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wget细节(geo数据 ,figshare数据

前面在学徒抽丝剥茧想搞清楚这个转录组数据问题出在哪里提到了(CNGBdb)数据下载问题,有小伙伴表示wget讲解的不过瘾,所以我们增加了一点内容,主要是关于GEO数据库以及figshare上面的单细胞表达量矩阵的下载...数据在CNGBdb,https://db.cngb.org/search/project/CNP0002454/ 查了一下批量下载的教程,发现一般是用Aspera下载 Aspera批量下载:http:/...---- geo数据,注意观察规律,比如;GSE136831 如果是在浏览器下载,文件很大,很容易断线,没办法断点续传,而且浏览器通常是下载到个人电脑,但是我们处理单细胞一般来说都是在服务器,还得从个人电脑上次到服务器...所以可以看到我8年前的教程,推文在: 解读GEO数据存放规律及下载,一文就够 解读SRA数据库规律一文就够 从GEO数据库下载得到表达矩阵 一文就够 遇到了单细胞表达量矩阵在GEO数据库,就可以使用下面的命令...文末友情宣传 强烈建议你推荐给身边的博士后以及年轻生物学PI,多一点数据认知,让他们的科研上一个台阶: 生物信息学马拉松授课(买一得五) ,你的生物信息学入门课 144线程640Gb内存服务器共享一年仍然是仅需

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    程序】网络数据请求

    程序中网络数据请求的限制 2. 配置 request 合法域名 3. 发起 GET 请求 4. 发起 POST 请求 5. 在页面刚加载时请求数据  5....程序中网络数据请求的限制 出于安全性方面的考虑,程序官方对数据接口的请求做出了如下两个限制: 只能请求 HTTPS 类型的接口 必须将接口的域名添加到信任列表中 2....发起 GET 请求 调用微信程序提供的 wx.request() 方法,可以发起 GET 数据请求,示例代码如下: 4....发起 POST 请求 调用微信程序提供的 wx.request() 方法,可以发起 POST 数据请求,示例代码如下: 5....Ajax 技术的核心是依赖于浏览器中的 XMLHttpRequest 这 个对象,由于程序的宿主环境是微信客户端,所以程序中不能叫做“发起 Ajax 请求”,而是叫 做“发起网络数据请求”。

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    数据科学技巧3:数据透视表

    这是我的第78篇原创文章,关于Python语言和数据科学。 阅读完本文,你可以知道: 1 使用Python语言实现数据透视表功能 “正是问题激发我们去学习,去实践,去观察。”...数据透视表是Excel里面常用的分析方法和工具,通过行选择,指定需要分组指标;通过列选择,指定需要计算指标,最后在指定需要聚合计算类型,比方说是计数,还是求均值,还是累加和等等。...第三个数据科学技巧:数据透视表。前面的数据科学技巧,可以点击下面链接进入。...数据科学技巧系列 1数据科学技巧1:pandas库apply函数 2数据科学技巧2:数据画像分析 我们用Python语言和pandas库轻松实现数据透视表功能。...第二步:导入数据集 ? 第三步:数据检视 ? 第四步:数据透视表 ?

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    程序JAVA实战」程序数据缓存API(54)

    刚开始写程序的时候,用户信息我是按照app.js增加全局变量的方式来做的,后来当看到搜索插件可以保存上次的搜索内容,让我知道了原来程序还有缓存的API,来一起了解下。...在微信程序的开发中,缓存会用到如下的几个方法,分别对应一个同步和异步的方法,最大上限是10MB。...,但是在程序里面用到异步的情况会非常的少,同步的缺陷是什么呢?...10MB,你试想一下子提取10MB的数据出来,会是什么样的情况,那这个时候你就要考虑异步的情况了。...wx.setStorage(Object object) 将数据存储在本地缓存中指定的 key 中,会覆盖掉原来该 key 对应的内容。

