语法; 文件元Tag...输出值的单位.这是一个枚举值, LO 2.3 DataElement的VR VR(Value Representation)值表示法是DICOM文件中特有的一种数据类型表示方式,规定了不同数据类型的含义及存储格

    7.4K32

    从共享文件夹到远程桌面的设置...

    共享文件夹 共享文件夹这个功能还是比较简单,主要是便于在局域网内分享文件、传输文件等。设置方式没啥技术含量,超级简单...接下来看看如何设置。 首先右键需要共享文件、文件夹或磁盘 (见下图) ?...这里小编就不弄太复杂,例子直接是everyone 这一步完成后,就可以在局域网能进行查看、修改文件等 当然是需要通过局域网内的Ip地址进行访问的 如何查看电脑的局域网内的...回到共享文件上面来.. 刚刚说到权限设置完成了 并且知道共享文件夹主机的ip地址后 就可以进行访问了 在地址栏直接输入\\ip地址就可以访问了 ... ? .....共享文件是一个很简单的东西 没啥难的 想要进行权限控制的话 稍微研究一下应该是也很容易做到的 可能很多人觉得这个没啥帮助 其实不然 有时候在同事之间相互共享文件等都是很方便的 可能有人说我有severs...总结一下 这是一篇主要介绍共享文件、远程桌面的文章...小编认为或多或少对大家可能还是有点帮助的...举个例子,如果你买一个高配置的电脑,把这个电脑弄成远程桌面,然后安装上一些安装经常出问题的软件...

    3.7K21

    使用Python复制某文件夹下子文件夹名为数据文件夹下的所有以DD开头的文件夹到桌面

    ,遍历的文件夹下的所有文件夹,遍历的文件夹下的所有文件 for root, dirs, files in os.walk(path): for dir in dirs:...if "数据" in dir: if "DD" in dir: # 多了一层限定条件 shutil.copyfile(root...思路是:第一次提取所有包含“数据”打头的文件夹,第二次,再针对获取到的“数据”的文件夹,再做一次代码处理,增加“DD”文件夹的筛选条件即可。...代码分别如下所示:第一次提取: def copy_file(path): num = 1 # (root,dirs,files)分别为:遍历的文件夹,遍历的文件夹下的所有文件夹,遍历的文件夹下的所有文件...for root, dirs, files in os.walk(path): for dir in dirs: if "数据" in dir:

    25130

    dotnet C# 简单的追加文件夹到 ZipArchive 压缩文件的方法

    本文将告诉大家一个在 ZipArchive 里追加文件夹,以及添加过滤文件处理的压缩文件辅助方法 实现的方法的代码如下 /// /// 追加文件夹到压缩文件里面...= "foo.ignore.file"; }); } 支持设置文件夹加入之后在安装包的什么相对路径下,也支持过滤文件 如果加入到安装包的根路径下,只需要让 zipRelativePath 参数传入空字符串即可...= "foo.ignore.file"; }); } class Foo { /// /// 追加文件夹到压缩文件里面 /// </summary...{ folders.Push(item); } } } } 以上的 C:\lindexi\Library 等文件夹是我的用于测试的文件夹...,还请大家换成自己的文件夹 本文代码放在 github 和 gitee 上,可以使用如下命令行拉取代码 先创建一个空文件夹,接着使用命令行 cd 命令进入此空文件夹,在命令行里面输入以下代码,即可获取到本文的代码

    27710

    教程 | 使用深度学习进行医疗影像分析:文件格式篇

    一个 DICOM 文件包含文件头部和同文件名的*.dcm 图像数据。文件头部的大小取决于它所提供的信息的多少。文件头包含以下信息:病人的 ID,病人的姓名,图像的模态以及其他信息。...HDF5 支持无限制多的数据类型,并且它就是为灵活高效的 I/O 和大容量的复杂数据而设计的。这些附加的特征有助于 Minc2 处理大量的复杂数据集。...医疗图像格式 格式转换 dicom 转换成 NIFTI dicom2nii(https://www.nitrc.org/projects/dcm2nii/)是一个用来把 DICOM 转换为 NIFTI...nibabel 是一个读写 nifiti 文件的 python 库。如果你你想把 DICOM 转换成 NIFTI,可以使用自动转换的工具(例如,dcm2nii)。...这些数组能够被写成 NIFTI 的文件,同时还加上一个可选的头部扩展,这个头文件包含原始 DICOM 文件的所有元数据。

    3K61

    医疗图像分割结果的3D可视化

    1.1 Dicom 数据 Dicom文件包含了诸多的元数据信息(比如像素尺寸,每个维度的一像素代表真实世界里的长度),Dicom文件即文件后缀为.dcm的文件。...每个CT扫描的病例(case)可以包含几十到上百个dcm文件,想要可视化查看CT文件,以开源免费软件ITK-SNAP为例,直接将该case文件夹里的其中一个dcm拖进软件,可以看到这个CT扫描文件有134...个dcm文件,每个slice大小为512 x 512,组成大小为512 x 512 x 134的3D数据。...可以使用Python的dicom依赖包来读取dicom数据dicom.read_file(‘a.dcm’) 1.2 mhd格式 每个病人一个mhd文件和一个同名的raw文件的格式,mhd即meta header...data,数据头部信息,raw存储了像素信息,同样可以用ITK-SNAP软件打开。

