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看起来全部的报错但是R包居然是安装并且成功加载

给一个学员设置R语言安装以及R包环境，遇到了一个超级有意思的现象，首先呢，在中国大陆网络设置太难了，不出意外GitHub在线安装失败： > if (!...GitHub包的压缩包文件网络传递给学生。...下载GitHub包的压缩包文件本地安装 前面的 install_github 命令，这个时候替换成 install_local 命令即可： > install_local('carmonalab-UCell-v1.1...因此不会被安装 将程序包安装入‘C:/Users/win10/Documents/R/win-library/4.1’ (因为‘lib’没有被指定) 尤其是： 有二进制版本的，但源代码版本是后来的:...It probably needs manual configuration ********************************************** 但是居然不影响它的成功安装和加载

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R包安装与使用的常见问题和解决方法速查

见：为什么你的R语言不能默认显示英文呢 0.没有关键词的提示信息 例如： 检查是否有error，没有就忽略 1.缺包 关键词是there is no package called，例如： Error...in library(Seurat) : there is no package called ‘Seurat’ 解决办法是缺啥补啥，安装报错的这个包 2.忘记加载包 关键词是 could not...原因1：包名写错 原因2：安装命令使用错误，企图用install.packages安装bioconductor 的包 原因3：本机的R语言版本与包所要求的版本不符（极少） 例如matrix：R语言4.3...，如果没啥特殊情况(例如报错的包实际上已经被移除)，直接安装就会给你装最新版本。...第一步，取消加载： 第二步：重启 正上方菜单栏-session-restart R 第三步 ：装包，根据包来自哪个网站(很容易搜到)，决定使用install.packages或者是BiocManager

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    Python环境构建

    Python环境构建 说明 同一台机器上，如果要使用不同版本的Python编译器，直接安装Python的编译的话，环境变量和安装路径都难以兼顾，所以Python提供了pyenv这个工具对Python的运行环境进行管理...，需要将pyenv加入到加载路径下 [python@dcx ~]$ vim ~/.bashrc #编辑启动加载文件 [.bashrc追加内容] [python@dcx ~]$ source .bashrc...-rw-rw-r--. 1 python python 15213396 Feb 2 17:36 Python-3.5.3.tar.xz -rw-rw-r--. 1 python python 20656090...，使用pip安装的包，都放置在一下路径下 [虚拟环境下的第三方包路径] 3.公共环境下的包放置在对应版本下的lib路径下 [公共环境的第三方包位置图] 4.在~/.pyenv/version文件保存了pyenv...当前使用的python版本 [版本图] 安装指定的python版本，如果直接用install就会去官网上去找 versions:查看当前系统上已经安装的python版本 version:查看当前正在使用的

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    离线安装支持Intel MKL的R-3.6

    笔者测试安装和使用R时，所用Linux系统为CentOS 7，R版本为R-3.6.1，Intel编译器（含MKL）2018和2019都用过（分别在两台机器上）。 1....下载R及其常用包 可以在官网（https://cloud.r-project.org/）或其镜像下载R的压缩包，笔者下载的是最新版R-3.6.1.tar.gz。...R默认内含了一些包（或库），比如MASS包，可以通过命令行R，然后输入library(MASS)查看是否已安装；官网上还有许多他人写好的包可供使用，较为方便。...点左侧Packages可显示出按字母排序的所有包，笔者下载了其中（根据自己所需挑选下载） MatrixModels_0.4-1.tar.gz Rcpp_1.0.2.tar.gz RcppArmadillo...安装 R的安装需要一些系统库及其头文件（如libicudata.so, liblzma.so, zlib.h, bzlib.h等），为避免系统上缺失某些库/头文件，亦或去手动一个个检查、安装，笔者采取一劳永逸的办法

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    python笔记40-环境迁移freeze生成requirements.txt

    需要部署到另外一台电脑或者服务器上的时候，需要导入python相关的依赖包，可以用freeze一键生成requirements.txt文件 pip freeze >requirements.txt #...生成一个迁移文件 pip install -r requirements.txt # 安装依赖包 freeze生成文件 比如我在本地电脑开发完成了python的一个项目，会涉及到很多第三方的包...假设A服务器是没有网络的，你需要在A服务器上安装python第三方包，那么你先找个可以连网络的服务器B，在服务器B上先下载需要的安装包 服务器B上下载安装包 先使用pip freeze到处需要安装的包，...A上本地安装 由于服务器A上无法联网，可以先把上面下载到的相关包传到服务器A上，然后就可以使用pip本地安装了. .whl后缀的包是可以直接使用pip本地安装的。...(注意：windows系统上导出的包，在linux上安装可能会有失败的)

