今天跟大家分享的是ggplot图表中的一类重要元素——线条。...R语言中ggplot函数系统中涉及到线条的地方有很多,最常见的场景就是我们做geom_line()(折线图)、geom_path()(路径图),以及图表的绘图区(panel)、图表区、网格系统(grid...今天以一个折线图为例,简要说明ggplot函数中关于线条的主要参数及其效果。...以上依次使用的线条粗度值为1,2,3,4,5,6,大家可以通过图表感受到ggplot图表中线条的粗度变化规律。...除了折线图(以及路径图,等图层中的线条之外),在theme系统中存在大量的关于线条的属性设置(网格系统、图表边框、轴线、图例系统),均可以参照以上参数进行设置。
尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式,以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行,不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象(例如,在一个plot()-风格的函数中)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法,但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的...如果没有,则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中,而该字节码可能与安装的ggplot2不一致!
有读者询问如何对散点图拟合非线性的曲线。实际上我们通常看到的无论是直线拟合还是各种曲线拟合都属于广义线性模型。 这里我们构造一组数据来看看如何使用 ggplot2 来拟合数据。...geom_point() p 我们先直接利用 geom_smooth() 对散点进行平滑拟合,默认使用的是 loess 方法。...,我们可以通过 R 支持的公式来设定如何拟合散点。...,然后使用线条添加在图上也是可以的。...https://stackoverflow.com/questions/37494969/ggplot2-add-regression-equations-and-r2-and-adjust-their-positions-on-plot
在ggplot2语法中,我们说它们使用不同的geom。 geom是绘图用于表示数据的几何对象。 人们经常根据情节使用的几何类型来描绘情节。...这里,4代表四轮驱动,f代表前轮驱动,r代表后轮驱动。 如果这听起来很奇怪,我们可以通过在原始数据上叠加线条然后根据drv着色所有内容来使其更清晰。 请注意,此图包含同一图表中的两个geom!...获得全面概述的最佳方法是ggplot2备忘单,您可以在http://rstudio.com/cheatsheets找到它。要了解有关任何单个geom的更多信息,请使用help:?...image.png 如果将映射放在geom函数中,ggplot2会将它们视为图层的本地映射。 它将使用这些映射来仅扩展或覆盖该层的全局映射。 这使得可以在不同层中显示不同的aesthetics。...您可以使用相同的想法为每个图层指定不同的数据。 在这里,我们的平滑线仅显示mpg数据集的子集,即小型汽车。 geom_smooth()中的本地数据参数仅覆盖该层的ggplot()中的全局数据参数。
16.2.4 图形参数 在lattice图形中,lattice函数默认的图形参数包含在一个很大的列表对象中,你可通过trellis.par.get()函数来获取,并用trellis.par.set()函数来修改...在lattice图形中你还可以改变面板的顺序。高级绘图函数的index.cond =选项可以设定条件变量水平的顺序。...它弥补了R中创建图形缺乏一致 性的缺点,使得用户可以创建有创新性的、新颖的图形类型。ggplot2中最简单的绘图方式是利用qplot()函数,即快速绘图函数。... 按住Ctrl键不动,将鼠标移动到某幅图形中点、条、箱线图或线上,该对象的详细信息将会在一个弹出窗口中显示出来。 右击任何对象,便可在右键菜单中获得一些选项。... 拖动鼠标可选择不止一个对象(点、条等),或使用Shift键通过单击选择不邻接的对象。 你可尝试在柱状图(gears)窗口选择三号和五号齿轮条。
