首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

用Graphviz绘制Networkx子图

Graphviz是一种开源的图形可视化工具,可用于绘制各种类型的图形,包括网络图。它提供了一种简单易用的描述语言,通过描述图形中节点和边之间的关系,可以生成美观的图形输出。

Networkx是一个基于Python的图论和复杂网络建模工具包。它提供了创建、操作和分析各种类型的复杂网络的功能,并支持多种图形可视化方法。

绘制Networkx子图可以通过以下步骤完成:

  1. 首先,需要安装Graphviz和Networkx库,可以使用pip命令进行安装:
代码语言:txt
复制
pip install graphviz
pip install networkx
  1. 在Python脚本中导入所需的库:
代码语言:txt
复制
import networkx as nx
from networkx.drawing.nx_agraph import graphviz_layout
import matplotlib.pyplot as plt
  1. 创建一个Networkx图对象,并添加节点和边:
代码语言:txt
复制
G = nx.Graph()
G.add_nodes_from([1, 2, 3, 4])
G.add_edges_from([(1, 2), (2, 3), (3, 4), (4, 1)])
  1. 使用Graphviz布局算法来确定节点的位置:
代码语言:txt
复制
pos = graphviz_layout(G)
  1. 使用Matplotlib库绘制子图:
代码语言:txt
复制
plt.figure(figsize=(6, 6))
nx.draw_networkx(G, pos, with_labels=True, node_color='lightblue', node_size=500, font_size=12, font_color='black', edge_color='gray')
plt.axis('off')
plt.show()

这样就可以生成一个使用Graphviz绘制的Networkx子图。在上述步骤中,可以根据实际需求自定义节点和边的属性,以及图形的大小、字体样式等。

Graphviz和Networkx的组合可以有效地实现复杂网络的可视化和分析。在实际应用中,它们可以用于研究社交网络、推荐系统、生物网络等领域,帮助人们更好地理解和解释复杂关系。对于Graphviz绘制Networkx子图的更详细的用法和示例,可以参考以下链接地址:

  • Graphviz官方网站:https://graphviz.org/
  • Networkx官方网站:https://networkx.org/
  • Networkx绘图文档:https://networkx.org/documentation/stable/reference/drawing.html
页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

networkx遍历和绘制

networkx遍历和绘制 文章目录 networkx遍历和绘制 数据读取后默认标签(labels)为索引,如何使用编号id? 数据读取后,如何得到节点集和边集?...如何绘制多样的数据读取后默认标签(labels)为索引,如何使用编号id?...在数据读取后,我们在算法中处理数据时往往会对的节点集和边集进行处理,下面提供几种遍历方式: ---- 如何绘制多样的?...在绘制图时,有时我们可能需要为节点着不同的颜色,展示不同属性和大小等等,需要为边添加不同的线型,颜色、粗细等等,这时需要分步绘制,其各类属性如下: # 画点 draw_networkx_nodes(G,...—— 基本操作及画图 下面以karate_club数据集为例绘制图: import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt G = nx.karate_club_graph

1.8K20

❤️ Python 利用NetworkX绘制精美网络 ❤️

文章目录 一、NetworkX 概述 二、NetworkX的安装 三、NetworkX基础知识 1. 创建 2. 网络的加点和加边 3. 运用布局 四、利用NetworkX实现关联类分析 1....一、NetworkX 概述 NetworkX 是一个 Python 语言开发的图论与复杂网络建模工具,内置了常用的与复杂网络分析算法,可以方便的进行复杂网络数据分析、仿真建模等工作。...创建 可以利用 networkx 创建四种: Graph 、DiGraph、MultiGraph、MultiDiGraph,分别为无多重边无向、无多重边有向、有多重边无向、有多重边有向。...(G), node_color = 'b', edge_color = 'r', with_labels = True, font_size =18, node_size =20) G:待绘制的网络G...算法排列节点(样子类似多中心放射状) spectral_layout:根据的拉普拉斯特征向量排列节点 绘制网络实例如下: import networkx as nx import matplotlib.pyplot