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    IDEA配置Maven教程

    maven.apache.org/download.cgi 请根据自己的系统下载对应的 Maven 安装包，Maven 最新版本为 3.9.3： （我本地是3.5.3 暂时为，具体版本大家自行决定）...点击下载 2、maven的安装 大家在自己的电脑上面选择一个 磁盘 ，根目录建一个mavne的模块，用于存放刚刚下载的maven的压缩包；（目录禁止存放中文地址） 将 apache-maven-3.9.3...-3.5.3，点击确定； 大家根据自己的版本自行填写 点击确定 进入path 中新建写入 %MAVEN_HOME%\bin, 确定保存即可 依次点击确定，保存； 我们下面win +R 输入...jar包 **settings配置，在 settings 节点下添加如下配置，用于自定义本地 Maven 仓库路径： ** 下面我推荐几种常用的maven仓库 大家自行挑选 阿里云mavne...依赖并下载; repository 中； 7、清理下载失败的jar插件； D:\maven\apache-maven-3.5.3-bin\repository 是我存在下载jar的地址 大家需要修改为自己的

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    R包来源及安装

    说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包的来源 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("包名")来安装 2....Bioconductor 里面多是跟生信相关的R包，通过BiocManager::install("包名")来安装，今天的例子edgeR和limma都可以通过这种方法安装。 3....部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可以在其Github上安装，通过devtools::install_github("用户名/包名")安装 # 综上 install.packages(...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。

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    利用UIRecorder做页面元素巡检

    1.环境搭建 1.1 NodeJS根据电脑操作系统，选择对应的安装包，下载链接：https://nodejs.org/en/ 1.2 NPMNPM 是 NodeJS 自带的包管理器，可以批量下载指定包的指定版本...-g cnpm list mocha -g cnpm list macaca-reporter -g 1.5 查看环境搭建是否OK /usr/local/lib └── uirecorder@3.5.3...当 common/test.login.js 加载完成后，继续下面的录制步骤，效果如下： 2.3 开始录制 image.png 咱们就录制一个非常简单的用例：打开壹心理网站，并检查“发布文章”这几个字的文案是否正常...默认会打开同步校验浏览器，该浏览器的作用是在录制的同时做回归测试校验，如果提示执行失败，则说明回归测试过程很大几率也会执行失败，需要对录制过程进行优化（比如借助工具栏辅助功能）。...「上传过程略」 4.Jenkins任务配置 我本地的Jenkins是通过Tomcat 8运行，将Jenkins war包放到tomcat的webapps下直接启动tomcat即可。

    2.2K20

    springboot2整合mybatis-plus3踩到的坑

    因为mybatis-plus在mybatis的基础上只做增强不做改变，因此切换的成本很低，就只需改jar和配置内容，原先的代码无需改动。...然而一启动就翻车了，报了如下的错误 com.baomidou.mybatisplus.core.MybatisConfiguration.getLanguageDriver(Ljava/lang/Class...按住快捷键Ctrl+Shift+R 很遗憾事情不是我们想的那样，MybatisConfiguration只有一个 2、项目中存在多个Configuration？...3、验证包冲突 利用maven-helper插件查看jar冲突 很明显存在mybatis包冲突，而且我们项目引入的3.4.4版本的mybatis，而mybatis-plus需要引入的是3.5.3版本的...因此我们把有引用3.4.4版本mybatis的项目升级成引入mybatis 3.5.3版本就行 总结 本文出现的坑挺常见的，利用搜索引擎应该都可以找到答案。

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    springboot2整合mybatis-plus3踩到的坑

    因为mybatis-plus在mybatis的基础上只做增强不做改变，因此切换的成本很低，就只需改jar和配置内容，原先的代码无需改动。...然而一启动就翻车了，报了如下的错误 com.baomidou.mybatisplus.core.MybatisConfiguration.getLanguageDriver(Ljava/lang/Class...3、验证包冲突 利用maven-helper插件查看jar冲突 [冲突.png] 很明显存在mybatis包冲突，而且我们项目引入的3.4.4版本的mybatis，而mybatis-plus需要引入的是...3.5.3版本的mybatis 解决思路 借助maven-helper插件，我们可以看出项目是因为包传递依赖间接引入3.4.4版本的mybatis。...因此我们把有引用3.4.4版本mybatis的项目升级成引入mybatis 3.5.3版本就行 总结 本文出现的坑挺常见的，利用搜索引擎应该都可以找到答案。

