生物信息的学习离不开Linux系统，不管自己写命令处理数据，还是使用现有的工具。Linux对我们来讲最重要的是它强大的命令行功能，可以快速、批量、灵活的处理数据的提取、统计和整理等耗时耗力的重复性工作。事实上在日常生信分析中，多数整理工作也都是用Linux命令的组合完成的，相比于写完整的Python或Perl程序更简便快捷；另外，生信分析用到的工具大都只在Linux下运行，而Linux发行版众多，更新速度不一，软件的安装是一个令人头大的事情。
关于Java、Python这两个目前“斗”的最狠的编程语言，我相信很多人都并不陌生，每一个拿出来将都是长篇大论，所以我就长话短说，希望帮助你在未来的编程生涯中，有一些帮助。
正文: 今天为大家分享一篇文章“宝塔面板卸载方法，如何删除残留文件！”宝塔面板是目前比较火热的Linux服务器面板，管理网站非常轻松简单，但是有很多人想更换面板，卸载宝塔，并删除残留文件，如何操作那？下面我们就详细为大家讲解。
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本系列教程将完整的讲解整个Linux相关的知识，这是楼主学完兄弟连的Linux教程之后重新对Linux知识体系的整理。个人感觉兄弟连的Linux教程可以很好的入门，从最基础的知识开始，对于一个完全不懂Linux系统的人，相信在看完整个系列教程之后，都能对Linux有一个完完全全的了解。那么废话不多说，本篇博客作为整个教程的第一讲，我们就先来对Linux有个简单的整体介绍。
vi编辑器是Linux系统新安装时都自带的代码编辑器，但其不具有主动的以字体颜色辨别语法的正确性的功能
Clam AntiVirus（ClamAV）是免费而且开放源代码的杀毒软件，软件与病毒码的更新皆由社群免费发布。目前ClamAV主要是使用在由Linux、FreeBSD等Unix-like系统架设的邮件服务器上，提供电子邮件的病毒扫描服务。ClamAV本身是在文字接口下运作，但也有许多图形接口的前端工具（GUI front-end）可用，另外由于其开放源代码的特性，在Windows与Mac OS X平台都有其移植版。
是个操作系统（OS） 类似Windows这种，但是简单，占地方小指令易操作，可以同时连通多个服务器
本文内容需要一台已经设置好可以使用sudo命令的非root账号的Ubuntu服务器，并且已开启防火墙。没有服务器的同学可以在这里购买，不过我个人更推荐您使用免费的腾讯云开发者实验室进行试验，学会安装后在购买服务器。
以下分享红旗Linux操作系统RedFlag Linux Desktop 9.0安装教程，你可以用Vmware、VirtualBox虚拟机、硬盘、U盘、光盘的方式来安装。本文以光盘的方式来演示安装RedFlag Linux Desktop 9.0全过程。
下面通过一个例子来演示以上 3 个命令的具体用法。首先，我们新建一个 demo.txt 文件并打开，键入一行内容，例如：
CentOS 7默认安装了Python 2.7，系统本身也使用它来启用系统命令例如‘yum’
CentOS7 的防火墙配置跟以前版本有很大区别，CentOS7这个版本的防火墙默认使用的是firewall，与之前的版本使用iptables不一样
vim 有三种模式，注意：这三种模式有很多不同的叫法，我这里是按照鸟哥的linux书中的叫法。
Fish的全称是Friendly Interactive Shell，是一种替代性的shell，马上就可以使用，并可以提供自动建议，用已安装的手册页就可编程完成，是一种功能齐全、可读的脚本语言，并支持彩色文字。
可以理解为类似于windows和mac一样的操作系统，但是它不区分设备，据了解很强大，但具体强不强大，等我学学看。
Vesta Control Panel是一个免费的开源控制面板，具有网站搭建，数据库，邮件管理等功能。在本教程中，您将在Ubuntu或CentOS服务器上安装控制面板，更新默认管理界面端口，并了解如何从现有安装迁移用户数据。
启动新服务器时，会创建一个默认帐户命名为root。此用户具有完整系统的访问权限，应仅用于管理任务。作为根用户，这个账户对你的系统都没有限制，虽然root用户管理权限很强，但是它不够安全。
DokuWiki 是一个使用，用途多样的开源 Wiki 软件，并且不需要数据库。它因简洁易读的语法受到用户的喜爱。而容易维护、备份和整合则使它成为管理员的最爱。内置的访问控制列表和认证连接器使 DokuWiki 在企业环境下特别有用，由充满活力的社区贡献的众多插件则令它拥有比传统维基更广阔的应用范围。