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    Python数据科学库-测验

    (图中数据仅作为演示用) ?...题3运行结果.png 4、订单交易记录数据集 题目数据集csv文件下载链接: https://pan.baidu.com/s/1-pO92xn2NxGCSO5R3j1XTQ 密码: e1b4 文件中一部分数据如下图所示...编写python代码,用随机函数生成一个有100个样本点的正态分布数据集,并根据数据集完成如下需求: (1)求数据样本的偏度和分度,根据偏度和峰度值判断数据样本是正偏还是负偏,是高峡峰还是低阔峰。...(2)使用matplotlib库绘制出数据样本的分度直方图、 (3)编写代码说明在数据集中有多少个样本比1大,有多少个数据样本比1。...import pyplot as plt import numpy as np a = np.random.randn(100) print("比1大的样本数量",np.sum(a>1)) print("比1的样本数量

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    DrugBank:分子数据信息挖掘

    DrugBank数据库简介 DrugBank数据库是唯一将详细的药品数据(即化学、药理学和制药)与综合药物靶点信息(即序列、结构和作用通路)相结合的“生物信息学和化学信息学”资源。...DrugBank数据库功能 开发DrugBank数据库旨在缩小临床药品资源和化学药品数据库之间“深度与广度”的差距。...作为化学导向的药品数据库,DrugBank能够提供许多内置的工具,用于查看、排序、搜索和提取文本、图像、序列或结构数据。...DrugBank数据分子信息的解析,药物结构提取: 下载XML文件 https://www.drugbank.ca/releases/latest ?...---- 如果想获取DrugBank数据库的分子结构,只需从XML文件中解析出的csv中提取结构的smiles信息,然后转换成结构。

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    团队如何玩转大数据

    在这场新变革的席卷下,我们不禁又要问团队,你的大数据在哪里? 诚然,缺技术、缺人才、缺数据等种种现实,都将团队置身于水深火热之中。那么大数据时代的团队还有机会吗? “当然有。”...团队的大数据挑战 近几年,以Hadoop生态为代表的数据基础设施发展很快,给大数据技术的易用性提供了很大改善,也使技术门槛降低很多。...在卢学裕看来,团队在大数据方面的挑战主要表现为人才短缺和数据来源。卢学裕讲到,为了应对这两个问题,团队必须要在业务上下功夫,依据核心的业务形态,深入挖掘自身数据。 具体应该怎么做呢?...但团队的业务发展很快,因此在初期不要规划得太大,而是根据业务需要,细分业务场景,在每个小场景里构建数据模型,分析用户就建用户模型,分析产品用简单的产品模型。...重视数据积累 团队在前期积累数据时,一定要多花点儿功夫,不要偷懒,把数据尽可能采集全、采集准。

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    数据分析实验(下)

    目录 一、数据准备 二、缺失值处理 三、清洗数据 四、聚类分析 五、结果评估与分析 三、清洗数据 对categorical data特征进行观察。...发现很多特征属于偏态分布或分类太多,对于我们进行分析是非常不利的,因此需要对部分数据合并。 1)workclass 在进行合并时。一些和我们分析的目标相关的关键信息是需要单独保留的。...处理好之后的数据如下: ? 是不是以为就结束了,但是还有一步没做,目前的结果并不能直接放到模型中,还需对特征,转变哑变量,利用pd.get_dummies处理。...到此,数据清洗和缺失值的处理的过程就全部完成了。 四、聚类分析 在做聚类之前,需要做特征选择,选出一些和income相关性高的特征出来,再做聚类分析。这样聚类得到的结果可信度高。...sklearn.cluster中的KMeans做聚类,但是做聚类之前,要考虑聚类后的结果具可解释性,能够对具体营销有指导意义,因此需要确定最大K值的选取,如果k值太大,聚类本身也就失去意义,举个极端的例子,如果每个数据本身成为一个类别呢

