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基因组选择和SNP分析在ASREML-SA中的实现方法

基因组选择在育种中的应用, 其基础是常规的系谱动物模型, 动物模型也可以很复杂, 看一下asreml的说明书就知道了, 有300多页, 据我了解, 其厚度可以用这个公式表示: ?...这个教程是asreml在基因组选择和分子育种中的应用, 下面是我的读书笔记....简介 这篇文档的主要目标是介绍ASReml在基因组分析中的实现方法, 它假定读者有一定的统计基础....相关的R包, 参考wgaim包 在下一章节中, 我们将对GS的延伸方法: Fast Bayes A进行介绍. 4, 基因组选择的其它方法 EM BayesA-like方法, 参考 Sun et al....PEV会给出标记的标准误, 结果不可靠 基因型的GBLUP在.sln中, mark的效应在.mef中, 标记的权重(weight)在.mef中, 大效应的标记在.res文件中. 6, asreml基因组选择考虑

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Python 中的正则表达式全部用法速查

字符  元字符 : 特殊字符  它们不匹配自己,在正则中具有其它的意义,匹配自己需要转义. ...groupindex命名捕获组的字典,如果没有命名捕获组则字典为空pattern编译对象的原始样式字符串 模块的顶级方法   顶级函数允许同时传入正则表达式和要匹配的字符串,返回值和re.compile...P=word)\b') p.search('Paris in the the spring').group() # 'the the' 传递到 re.sub() 里的 repl 参数中  非捕获组  (...:表达式)  对部分值进行匹配但不作为结果,也不会分配组号,当然也不能在表达式和程序中做进一步处理除了无法检索组匹配内容的事实外,非捕获组的行为与捕获组完全相同可以在里面放任何东西,用重复元字符重复它可以用它添加新组而不更改所有其他组的编号方...将多个字符替换为其它多个字符或删除,使用translate()替换re.sub()  在转向re模块之前,请考虑是否可以使用更快更简单的字符串方法解决问题  区别search()和match()  总体来说

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    超详细的字符串用法大全

    方法做字符串替换 利用正则表达式中的捕获组,捕获每个部分的内容,然后在替换在替换的字符串中调整各个捕获组的顺序!...('(\d{4})-(\d{2})-(\d{2})', r'\2/\3/\1', file)) 捕获组中每组需要用括号括起来,然后默认从左至右分为组1, 组2… 下一个参数是我们要替换的格式,用 1,...2,3 分别表示组1, 组2… 运行结果如下: 对字符串进行左,右,居中对齐 解决方案: 1.使用字符串中的 str.ljust(), str.rjust(), str.center() 进行左右居中对齐...hǎo mā 解决方案: 使用 str.strip(), str.lstrip(), str.rstrip() 方法去掉字符串两端字符 使用 str.replace() 或者正则中的 re.sub()...使用字符串中 str.translate() 方法,可以同时删除多个不同的字符

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    【Python】正则表达式的艺术:轻松驾驭 Python 的re库

    1.案例引入 本文将会先介绍什么是正则表达式,然后在介绍正则表达式在python中的应用。 下方图片及案例思路来自:正则表达式 在没有学习正则表达式前,当你被要求实现上图的功能,你会怎么实现呢?...与普通的捕获组 () 不同,命名捕获组为每个捕获的子表达式指定一个可读的名称,而不仅仅使用数字索引来引用它。这使得代码更加易读,特别是在多个捕获组时,能够明确标明每个捕获组的意义。...是正则表达式中的正向前瞻(Positive Lookahead),用于在某个位置检查后面是否跟着某个特定的模式,但不会消耗这些字符,即匹配时并不会把 (?=...) 中的内容包括在最终结果中。...match object的常见方法和属性: group():返回匹配到的子串。 group(0):返回整个匹配到的字符串。 group(n):返回第n个捕获组(如果存在的话)。...总结 正则表达式是处理文本数据的强大工具,它以灵活的模式匹配能力广泛应用于数据清洗、验证、提取和替换等任务中。