1.9K31
  • Python数据分析 利用NetworkX绘制网络

    NetworkX 概述 NetworkX 是一个Python语言开发的图论与复杂网络建模工具,内置了常用的与复杂网络分析算法,可以方便的进行复杂网络数据分析、仿真建模等工作。...networkx支持创建简单无向、有向和多重图;内置许多标准的图论算法,节点可为任意数据;支持任意的边值维度,功能丰富。主要用于创造、操作复杂网络,以及学习复杂网络的结构、动力学及其功能。...用于分析网络结构,建立网络模型,设计新的网络算法,绘制网络等等。 2....NetworkX基础知识 创建 可以利用networkx创建四种: Graph 、DiGraph、MultiGraph、MultiDiGraph,分别为无多重边无向、无多重边有向、有多重边无向...算法排列节点(样子类似多中心放射状) spectral_layout:根据的拉普拉斯特征向量排列节点 绘制网络实例如下: import networkx as nx import matplotlib.pyplot

    7.7K42

    精选:15款顶尖Python知识图谱(关系网络)绘制工具,数据分析的强力助手

    知识图谱(关系网络)可以简单的形状和线条显示复杂的系统,帮助我们理解数据之间的联系。我们今天将介绍15个很好用的免费工具,可以帮助我们绘制网络。...NetworkX NetworkX是一个用于处理网络的Python工具。许多人在Python中处理数据时使用NetworkX。它也是许多AI工具的基础。...https://graph-tool.skewed.de/static/doc Graphviz Graphviz使绘制图形变得容易。...https://github.com/cytoscape/py4cytoscape pydot pydot是Graphviz的Python接口,纯Python编写。...由节点和节点之间的有向/无向/多边组成。网络是节点和/或边缘上有数据的c++编写的SNAP库是为快速工作和清晰的网络而设计的。

    43010

    一文读懂Python复杂网络分析库networkx | CSDN博文精选

    参考 1 简介 networkx是一个Python语言开发的图论与复杂网络建模工具,内置了常用的与复杂网络分析算法,可以方便的进行复杂网络数据分析、仿真建模等工作。...networkx(graph)为基本数据结构。既可以由程序生成,也可以来自在线数据源,还可以从文件与数据库中读取。 安装 安装的话,跟其他包的安装差不多,的是anaconda就不用装了。...() 4G=nx.MultiGraph() 5G=nx.MultiDiGraph() 6G.clear() #清空 绘制网络基本流程 导入networkx,matplotlib包 建立网络 绘制网络...])绘制网络G的节点 4draw_networkx_edges(G,pos[edgelist])绘制网络G的边 5draw_networkx_edge_labels(G, pos[, …]) 绘制网络...www.jianshu.com/p/f62991aa1f8a python+graphviz/networkx画目录结构树状:https://blog.csdn.net/XiaoPANGXia/article

    27.5K42

    Subplot和Subplots绘制

    Subplot和Subplots绘制 plot可以绘出精美的图形,但是如果想要在一张图中展示多个子,plot就很难办了。 matplotlib提供了subplot来解决这一问题。...现在的效果是两个图像挤在一张图片中,有些情况下这样的布局比较好,有些情况下则需要将两个曲线分开到两个不同的图像中绘制,这样可以如下: subplot在指定分割图个数和定位子时可以使用参数连写的方式如...plt.subplot(2,1,1)会将原始的图像切割成2个图像,是2行1列,并将现在的操作位置转到第一个图上,这样便实现了绘制的方法。...Subplots绘图方法 subplots返回的值的类型为元组,其中包含两个元素:第一个为一个画布,第二个是 ? ? subplots指定一个: ?...subplots指定多个子: ? 可见,画布被分为了4各部分,而ax变成了一个包含四个对象的array 现在可以针对每一个进行画图:  ?

