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跟着Nature学作图:R语言ggplot2散点图并给指定的点添加颜色

最基本的散点图 library(tidyverse) fig1a<-read_delim("data/20230521/Figure1a.txt", delim = " ")...shape=21, fill="#f1f1f1", color="black")+ theme_bw() image.png 给指定的点映射颜色...这里我的处理方式是把想要映射颜色的点单独挑出来,然后再叠加一层 geneSelected<-c("ZBP1","IFNB1","CGAS","IFNAR1","STING","IFNAR2") match...(geneSelected,fig1a %>% pull(Gene)) 本来是想用上面的代码把图例基因的数据匹配出来,但是有些基因名没有找到,这里我就随机选择几个了 fig1a %>% sample_n...,内容可能会存在错误,请大家批判着看,欢迎大家指出其中的错误 示例数据和代码可以给推文点赞,然后点击在看,最后留言获取 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享

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如何在 Python 中的绘图图形上手动添加图例颜色和图例字体大小?

散点图没有大小或颜色信息,也不会显示悬停信息。绘图标题设置为“我的标题”。...然后使用 px.scatter() 方法创建散点图。数据帧中的“考试 1 分数”和“考试 2 分数”列分别用作 x 轴和 y 轴。“性别”列用于使用颜色参数对图中的标记进行颜色编码。 ...要创建散点图,使用了 Plotly Express 中的 px.scatter() 函数,并将数据集中的“total_bill”和“tip”列指定为图的 x 轴和 y 轴。...“size”列被指定为标记的大小,“color”列被指定为变量,用于根据支付账单的人的性别为标记着色。绘图的标题设置为“提示数据”。...legend_font_color='green', legend_font_size=14) # display the plot fig.show() 输出 结论 因此,我们学会了如何在 Python 中手动将图例颜色和图例字体大小添加到绘图图形中

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    seaborn关联图表之折线图和散点图

    折线图和散点图是最常用的展示两个变量间关系的图表,在seaborn中,通过以下两个函数来绘制对应的图形 1. satterplot, 绘制散点图 2. lineplot, 绘制折线图 seaborn采用了类似...除此之外,其他列的变量可以作为属性的映射,常用的属性映射列表如下 1. hue, 用于映射颜色 2. size,用于映射线条的宽度或者点的大小 3. style, 用于映射线条的样式或者点的样式 散点图的代码示例如下...seaborn会自动进行属性映射,并将对应的属性添加到图例上,在映射时,我们可以通过以下两类参数来控制对应的映射属性 1. order 该系列包含了以下3个参数 1. hue_order 2. size_order...从图例可以看出,会按照hue_order自定的顺序去映射颜色梯度,其实style属性也是类似的效果。...但是有一个例外,就是size属性,当size属性对应的列为数值时,seaborn会自动将数值设置为点的大小,此时指定size_order属性时没用的。

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    matplotlib基础绘图命令之scatter

    在matplotlib中,scatter方法用于绘制散点图,与plot方法不同之处在于,scatter主要用于绘制点的颜色和大小呈现梯度变化的散点图,也就是我们常说的气泡图。...x和y参数指定x轴和y轴坐标,s参数指定mark size, 即点的大小,c参数指定color,即颜色。...简单的散点图,用plot方法绘制速度会更快,scatter方法则慢一点,所以只有当颜色和大小超过了一定数量时,才推荐使用scatter方法。...点的大小图例 legend_elements方法是有很多参数可以调整的,其中prop参数指定返回的信息,有两种取值,默认是colors, 表示返回的是点的颜色信息,取值为sizes时,返回的是点的大小信息...本公众号深耕耘生信领域多年,具有丰富的数据分析经验,致力于提供真正有价值的数据分析服务,擅长个性化分析,欢迎有需要的老师和同学前来咨询。

    1.2K10

    53-R可视化-二-基础包绘图的入门功夫

    颜色 col # 默认绘图颜色,如 col = c('red', 'blue') col.axis # 坐标轴刻度的颜色 col.lab # 坐标轴的名字颜色 col.main # 标题的名字颜色 col.sub...指定绘图使用的字体样式。1=常规,2=粗体,3=斜体,5=符号字体 Adobe 编码。...图例 legend(),常用选项包括: x,y # 指定图例所在的坐标位置,坐标可以通过locator 函数获取。...title # 图例标题的字符串 legend # 图例的名字 horiz # 默认F,T则会水平放置图例 文本标注 text() 或mtext() 可以添加文本到图形上,其中text() 会将文本添加到图形上...获取位置坐标 如果你是在具有图形界面的系统中使用R,则可以通过下面的函数,在图形界面上选择某个点,获取其坐标: > locator(1) # 点一下你的绘图Quartz界面 $x [1] 1.634064