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    超详细Python字符串用法大全

    我们想把其中的日期改为美国日期格式'mm/dd/yyyy'.比如 2019-06-12 改成 06/12/2019 格式 解决方案:使用 re 中的 sub() 方法做字符串替换 利用正则表达式中的捕获组...,捕获每个部分的内容,然后在替换在替换的字符串中调整各个捕获组的顺序!...('(\d{4})-(\d{2})-(\d{2})', r'\2/\3/\1', file)) 捕获组中每组需要用括号括起来,然后默认从左至右分为组1, 组2… 下一个参数是我们要替换的格式,用 1,2...hǎo mā 解决方案: 使用 str.strip(), str.lstrip(), str.rstrip() 方法去掉字符串两端字符 使用 str.replace() 或者正则中的 re.sub()...使用字符串中 str.translate() 方法,可以同时删除多个不同的字符 以上便是今天为大家总结的字符串常用方法,感谢大家阅读,希望对各位有所帮助。

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    关于字符串处理,你真的全掌握了吗?

    我们想把其中的日期改为美国日期格式'mm/dd/yyyy'.比如 2019-06-12 改成 06/12/2019 格式 解决方案:使用 re 中的 sub() 方法做字符串替换 利用正则表达式中的捕获组...,捕获每个部分的内容,然后在替换在替换的字符串中调整各个捕获组的顺序!...('(\d{4})-(\d{2})-(\d{2})', r'\2/\3/\1', file)) 捕获组中每组需要用括号括起来,然后默认从左至右分为组1, 组2… 下一个参数是我们要替换的格式,用 1,2...hǎo mā 解决方案: 使用 str.strip(), str.lstrip(), str.rstrip() 方法去掉字符串两端字符 使用 str.replace() 或者正则中的 re.sub()...使用字符串中 str.translate() 方法,可以同时删除多个不同的字符

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    正则表达式

    一、在python中, 使用正则表达式, 需要导入re模块 import re 二、普通字符匹配, 使用findall 1 #字符匹配, 普通字符 2 #findall: 返回所有满足条件的列表集合 3...返回结果是(3, 6) print( matchObject.span( 2 ) ) # re.sub: 替换 # re.sub(pattern, repl, str, max=0, flags=...0) # re.sub("查找字符串","替换后的字符串","字符串","替换次数,默认是0,全部替换", 替换模式) print( re.sub( "g.t", "have", "I get you,...只需转换一次, 即正则表达式转换   l ) 优先捕获 #优先捕获 #在findall里面,如果正则表达式有()也就是组, 则优先取得组的内容. print(re.findall("www....(baidu|sina).com","www.baidu.com")) # 结果返回: baidu #在组的前面加一个?: 则去掉优先捕获 print(re.findall("www.(?

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    Python:爬虫系列笔记(6) -- 正则化表达(推荐)

    3.正则表达式相关注解 (1)数量词的贪婪模式与非贪婪模式 正则表达式通常用于在文本中查找匹配的字符串。...例如 1 pattern = re.compile(r'hello') 在参数中我们传入了原生字符串对象,通过compile方法编译生成一个pattern对象,然后我们利用这个对象来进行进一步的匹配。...值与Pattern.match()和Pattern.seach()方法的同名参数相同。 5.lastindex: 最后一个被捕获的分组在文本中的索引。如果没有被捕获的分组,将为None。...4.start([group]): 返回指定的组截获的子串在string中的起始索引(子串第一个字符的索引)。group默认值为0。...5.end([group]): 返回指定的组截获的子串在string中的结束索引(子串最后一个字符的索引+1)。group默认值为0。

