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R语言绘制圈图、环形热图可视化基因组实战:展示基因数据比较

p=23891 可以使用环状图形展示基因数据比较。可以添加多种图展信息,如热图、散点图等。 本文目标: 可视化基因组数据 制作环形热图 环形热图很漂亮。可以通过R来实现环形热图。...环形布局 与生成的其他圆形图类似,环形布局可以在制作图之前由par()控制。...如果你制作一个包含多个轨道的更复杂的环状图,你应该了解关于heatmap()的更多细节。 heatmap()的第一次调用实际上是初始化布局,即应用聚类和拆分矩阵。树状图和分割变量是内部存储的。...convert_x()将x方向上的单位转换为环形坐标系中测量的适当数值。...下图是正常布局的热图,现在我将用圆形布局改变它们。 热图直观地显示了DNA甲基化、基因表达和其他基因组水平信息之间的相关性。 原始热图是用随机数据集生成的。

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iSlide2022免费版PPT插件功能详情介绍

矩阵布局将选中一个的图形(也可以是ICON图标或图片),横向/纵向复制出的间距相等多个图形的矩阵布局。也可以将一组分散的图形,快速聚排列成横向和纵向间距相等的矩阵布局。...矩阵裁剪将选中的图形(或图片)按照横向和纵向裁剪,适用于做网格化图形/图片,或金字塔图。环形布局将选中一个的图形,按照环形排列复制出多组图形。...或选中一组分散的图形,快速聚排列成环形(半径/间距)相等的环形布局。环形裁剪将选中的圆形(正圆或椭圆)的图形或图片、饼形按照环形裁剪切分。适用于做靶心图及同比数据饼形图等。...图示库图示即图形视觉化来表示或说明某种事物,有直观易懂,便于记忆的特点。图形化的表达让 PPT 区别开 Word 文档,iSlide 图示库功能帮助非专业设计人士更形象的表达和传递信息。...图表库提供更专业的PPT条形图、柱状图、渐变图、环形图、饼图等Excel可编辑数据图表模板,同时还提供智能图表,通过参数调节快速实现数据和图形的精准表达,让人人都能编辑实现的数据视觉化设计。

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    生信爱好者周刊(第 57 期):深度学习并非“简单的统计”,二者距离已越来越远

    ,对环形RNA的细胞异质性进行了深入探究,揭示了环形RNA作为细胞类型标志物的应用潜力。...该研究将目前环形RNA研究从传统组织水平提升至单细胞水平,为探索不同细胞类型中环形RNA的生物学功能提供了重要的数据资源和分析技术。...Taskfile 内置了动态变量、操作系统等环境变量识别等高级功能都更贴合现代化的 Coding 方式。...{eventloop} 包提供了一个框架,用于呈现交互式图形,并以足够快的速度处理用户的鼠标+键盘事件,以满足游戏和其他实时应用程序的需求。...11、tkinter-helper - 一款为Tkinter打造的布局助手 TkinterHelper(Tkinter布局助手)是一款为Tkinter打造,仅需拖拽组件进行布局,所见即所得,非常方便就能做出一个

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    腾讯地图JSAPI-在地图上添加自定义覆盖物

    另一种方式是通过CSS布局将其他DOM元素叠加到地图容器之上,这种方式下视角变换时DOM元素需重新计算布局,比如JSAPI v2的Marker/Polygon等覆盖物,以及JSAPI GL的InfoWindow...绑定时一方面主要是将createDOM()返回的DOM元素加入到特定的节点下,使其覆盖在地图上方且可以进行相对定位;另一方面是监听地图变换执行updateDOM(),使DOM元素可以跟随地图更新定位或内容...解绑时则是将其从父节点下去除,同时删除对地图事件的监听。...imageslim] 基于DOMOverlay实现自定义覆盖物 举个:自定义环形饼图 [1] 以官网示例中的Donut为例,创建自定义环形饼图。...,位置为${donut.position}`); }); 需要注意的是,在销毁时应该将事件监听删除,所以onDestroy应相应修改为: // 销毁时需解绑事件监听 onDestroy(

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    如何用Tableau可视化?

