和文献中的差距较大，以下几个方面可改进： A：上下调基因的区分； B：横轴，纵轴的阈值线； C：重点基因的标示。...2）添加阈值线 使用geom_hline() 和 geom_vline( )参数添加阈值线 ggplot(data = data, aes(x = logFC, y = -log10(adj.P.Val...4） 解决基因名重叠问题 基本和paper一致，但是因为差异表达基因太多，存在重叠情况，现使用R语言的ggrepel包解决标签太多导致的重叠问题。...5） 标示感兴趣的基因的表达情况 将我们感兴趣的基因添加到数据的LABEL列中，假设以下几个基因是我们重点关注的基因，单独查看以下基因的表达情况 ?...呐，到这里除了数据不一样，基本实现了文献中的火山图，是不是以为到这就结束了？NO!NO!NO! 实现上述静态的就可以发paper去了！
ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来 火山图只标示指定基因？这需求都遇到过吧。...base_size = 15) + theme(panel.grid.minor = element_blank(),panel.grid.major = element_blank()) + geom_hline...了解一下ggplot2绘图的方式，标示的基因就是各个基因的text，然后想办法将其赋予到一个 aes 中即可。 三 标示指定基因 和上面类似，将指定基因添加到绘制数据中即可。...3.3 标示文件中的指定基因 ggplot(data = data2, aes(x = logFC, y = -log10(adj.P.Val), color = change)) + geom_point...3.4 ggrepel 解决重叠问题 如果目标标示基因太多会导致重叠，可使用ggrepal函数 library(ggrepel)ggplot(data = data2, aes(x = logFC,
本章介绍如何使用%XML.Reader将XML文档导入到 IRIS对象中。注意：使用的任何XML文档的XML声明都应该指明该文档的字符编码，并且文档应该按照声明的方式进行编码。...这些方法指定XML源文档，将XML元素与启用XML的类相关联，并将源中的元素读取到对象中。...如果要将对象存储在数据库中，则必须调用%Save()方法(对于持久对象)，或者将相关属性值复制到持久对象并保存它。...将这个文件中的一个或多个XML元素名与具有相应结构的支持InterSystems IRIS XML的类关联起来。...它从输入文件中读取每个元素，直到没有剩余元素。最后，如果循环因错误而终止，则该错误将显示在当前输出设备上。如上所述，此示例不将对象存储到数据库。
在之前的推送中，曾经有过一篇介绍excel图表辅助线的制作方法，其中用到的技巧五花八门、令人眼花缭乱。 而ggplot图表系统中的辅助线添加起来却异常简单，非常易于操作。...这主要得益于ggplot函数系统的图层控制理念以及该包的开发者很早就意识到图表辅助线这一层面的图表元素需求。...ggplot(mydata,aes(reorder(Conpany,-Sale),Sale,fill=Conpany))+geom_bar(stat="identity")+geom_hline(aes...以上散点图没有很明显的分散趋势，不过为了演示散点图中的辅助线，我还是将散点像素画处理，给散点图加上均值十字线。...像素画处理之后，再加上均值十字线，你可以清晰地看到，数据分布形态中，左下角最为密集。 辅助线的另外一种常见的用途就是在时间序列数据中。
可视化的展示方式可以使数据更易读，且容易看出一些数据下隐藏的“结果”，而添加注释则可以进一步聚焦到想重点展示的“信息”。...一 绘制基础图 library(ggplot2) p ggplot(mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) + geom_point() ?...更多参数ggplot2|详解八大基本绘图要素，主题ggplot2|theme主题设置，详解绘图优化-“精雕细琢”，图例ggplot2 |legend参数设置，图形精雕细琢 可参考。...如果待注释的text太多，可使用ggrepel包解决标签太多导致的重叠问题 ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来 2.2 点注释 1）添加点 p + annotate(geom = "...2.4 添加垂直线 p + geom_hline(yintercept=25, color="orange", size=1) + geom_vline(xintercept=3, color="orange