    2.5K30

    Linux 常用命令(二)

    lost+fount/：系统异常产生错误时，会将一些遗失的片段放在此目录下，通常这个装备会自动出现在装置的目录下。...-n：加载没有写入文件"/etc/mtab"中的文件系统 -r：将文件系统加载为只读模式 -a：加载文件“/etc/fstab”中描述的所有文件系统 -t：限制文件系统类型的集合 -auto：当下载mount...-r apache-maven-3.5.3.zip apache-maven-3.5.3 -r 代表迭代的意思 8.1.3.4 删除压缩包中的文件 $ zip -d shellShell.zip shellShell...-3.5.3-bin.zip压缩包中 $ zip -m apache-maven-3.5.3-bin.zip shellShell *********** adding: shellShell/ (stored...i:忽略闲置和僵死进程，这是一个开关式命令 q:退出程序 r:重新安排一个进程的优先级别 S:切换到累计模式 s:改变两次刷新之间的延迟时间（单位为s），如果有小数，就换算成ms。

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    R包来源及安装指定版本R包方法

    说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....Github 部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可通过其Github进行安装，通过devtools::install_github("用户名/pkg_name")安装。...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...在装有devtools的基础上，我使用以下命令重新装了0.1.8版本的rvcheck后，顺利的安装了clusterProfiler。

    12.6K50

    scCancer包：自动分析肿瘤单细胞转录组利器

    checkPkg("RcppArmadillo")) install.packages("RcppArmadillo") if(!...情况2：只有raw_feature_bc_matrix(~50w cells) 此时我们可以提前加载DropletUtils包，runScStatistics()函数会自动调用该包，过滤raw_feature_bc_matrix...B：细胞干性：主要使用参考数据集(stem/progenitor cells)，类似上述细胞注释的方法，使用OCLR算法，计算每个细胞在表达水平上的相关性。 ?...算法有GSVA与Seurat的AddModuleScore()[默认]两种。此外我们也可以提供自己感兴趣的基因集。 ? D: 潜在特征基因表达谱分析：上一种方法是已知基因集具有确定的生物学意义。...以上就是runScAnnotation()报表结果的基本组成。里面有很多参数可以调整，或者加载结果提供的Seurat对象进行感兴趣的个性分析。

    2.5K61

    一文教会你使用 Neo4j 快速构建明星关系图谱

    启动Neo4j程序：组合键Windows+R，输入cmd，打开命令行窗口，切换到主目录cd E: eo4j-file eo4j-community-3.5.3，以管理员身份运行命令：neo4j.bat...百度解决方案，在“我的电脑”-“属性”-“高级系统设置”-“环境变量”,将主路径放入系统变量中NEO4J_HOME=E: eo4j-file eo4j-community-3.5.3，同时将%NEO4J_HOME...接着还有错误：Import-Module : 未能加载指定的模块“Neo4j-Management.psd1”，于是更改E: eo4j-file eo4j-community-3.5.3in eo4j.ps1...-3.5.3inNeo4j-Management.psd1" 保存文件后，重新启用，红色提示消失，运行Neo4j install-service命令，将Neo4j服务安装在系统上。...Neo4j 初体验 安装完成后，在以后的岁月里，只需在命令行窗口进入E: eo4j-file eo4j-community-3.5.3in文件夹，运行neo4j start便可启动 neo4j，然后打开网址

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    一文教你用 Neo4j 快速构建明星关系图谱

    启动Neo4j程序：组合键Windows+R，输入cmd，打开命令行窗口，切换到主目录cd E:\neo4j-file\neo4j-community-3.5.3，以管理员身份运行命令：neo4j.bat...接着还有错误：Import-Module : 未能加载指定的模块“\Neo4j-Management.psd1”，于是更改E:\neo4j-file\neo4j-community-3.5.3\bin\...-3.5.3\bin\Neo4j-Management.psd1" 保存文件后，重新启用，红色提示消失，运行Neo4j install-service命令，将Neo4j服务安装在系统上。...Neo4j 初体验 安装完成后，在以后的岁月里，只需在命令行窗口进入E:\neo4j-file\neo4j-community-3.5.3\bin文件夹，运行neo4j start便可启动 neo4j...手动去掉一些无用的列数据后，将ylq_star_nodes.csv和ylq_star_relations.csv 两个csv文件，放到E:\neo4j-file\neo4j-community-3.5.3