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    R绘图笔记 | 一般的散点图绘制

    lty=1, lwd=2, col=col) legend # 逻辑词,当按组绘制散点图且为TRUE时图上显示图例;为FALSE则不绘制图例; grid # 逻辑词,为TRUE则绘制浅灰色背景网格; groups...等; col # 未分组时,直接指定绘制颜色;分组时,设置参数长度应等于组数的颜色向量; pch # 点的绘图符号;分组时默认按顺序使用字符; library(car) scatterplot(Volume..., "confidence"、"t"、"norm"、"euclid"等 ellipse.alpha # 椭圆的透明度,用于指定填充颜色的透明度,无填充颜色,设置为0。...ellipse.border.remove # 逻辑词,为TRUE,则删除椭圆边框线 mean.point # 逻辑词,为TRUE,则将分组平均点添加到绘图中 mean.point.size # 指定平均点大小的数值...# 长度为2的数字向量,指定相关系数的x、y坐标,默认值为NULL cor.coef.size # 相关系数文字字体的大小 ggp # 不为NULL,则将点添加到现有绘图中 show.legend.text

    5.3K20

    Python气象绘图教程(十四)

    图例与句柄之间间距 columnspacing 列间距 title 图例标题 bbox_to_anchor 指定图例在轴的位置 在之前,我们制作了一个墒情图,本次即以此图展示legend命令。...,所以就有bbox_to_anchor命令,这个命令类似于前面推荐的add_axes命令,指定的是图例的绝对位置,不妨通过上一个图片展示: ax2.legend((bar1,bar2,line1,line2...这之后,合并的图例能正常显示了。当然散点图也能进行分类处理: ? 其他绘图样式也都可以在图例中进行分组: ?...五、散点图多变量下图例的添加 在前面的推送中,介绍到散点图的两种使用方法:一种为以s为变量,固定颜色,通过散点直径大小展示数据;一种是以颜色映射为变量,固定s,通过填色变化来展示数据。...B、通过两个图例分别展示散点直径和散点颜色 前面的程序与A中完全相同,在第四节中已经讲了如何建立多个子图,这里马上就上手使用了,这次不使用colorbar展示颜色变化,而使用带颜色的散点: from matplotlib.lines

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    Day7:R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    加载ggplot2,它是tidyverse包的一部分。 library(ggplot2) ggplot()函数用于初始化基本图形结构。基本思想是指定绘图的不同部分,并使用+运算符将它们添加到一起。...映射的例子包括: 位置(即在x和y轴上) 颜色(“外部”颜色) 填充(“内部”颜色) 形状(点数) 线型 尺寸 首先,必须添加x轴和y轴的位置,因为geom_point需要有关散点图的最基本信息,即要在...ggscatter1 有了必须的映射,再为图片添加一些可选的映射,比如颜色。通过指定列标题来,按照基因型给点上色。自动使用一组默认颜色,不必指定。此外,ggplot2还自动绘制了图例!...ggbox 注意:如果要更改这些箱线图的颜色,scale_fill_manual()可以在代码中添加另一个图层,并在函数中使用values参数指定要使用的颜色。...注意:不限于上面指定的颜色,你可以使用十六进制代码选择许多颜色,获取有关R中调色板的更多信息:http://www.cookbook-r.com/Graphs/Colors_(ggplot2)/。

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    Python+matplotlib数据可视化设置图例3个精选案例

    本周推荐书目:《Python程序设计实验指导书》,董付国编著,清华大学出版社 正文=================== 图例往往位于图形的一角或一侧,用于对所绘制的图形中使用的各种符号和颜色进行说明...'、'xx-large' numpoints 用来指定折线图的图例中显示几个标记符号的整数 scatterpoints 用来指定散点图的图例中显示几个标记符号的整数 markerscale 用来指定图例中标记符号与图形中原始标记符号大小的相对比例...用来指定图例是否显示阴影的布尔值 framealpha 用来指定图例背景透明度的实数 facecolor 用来指定图例的背景颜色 edgecolor 用来指定图例的边框颜色 mode 如果设置为"expand...columnspacing 用来指定图例的多栏之间横向距离的实数 例1 绘制正线余弦图像,然后设置图例字体、标题、位置、阴影、背景色、边框颜色、分栏、符号位置等属性。...例3 生成模拟数据,绘制正弦曲线、余弦曲线和两个散点图,然后分别为曲线和散点图设置图例,在一个图形上显示两个图例。 ? 运行效果: ?

