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使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

在日常的计算化学研究中,我们经常需要将计算得到的分子或者固体/晶体体系简谐振动通过动画的方式直观地呈现在屏幕上,从而可以清楚地知道在某个特定的振动模式下是哪些原子在运动。一方面,这种振动的可视化可以在实验测量得到了振动光谱(红外、拉曼)的情况下帮助我们借助理论计算对振动谱图进行指认;另一方面,在反应机理研究的过渡态计算中,通过对虚频振动的观察,我们可以很快知道计算得到的过渡态结构是否能把反应物、产物的结构串起来。 以最常用的量化计算程序高斯为例,与之配套使用的GaussView软件可以很轻松地对振动分析 (freq) 计算结果进行可视化。类似地,Q-Chem也有一个配套的IQmol程序(免费、开源)可以呈现Q-Chem的振动分析结果。此外,一些第三方的程序如Avogadro、MOLDEN等也可以对高斯程序的振动分析结果进行可视化。计算化学公社的社长sob老师曾经写过一个可以将ORCA的振动分析结果转换为高斯输出格式的工具(http://sobereva.com/498)以及一个可以在VMD程序中显示振动模式静态矢量的工具(http://sobereva.com/567)。

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    CONQUEST 第一性原理计算框架

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    云计算如何助力夯实制造业“底盘”?材料科学领域专家学者分享新材料前沿技术成果

    新材料技术是我国制造业的“底盘技术”,在人工智能、云计算等信息技术的加持下,新材料的发现与设计、分析与计算迎来了哪些变化?8月26日,腾讯教育联合腾讯云、腾讯量子实验室、龙讯旷腾、NVIDIA共同举办云计算助力材料多尺度计算研讨会,邀请11位材料科学领域专家学者分享多尺度计算模拟与云计算领域的最新进展、技术及成果,推动多尺度计算模拟的理论发展和应用探索。 腾讯杰出科学家、腾讯量子实验室负责人张胜誉,龙讯旷腾CEO吕海峰,香港城市大学讲座教授张瑞勤,北京航空航天大学物理学院院长、教授吕广宏,中国科学院半导体

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    突破极限!腾讯云高性能计算助力实现超大体系平面波精度第一性原理计算

    近日,腾讯量子实验室、腾讯云高性能计算产品团队、北京龙讯旷腾科技有限公司和盐城工学院石林教授团队联合攻关,成功实现了百万硅原子超大规模体系的平面波精度第一性原理计算。该项工作由腾讯量子实验室牵头,基于龙讯旷腾公司的线性标度三维分块算法(LS3DF)以及腾讯云高性能计算集群产品完成。 一直以来,第一性原理计算作为研究材料物化性质的重要手段,对于新材料的发展具有重要意义。第一性原理计算从量子理论的基本原理出发,结合高性能计算系统的强大算力,通过数值迭代方法获取材料的物理或化学性质,为理解材料的性质、预测材

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    第一性原理计算框架 CONQUEST 的安装与测试

    随着计算机的计算能力和运行规模的不断提升,基于第一性原理计算理论的计算材料学科越来越得到重视。但是一般来说这样的模拟对一个包含成千上万的原子、电子而言,所需的计算框架是非常复杂的,计算代价是相当昂贵的。比如为人所熟知的商用类型 第一性原理计算框架 VASP 授权通常需要五六万人民币以上,而且在一个普通超算集群上计算一个完整的体系结构(超过 1,000 个原子)可能需要几周,甚至几个月。无论是软件授权成本,还是时间成本,都比较高昂。对于想学习和实践第一性原理计算的小伙伴而言,当然也有比较节省的方式。首先软件可以选用免费的开源第一性原理计算框架,比如说本文中即将介绍到的 CONQUEST,以及 ABINT,SMASH 和 QUANTUM ESPRESSO 等。

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    WeCity观察丨城市的第一性原理与数字化转型

    作者 王  鹏  腾讯研究院资深专家 摘要:城市数字化转型是我国“十四五”期间的重要发展方向。本文从城市的第一性原理角度分析,认为城市的本质即通过设施与服务的集中供给,解决人们日益增长的需求。在此基础上,提出城市数字化转型技术方法层面的几个趋势,包括:表面化需求,深层次解决,碎片化需求,系统化解决,运营端需求,市场化解决。 城市的第一性原理 《中共中央关于制定国民经济和社会发展第十四个五年规划和二〇三五年远景目标的建议》中,明确提出要“加快数字化发展”,要“发展数字经济,推进数字产业化和产业数字化,推动数字

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    从第一性原理解读大模型Agent技术

    本文讲述了从大型人工智能模型到智能体的转变,强调了核心概念和技术进展的重要性。文章中的图表对于理解这些复杂概念至关重要,它们不仅简洁而且包含了关键信息,这使得文章成为一个值得收藏的资源。 技术脉络从“Prompt工程”开始,这是AI领域的一个基本概念,指的是如何有效地构造和使用提示词(Prompt)来引导AI模型生成期望的输出。随后发展到“Prompt Chain或Flow”,这进一步细化了Prompt工程,涉及如何将多个提示词串联起来,形成一个流程,以指导AI完成更复杂的任务。 进一步地,文章讨论了“Agent”概念的发展,这指的是一个能够自主行动并且进行决策的智能实体。这些智能体可以是单独操作的,也可以是多个智能体协同工作。多Agent系统在处理复杂任务和环境中显得尤为重要,因为它们可以协作,共享信息和资源,从而提高整体性能和效率。 文章还提到了“提示词万能公式”,这是一种构造有效AI提示词的方法,包括角色、角色技能、任务核心关键词、任务目标、任务背景、任务范围、任务解决与否判定、任务限制条件以及输出格式/形式和输出量。这种公式的目的是为了最大化AI的效能和准确性。

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    元宇宙产业投资全景图,快人一步走进元宇宙新时代!

    👆点击“博文视点Broadview”,获取更多书讯 元宇宙是一个大的应用场景实现,实现这个场景需要更多的技术和更深层次的内容,多元化的互联网应用及创新的商业模式相互融合、配合,才能够勉强称得上是一个元宇宙项目或生态。 投资元宇宙,要落实到对产业方向的投资。 同样是元宇宙领域,应当根据其具体的产业发展格局与步骤来安排投资方向。提高对产业分布的认知清晰度是产业投资的第一课。 元宇宙整体推进互联网产业 纵观互联网产业或移动通信产业的发展,从来都不是依靠任何单一力量或是单一行业的驱使就能完成的,例如英伟达的发展必

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