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    今天我把话放这儿,明天我要会【正则表达式】

    ---- 文章目录 第一题:普通字母匹配 第二题:大杂烩 第三题:否定式上场 第四题:依旧练否定式 第五题:捕获组 补缺补漏 贪婪与非贪婪匹配 定位符 修饰符 元字符串 运算符优先级 Python正则表达式...先给个模板函数吧 re.search方法 re.group(s)方法 re.sub方法 findall方法 re.compile方法 正则表达式可视化工具 我想我们就直奔主题吧,不想废话了,能点进来的也是想学点干货嘛...第五题:捕获组 说实话,我觉得这个题好像没必要。 这个你们别管了,我直接实现 ---- 题目呢,就讲解这些。 后面各位还需要加强训练,反正题库也给你们了。...re.sub方法 re.sub用于替换字符串中的匹配项。...findall方法 在字符串中找到正则表达式所匹配的所有子串,并返回一个列表,如果没有找到匹配的,则返回空列表。 findall(pattern,string) 这是一种,我就不演示啦。

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    玩转Python正则表达式:实用教程带你快速入门

    引言正则表达式是一种强大的文本匹配和处理工具,广泛应用于各种编程语言中。在Python中,我们可以使用内置的re模块来处理正则表达式。...else: print("No match")2.3 re.search()方法re.search()方法用于在字符串中搜索匹配模式,如果找到任意位置的匹配,则返回一个匹配对象;否则返回None。...else: print("No match")2.4 re.findall()方法re.findall()方法用于在字符串中搜索所有匹配模式的子串,并将它们作为列表返回。...result = re.findall(pattern, string)​print(result) # Output: ['10', '20']2.5 re.sub()方法re.sub()方法用于在字符串中搜索匹配模式的子串...正则表达式的高级用法3.1 分组和捕获正则表达式中的分组和捕获允许我们将匹配的子串提取出来,并在后续操作中使用。

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    C# WPF MVVM开发框架Caliburn.Micro 名称Transformer⑩①

    使用名称Transformer NameTransformer是在Caliburn.Micro v1.1中引入的,它是ViewLocator和ViewModelLocator如何将类名映射到其伙伴角色的一个组成部分...[A-Za-z_]\w*View$" ); 这两个调用的“globalFilterPattern”参数相同,只是在第二个方法调用的参数中添加了“Views.”。...它只是一个replace值,它将回显所有捕获组以供演示。 您可能会注意到,捕获组并不是相互排斥的。...上面示例中的捕获组“后缀”对以“ViewModels”结尾的名称进行模式匹配。此捕获组的主要目的不是将其用作转换的一部分,因为ViewLocator的目的是解析视图名称。...使用此捕获组的主要原因是防止子字符串“ViewModels”在“basename”组中被捕获,在大多数情况下,这是字符串转换的一部分。

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    一篇搞定Python正则表达式

    来实现 1.3 组与捕获     1 ()的作用:       1. 捕获()中正则表达式的内容以备进一步利用处理,可以通过在左括号后面跟随?:来关闭这个括号的捕获功能       2....:的小括号都会分配一个组好,从1开始,从左到右递增,可以通过i引用前面()内表达式捕获的内容       2. 通过组名反向引用前面小括号内捕获的内容         可以通过在左括号后面跟随?...对于x可以使用/i或者/gid可以是组名或者编号来引用捕获到的内容。       模块方法re.sub(r, x, s, m)中的x可以使用一个函数。...6. rx.subn(x, s, m):       与re.sub()方法相同,区别在于返回的是二元组,其中一项是结果字符串,一项是做替换的个数。     ...字典的键是所有命名的组的组名,值为命名组捕获到的内容       如果有default参数,则将其作为那些没有参与匹配的组的默认值。

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    正则表达式Python_python正则表达式匹配字符串

    (三)组与捕获 1、()的作用: 捕获()中正则表达式的内容以备进一步利用处理,可以通过在左括号后面跟随?:来关闭这个括号的捕获功能。...:的小括号都会分配一个组好,从1开始,从左到右递增,可以通过\i引用前面()内表达式捕获的内容 通过组名反向引用前面小括号内捕获的内容 可以通过在左括号后面跟随?...对于x可以使用/i或者/gid可以是组名或者编号来引用捕获到的内容。 模块方法re.sub(r, x, s, m)中的x可以使用一个函数。...rx.subn(x, s, m): 与re.sub()方法相同,区别在于返回的是二元组,其中一项是结果字符串,一项是做替换的个数。...对于正则表达式的分割功能,可以使用正则表达式对象的split()方法,需要注意如果正则表达式对象有分组的话,分组捕获的内容也会放到返回的列表中。