    你将学会: 如何可视化数据? 如何创建筛选器? 如何绘制地图? 常用图表可视化 页面布局和格式设置 项目案例 这是一家咖啡店的数据,Excel里有两个表,分别是销售数据表、产品表。...首先,将案例数据的2个表导入Tableau,可以看之前的内容:如何导入数据。 现在假如领导想要知道每种咖啡的下单数量占总数量是多少,如何用Tableau来实现呢? 这个案例我们选择用环形图进行分析。...首先,新建工作表命名为环形图,标题居中,将数量拖至标记,图形选饼图: image.png 将数量标记选为角度 image.png 将咖啡种类拖至标记,选择颜色 image.png 选择整个视图...会得到一个灰色的实心单色圆 image.png 最后把灰色改为白色 image.png 最后环形图就呈现出来了,也可以跟进需要再次调整环形图大小进行美化 image.png 2.如何创建筛选器...image.png 现在领导想更详细的了解:每个城市【每家店铺】每种咖啡的销量,怎么办?

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    Gephi实战,从零开始

    Gephi 工具介绍 主要功能:布局、分割、排序、过滤、统计 布局(Layout): 根据算法规则自动美化图形的工具。 Gephi提供12中布局方式,前6种是主要布局工具,后面6种是辅助布局工具。...最常用的是:力导向算法(Force Atlas和 ForceAtlas2)、圆形布局和胡一凡布局(Yifan Hu、Yifan Hu比例、Yifan Hu多水平)。 ?...FR算法建立在粒子物理理论的基础上,将图中的节点模拟成原子,通过模拟原子间的力场来计算节点间的位置关系。算法通过考虑原子间引力和斥力的互相作用,计算得到节点的速度和加速度。...Yifan Hu多水平布局Yifan Hu、Yifan Hu比例、Yifan Hu多水平为胡一凡布局,Yifan Hu多水平布局适用于非常大的图形,特点是粗化图形,减少计算量,运行速度比较快。...布局 选择"Force Atlas"布局,属性"斥力强度"修改为 10000,"由尺寸调整"打钩选中,然后点击"运行"。 ? 预览效果如下: ?

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    台积电公布将模拟设计迁移到3nm的方法

    模拟单元布局 自动化模拟单元布局 通过限制模拟单元内的模拟晶体管使用更有规律的模式,那么就可以更容易地使用布局自动化,如:使用模板自动布局、具有电气感知宽度和空间的自动布线,以及添加备用晶体管以支持设计过程中后来出现的任何...将模拟电路迁移到新的工艺节点需要一系列设备映射、电路优化、版图重用、模拟 APR、EM 和 IR 修复以及版图后仿真。在映射期间,使用 Id 饱和方法,其中器件根据其上下文自动识别。...使用自动化步骤和模板方法将 N4 的 VCO 布局迁移到 N3E 节点,重用差分对和电流镜像设备的布局和方向。...N4 到 N3E VCO 布局迁移 基于环形的VCO也使用Pcell手动和自动从N40节点迁移到N22节点。通过使用自动化流程,生产率提高了 2 倍。...两个迁移示例表明,当使用较小的节点(如 N5 到 N3)时,生产力提高可以达到 2.5 倍。即使使用像 N40 这样的成熟节点,您也可以期望使用 Pcell 将生产率提高 2 倍。

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    matplotlib绘制常见统计图形(一)

    参见下面代码,注意x的值和前面代码的差别,实现的效果是一样的。 ? 水平方向柱形图 水平方向柱形图对应的函数是barh,参数和bar是类似的。上面的图改成水平方向的效果如下: ?...水平方向堆积 ? 并列直方图 并列直方图只需要在堆积直方图基础上将stacked改为False。 垂直方向并列 ? 水平方向并列 ?...分裂式饼图 饼图是用来展示比例分布特征的图形,主要使用pie()函数来实现。 ? 使用的参数含义如下表所示: ? 非分裂式饼图 与分列式饼图相比,只需去掉explode参数即可使饼片不分裂。...环形饼图 环形饼图的实现主要是通过控制wedgeprops参数来实现,它是指组成扇形的饼片对象,可以传入字典参数设置宽度,实现环形效果。如下面代码所示: ?...其中宽度是参考半径显示的,当设置为和半径一样时,就不会显示环形了。此外还设置了textprops参数,控制了环形上的文字颜色。 内嵌环形饼图 将饼图进行嵌套,可以显示多组定性数据的比例分布。

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    Excel实例:Excel图表可视化:条形图、折线图、散点图和步骤图

