我想在Jupyter环境中使用RDKit。然而，在我遵循了this document中概述的过程之后。 在完成这个过程之后，包括获取jupyter的内核，我尝试访问RDKit并使用它。并使用它进行测试。现在，我尝试通过iPython访问它： (rdkit-test) [user] ~ $ ipython
Python 3.8.7 (v3.8.7:6503f05dd
浏览 52提问于2020-12-25得票数 0
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我只是简单地从rdkit (https://www.rdkit.org/docs/GettingStartedInPython.html#generating-images-of-fingerprint-bitsfrom rdkit import Chem from rdkit.Chem import Draw
mol = Chem.MolFromSmiles在进阶阶段非常感谢。 我现
浏览 121提问于2019-02-25得票数 0
我正在尝试使用包RDkit，我用conda安装了它，并使用文档命令：activate my-rdkit-env提示告诉我它正在使用新的env，然后我从这个提示启动jupyter笔记本，但是我不能导入rdkit，它似乎在使用常规的env。另外，由于某些原因，安装conda后，cmd或</
浏览 3提问于2017-06-17得票数 0
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Hello1我试着用rdkit pack在Jupyter Notebook，"import IPython.core.interactiveshell“和"import InteractiveShell”，以及"from rdkit.Chem.Draw import DrawingOptions“packs中完成显示分子原子数的工作，然后我使用"DrawingOptions.includeAtomNumbers
浏览 8提问于2018-11-15得票数 2
我正在尝试让模块与ipython3 (我已经安装了它)一起工作。RDKit是作为Python3的一部分包含在RDKit中的，所以第一步就是安装imolecule。我使用了以下命令：在RDKit文档的2.2节中找到了。当我在Python2中执行'import rdkit</
浏览 1提问于2016-02-08得票数 1
RDKit是一个用于化学的Python库。我不想使用Anaconda发行版，我也不确定(从文档： )是否有一种没有它的使用包的方法。有人能给我一些关于在没有conda或安装Anaconda发行版的情况下安装和使用它的提示吗？
浏览 7提问于2022-06-04得票数 0
我一直在通过jupyter笔记本使用VS代码。所以，我必须生成由15个分子组成的网格图像，并将其保存到我的计算机上，但我一直使用的脚本没有显示任何错误，但仍然没有生成任何图像，也没有将它们保存到我的计算机指定的文件中，即使电池气体已经成功执行。from rdkit import Chemfrom rdkit.Chem.Draw import MolsToGridImage
from rd
浏览 0提问于2021-02-24得票数 0
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我通过/usr/local/opt/python/bin/python2.7 -m pip install jupyter安装了jupyterTraceback (most recent call last):
File "/usr/local/bin/jupyter-notebookimport
浏览 0提问于2016-03-23得票数 4
我对如何安装rdkit和deepchem感到困惑。在这里，我列出了我遇到的问题，并感谢你的帮助。$ conda create -n rdkit -c rmg rdkit在从终端窗口调用时，我确保成功地安装了rdkit，因为我获得了正确的版本：
>>>
浏览 0提问于2018-08-04得票数 1
当我在Jupyter Lab中启动一个运行在GCP AI平台Notebook上的笔记本时，它无法识别一个软件包，尽管它已经安装了它。我已经使用conda安装了这个包(RDKit)，当我运行在终端中不存在问题。然而，当我打开我的笔记本并尝试同一行代码时，我得到一个错误，告诉我它找不到模块。
浏览 1提问于2019-07-11得票数 1
time conda install -q -y -c conda-forge rdkit
sys.path.append('/usr/local/lib/python3.7/site-packages/') 在这段代码中，为什么我们必须在安装rdkit之后添加路径？
浏览 33提问于2021-01-17得票数 1
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我对jupyter/ipython很陌生。我通常在远程机器上启动笔记本并创建一个ssh隧道。以下是这方面的截图：[NotebookApp] Serving notebooks fromlocal directory: /x/y/z[NotebookApp] The Jupyter Notebook is runn
浏览 6提问于2016-03-24得票数 2
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我已经在我的Debian 9.1.064位Linux平台上安装了Spyder3.2.1当前版本的Miniconda3。Spyder表现不错，但我在安装RDKit时遇到了困难。我遵循RDKit_Docs_current.pdf的指示
使用这些包创建一个安装了RDKit的新conda环境需要一个类似于以下命令的命令：
$ conda create-c rdkit -n my-rdkit
浏览 11提问于2017-08-16得票数 4
Traceback (most recent call last):from jupyter_core.utils
浏览 4提问于2018-01-21得票数 30
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由于数据处理的需要，我想在Ipython笔记本中等待当前循环运行期间的一组任务的结果。在Ipython notebook中，默认情况下运行事件循环。无论何时运行下面的代码，您都会得到Trueloop = asyncio.get_event_loop()而且您不能关闭当前循环，因为笔记本正在使用它我还有一些任务要在Ipython notebook中完成。但是我不能在不关闭当前循环的情况下创建新的循环。我
浏览 4提问于2018-08-17得票数 2
我有以下代码：from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsolefrom IPython.display import SVG
m = Chem.MolFromSmiles('c1cc代码可以在我的中进行测试。
浏览 3提问于2021-10-27得票数 1
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我正在测试一个python程序，其中包含对IPython的调用。但是我在下面的代码中得到了错误：我在"%“符号处遇到语法错误。我使用以下命令找到了这个问题的解决方案：get_ipython().run_line_magic('matplotlib', 'inline')AttributeError
浏览 0提问于2016-12-25得票数 3
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我需要安装2019年之前发布的rdkit库的一个版本，当时对Python 2的支持被删除了。这是使用这个库所必需的：我得到以下错误：
命令python setup.py egg_info: Traceback (最近一次调用)：IOError中的“文件”：IOError: Errno 2中没有这样的文件或目录：
浏览 3提问于2019-08-17得票数 0
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在Anaconda3中使用rdkit 2017.09.1和Python3.6、3.7或3.8、木星笔记本和/或Python提示符，在Windows8专业人员的2台e7 64计算机中，我正在寻找一个简单的import MolDraw2DCairo # cannot import from IPython.displa
浏览 16提问于2021-01-21得票数 0
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在ipython qtconsole中，当我键入左括号时，它会自动显示函数的文档。例如，当我输入当我键入以下内容时，将显示pyplot.show的文档该文档显示在一个弹出窗口中，该窗口通常会阻止我的视图显示我键入的内容。是否有阻止ipython qtconsole执行此操作的配置？
浏览 1提问于2014-05-23得票数 1
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