ggplot2 初探 在ggplot2中,图是采用串联起来(+)号函数创建的。每个函数修改属于自己的部分。...在上述例子中,geom_point()函数在图形中画点,创建了一个散点图。labs()函数是可选的,可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数,并且大多数包含可选的参数。...分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意,ggplot2包在定义组或面时使用因子。 这里我们使用mtcars数据集查看分组和面,并进行绘图。...分组 在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...在ggplot2中标尺的概念很普遍,可以通过查看以scale_开头的函数来了解更多信息。 主题 主题可以让我们控制这些图的整体外观。
这里涉及到三个设计线条的特殊图层函数: geom_smooth()、geom_path()、geom_line() 下面分别讲解: 关于geom_smooth():平滑曲线 ggplot(mpg,aes...平滑曲线专门用于对于散点图趋势的拟合,geom_smooth函数内部有默认的拟合规则(根据统计统计算法计算出的拟合规则,而非实际的点)。...method中的类型常见的有lm\glm\gam\loess\rlm等,当数据集记录小于1000时,method的默认参数即为loess,大于1000时则为gam。...折线图:geom_line() 以上是直线图的图层函数;它与路径图的唯一区别就是,在连接各点之前,会按照x轴数据对总体升序排列,所以最终的连线是非常清晰的顺序折线,不会存在交叉。...默认的折线线条位置参数应该position=identity,我们也可以尝试使用其他几个参数 ggplot(iris,aes(Sepal.Length,Sepal.Width,colour=Species
那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...彩虹图(在连续的x值上表示y的范围,例如Tufte著名的拿破仑远征图) geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑的条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text...stat_smooth 添加平滑曲线 stat_spoke 绘制有方向的数据点(由x和y指定位置,angle指定角度) stat_sum 绘制不重复的取值之和(通常用在三点图上) stat_summary...coord_map 地图投影 coord_polar 极坐标投影 coord_trans 变换笛卡儿坐标 分面函数 描述 facet_grid 将分面放置在二维网格中 facet_wrap 将一维的分面按二维排列...中重要的图层控制对象,因为它负责图形渲染的类型。
,以便以后能够在绘图上区分它们。...还计算了最小和最大集数,以便能够绘制每个季节的水平段。由于我们将之前的绘图保存为 ggplot2 对象,因此添加线条只需要对额外的图形元素进行编码并将其添加到保存的元素之上。 # 计算季平均值。...go_eme(daa = eas, as( xmin, max, = mean, en= man)) ---- 01 02 03 04 变化点检测算法 如果您的目标是找到系列中的突然变化...gem_segnt(dat = eg) 平滑算法:LOESS(局部加权回归)和三次样条 现在让我们平滑这个系列。基本图都将使用相同的数据,我们将在其上叠加一条通过不同方法计算的趋势线。...更复杂的平滑方法使用 splines 。它仅用于最后一个图中。
默认的nstart是1,推荐使用较大的值,以获得一个稳定的结果。比如可以使用25或者50。...iris.kmeans$cluster存储的是每个样本被归为哪一类iris.kmeans$size存储的是每一个大类有多少个样本 使用散点图展示结果,借助factoextra包中的fviz_cluster...他提到可以使用 cluster$tot.withinss这个参数,选择出现平滑变化的那个点,他起的名字是 elbow method,英文解释是 This method uses within-group...image.png 从图上看划分成7类有点多了 https://www.datanovia.com/en/lessons/k-means-clustering-in-r-algorith-and-practical-examples...从图上看4到5变得平滑了,选择4试一下 usa.kmeans<-kmeans(df,centers=4,nstart = 25) fviz_cluster(object=usa.kmeans,df,
