在Salesforce中，未在Visualforce页面中显示的HTML元素在呈现为PDF时，可能是由于以下原因：

1. Visualforce页面的渲染机制：Visualforce是Salesforce的一种开发框架，用于构建自定义的Web页面。在Visualforce页面中，只有通过标签或组件显示的内容才会被渲染和呈现。如果某些HTML元素没有在Visualforce页面中显示，那么在生成PDF时也不会被包含在其中。
2. PDF生成过程中的样式处理：在将Visualforce页面转换为PDF时，Salesforce会应用一些默认的样式和布局规则。这些规则可能会导致某些HTML元素在PDF中不可见或呈现不正确。例如，某些CSS样式可能不被支持或被修改，导致元素的位置、大小或颜色发生变化。

为了解决这个问题，可以考虑以下方法：

1. 使用可见的HTML元素：确保需要在PDF中显示的HTML元素在Visualforce页面中是可见的，可以通过合适的标签或组件进行显示。例如，使用<apex:outputText>标签来显示文本内容，使用<apex:outputField>标签来显示字段值。
2. 调整样式和布局：如果某些HTML元素在PDF中呈现不正确，可以尝试调整其样式和布局。可以使用内联样式或外部CSS文件来定义元素的样式，并确保这些样式在PDF生成过程中能够正确应用。
3. 使用PDF生成工具：Salesforce提供了一些用于生成PDF的工具和功能，例如<apex:page renderAs="pdf">标签和getContentAsPDF()方法。这些工具可以帮助您更好地控制PDF的生成过程，并确保HTML元素正确地呈现在PDF中。

总结起来，要在Salesforce中将未在Visualforce页面中显示的HTML元素呈现为PDF，需要确保这些元素在页面中可见，并根据需要调整样式和布局。同时，可以利用Salesforce提供的PDF生成工具来更好地控制PDF的生成过程。