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    8个plotly绘图技巧

    公众号:尤而小屋作者:Peter编辑:Peter大家好,我是Peter~本文介绍可视化神器plotly绘图的8个常见技巧点:如何添加标题及控制标题的颜色和大小如何自定义x轴和y轴的名称饼图中如何同时百分比和数值如何控制柱状图宽度如何添加注释如何绘制多子图如何添加图例以及控制其大小...、颜色如何快速绘制桑基图什么是PlotlyPlotly 是一个用于创建交互式数据可视化的 Python 库,它允许你轻松地生成各种类型的图表和图形,包括折线图、散点图、柱状图、饼图、热力图、3D 图等。...美观性: Plotly 图表具有出色的视觉效果和美观性,支持自定义样式和主题,以满足不同的可视化需求。...fig.update_layout( title_text="多子图示例", showlegend=False, # 隐藏图例)# 显示图表fig.show()图片如何添加图例以及控制其颜色...、大小、位置等In 10:import plotly.graph_objects as go# 创建散点图fig = go.Figure()# 添加散点图数据并设置图例标签、颜色和大小fig.add_trace

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    R for data science (第一章)①Chapter1 使用ggplot2进行数据可视化

    4.制作hwy vs cyl的散点图。 5.如果你制作一个类vs drv的散点图会发生什么? 为什么情节没用?...您可以将第三个变量(如类)添加到二维散点图中,方法是将其映射到美学。aesthetic是你的情节中物体的视觉属性。美学包括诸如点的大小,形状或颜色之类的东西。...ggplot2还将添加一个图例,说明哪些级别对应于哪些值。 颜色显示许多不寻常的点是双座汽车。这些车似乎不像混合动力车,实际上是跑车!...它选择了一个合理的尺度来与美学一起使用,它构建了一个解释水平和价值之间映射的图例。对于x和y美学,ggplot2不会创建图例,但会创建带有刻度线和标签的轴线。...不同之处在于颜色的相互作用。 中空形状(0-14)具有由颜色确定的边界; 实心形状(15-18)充满了颜色; 填充的形状(21-24)具有颜色边框并填充填充。

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    复杂相关性散点图复现(ggplot2绘图的层层递进)

    # 计算图例里需要绘制多少圆圈 num <- length(unique(data$range2)) num # 散点图例 points(x = rep(par("usr")[2] + 2.2,...# 设置bty="o"会使得图形具有一个完整的矩形边框 par(new = T, bty="o") # 这行代码创建一个空白的图形窗口,具有指定的坐标轴范围,但没有轴标签和刻度。...,需要下很深的功夫,一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个映射。...✦ 标度(Scales)是将数据的取值映射到图形空间,例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值,展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。...✦ 分面(faceting)如何将数据分解为子集,以及如何对子集作图并展示。 ✦ 主题(theme)控制细节显示,例如字体大小和图形的背景色。

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    机器学习笔记之Matplotlib库legend() scatter() plot() figure() subplot()函数参数解释

    0x01 plt.lengend() 用于给图像加图例。 图例是集中于地图一角或一侧的地图上各种符号和颜色所代表内容与指标的说明,有助于更好的认识地图。...the number of points in the legend for scatter plot 为散点图图例条目创建的标记点数 scatteryoffsets a list of yoffsets...for scatter symbols in legend 为散点图图例条目创建的标记的垂直偏移量 frameon If True, draw the legend on a patch (frame...between columns 列间距 title the legend title bbox_to_anchor the bbox that the legend will be anchored.指定图例在轴的位置...图表的整个绘图区域被分成numRows行和numCols列,plotNum参数指定创建的Axes对象所在的区域(左上角序号为1) 如果行数、列数和序号都是个位数可以简写成一个整数,否则需要用逗号隔开。

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    Python自动化办公-玩转图表

    通过散点图的方式采用不同维度展示花的特性,让你能根据颜色把三种花区分出来,我们来看一下代码: import seaborn as sns import ssl import matplotlib.pyplot...,设置点的颜色和样式 sns.pairplot(iris, kind = 'scatter', #散点图 diag_kind = 'hist', #直方图 hue = 'species', #按照某一字段进行分类...我在代码中使用了示例数据“鸢尾花分类”来为你展示数据的加载。 第二部分,sns.pairplot 是指定图表类型,它是由“kind = 'scatter'”参数指定的。...例如我指定了每个点的大小“height=2”,以及指定了色彩样式“palette='husl'”,并为每个列指定不同的颜色“hue = 'species'”。...同时你会发现,在某一维度下,其中一种颜色和其他颜色有明显的分界,非常容易把其中一种和另外两种花区分开。

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    数据科学 IPython 笔记本 8.9 自定义图例

    例如,我们可以指定位置并关闭边框: ax.legend(loc='upper left', frameon=False) fig 我们可以使用ncol命令来指定图例中的列数: ax.legend(frameon...'], cities['area_total_km2'] # 将点绘制为散点图,使用尺寸和颜色,但没有标签 plt.scatter(lon, lat, label=None,...在这种情况下,我们想要的对象(灰色圆圈)不在图上,所以我们通过绘制空列表来伪造它们。另请注意,图例仅列出了指定标签的绘图元素。...我们可以通过从头开始创建一个新的图例艺术家来解决这个问题,然后使用较低级别的ax.add_artist()方法,手动将第二个艺术家添加到绘图中: fig, ax = plt.subplots() lines...来实现),你会看到该函数只包含一些逻辑,创建合适的Legend艺术家,然后将其保存在legend_属性中,并在绘图时添加到图形中。

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