    通过选择“ 布局”>“标签” |“轴标题”>“主水平轴标题”>“轴下方的标题”  并输入单词“城市”,可以类似的方式添加  水平轴的标题。...最后,通过选择“ 布局”> “垂直轴”的标题可以添加水平轴的标题。  标签|轴标题>主垂直轴标题>旋转标题。...接下来,我们描述要对图表进行的一系列修改。 标有收入的图例不是特别有用,因此我们通过单击图表并选择布局>标签|图例>无来消除它  。...接下来,我们只需突出显示标题(收入),然后将其更改为更具信息性的标题,例如“按年龄划分的平均收入”,即可更改图表标题。我们还像示例1中的条形图一样插入了水平和垂直轴标题。...选择“  轴选项”  ,然后将“ 最小值 ”单选按钮   从“  自动”  更改为“  固定”,  然后输入20000。 我们还决定更改标签的格式,以使用数千个逗号分隔符。

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    Excel实例:Excel图表可视化:条形图、折线图、散点图和步骤图

    通过选择“ 布局”>“标签” |“轴标题”>“主水平轴标题”>“轴下方的标题” 并输入单词“城市”,可以类似的方式添加 水平轴的标题。...最后,通过选择“ 布局”> “垂直轴”的标题可以添加水平轴的标题。 标签|轴标题>主垂直轴标题>旋转标题。...接下来,我们描述要对图表进行的一系列修改。 标有收入的图例不是特别有用,因此我们通过单击图表并选择布局>标签|图例>无来消除它 。...接下来,我们只需突出显示标题(收入),然后将其更改为更具信息性的标题,例如“按年龄划分的平均收入”,即可更改图表标题。我们还像示例1中的条形图一样插入了水平和垂直轴标题。...选择“ 轴选项” ,然后将“ 最小值 ”单选按钮 从“ 自动” 更改为“ 固定”, 然后输入20000。 我们还决定更改标签的格式,以使用数千个逗号分隔符。

    5.2K10

    CorelDRAW Graphics Suite2023新版矢量图排版软件功能介绍

    CorelDRAW Graphics Suite2023是配备齐全的专业设计工具包,可以非常高的效率提供令人惊艳的矢量插图、布局、照片编辑和排版项目。...该软件提供了更快,更智能,更多地方工作所需的所有专业矢量插图,布局,照片编辑和设计工具,可以轻松创建高质量矢量插图、徽标设计、页面布局和Web图形,能够广泛应用于排版印刷、矢量图形编辑及网页设计等领域!...Coreldraw2023创意软件的新生属性和智慧型工具将帮助用户成倍的提高工作效率。图像领域的专业和商业用户都将发现,强力的图像软件包将帮助他们更快的完成工作和项目,给客户留下极为深刻的印象。...Coreldraw2023是因为杰出和革新的特性,为Coreldraw图像程序赢得了一个长期的的声誉。这套新程序包超越了以往人们看到的任何图像程序的水平。...1、将安装目录下的文件重命名如:C:\Program Files\Corel\CorelDRAW Graphics Suite2023\RMPCUNLR.DLL修改为C:\Program Files\Corel

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    52个数据可视化图表鉴赏

    地图的几何体或空间被扭曲,以便传达该替代变量的信息。 13.弦图 弦图是一种显示矩阵中数据之间相互关系的图形方法。数据围绕圆呈放射状排列,点之间的关系通常绘制为将数据连接在一起的圆弧。...20.环形图 (按产品种类、客户类型划分销售额,圆心为销售总额) 就像饼图一样,环形图是一种图形类型,其中一个圆被划分为多个扇区,每个扇区代表整体的一部分。...22.甘特图 (不同产品在特定时间段是否完成装运) 甘特图是一种图表,其中一系列水平线显示在特定时间段内完成的工作量或完成的生产量与这些时间段内计划的工作量的关系。...39.圆型树形图 这种类型的可视化通过一系列环显示层次结构,这些环为每个类别节点切片。每个环对应于层次中的一个级别,中心圆表示根节点,层次从根节点向外移动。环根据其与父切片的层次关系进行切片和划分。...44.小倍数图 小倍数图(有时称为网格图、格子图或面板图)是一系列使用相同比例和轴的类似图形或图表,便于比较。它使用多个视图来显示数据集的不同分区。Edward Tufte推广了这个概念。