然而问题来了,以上图形仅仅基于同一个图层进行维度分面,倘若我有如下需求,不仅要对地图进行分面,而且要在单个区域地图上呈现一些点信息、线条的信息,这就意味着我们需要在保持分面的基础上,叠加图层,那么我们给分面函数指定的分面规则是否能够作用于第二个图层呢...带着以下疑问,我们先尝试着在原始分面图层的基础上叠加一个散点图层。...实际上以上结果并不难解释,因为我们在分面参数设定是,参数设置的依据是第一个图层的数据源中的NAME_1字段,但是我们并没有保证第二个图层中有这个同属性,同名称的字段。...接下来我将图层二中的省份名称变量更改为更图层一中名称相同,再看下结果: mydata%rename(NAME_1=Province) ggplot() + geom_polygon(...这下效果一目了然,分面函数很顺利的识别了通过设定的分面依据字段NAME_1,在图层一、图层二中均探测到了同名字段,而且字段结构类别均一致,分面操作成功。
并且,无论你喜欢在R或Python,都有快速和简单的方法把你的数据展现在地图上。...最终的成果清楚地描述了美国哪些州每天吸烟人数最多。 美国的吸烟者和非吸烟者在地图上的分布。...这里,还有一些更好的资源用于使用地图、mapsdata和ggplot2: 在R中绘制地图 http://eriqande.github.io/rep-res-web/lectures/making-maps-with-R.html...使用ggplot2软件包在R中绘制地图 http://zevross.com/blog/2014/07/16/mapping-in-r-using-the-ggplot2-package/ 请注意,你目前无法在内核中使用...://plot.ly/python/scatter-plots-on-maps/ 气泡图 https://plot.ly/python/bubble-maps/ 地图上的线条 https://plot.ly
1 什么是ggplot2 ggplot2是用于绘图的R语言扩展包,其理念根植于《Grammar of Graphics》一书。它将绘图视为一种映射,即从数学空间映射到图形元素空间。...该绘图包的特点在于并不去定义具体的图形(如直方图,散点图),而是定义各种底层组件(如线条、方块)来合成复杂的图形,这使它能以非常简洁的函数构建各类图形,而且默认条件下的绘图品质就能达到出版要求。...2 与lattice包的比较 ggplot2和lattice都属于高级的格点绘图包,初学R语言的朋友可能会在二者选择上有所疑惑。...然后使用+号添加了两个新的图层,第二层是加上了散点,第三层是加上了loess平滑曲线。...上图是对几种不同汽缸的数据分别平滑,如果需要对整体数据进行平滑,可将colour参数设置在散点图层内而非第一层,这样第三层的平滑图形就不会受到colour参数的影响。
4.6 ggplot2程序包 ggplot2是R中用于绘图的高级程序包,它将绘图视为一种映射—数学空问到图形元索空间的映射,例如将不同的数值映射为不同的颜色或其他图形属性。...ggplot2在画图时就是采用了类似photoshop的图层设计方式,允许用户一步步构建图形,并且便于图层的修改。...=clarity))#定义的第一图层存储于p中 (2)几何对象 基本图层确定了数据源和映射后,通过加号(+)就可以不断地添加新图层.第二图层添加几何对象类的函数,在图中绘制图形元素其他类型的图形,如直方图...例如用stat_smooth对数据作loess平滑,在carat-price散点图上添加非线性回归线。...”) 生成文件后,默认在后台扫一开,所以查看图形文件前需要用dev.off()关闭文件 此外,程序包ggplot2中的函数ggsave()也用于保存图形,并且可以指定为不同的文件类型。
今天跟大家分享ggplot图表系统中形状。 在ggplot函数系统中,形状是一类重要的映射属性,如同颜色一样,它可以被赋予给变量,当然也可以直接指定实际的形状类别。...ggplot函数的图层理念中,修改局部图层的元素,需要在局部图层内进行设定,这里需要在geom_point()函数内部进行形状设定。 R绘图系统中存储着的形状符号多达25种: ?...至于形状的大小,你可以根据自己的需要和喜好自由调整,就像调整线条的size一样。...作用于单个图层的映射属性要放在对应图层中,(比如作用于线条的属性要放在geom_line()内,作用于形状的属性要放在geom_point()内),作用于全局的属性要放在全局系统函数层内【ggplot(...(比如本例中同时作用于折线图和散点图的数据集、x轴y轴变量以及分组变量等) 以上是个人学习ggplot函数过程中所获得的一些体会和心得,希望能够帮助大家在学习R语言可视化过程中少走一些弯路,限于个人能力和水平