    1.1K10

    一文教你用 Neo4j 快速构建明星关系图谱

    启动Neo4j程序：组合键Windows+R，输入cmd，打开命令行窗口，切换到主目录cd E:eo4j-fileeo4j-community-3.5.3，以管理员身份运行命令：neo4j.bat console...百度解决方案，在“我的电脑”-“属性”-“高级系统设置”-“环境变量”,将主路径放入系统变量中NEO4J_HOME=E:eo4j-fileeo4j-community-3.5.3，同时将%NEO4J_HOME...接着还有错误：Import-Module : 未能加载指定的模块“Neo4j-Management.psd1”，于是更改E:eo4j-fileeo4j-community-3.5.3ineo4j.ps1..." 保存文件后，重新启用，红色提示消失，运行Neo4j install-service命令，将Neo4j服务安装在系统上。...Neo4j 初体验 安装完成后，在以后的岁月里，只需在命令行窗口进入E:eo4j-fileeo4j-community-3.5.3in文件夹，运行neo4j start便可启动 neo4j，然后打开网址

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    微服务项目部署实践：使用Gitlab Runner实现微服务项目的持续集成，持续交付和持续部署

    ,频繁(一天多次)地将代码集成到主干,优点有两个: 快速发现错误: 每完成一点更新, 就集成到主干,可以快速发现错误,定位错误 防止分支大幅偏离主题: 如果不是经常集成,主干又在不断更新,会导致以后集成难度变大...完成后,下一个Stage才会开始 只有当所有Stages完成后,该构建任务(Pipeline)才会成功 如果任何一个Stage失败,那么后续的Stages都不会执行,该构建任务(Pipeline)失败...,该Stage才会执行成功 如果任何一个Job失败,那么该Stage失败,即构建任务(Pipeline)失败 持续交付 持续交付(Continuous Delivery): 频繁地将软件的新版本,交付给质量团队或用户以供评审...评审通过,代码就进入生产阶段 持续交付是持续集成的下一步,强调的是:不管怎么更新,软件是随时随地可以交付的 持续交付是在持续集成的基础上,将集成后的代码部署到更接近真实运行环境的类生产环境(production-like...的一部分,由GitLab CI来运行构建任务的化,GitLab的性能会大大下降 GitLab CI最大的作用: 是管理各个项目的构建状态 GitLab Runner GitLab Runner可以安装到不同的机器上

    1.4K21

    Android-Universal-Image-Loader图片异步加载并缓存

    三、使用方法   这是 一个开源的Android关于下载显示图片的工具类，在这个下载包里面jar文件，用于我们导入项目使用，具体使用方法在包里面也含有。...) //设置图片在下载期间显示的图片  .showImageForEmptyUri(R.drawable.ic_launcher)//设置图片Uri为空或是错误的时候显示的图片 .showImageOnFail...(R.drawable.ic_launcher)   .cacheInMemory(true) //设置图片加载/解码过程中错误时候显示的图片 .cacheInMemory(true)//设置下载的图片是否缓存在内存中...    }   @Override public void onLoadingFailed(FailReason failReason) {         //加载失败的时候执行...    }   @Override public void onLoadingFailed(FailReason failReason) {         //加载失败的时候执行

    1.2K60

    Linux终端回话记录和回放工具 - asciinema使用总结

    之所以说asciinema比script略微技高一筹, 那是因为它们在处理方式上不同: 1) asciinema略显得"高级"和智能的是,asciinema录制与播放都是使用的同一个工具和文件。...如果没有在官方源中找到这个工具,asciinama网站上已经提供了较详细的安装教程,git上也提供另外的安装方法。...3.4 开始就已经自带了pip和easy_install（setuptools 包带的命令） 包管理命令，可以在 /usr/local/python3/bin/ 目录下看到这些安装的扩展包： [root...auth Manage recordings on asciinema.org account # 管理asciinema.org帐户上的记录...( 然而使用script 时, 可能因为 script 录制时产生的时序信息是以标准错误产生的，如果不将它们单独重定向到一个文件中(后来才知道可以使用长参数避免这个问题)，它们不仅会发送到终端窗口上而让终端一片混乱

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