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我是.sh脚本的初学者，所以请原谅我的无知。这是我的问题：#!/bin/sh ########## Begin Slurm header ###########SBATCH --job-name=blabla########### End Slu
浏览 0提问于2021-09-17得票数 3
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在previous question中，我询问如何将作业B排队，使其在作业A之后开始，这是通过 sbatch --dependency=after:123456:+5 jobB.slurm 其中123456sbatch jobA.slurm将返回Submitted batch job 123456，我需要将作业id传递给除了第一个作业之外的所有依赖项的调用。由于我使用的是一个繁忙的集群，我不能依赖于将作业ids递增1
浏览 86提问于2021-01-12得票数 1
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我使用用pytorch_lightning (pytorch)编写的深度学习模型，并在slurm集群上对它们进行训练。我像这样提交作业： sbatch --gpus=1 -t 100 python train.py 当请求的GPU时间结束时，slurm会终止我的程序，并显示以下消息： Epoch 0: : 339itslurmstepd: error: *** JOB 375083 ON cn-007 CANCELLED AT 2021-10-04T22:20:54 D
浏览 332提问于2021-10-04得票数 1
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我需要使用sbatch / slurm运行python脚本，脚本工作到必须使用ptemcee的步骤(即运行monte马尔可夫链)。在这个步骤中，什么都不会发生(就像脚本落入无限循环中一样)。我知道脚本中没有错误，因为当我从slurm中运行它时，它工作正常。有人知道我应该如何在S批/ slurm中运行ptemcee (或emcee)？
#!/usr/bin&#x
浏览 5提问于2021-11-21得票数 0
Slurm sbatch将stdout和stderr定向到由-o和-e标志指定的文件，但如果文件路径包含不存在的目录，则无法这样做。是否有办法自动生成我的日志文件的目录？让作业名称的变化存在于文件名中，而不是目录中，这会造成大量的、组织不良的日志，当我需要检查我的作业做得如何时，我必须对其进行排序。我找到这样做的唯一方法是将对sbatch的调用封
浏览 0提问于2019-01-25得票数 9
我可以使用slurm访问集群，并希望将其扩展为使用python来编写批处理提交脚本。我该怎么做？#!/bin/python#!/usr/bin/env python
为了完成，这里是我的</e
浏览 13提问于2020-03-27得票数 0
当我试图在Ubuntu上设置一个虚拟环境时，使用"virtualenv -系统站点-packages myenv"，并试图使用slurm (srun/sbatch)运行python脚本时，我遇到了一个问题尽管我以前运行代码时没有问题，但在这一点上，当我的环境被激活(源代码./myenv/bin/activate)运行时，我得到了一个"ModuleNotFoundError"。我注意到，虽然我可以在当前环境激活的</em
浏览 5提问于2020-10-03得票数 2
我一直在努力尝试让python脚本的多个实例在SLURM上运行。在我的登录节点中，我已经安装了python3.6，并且我有一个python脚本"my_script.py“，它接受一个文本文件作为输入来读取运行参数。/slurmd/job00130/slurm_script: line 9: python3.6: command not 当我尝试以数组的</
浏览 2提问于2018-10-24得票数 0
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将参数传递到slurm脚本
、、、、
我使用slurm脚本在集群上运行用于Matlab计算的数组。每个脚本都使用一个数组来循环matlab参数。例如，我的slurm文件当前看起来像Shell脚本<
浏览 0提问于2019-06-18得票数 2
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我对HPC和SLURM特别陌生。下面是我用来运行python脚本的示例代码：#SBATCH --mem 0 --num_nodes 4 \现在，每当我使用sbat
浏览 5提问于2021-04-11得票数 2
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因此，我有一个使用多处理的python脚本，它有4种运行方式，这取决于它在运行时读取的环境变量APP_TYPE。python script started
浏览 1提问于2021-05-28得票数 0
我已经写了一个python脚本，我打算将它传递到我的大学的Slurm sbatch系统上进行计算。我已经编写了一个简短的shell脚本，它应该只是将python脚本输入到sbatch系统中，但我得到了一个错误，内容是：
python:无法打开文件“”Retrie.py“”：Errno 2没有这样的文件或目录即使在网上阅读了很多关于该系统的内容后，
浏览 22提问于2021-03-08得票数 0
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我可以访问一个计算集群，特别是一个具有两个12核心CPU的节点，它与一起运行。有谁有关于这个主题的想法、教程或任何来源吗？
浏览 8提问于2016-01-16得票数 20
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我已经编写了一个需要两个参数的python脚本，当我在命令行中使用以下命令运行它时，该脚本工作得很好：我需要在SLURM批处理脚本中运行它，但是每当我这样做时这是我使用的脚本的一个示例：#SBATCH --ntasks-per-node=1
#SBATCH --cpus-per-tas
浏览 1提问于2015-07-06得票数 5
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我有一个运行在slurm上的python程序。我的python程序正在导入不同的包。当我尝试import cv2时，我面临以下错误：ImportError: No module named 'cv2'#!/bin/bash#SBATCH --account=default
#
浏览 5提问于2017-04-26得票数 2
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我想运行官方视频分类脚本here。 我计划在slurm机器上运行它。如果我想在2个节点上运行这个脚本，每个节点都有8个V100 GPU，我不确定如何正确设置SBATCH参数--ntasks或--ntasks-per-node。
浏览 446提问于2021-01-25得票数 1
Problem：在这个的启发下，我尝试编写一个包装器脚本来提交带bash变量的SLURM数组作业。但是，我遇到了像$SLURM_ARRAY_TASK_ID这样的SLURM环境变量的问题，因为它是一个空变量。我怀疑这与test_wrapper.sh如何解析尚未定义的SLURM变量有关，但我似乎找不到解决方案。下面我提供了一个简单python脚本的工
浏览 45提问于2022-09-16得票数 0
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我是一名癌症研究人员，我们想知道你们中是否有人知道如何编写一个调用其他SLURM的SLURM脚本。如果上一个脚本成功完成，则继续执行下一个调用。也就是说，类似于：#SBATCH --nodes=1 #SBATCH --time=24:00:00
#SBATCH --mem=40GB?#SBATCH
浏览 7提问于2018-12-07得票数 2
对于slurm作业，环境变量$SLURM_JOB_NUM_NODES提供请求的节点数。#!/bin/bash#S
浏览 7提问于2022-01-28得票数 2
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