## 不需要安装任何东西，自带terminal，直接使用；或者使用界面更好看的iterms
目录相当于windows的文件夹，linux系统没有C/D/E/F盘，文件系统呈树状。由于用户不唯一，像类似“我的电脑”这种级别的文件，用户是无法访问的，每个用户能到达的最高级目录“宿主目录”，即用户登录时所在的目录，宿主目录放在home目录下。
Jenkins是一个开源自动化服务器，旨在自动执行持续集成和交付软件所涉及的重复技术任务。Jenkins是基于Java开发，可以从Ubuntu软件包安装，也可以使用ARchive（WAR）文件构成一个完整的Web应用程序，在服务器上运行。
Tomcat是由Apache软件基金会下属的Jakarta项目开发的一个Servlet容器，按照Sun Microsystems提供的技术规范，实现了对Servlet和JavaServer Page（JSP）的支持，并提供了作为Web服务器的一些特有功能，如Tomcat管理和控制平台、安全域管理和Tomcat阀等。由于Tomcat本身也内含了一个HTTP服务器，它也可以被视作一个单独的Web服务器。如果您开发Java应用程序，Tomcat是一种快速简便的方法，可以在专门为此目的设计的完整服务器环境中为它们提供服务。
Python是一种灵活多样的编程语言，可用于许多用例，包括脚本，自动化，数据分析，机器学习和后端开发。1991年首次出版，其名称灵感来自英国喜剧组织Monty Python，开发团队希望使Python成为一种有趣的语言。快速设置，并以相对简单的方式编写并立即反馈错误，Python是初学者和经验丰富的开发人员的绝佳选择。Python 3是该语言的最新版本，被认为是Python的未来。
GNU nano，简称nano，是大多数Linux发行版的基本内置编辑器。GNU nano是一个小巧友好的文本编辑器. 与基本的文本编辑相比，nano提供许多额外的特性，例如：交互式的查找和替换，定位到指定的行列，自动缩进，特性切换，国际化支持，以及文件名标记完成。本教程中，我们将介绍一些帮助您入门的基本知识。
由于换行符（为不可见字符），在 Windows 为 CR+LF（Carriage-Return+Line-Feed：回车加换行），而在 Linux/Unix 上为 LF（换行）。因此在linux 编辑的文本，在windows 显示会是没有换行的。
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图片高频Linux命令的学习：一、显示当前路径pwdprint working directory 显示当前路径二、创建指令mkdirmake directory 创建空目录三、显示列表指令ls 显示列表，不管是目录还是文件都能显示四、 删除指令rm根据操作对象可分为三类（1）删除文件rm（2）删除空目录rmdir（3）删除非空目录rm-r 这三个命令后面要跟上要删除的目录名rm-rf/权限高的人使用这个代码会将服务器清空，是（3）命令的改进-r 递归，多级目录一并删除-f 强制删除，没有任何提示五
Alias是一个自定义快捷方式，用于表示一组命令或使用特定选项运行的单个命令。只需要一个字符，我们就可以使用Alias来执行经常使用的进程。
Solr是一个高性能，采用Java5开发，基于Lucene的全文搜索服务器。同时对其进行了扩展，提供了比Lucene更为丰富的查询语言，同时实现了可配置、可扩展并对查询性能进行了优化，并且提供了一个完善的功能管理界面，是一款非常优秀的全文搜索引擎。它对外提供类似于Web-service的API接口。用户可以通过http请求，向搜索引擎服务器提交一定格式的XML文件，生成索引；也可以通过Http Get操作提出查找请求，并得到XML格式的返回结果。 文档通过Http利用XML 加到一个搜索集合中。查询该集合也是通过http收到一个XML/JSON响应来实现。它的主要特性包括：高效、灵活的缓存功能，垂直搜索功能，高亮显示搜索结果，通过索引复制来提高可用性，提供一套强大Data Schema来定义字段，类型和设置文本分析，提供基于Web的管理界面等。
linux 命令行概述 生信星球linux 基础操作 显示当前路径-pwd pwd 路径显示为：/home/username 创建空目录-mkdir mkdir project #存放文件 命令为mkdir；project为空目录的名称; #注释，帮助理解 显示列表-ls ls 可以看删除后命令是否执行，当前目录下还有哪些子目录 删除—rm rm 1.txt #删除文件 rmdir project #删除空目录 rmrm -r src #删除非空目录 -r #多级目录一并删除≈删除整个文件夹 -f #