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    数据安全保护的技巧

    为什么保持数据安全如此重要?保护数据安全不应该仅仅局限于组织和企业。个人也需要数据保护解决方案。他们也会丢失至少对他们来说很重要的个人和金融数据。...因此,即使是个人用户也需要保护他们的数据,确保万无一失。分享5个技巧技巧一;千万不要在论坛、贴吧等公共社交平台上发布或讨论公司的敏感信息,小心隔墙有黑客。...现场托管解决方案、加密文档和数据、自定义访问设置、连接验证服务并管理访问权限,保护自己免受未经授权的访问、数据泄漏和内部操纵的侵扰。...可为每个用户或组设置门户模块与数据的访问权限,从而保护特定数据免受不必要的关注和内部操纵。...结语;科技与人来带来了巨大的便利,同样也带来了一些未知的风险,比如现在的大数据监控,让人丝毫没有隐私可言,你是否被大数据监控过?

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    程序探索】:深入理解程序中的数据

    天生的延时 为了解决管控与安全问题,程序提供了一个沙箱环境来运行开发者的JavaScript 代码 基于双线程模型,意味着任何数据传递都是线程间的通信 在程序架构里,这一切都会变成异步 异步会使得各部分的运行时序变得复杂一些...UI 程序作为MVVM框架中的一员,数据驱动是核心,得数据者得天下 要理解数据通信,和生命周期、运行机制密不可分,像双线程通信模型、数据驱动、底层框架、界面渲染机制等等,本文不会展开叙述,也不可能讲的比官方文档更好...、更实时 本文主要理解以下几点:(想了半天,才概括如下) 1、程序中数据的作用域 2、合理操作数据,提升性能 3、组件间的数据通信 4、缓存数据 5、扩展-状态管理westore 在这之前,还是上几张官方的图...明确几点概念 渲染层和数据相关 逻辑层负责产生、处理数据程序的JS脚本运行在同一个JsCore线程里 逻辑层和渲染层是一对多的关系,但页面对象(page)和页面层级(webview)一一对应 一、程序中数据的作用域...,可移植和复用 纯组件只能通过 props 获得所需参数,通过 triggerEvent 与外界通讯 四、缓存数据 本地数据缓存是程序存储在当前设备上硬盘上的数据程序宿主环境从不同程序和不同用户两个维度来隔离缓存空间

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    程序】全局数据共享

    目录 全局数据共享 1. 什么是全局数据共享 2. 程序中的全局数据共享方案 全局数据共享 - MobX 1. 安装 MobX 相关的包  2. 创建 MobX 的 Store 实例  3....在组件中使用 Store 中的成员 全局数据共享 1. 什么是全局数据共享 全局数据共享(又叫做:状态管理)是为了解决组件之间数据共享的问题。...开发中常用的全局数据共享方案有:Vuex、Redux、MobX 等。 2....程序中的全局数据共享方案 在程序中,可使用 mobx-miniprogram 配合 mobx-miniprogram-bindings 实现全局数据共享。...其 中: mobx-miniprogram 用来创建 Store 实例对象 mobx-miniprogram-bindings 用来把 Store 中的共享数据或方法,绑定到组件或页面中使用 全局数据共享

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    Python数据持久化-测验

    2018年7月13日考试 1.Python读写csv文件 现有如下图1所示的data.csv文件数据,请使用python读取该csv文件数据,并添加一条记录后输出如图2所示的output.csv文件(10...sql语句 (1) 使用sql创建出如下图所示的数据表,数据库名为movies,表名为movieRank,表中包含MovieName、boxOffice、percent、days、totalBoxOffice...此题接第3题题干,在第三题的基础上完成以下需求: (1)编写python代码连接mysql数据库,并向movieRank表中新添加两条数据(已提供second.txt) import pymysql...db = database ) return pymysql.connect(**args) if __name__ == "__main__": #从mysql数据库中取出数据赋值给...,并将数据插入到rooms表中,添加到rooms表中的数据结构如下图所示 ?

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