    1.5K10

    论文中绘制神经网络工具汇总

    ,我的想法是这样的,尽管很多工具都能完成同样的一项工作,但是它们的效果和效率肯定是不一样的,你Visio需要2个小时的一张或者利用另外的一个工具仅仅需要花费20分钟,这可能就是所谓的区别,如果你感觉你的时间很多...这个软件可能很多人都使用过,我以前所有的基本上都是用它完成的,它的确很强大,值得去推荐,但是我总想去寻找一个更优的工具。以下是使用Visio绘制的几张神经网络。 ? ?...可以用来绘制图表,流程,组织结构图以及插图,也可以用来组织头脑中思考的信息,组织头脑风暴的结果,绘制心智,作为样式管理器,或设计网页或PDF文档的原型。...可以用来绘制图表,流程,组织结构图以及插图,也可以用来组织头脑中思考的信息,组织头脑风暴的结果,绘制心智,作为样式管理器,或设计网页或PDF文档的原型。...NetworkX 一个可以用来绘制神经网络的python包,其相应的资源如下所示: 1、NetworkX文档 https://networkx.github.io/documentation/latest

    3.9K20

    Python绘制地理

    colorscale ='Viridis':显示一个颜色(f或更多颜色比例,请参阅 此处)。 location = df ['Country']:添加所有国家/地区的列表。...布局 -一个Geo对象,可用于控制 在其上绘制数据的基础地图的外观 。 这是一本嵌套的字典,其中包含有关地图/绘图外观的所有相关信息。 生成/ ? ?...密度 密度映射只是一种显示点或线可能集中在给定区域中的方式。 在Python中使用密度 在这里,我们将使用世界范围 的地震及其震级数据集。 好的,让我们开始吧。 导入库 ?...绘制数据 ? lat ='Latitude':获取数据框的“纬度”列。 lon ='Longitude':获取数据框的经度列。 z:显示地震震级的整数列表。...我们已经绘制了“地震及其烈度”的密度,从上面我们可以看到,它覆盖了遭受地震破坏的所有领土,并且还显示了当我们将鼠标悬停 在上方时每个区域的地震烈度。

    2.2K20

    【JavaScript】echarts绘制

    ‍ 哈喽大家好,本次是JavaScript专栏echarts板块第一期 ⭐本期内容:echarts绘制 系列专栏:JavaScript 一起学习,一起加油!...---- 文章目录 前言 效果 思路 准备一个dom 基于准备好的dom,初始化echarts实例 指定图表的配置项和数据(对象) HTML 总结 ---- 前言 echarts(Enterprise...echarts官网地址:https://echarts.apache.org 指定图表的配置项和数据(对象) 设置数据,这里数据是数组的形式,一个对象包括了name和value两个属性,属性键值对的方式进行设置...设置鼠标移动到相应色块的效果和图例的位置 设置系列配置项,设置的类型、数据、标签等。 label为标签,show显示标签,formatter为回调函数,返回标签显示的内容。...radius是院的内外半径,center是的位置。 rosetype是圆心角的类型,area是每个部分圆心角不变,radius是圆心角会变化。

    1.1K10

    Basemap系列教程:绘制及小地图

    有几种方法可以实现这种图形的绘制,而且根据所绘图形的复杂性来选择不同的方法: 直接使用 add_subplot 添加 axis 使用 pylab.subplots 创建 使用 subplot2grid...map.fillcontinents(color='coral',lake_color='aqua') map.drawcoastlines() plt.show() 传递给 subplots 方法的参数分别为绘制的...verts2, codes2) patch = patches.PathPatch(path, facecolor='r', lw=2) ax2.add_patch(patch) plt.show() 每一个都是...3) rowspan 或 colspan,注:即每个子占据多少行多少列,默认只占据一行一列 注:关于绘制的方法会在关于 matplotlib 的相关文章中进行解释。...嵌入定位器 [注5] 注:原文此部分单独成节,因为部分包括这部分,因此翻译时将此部分与部分合并。 使用嵌入定位器可以在大地图中添加小地图,结果比在主地图中创建要好。

    5K10

    ComplexHeatmap 包绘制复杂热

    最近碰到个画热的需求,以前一直的 pheatmap,但这次的有些复杂,靠我的水平 pheatmap 还是做不出来。...) = paste0("row", seq_len(nr))colnames(mat) = paste0("column", seq_len(nc)) 使用基础函数 Heatmap() ,一行代码即可绘制默认参数下的热...绘制更复杂的热 为基因表达矩阵加入更多信息 热常用于可视化基因表达矩阵,矩阵中的行与基因相对应,我们可以在表达热后附加有关这些基因的更多信息。 在下面的示例中,大的热展示了基因的表达量。...在热的最左侧,是由 anno_block() 绘制的彩色矩形,用于区分根据 k-means 聚类识别出五个聚类。...这幅热显示,高甲基化的 DMR 在基因间和基因内区域富集,但很少与增强重叠。相反,低甲基化的 DMR 富集于转录起始位点(TSS)和增强