配置管理系统目的是让使管理员和运营团队轻松控制大量服务器。它们允许您从一个服务器以自动方式控制许多不同的系统。虽然有许多流行的配置管理系统可用于Linux系统，例如Chef和Puppet，但这些系统比较复杂。Ansible是这些选项的绝佳替代品，因为服务开销小很多，软件又非常易用。
Linux最早由Linus Benedict Torvalds在1991年开始编写。在这之前，Richard Stallman创建了Free Software Foundation(FSF)组织以及GNU项目，并不断的编写创建GNU程序(此类程序的许可方式均为GPL: General Public License)。在不断的有杰出的程序员和开发者加入到GNU组织中后，便造就了今天我们所看到的Linux，或称GNU/Linux。 Linux发行版本可以大体分为两类，一类是商业公司维护的发行版本，一类是社区组织维护的发行版本，前者以著名的Redhat(RHEL)为代表，后者以Debian为代表。下面介绍一下各个发行版本的特点： Redhat，应该称为Redhat系列，包括RHEL(Redhat Enterprise Linux，也就是所谓的Redhat Advance Server，收费版本)、Fedora Core(由原来的Redhat桌面版本发展而来，免费版本)、CentOS(RHEL的社区克隆版本，免费)。Redhat应该说是在国内使用人群最多的Linux版本，甚至有人将Redhat等同于Linux，而有些老鸟更是只用这一个版本的Linux。所以这个版本的特点就是使用人群数量大，资料非常多，言下之意就是如果你有什么不明白的地方，很容易找到人来问，而且网上的一般Linux教程都是以Redhat为例来讲解的。Redhat系列的包管理方式采用的是基于RPM包的YUM包管理方式，包分发方式是编译好的二进制文件。稳定性方面RHEL和CentOS的稳定性非常好，适合于服务器使用，但是Fedora Core的稳定性较差，最好只用于桌面应用。 Debian，或者称Debian系列，包括Debian和Ubuntu等。Debian是社区类Linux的典范，是迄今为止最遵循GNU规范的Linux系统。Debian最早由Ian Murdock于1993年创建，分为三个版本分支(branch)： stable, testing和unstable。其中unstable为最新的测试版本，包括最新的软件包，但是也有相对较多的bug，适合桌面用户。testing的版本都经过unstable中的测试，相对较为稳定，也支持了不少新技术(比如SMP等)。而stable一般只用于服务器，上面的软件包大部分都比较过时，但是稳定和安全性都非常的高。Debian最具特色的是apt-get/dpkg包管理方式，其实Redhat的YUM也是在模仿Debian的APT方式，但在二进制文件发行方式中，APT应该是最好的了。 Ubuntu严格来说不能算一个独立的发行版本，Ubuntu是基于Debian的unstable版本加强而来，可以这么说，Ubuntu就是一个拥有Debian所有的优点，以及自己所加强的优点的近乎完美的Linux桌面系统。根据选择的桌面系统不同，有三个版本可供选择，基于Gnome的Ubuntu，基于KDE的Kubuntu以及基于Xfc的Xubuntu。特点是界面非常友好，容易上手，对硬件的支持非常全面，是最适合做桌面系统的Linux发行版本。 伟大的Gentoo是Linux世界最年轻的发行版本，正因为年轻，所以能吸取在她之前的所有发行版本的优点，这也是Gentoo被称为最完美的Linux发行版本的原因之一。Gentoo最初由Daniel Robbins(FreeBSD的开发者之一)创建，首个稳定版本发布于2002年。由于开发者对FreeBSD的熟识，所以Gentoo拥有媲美 FreeBSD的广受美誉的ports系统——Portage包管理系统。不同于APT和YUM等二进制文件分发的包管理系统，Portage是基于源代码分发的，必须编译后才能运行，对于大型软件而言比较慢，不过正因为所有软件都是在本地机器编译的，在经过各种定制的编译参数优化后，能将机器的硬件性能发挥到极致。Gentoo是所有Linux发行版本里安装最复杂的，但是又是安装完成后最便于管理的版本，也是在相同硬件环境下运行最快的版本。 