为了将其纳入上下文，蛋白质相互作用网络代表了蛋白质与参与相同生物过程或共同履行特定功能的相互作用蛋白质群之间的成对连接。我刚刚开始深入研究生物信息学和研究，所以我很有可能已经做过这件事，而且我对此的研究还不够广泛。如果是这样的话，我将非常感谢链接。我希望有任何可能的帮助，或关于如何思考这个问题的想法。
浏览 1提问于2015-12-10得票数 0
有一个包含特定基因的文件列表，我想在R中创建一个二进制关系矩阵，显示每个文件中每个基因的存在。ccc=c("HERC1")我需要生成另一个表，其中，对于每对基因</
浏览 0提问于2019-05-17得票数 1
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我是一名生物系的学生，在我们的实验室里，我们正在用老鼠来测试某种药物。在正常状态下，我们有许多组生物复制的基因表达数据：gene replicate 1 replicate2 gene10.724579 gene6 -0.815476 -0.737112 .... gene 20000 我的问题是，我如何将那些真正受影响的基因与那
浏览 2提问于2017-05-15得票数 1
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注意:如果我的语言是以生物学为导向的，我很抱歉。我是生物学家。我想做的是用另一个基因学家做这些基因的子集。有没有办法，在excel中，只过滤掉我想要的基因，这样我就可以导出它们的价值？
所以我想要做的是通过一个小得多的基因学家过滤大量的基因及其表达价值。输出将是一幅类似于上面的图像，只有少得多的基因( pic
浏览 5提问于2014-05-04得票数 0
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筛选表以只保留非冗余组。
、、、、
1 正如所预期的那样，在处理生物实体群体时，这些实体有许多相互关联的方式:基因11、25和33构成一个群体，它们的关系也可以被描述为较小的群体，描述成一对关系。因此，是重要的：group_2、group_5和group_8是与生物相关的基因群，而事先并不知道是相关的组<code>E 210</code&
浏览 0提问于2019-08-13得票数 1
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我正在对word2vec进行生物医学方面的培训。为了执行单词相似性和词类比测试，我希望有一对具有相同关系的生物医学术语(可能是任何关系)，就像我们在word2vec中有一个完整的城市州数据列表一样。那么，在哪里可以找到与药物基因或蛋白质作用等相关的清单呢？或者我怎么才能挖掘这些数据。请建议公开提供这类数据集。此外，请提出任何其他有趣的关系，我也可以查询。另一种方法是使用可用的本体论，因为它们包括概念之间的关系，如有部分、有向、有原因、有症状等。我能用本体论来提取这样的对
浏览 3提问于2016-06-21得票数 1
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它代表了生物样品中基因表达的测量。问题是，有时测量直接在基因上(“探针”然后为空)，有时测量是通过基因的“探针”进行的(“基因”仍然是设置的)。一个基因可以有多个探针。没有其他表格包含基因-探针关系。"probe" INTEGER REFERENCES "probes" ON DELETE CASCADE,);
常见的查询包括获取给定样本中所有
浏览 2提问于2020-05-09得票数 0
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我正在将一个neo4j数据库迁移到Grakn中，用于基因组学和生物数据，我在CSV中有这方面的文件，但我需要一个ETL工具来以最简单的方式解决这个问题。neo4j中的边映射到Grakn中的关系吗？
标签映射到属性吗？
浏览 0提问于2019-02-19得票数 3
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我有一个由三行组成的矩阵:基因1，基因2，距离。我如何在不使用生物信息学或神经网络工具箱的情况下做到这一点？
浏览 1提问于2014-07-15得票数 1
我试图找到一种方法来读取列表列表中的项目，在一组三项中，并找到由3项(密码子)组成的组合来确定片段的开头，并找到另一种组合来查找片段的末尾(停止密码子)。清单1: XXXXX-开始-兴趣片段-停止-XXXXXXX这是一个更具体的例子：停止密码子:标记gene_2= 'GGCCATGAGTAACGCATAGGGCCC
gene_3=GGGCCCATGACGTACTAGGGGCCCATGC
浏览 3提问于2020-07-31得票数 0
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好的，我有一项任务是编写代码(使用Java，但我不认为这很重要)一个模拟/继承模型，就像生物学意义上的那样，而不是OOP，你知道，父亲有棕色的眼睛/头发，妈妈有黑色的眼睛/头发等等。第二，是否有任何现有的模拟生物遗传(无论有没有源代码)？它将给我一个确切的想法，我应该做什么，如果来源是可用的，它可能会证明非常有用。 Q-1你到底是如何编程图形模拟的？和
Q-2在互联网上是否存在生物遗传的模拟？
浏览 3提问于2011-12-17得票数 1
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我有一个服务器，有很多进程使用TCP进行进程间通信(微服务体系结构)。是否有一个免费/开放源代码的脚本或工具，可以构建一个显示进程和通信路径的网络图？
我知道这样的图表可能是不完整的，因为netstat只捕捉某个时间点，但在这种情况下这是可以接受的。根访问在已使用的服务器上可用。
浏览 0提问于2022-09-23得票数 0
有没有什么方法可以自动将长基因名称列表(如Cadherin_3453)转换为其缩写(如CDHRN_3453 )？在基因组学、生物信息学中有缩写命名惯例吗？
对不起，这里没有代码
浏览 3提问于2013-09-05得票数 0
我正在尝试找出如何使用ode23来做这件事。我有一个函数： fA = inAFrequency; wAa = inFitness_Aa; res = (fA*(1-fA)*(fA*(wAa - wAA) + (1-fA)*(waa - wAa)))/(fA*fA*wAA + 2*fA*(1-fA)*wAa
浏览 2提问于2013-03-10得票数 0
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我在玩进化模拟，所以我创造了大量的生物，每个生物都有自己的基因。正如你可以想象的那样，能够改变基因并创造出新的生物是很重要的。我将每个生物的基因保存在字典中，每个基因都是字典中的一个列表(字典中可能有更多的列表)。
当试图对基因进行突变时，问题就出现了。如果我不复制基因字典，字典的任何变化都会导致所有其他生物也发生类似的变化。(这并不是什么大问题，但我很想知道其中的原因。字典和类不能很好地结合在一起
浏览 1提问于2017-11-27得票数 0
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我有一个描述基因的生物数据集。总体的想法是，有成千上万的这些基因需要分类，所以如果ML能够对它们进行排序，我就可以知道哪些基因应该首先进入实验室进行功能研究。目前，我根据这些基因的已知生物学为这些基因制作有监督的分类标签(例如，一些基因与与疾病相关的药物相互作用，因此我将它们贴上“最有可能引起疾病的可能性”的标签，直到我有最后第四个标签“不太可能引起疾病”为止它甚至还可能使用无人监督的学习来创建标签本身，还是这也是不可靠的，因为你不知道它为什么要将某些
浏览 0提问于2020-05-22得票数 1
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