    9.1K40

    matlab遍历文件制作自己的数据集 .mat文件

    看到深度学习里面的教学动不动就是拿MNIST数据集,或者是IMGPACK数据集来教学,这些都是已经制作好的数据集,我们大家肯定都很疑惑怎么制作自己的数据集呢?...接下来我就自己制作了一个数据集,图片3600张,每张的高宽分别为240-320 获取根目录下所有子文件夹: PathRoot = 'F:\process\finger_vein-master\db100...'; list = dir(PathRoot); 获取在下一层的所有子文件夹,因为我们的数据很多时候都是不在一个文件夹,或者是在一个大文件夹中的很多小文件中,所以这时候就需要多重遍历,一层,一层的遍历下去...,拿到我们想要的所有数据   至于这里为什么是 3 开始? ...db100 里面的每一个小文件夹(001-002-003)中的left  和 right 中 这里用matlab 三重遍历文件提取数据  最后全部保存在 imgPack中 在用 save 的函数 将数据集保存成

    2.4K50

    linux中复制文件夹到另一个文件夹_linux 文件夹复制

    1、将一个文件夹下的所有内容复制到另一个文件夹下 cp -r /home/packageA/* /home/cp/packageB/ 或 cp -r /home/packageA/....方法示例: 2、将一个文件夹复制到另一个文件夹下 cp -r /home/packageA /home/packageB 运行命令之后packageB文件夹下就有packageA文件夹了。...方法示例: 3、删除一个文件夹及其下面的所有文件 rm -rf /home/packageA -r表示向下递归,不管有多少级目录,一并删除 -f表示直接强行删除,不作任何提示的意思 方法示例:...4、移动一个文件夹到另一个文件夹下面 mv /home/packageA /home/packageB/ 或 mv /home/packageA /home/packageB 这两种方法效果是一样的...方法示例: 5、移动一个文件夹下的所有内容到另一个文件夹下面 mv /home/packageA/* /home/packageB/ 方法示例: 参考文章 https://blog.csdn.net

    28K40

    Dicom图像解析

    医疗图像解析 Dicom 后缀: .dcm、.DCM Dicom中规定的坐标系是以人坐标系为绝对坐标系的,规定X轴正向指向病人的左侧,Y轴正向指向病人的背部,Z轴正向指向病人的头部。...解析举例 import dicom import pylab import os dcm_img_base_url = "/home/fan/datas/dcmFile" ds = dicom.read_file...(os.path.join(dcm_img_base_url, "N2D_0020.dcm")) print("图片中存在的属性: ", ds.dir("pat")) print("病人方位: ", ds.PatientOrientation...(os.path.join(dcm_img_base_url, "N2D_0140.dcm")) pix1 = ds1.pixel_array pylab.imshow(pix1, cmap=pylab.cm.bone...) pylab.show() 以上使用的图片为ADNI数据集中的一个.nii图像转换为Dicom图像后的一个图片 图片中存在的部分信息为 ImageOrientationPatient: ['1',

    1.8K41

    文件系统:程序集内嵌文件系统

    如果需要将静态文件作为目标程序集的内嵌文件,我们需要修改当前项目对应的.csproj文件。...每个程序集都有一个清单文件(Manifest),它的一个重要作用就是记录组成程序集的所有文件成员。...针对上图所示的项目结构,如果我们将四个文本文件以资源文件的形式内嵌到生成的程序集(App.dll)中,程序集的清单文件将会采用如下所示的形式来记录它们。...由于内嵌于程序集的资源文件采用扁平化存储形式,所以在通过 EmbeddedFileProvider构建的文件系统中并没有目录层级的概念。我们可以认为所有的资源文件都保存在程序集的“根目录”下。...由于内嵌于程序集的资源文件总是只读的,它所谓的最后修改时间实际上是程序集的生成日期,所以EmbeddedFileProvider在提供EmbeddedResourceFileInfo对象的时候会采用程序集文件的最后更新时间作为资源文件的最后更新时间

    1.5K30

    猫头虎分享:什么是 DICOM 3.0 协议?

    DICOM 不仅定义了影像文件的格式,还包括用于数据交换的通信协议。 2. 为什么需要 DICOM 3.0? 在 DICOM 3.0 之前,不同厂商的设备使用自定义格式,导致影像数据难以共享和兼容。...数据结构 DICOM 文件包含两大部分: 文件头(Header): 存储元数据,如患者信息、影像设备类型、扫描参数等; 影像数据: 存储实际的医学影像,支持多种压缩格式(如 JPEG、JPEG2000)...常见问题与解决 Q1: DICOM 文件如何查看? 可以使用开源工具如 RadiAnt DICOM Viewer 或 OsiriX; 大多数 PACS 系统也提供内置的 DICOM 查看功能。...Q2: DICOM 数据如何转换为普通格式(如 JPEG/PNG)? 使用 Python 的 pydicom 库读取 DICOM 文件,并结合 Pillow 库保存为普通图像格式。...("example.dcm") # 提取像素数据 pixel_array = dicom_file.pixel_array # 转换为图像格式并保存 image = Image.fromarray(

    14310

    医学图像了解

    DICOM可以便捷地交换于两个满足DICOM格式协议的工作站之间 一个DICOM文件由一个数据头和图像数据组成的。数据头的大小取决于数据信息的多少。数据头中的内容包括病人编号、病人姓名等等。...每个病人的一次扫描CT(scan)可能有几十到一百多个dcm数据文件(slices)。...后缀为 .dcm,可以使用 python的dicom包读取,一般使用其pixl_array数据 Dicom格式数据处理过程 医学扫描图像(scan)其实是三维图像,使用代码读取之后开源查看不同的切面的切片...同时NIfTI也可使用独立的图像文件(.img)和头文件(.hdr) DICOM和NIFTI间的区别 DICOM和NIFTI之间最主要的区别在于NIFTI中的原始图像数据是以3D图像的格式储存的,而...NIFTI的每一张3D图像中只需储存两个文件,而在DICOM中则要储存更多文件。

    2K31
    领券