有的时候学习不到相关的分析的思路，因此看到这篇文章，作者把全部的代码都整理到一个网站上了，然后提供给相关的研究人员进行后面的复现，真是太优秀了，必须打call，复现好香，自己不用调试代码，自己最近调试到要疯...因此，本研究中作者通过单细胞rna的测序技术，解析了肺癌肿瘤微环境中的肿瘤上皮细胞和相关的恶性肿瘤细胞，丰富了以前的单细胞组学研究。...首先是将所需要的R包进行加载，对后面要绘图的元素进行颜色的选取及加载，保证全文的配色统一，作者选用的配色相对而言，是比较好看的，我们可以考虑在后面进行摘取，选用。...这篇文献的作者是将所有的sample整合到一个excel表里面，选用的for循环，进行文件的读取；如果后面我们要用的话，需要保证的是路径正确及sample的表格尽量与作者对应一致。...(ggplot(qc_data, aes(pRP, pMT, color = nFeature_RNA))) + geom_hline(yintercept = pMT_lower, color
在BBC数据团队开发了一个R包，以ggplot2内部风格创建可发布出版物的图形，并且使新手更容易到R创建图形。 例如： ? 加载所有所需的R语言包 通常在R中创建图表需要安装和加载某些软件包。...bbc_style()没有参数，并且在创建绘图后将其添加到ggplot“链”中。...请注意，对于折线图而言，折线的颜色或对于条形图而言是条形的颜色，并不是从bbc_style（）函数中直接获得的，而是需要在其他标准ggplot图表函数中明确设置 。...它本质上修改了ggplot2的主题功能中的某些参数。例如，第一个参数是设置绘图标题元素的字体，大小，字体和颜色。...添加到guide中来更改图例符号的默认外观，例如下面将增加图例符号的大小： + guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 4)))) 在图例标签之间添加空格
所有的音乐都在 iPod 中，会不会突然有一天坏掉了，还是备份到电脑中比较安心啊。那么如何把音乐从 iPod 中再拷贝到新电脑中呢？...需要准备的材料 你的iPod 你的Mac 一根数据线 避免 iTunes 自动同步 如果你之前选的是自动同步，那么在将 iPod 连接到 Mac 之前，一定要小心，否则会自动将 iPod 中的内容删除，...注意如果把Music文件夹拷贝到桌面后，在后面添加到iTunes中时，仍然无法查看到这个隐藏文件夹。为此，我们最好新建一个文件夹，并将每个子文件夹下的文件拷贝到这个新建的文件夹下。...将文件重新加入 iTunes 中 接下来的事情大家应该比较熟悉了，既然我们已经将音频文件拷贝到了电脑中，接下来我们只需要添加到iTunes中就可以了。...注意添加前检查一下将文件拷贝到iTunes library这个选项要选中。然后我们通过 File->Add to Library选择拷贝到Mac中的文件夹，就可以了。 ?
对于折线图而言，折线的颜色或条形图的颜色，并不是从bbc_style（）函数中直接实现的，而是需要在其他标准ggplot（ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)）图表函数中明确设置...这是一个非常简单的折线图的示例，使用了gapminder程序包中的数据。...它实质上修改了ggplot2主题功能（ggplot2学习笔记之图形排列）中的某些参数。 例如，第一个参数是设置图标题元素的字体、大小、和字体颜色。...bbc_style（）函数中包含的主题添加额外的主题参数，例如添加一些网格线。...它还可以将图表保存到指定的位置。
在编译的过程中很有可能会出现错误，这时候需要根据具体的错误信息自行百度解决。...一路回车编译完成就可以在eclipse中导入了，导入的时候记得勾选eclipse中的列出下层的所有工程选项，否则导入的就是一个大的spring工程而不是各个工程分开。 5....导入完成之后发现spring-beans-groovy工程中有错误，这是由于eclipse中没有安装groovy插件导致的。直接： help--->install new software....Spring core 的时候报 java.lang.reflect.Parameter找不到，且javac -version显示还是老版本 原因：本地前面安装了jdk1.6, 通过修改JAVA_HOME将路径指向...确保path中 %JAVA_HOME%\bin的配置在system32的配置前（索性将其移到第一位） 2. 确保只配置了一个path变量，需要注意包括用户变量和系统变量。
本文告诉大家如何把 dll 打包到程序中。很多时候的 软件 在运行的时候需要包括很多 dll 或其他的文件，这样的软件在给其他小伙伴，就需要做一个压缩包，或者用安装软件。
Castle是针对.NET平台的一个开源项目，从数据访问框架ORM到IOC容器，再到WEB层的MVC框架、AOP，基本包括了整个开发过程中的所有东西，为我们快速的构建企业级的应用程序提供了很好的服务.具体可参看...可以通过称为 Facility 的组件用控制反转 (Inversion of Control, IoC) 和依赖注入将 第三方组件插入内核中。...要使 Quartz 的生命周期跟随 Castle，将 Start() 调用放入 IStartable的 Start() 方法中，并将 Shutdown() 调用放入 IStartable的 Stop()...方法中。...", se); 76: } 77: 78: } 79: } 80: } 将Quartz.net集成到Castle