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    一篇搞定Python正则表达式

    来实现 1.3 组与捕获     1 ()的作用:       1. 捕获()中正则表达式的内容以备进一步利用处理,可以通过在左括号后面跟随?:来关闭这个括号的捕获功能       2....:的小括号都会分配一个组好,从1开始,从左到右递增,可以通过i引用前面()内表达式捕获的内容       2. 通过组名反向引用前面小括号内捕获的内容         可以通过在左括号后面跟随?...对于x可以使用/i或者/gid可以是组名或者编号来引用捕获到的内容。       模块方法re.sub(r, x, s, m)中的x可以使用一个函数。...6. rx.subn(x, s, m):       与re.sub()方法相同,区别在于返回的是二元组,其中一项是结果字符串,一项是做替换的个数。     ...字典的键是所有命名的组的组名,值为命名组捕获到的内容       如果有default参数,则将其作为那些没有参与匹配的组的默认值。

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    Python正则表达式很难?一篇文章搞定他,不是我吹!

    每日分享一些学习的方法和需要注意的小细节 1.3 组与捕获 1 ()的作用: 1. 捕获()中正则表达式的内容以备进一步利用处理,可以通过在左括号后面跟随?:来关闭这个括号的捕获功能 2....:的小括号都会分配一个组好,从1开始,从左到右递增,可以通过i引用前面()内表达式捕获的内容 2. 通过组名反向引用前面小括号内捕获的内容 可以通过在左括号后面跟随?...对于x可以使用/i或者/gid可以是组名或者编号来引用捕获到的内容。 模块方法re.sub(r, x, s, m)中的x可以使用一个函数。...6. rx.subn(x, s, m): 与re.sub()方法相同,区别在于返回的是二元组,其中一项是结果字符串,一项是做替换的个数。...对于正则表达式的分割功能,可以使用正则表达式对象的split方法,需要注意如果正则表达式对象有分组的话,分组捕获的内容也会放到返回的列表中

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    【珍藏版】长文详解python正则表达式

    接下来本文将会介绍这些函数的使用情况,然后通过分析编译流程对比两种re模块的调用方式,之后会介绍其他一些应用正则表达式需要知道的理论知识,最后通过一些经典的实例将之前学习的理论应用于实际。...3. re.sub函数 功能:re.sub用于替换字符串中的匹配项。...匹配到的; 因为只有匹配结果中只有两组,所以如果填 3 时会报错。...扩展:其他组操作如:命名组的使用、定义无捕获组、使用反向引用等,这部分内容还未弄懂,想了解的同学可以查看以下链接http://wiki.jikexueyuan.com/project/the-python-study-notes-second-edition...接下来我将整理一些常见的正则表达式应用实例,大家可以试着将前面学的理论知识应用于实践啦。 (1)匹配国内13、15、18开头的手机号码的正则表达式 ?

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    Python正则表达式很难?一篇文章搞定他,不是我吹!

    来实现 1.3 组与捕获 1.3.1 ()的作用: 1. 捕获()中正则表达式的内容以备进一步利用处理,可以通过在左括号后面跟随?:来关闭这个括号的捕获功能 2....:的小括号都会分配一个组好,从1开始,从左到右递增,可以通过i引用前面()内表达式捕获的内容 2. 通过组名反向引用前面小括号内捕获的内容 可以通过在左括号后面跟随?...对于x可以使用/i或者/gid可以是组名或者编号来引用捕获到的内容。 模块方法re.sub(r, x, s, m)中的x可以使用一个函数。...6. rx.subn(x, s, m): 与re.sub()方法相同,区别在于返回的是二元组,其中一项是结果字符串,一项是做替换的个数。...对于正则表达式的分割功能,可以使用正则表达式对象的split方法,需要注意如果正则表达式对象有分组的话,分组捕获的内容也会放到返回的列表中

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