两篇综述系统性的整理和比较了主流算法,
Hackl H, Charoentong P, Finotello F, et al....近几年开发的CIBERSORT算法正是去卷积方法的应用。...1:4,1:4]
X[1:4,1:4]
boxplot(X[,1:4])
save(X,Y,file = 'input.Rdata')
从代码里面,可以看到,LM22矩阵进行了zscore转换,待反卷积的表达矩阵虽然并没有被...第二步,搞清楚 CoreAlg 函数
这里会使用被zscore后的LM22矩阵,来使用SVM算法来预测一个随机的Y变量。...colnames(X),"P-value","Correlation","RMSE")
obj
save(obj,file = 'output_obj.Rdata')
第五步,可视化cibersoft去卷积结果