最后，介绍一下FreeBSD，需要强调的是：FreeBSD并不是一个Linux系统!但FreeBSD与Linux的用户群有相当一部分是重合的，二者支持的硬件环境也比较一致，所采用的软件也比较类似，所以可以将FreeBSD视为一个Linux版本来比较。FreeBSD拥有两个分支： stable和current。顾名思义，stable是稳定版，而current则是添加了新技术的测试版。FreeBSD采用Ports包管理系统，与Gentoo类似，基于源代码分发，必须在本地机器编后后才能运行，但是Ports系统没有Portage系统使用简便，使用起来稍微复杂一些。 FreeBSD的最大特点就是稳定和高效，是作为服务器操作系统的最佳选择，但对硬件的支持没有Linux
Ubuntu 18.04是一个长期支持（LTS）版本，LTS 版本每两年发布一次，而 Ubuntu 18.04 是自 2016 年以来的第一个长期支持版本。Ubuntun 长期支持版本可以获得 Canonical 官方长达五年的技术支持，这意味着在 2023 年之前所有用户都可以放心使用 Ubuntu 18.04 LTS。。本教程将展示如何将您的CVM从Ubuntu 16.04（Xenial Xerus）或Ubuntu 17.10（Artful Aardvark）升级到Ubuntu 18.04（Bionic Beaver） ）。
Secure Shell（安全外壳协议，简称SSH）是一种加密的网络传输协议，可在不安全的网络中为网络服务提供安全的传输环境。SSH通过在网络中创建安全隧道来实现SSH客户端与服务器之间的连接。虽然任何网络服务都可以通过SSH实现安全传输，SSH最常见的用途是远程登录系统，人们通常利用SSH来传输命令行界面和远程执行命令。
–enable-R-shlib 表示生成libR.so库，当需要进行gcc等编译的时候很重要，确保之后安装R-studio-server时会出现 找不到"lib.so"文件的错误。
《求生之路2》（英语：Left 4 Dead 2）是2008年由V社开发、以丧尸为主题的恐怖生存类游戏《求生之路》的续作，游戏初次于2009年电玩E3展亮相，并已在2009年11月17日于PC以及Xbox 360平台上发行。本教程将解释如何准备您的腾讯云CVM服务器，安装SteamCMD，然后在Debian或Ubuntu上安装和配置Left 4 Dead 2。
Linux最早由Linus Benedict Torvalds在1991年开始编写。在这之前，Richard Stallman创建了Free Software Foundation（FSF）组织以及GNU项目，并不断的编写创建GNU程序（此类程序的许可方式均为GPL: General Public License）。在不断的有杰出的程序员和开发者加入到GNU组织中后，便造就了今天我们所看到的Linux，或称GNU/Linux。
饥荒（英语：Don't Starve，直译为别饿死）是一款由加拿大公司Klei Entertainment开发的开放世界生存游戏。这个游戏围绕在一位名叫Wilson的科学家，他发现自己身处黑暗阴暗的世界，必须尽可能长时间生存。为此，玩家必须保持Wilson的健康、食物和精神稳定来避免了各种超现实和超自然的敌人杀死和吞噬他。
CoreOS是一个Linux发行版，专注于利用Docker容器和服务查询快速启动集群环境。但是，Docker镜像可能占用Docker主机上相当多的磁盘空间。普通映像的大小可以达到数百MB，自定义映像也可以随便就达到1 GB。如果您的应用程序有许多新的Docker镜像版本，它们可以轻松地存储在服务器存储上；如果您不时清除旧的或未使用的镜像，则服务器可能会耗尽磁盘空间。
怎样登陆服务器？——xshell(windows用户)，需要账号密码IP及网络四大条件
2016年10月19日，披露了Linux内核中的权限提升漏洞。该漏洞被昵称为Dirty COW，因为底层问题是内核处理写时复制（COW）的方式。Dirty COW已经存在了很长时间 - 至少自2007年以来，内核版本为2.6.22 - 所以绝大多数服务器都处于危险之中。
虽然mysqldump工具是数据库系统的首选备份方法，但它仅在数据库服务器可运行时才有效。如果无法启动数据库或无法访问主机系统，我建议直接复制数据库。
windows用xshell，操作流程：https://www.jianshu.com/p/8a340b103a41（生信星球）
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