    7.2K51

    怎么Python绘制这样的

    最近看到一张,感觉很酷炫,搜索得知是叫做弦。看到很多用R语言绘制的案例,以及有Excel大佬VBA也绘制了一个,简直不要太强。 那么,Python可以绘制吗?...最终,可算让我找到了Python绘制的免费方案,今天我们就一起来看看吧! 1. 什么是弦 下面这张就是弦,主要用于展示多个对象之间的关系,连接在圆上任意两点之间的线段叫做弦。...->对象的方向 一般来说,弦可以用于以下几种场景: 人口迁徙(不同城市之间迁入迁出) 电竞战队或球队之间选手交易 具有重叠成分的不同成品与各成分关系 类似以上几类场景的情况等等 今天,我们绘制要用到的可视化库是...弦绘制 HoloViews是一个开源的Python库,可以非常少的代码行中完成数据分析和可视化,除了默认的matplotlib后端外,还添加了一个Bokeh后端。...我们拿玩家在不同游戏中的付费金额来绘制,演示每一个步骤 2.1 数据准备 用以下数据进行案例演示 import pandas as pd df = pd.read_clipboard() df

    1.2K30

    Python绘制漫步实例讲解

    self.y_values.append(next_y) rw=RandomWalk() rw.fill_walk() plt.scatter(rw.x_values,rw.y_values,s=1) plt.show() 绘制出的如下所示...这段代码绘制了5000个数据点,这些点的分布完全是随机的。每次运行代码都会有不同的走向。...next_y) import matplotlib.pyplot as plt from random_walk import RandomWalk # 创建一个RandomWalk实例,并将其包含的点都绘制出来...().get_xaxis().set_visible(False) plt.axes().get_yaxis().set_visible(False) plt.show() 第二个实例内容差不多,是的...到此这篇关于Python绘制漫步实例讲解的文章就介绍到这了,更多相关使用Python绘制漫步图内容请搜索ZaLou.Cn以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持ZaLou.Cn!

    39110

    机器学习探索 A 股个股相关性变化

    导出的 GraphViz 可被导入可视化工具 Gephi10 进行分析与展示; 可以方便地使用其他绘图组件,如:JGraphX,mxGraph,Guava Graphs Generators 等工具绘制网络...,最好整个变化过程可以持久化地写入一个数据库中,并且可以实时地直接从数据库中加载或者全做分析。...Nebula Graph 的 Java 客户端 Nebula-Java 11 提供了两种访问 Nebula Graph 方式:一种是通过查询语言 nGQL 12 与查询引擎层 13 交互,这通常适用于有复杂语义的访问类型...本文代码可见18 Reference 1 NetworkX + Gephi + Nebula Graph 分析人物关系(上篇)https://nebula-graph.com.cn/posts.../game-of-thrones-relationship-networkx-gephi-nebula-graph/ 2 NetworkX + Gephi + Nebula Graph 分析<权力的游戏

    1.4K20

    NetworkX,网络结构图最强绘制工具·····

    Python-NetworkX包介绍 今天给大家介绍Python语言中绘制网络结构图的可视化拓展工具-NetworkX包。...安装 NetworkX 你可以使用 pip 命令来安装 NetworkX: pip install networkx 创建结构 NetworkX 允许你创建不带权重或带权重的,有向或无向。...([(1, 2), (2, 3)]) 可视化结构 NetworkX 提供了多种方法来可视化结构。...自定义节点颜色和标签 node_color = ['red', 'green', 'blue'] labels = {1: 'Node 1', 2: 'Node 2', 3: 'Node 3'} # 绘制自定义样式的...包的用法和案例可参考:NetworkX包官网[1] 另:本人编写的《科研论文配绘制指南-基于Python》一书也在修正和新增内容中,也会增加更多关于NetworkX绘制科研图形的案例。

    1.4K30
    领券