下列代码例子中实现的将窗体名字为Example的窗体嵌入到QWidget中。
一、简介 上一篇中我们介绍了ggplot2的基本语法规则，为了生成各种复杂的叠加图层，需要了解ggplot2中一些基本的几何图形的构造规则，本文便就常见的基础几何图形进行说明； 二、各基础图形 2.1...abline()、hline()与vline() 在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条，在ggplot2中当然也有类似的方法： geom_abline()： ...geom_hline()中传入参数yintercept来绘制垂直于y轴的线条： p ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) + geom_point() + geom_hline...(yintercept = 20) p p ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) + geom_point() + geom_hline(yintercept =...下面以美国5个消费指标上5个年份的数据为例绘制堆积面积图： library(ggplot2) library(reshape2) #将原数据转置以处理成行对应一个年份的形式 data <- data.frame
image.png 按照Y轴的范围填充三个颜色，比如大于3填充一个，小于-3填充另外一种，-3到3中间的填充另外一种 给数据添加一列新的用来映射颜色 df$color3,"A...c("green","blue","grey"))+ theme_bw()+ geom_hline(yintercept = -3,lty="dashed")+ geom_hline(yintercept...image.png y轴的密度分布也是这样画，下面就不重复了 接下来是拼图 library(ggplot2) library(aplot) p1ggplot(df,aes(x,y))+ geom_point...(aes(color=color))+ scale_color_manual(values=c("green","blue","grey"))+ theme_bw()+ geom_hline...(yintercept = -3,lty="dashed")+ geom_hline(yintercept = 3,lty="dashed")+ geom_vline(xintercept =
平常用的比较多的是 imread函数，直接将一个.jpg或者.bmp或者其他格式图片文件，读入到mat矩阵中。 本博文记录的是，如何将一段内存，或者文件流，读入到mat矩阵中。...Mat jpegimage = imdecode(Mat(buff), CV_LOAD_IMAGE_COLOR); 2、将图片文件读入到文件流，再解析成mat矩阵 std::ifstream file
如何高效便捷的在博客中更新自己的动态是困扰很多人的问题，简单的方案就是另起炉灶在博客重新发布一份，但这种方法耗时耗力，因此不建议这样做。从原po平台同步到博客的某个位置应该是最理想的解决方案。...对于照片来说，群晖的相册给我提供了一个来源库，那么如果我想让访客浏览我的近照，那么如何把照片从群晖相册同步到博客中就成了实现这一想法的核心问题。...注意这里说的群晖相册，特指 Photo Station，而不是Moments等套件、在使用 Photo Station 的过程中，比较好的地方在于照片的地图模式、缩略图加载速度以及丰富的配置设置项。...如果一切正常的话，通过RSS解析到图片，然后再通过自己的想法构造页面就可以了，这种方法是最贴合的嵌入方式，但暂时还不知道如何获得包含全部图片的订阅源。...待补充 … 写在最后 我已经将群晖相册做了整理并公开了部分相册，欢迎访问直接访问我的群晖相册。
listview分两部分： 1.activity 2.item 将item通过setAdapter绑定到activity。 activity布局如下： <?...database"); } } } 因为apk文件不带数据库.db文件，因此必须在raw目录下放入数据库文件，在程序启动时将该数据文件放复制到程序对于的目录下
; 8 9 /* 10 * 文件字节输出流 2014-7-29 11 * 1.给出输出流的目的地 12 * 2.创建指向目的地的输出流 13 * 3.人输出流把数据写入到目的地
本文告诉大家如何把 dll 打包到程序中。很多时候的 软件 在运行的时候需要包括很多 dll 或其他的文件，这样的软件在给其他小伙伴，就需要做一个压缩包，或者用安装软件。...参见：http://www.cnblogs.com/blqw/p/LoadResourceDll.html ILMerge将源DLL合并到目标EXE - HackerVirus - 博客园 ----
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