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    【连载】癌症中的嵌合RNA (Chimeric RNA) :嵌合核糖核酸的形成机制

    如上所述,标准嵌合RNA是已知的融合基因产物;非标准嵌合RNAs是通过两种已知机制(反式剪接和顺式SAGe)的基因间剪接产生的基因产物。反式剪接首次在低等真核生物如锥虫或线虫中被发现,他们具有一种特殊的反式剪接机制,称为SL-反式剪接[78,79]。在这些生物中,一个短的非编码前导序列(称为SL)连接到嵌合转录物的5’端(上游) [80],进一步促进剪接的募集[81]。SL-反式剪接还具有其他重要的生物学功能。例如,在锥虫中S1序列作为5’端的帽子保护新形成的转录物[82]。然而在高等真核生物中没有发现SL-反式剪接序列。最近在高等真核生物(即人类)体内发现了非SL-反式剪接机制的存在。该机制可能与细胞中的转录和剪接机制[83],亲本基因序列特异性[9],以及3D空间中前mRNA分子的3D结构形成[83,84]有关。还有假设认为反式拼接嵌合转录物可能促进基因组相互作用并导致染色体易位[85]。

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    【陆勤践行】奇异值分解 - 最清晰易懂的svd 科普

    在这篇文章中,我们以几何的视角去观察矩阵奇异值分解的过程,并且列举一些奇异值分解的应用。 介绍 矩阵奇异值分解是本科数学课程中的必学部分,但往往被大家忽略。这个分解除了很直观,更重要的是非常具有实用价值。譬如,Netflix(在线电影租赁公司)对能够提高其电影推荐系统准确率10%的人提供100万美元的丰厚奖金。令人惊奇的是,这个看似简单的问题却非常具有挑战性,相关的团队正在使用非常复杂的技术解决之,而这些技术的本质都是奇异值分解。 奇异值分解简单来讲,就是以一种方便快捷的方式将我们感兴趣的矩阵分解成更简单且

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    生化小课 | 蛋白质的四级结构范围从简单的二聚体到大的复合物(含蛋白质三级和四级结构 小结)

    许多蛋白质具有多个多肽亚基(从两个到数百个)。多肽链的结合可以发挥多种功能。许多多亚基蛋白具有调节作用;小分子的结合可能会影响亚基之间的相互作用,导致蛋白质活性的巨大变化,以响应底物或调节分子浓度的微小变化。在其他情况下,单独的亚基承担单独但相关的功能,例如催化和调节。一些关联,例如在本章前面讨论的纤维蛋白和病毒外壳蛋白中看到的关联,主要发挥结构作用。一些非常大的蛋白质组装体是复杂的多步骤反应的场所。例如,每个核糖体(即蛋白质合成位点)都包含数十个蛋白质亚基以及 RNA 分子。

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