二分类变量的最佳截点直接使用pROC包就可以直接得到,前面也介绍过,今天主要说一下生存资料ROC曲线的最佳截点,以及生存资料的ROC曲线如何变得平滑。...平滑曲线 加载R包和数据 多个时间点ROC 画平滑曲线 找最佳截点 平滑曲线 不考虑时间因素的ROC曲线可以使用pROC包中的smooth参数实现平滑版的曲线。...time dependent ROC目前还没发现比较好的方法可以直接实现,只能使用ggplot2曲线救国了。...下面是画图代码,平滑曲线,说简单确实简单,如果对ggplot2不熟悉,确实也很难想到: library(ggplot2) p <- ggplot(df_plot, aes(fpr, tpr, color...找最佳截点 找了好久也没发现一个R包可以完成time-dependent ROC的所有分析,timeROC是比较全能的了,但是不能计算最佳截点,survavalROC可以计算最佳截点,但是又不能同时计算多个时间点的
坐标:将对象的位置映射到绘图平面上。位置通常由两个坐标(x,y)指定,但可以是任意数量的坐标。此外,坐标变换发生在统计变换之后 面处理:在更一般的情节中称为条件图或网格图。...然而,图形语法的翻译在ggplot2中没有对应关系(它的作用是由内置的R功能发挥的)。...在ggplot2中,层负责创建我们在绘图上感知到的对象。层由四个部分组成:数据和几何映射、统计变换(STAT)、几何对象(GEOM)和位置调整(Wickham 2010)。一个图可能有多个图层。...因为即使我们使用了许多缺省值,ggplot2的显式语法语法也相当冗长,这使得快速尝试不同的绘图变得困难。它还模仿plot()函数的语法,使ggplot2对于熟悉Base R图形的用户更容易使用。...4.3.3.3 使用坐标系统来调节和限制X轴和Y轴 坐标系的用途是在计算机屏幕上调整从坐标到二维平面的映射。在ggplot2中可用的不同坐标系中,笛卡尔坐标系和极坐标系是最常用的坐标系。
那么,我们应该如何在图上找到我国呢,嗯,不如把人口数据也填进来。 下面是包含人口数据的气泡图,气泡的大小都和样本中人口的数目成正比。...… 通过对前几个样例的观察,我们发现一个规律,人均GDP较高的国家预期寿命普遍也比较高,下面我们就可以利用ggplot2提供的平滑曲线来展示这个趋势。...然后我们继续观察年份与寿命的关系,通常我们可以猜测,随时间推移,人的寿命是可以续一波的(例如改变了中国的他),所以我们尝试在图中将这种趋势展现。...…虽然大致可以观察到lifeExp较大的样本颜色也较浅(年份更靠后)。...此外我们同样观察到两个特殊的点,图一中1962年的数据点(连线上的第三个点),和图二中1992年的数据点。1962前后年的中国,我们都知道发生了什么。那么,1992年前后的世界,又发生了什么呢?
当数据集很大的时候,散点图上的数据会互相重叠,此时,很难在图上清晰的显示所有的数据点。通常,我们会先对数据进行汇总给,然后再绘制散点图。这里也会介绍一些数据汇总的操作。...#在heightweight中增加一列用来表示儿童的体重是否超过100磅 hw % mutate(weightgroup=ifelse(weightLb<100...("text", x = 16.5, y = 52, label = "<em>r</em>^2==0.42",parse=T)#这里是数学公式 *ggplot中的文本不能直接以表达式对象作为输入,其参数通常是字符串...核密度曲线是基于样本数据对总体分布做出的一个估计,曲线的平滑程度取决于带宽核函数的带宽,带宽越大 #曲线越平滑。...传递一个指定x和y带宽的向量到h,这个参数会被传递给实际生成密度估计的函数kde2d().在本例中,我们将在x,y轴方向上生成一个更小的带宽,以使密度估计对数据的拟合程度更高。
1.初识 ggplot2 包 ggplot2 包提供了一套基于图层语法的绘图系统,它弥补了 R 基础绘图系统里的函数缺乏一致性的缺点,将 R 的绘图功能提升到了一个全新的境界。...如果只想显示一条平滑线,就需要在 geom_point( )函数中单独设置颜色的映射,结果如下图所示。...接下来我们将探索用 ggplot2 包绘制常用统计图形的方法。 2.分布的特征 在探索数据的过程中,最基本的手段就是观察单个变量的取值情况。对于连续型变量,可以绘制直方图或密度曲线图。...ggpubr 包提供了在平行箱线图上添加组间比较的统计学差异的功能。该包是一个 ggplot2 的衍生包,可以生成用于论文发表的统计图形,值得医学研究工作者探索。...在 R 的应用中,可视化是一个非常活跃的领域,新的包层出不穷。网站 The R Graph Gallery 收集了各种新颖的图形以及相应的示例代码,值得对可视化感兴趣的读者关注。
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