Esc退出进入命令模式 ： #进入行末模式 Esc退出进入命令模式 wq #在行末模式下，输入wq（退出保存） vimtutor zh_CN#查看中文帮助文档 3 生信常见格式...#当前目录/上一层目录 ~ #家目录 '' & "" #在linux中有不同的含义 $ #使用变量前导符。..._64.sh #生信技能树安装包软链接地址 cd ~ ln -s /home/t_linux/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ./ #安装 输入yes或者enter...info -e conda env list # 每次运行前，激活创建的小环境rna conda activate rna # 退出小环境 conda deactivate 在小环境rna中安装生信软件..._64.zip ln -s /teach/software/hisat2-2.2.1-Linux_x86_64.zip ./ unzip hisat2-2.2.1-Linux_x86_64.zip
::opts_chunk$set(echo = TRUE,message=F,warning=F) R Markdown head(iris) plot(iris$Sepal.Length) 引用自生信技能树
Termius服务器登陆输入登录命令 ssh 用户名@IP地址Linux输入密码时没有任何显示：不用担心，是保密措施，输完按回车即可网络异常：重新登陆退出登录：exit修改复制粘贴的快捷方式：设置-Terminal...\e[32;1m\]$ \[\e[0m\]"' >> ~/.bashrcsource ~/.bashrc文件传输左侧选择SFTP左边是本地文件夹，右边是服务器上传：把左边文件拖到右边下载：右边拖左边Linux.../home 用户主目录的基点，比如用户user的主目录就是/home/user，可以用~user表示命令格式Linux中最遥远的距离，是你在空格前面，我在空格后面。多个空格等于一个空格。...引用自生信技能树
x1 = read.csv("C:/Users/win10/Desktop/x.csv")
[]中括号里面的可以是逻辑值判断，可以是具体的值（即下标），可以是函数，可以是向量
后起之秀奔涌而至，欢迎大家在《生信技能树》的舞台分享自己的心得体会！...ssGSEA GSEA分析，jimmy老师在《生信技能树》公众号多次讲解： GSEA分析一文就够（单机版+R语言版） GSEA的统计学原理试讲 GSVA或者GSEA各种算法都是可以自定义基因集的 但实际上
#10.把前面读取的样本信息表格的样本名字根据下划线分割看第3列元素的统计情况。第三列代表该样本所在的plate#plate指384孔PCR板，编号分别是48号...
2.在R包homologene里有张基因对应表 同时已经有可以转换的代码可用 homologene(genes, inTax, outTax) genes...
---title: "生信技能树学习笔记"引用自生信技能树author: "天空"date: "2023-01-02"output: html_document---一、文件读写1.
arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小 desc()
（参考B站生信小技巧获取runinfo table） SraRunTable <- read.table("http://www.bio-info-trainee.com/tmp/5years/SraRunTable.txt
如果代码可以运行但是不出图，可能是因为画板被占用，可以多次dev.off()关闭画板
---title: "生信技能树学习笔记"引用自生信技能树author: "天空"date: "2023-01-02"output: html_document---一、函数和R包1.
因为是癌症方面，自己不研究这一方面，所以不常用，但是GEO的转录组数据，是根据这个文件改写的
---title: "生信技能树学习笔记"引用自生信技能树author: "天空"date: "2023-01-02"output: html_document---一、数据框、矩阵和列表1.
---title: "生信技能树学习笔记"author: "天空"date: "2023-01-04"output: html_document---R语言综合应用1....[17] "test2.Rdata" ## [18] "\u0094\u009f信\u008a\u0080\u0083\u0091\u0094记day7.html" ## [19] "\u0094\u009f信
ggpubr http://www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/
数据包： ALL, CLL, pasilla, airway 软件包：limma，DESeq2，clusterProfiler 工具包：reshape2 ...
x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #是list 所以用[[]]
unexpected，一般是代码有误some tips1 Tab-打出前几个字母即出现提示，按↑↓翻动，按Tab补全2 光标放在>后面，按↑键，即可修改上一条命令，按回车重新运行图片图片（格式重于内容）引用自生信技能树
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