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    使用 Openbiox Hiplot (ORG) 在线开源绘图工具绘制发表级网络图

    更复杂的网络图考虑使用 Cytoscape 进行绘制。...以及 3 个可选数据列参数,节点大小列用于映射节点的大小,标注组列用于将分类节点用不规则图形进行框选,线条宽度列用于映射连线的宽度。在节点大小列未指定时,将计算节点的连线数作为其大小映射。...特殊参数中,布局样式用于控制网络图的布局(igraph 包中对应函数)。变换大小和变换宽度可以用于对节点大小列和连线宽度列进行数据缩放(支持加减乘除取余平方、对数变换等)。...(用于控制标记组的颜色),布局样式修改为 layout_in_circle。...缩放函数将节点数据大小列数值变为原来的 7/10,宽度数值变为原来的 1/6。如 图6 所示,与 Demo 1 的输出相比,节点的大小、颜色发生了改变,并将不同类型的节点进行了框选。

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    什么是网络拓扑?网络拓扑有哪些类型?

    网络拓扑有两种主要类型:物理网络拓扑: 物理拓扑是实际布线和连接布局(物理信号传输介质)逻辑网络拓扑: 逻辑拓扑是网络设备的虚拟布局,数据在设备之间通过网络传输的方式,与设备的物理连接无关。...,则整个系统将崩溃数据在任何时间点都只能沿一个方向传播不适用于流量可扩展的网络环形拓扑环形拓扑的每台计算机都恰好连接到另外两台计算机以形成环形,最后一个节点与第一个节点组合,消息传递本质上是单向和循环的...环形拓扑是半双工的,因此一次只能向一个方向发送数据,并且数据将通过每个网络节点到达其目标设备。在环形拓扑中,拥有令牌的节点是唯一能够传输数据的节点,从而降低了发生冲突的可能性。...路由是节点使用最短距离引导数据到达目的地。泛洪是将数据发送到网络中的所有节点的地方,泛洪不需要任何形式的路由逻辑即可工作。...,需要非常高的维护尽管它是可扩展的,但可以添加的节点数量取决于中央总线的容量和电缆类型混合拓扑混合拓扑是一种将两个或多个不同的拓扑组合起来以不显示任何标准拓扑的方式构建网络的拓扑。

    3.9K41

    如何构建一个在线绘图工具:Feakin 是如何设计与构建的?

    分析了它们的大致实现,以及部分的源码: Graphviz AT&A 实验室的作品,作为最古老的图形即代码的工具,它还提供了一个图形描述语言:Dot,可以直接将代码转换为图形。...布局上的抽象,提供了更好的可扩展性 —— 我们就可以参考它的实现了。在它的图形模型里,Node(节点) 和 Edge(边) 从形式上都算是 Element,然后在渲染时根据图形类型展开。...将通过 parser 解析类似于 Graphviz、Mermaid 设计的语法,将其转换为图形模型。 引入 Dagre.js 作为图形布局引擎。...将图形模型匹配到 Konva 中的图形,如 RectangleShap 对应于  组件、Edge 对应于 、 等。...诸如于: 更丰富的图形 当前只支持基础的图形,在未来,支持其它工具的图形库 —— 有了 GIM,我们就不需要自己设计了。 图形的属性 从颜色到边框,一个功能也没有。

    1.6K30

    领导嫌弃可视化太丑?学会这10个高级炫酷图表,胜过一切技巧

    制作方法:流程图由点和线构成,需要定义节点,在FineReport里首先需要选中流程图,右边属性面板选择新增空白节点,如下图所示 2、时序图 适用场景:时序图又名序列图、循序图,是一种UML交互图。...本插件根据特定的算法计算出指定直径圆内可以切割晶片的最大数量,且自动生成晶片切片的布局,自动生成晶片相对于晶圆中心的经纬度坐标及晶片编码。...如果您已经有晶片数据,也可以导入晶片数据,插件会自动生成晶片布局并着色区分各项测试指标。...12、轮播环形图 环形图可以通过改变内置饼图的内径占比实现,但是受制于内置饼图本身的局限性,无法实现环形图特效显示。...15、笛卡尔热力图 笛卡尔热力图主要是用颜色变化来表征某种数据经过降维处理后的变化情况的一种图表,可将三维数据以矩阵或地图形式展示在一张图表上。 使用本插件可以达到该功能,使图表内容更丰富。

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