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    人肝肿瘤微环境单细胞图谱

    肿瘤细胞与组成肿瘤微环境tumor microenvironment (TME) 的基质细胞之间的相互作用,影响了恶性细胞的生长。人的肝脏是肿瘤和转移的主要部位。在这些病理情况中,不同细胞类型间分子类型和细胞间相互作用还不清楚。在这篇文章里,作者对5例胆管癌或肝转移患者的恶性和邻近非恶性肝组织进行单细胞RNA测序和空间转录组分析。发现基质细胞表现出重复的,与患者无关的表达程序,并重建了突出肿瘤-基质相互作用的配体-受体图。通过结合激光捕获显微切割区域的转录组学,作者在非恶性肿瘤部位重建了肝细胞分区图谱,并表征了整个细胞在肿瘤微环境中的空间分布。这一研究为了解人类肝脏恶性肿瘤提供了数据支撑,并且揭示了潜在的干预措施。

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    python与地理空间分析(一)

    在气象数据分析中,地理空间要素是一个必须考虑的关键特征项,也是重要的影响因素。例如气温会随着海拔的升高而降低,地形的坡向朝向也会影响风速的分布,此外,典型的地形会形成特定的气候条件,也是数据挖掘中可以利用的区域划分标准。数据分析中,地理空间分析往往能提供有效的信息,辅助进行决策。随着航空遥感行业的发展,积累的卫星数据也成为了数据挖掘的重要数据来源。 地理空间分析有好多软件可以支持,包括Arcgis,QGIS等软件平台,本系列文章将会着重分享python在地理空间分析的应用。主要包括地理空间数据的介绍,常用的python包,对矢量数据的处理,对栅格数据的处理,以及常用的算法和示例。 地理空间数据包括几十种文件格式和数据库结构,而且还在不断更新和迭代,无法一一列举。本文将讨论一些常用的地理空间数据,对地理空间分析的对象做一个大概的了解。 地理空间数据最重要的组成部分:

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