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ggplot2学习笔记之图形排列

改变排列图的行列 设置面板为两行两列，其中sp占据第一行的两列，bxp以及dp置于第二行的两列 ggarrange(sp, #First row with scatter plot(sp) ggarrange...R包cowplot cowplot::ggdraw()可以将图形置于特定位置, ggdraw()首先会初始化一个绘图面板， 接下来draw_plot()则是将图形绘制于初始化的绘图面板中，通过参数设置可以将图形置于特定位置...draw_plot(plot, x=0, y=0, width=1, height=1) 其中： plot:将要放置的图形 x,y:控制图形位置 width,height:图形的宽度和高度 draw_plot_label...要相对grid.arrange()以及arrangeGrob()的输出进行注释，首先要利用as_ggplot()将其转化为ggplot图形，进而利用函数draw_plot_label()对其进行注释。...ymin, ymax) 其中： grob:要添加的图形元素 xmin, xmax: x轴方向位置（水平方向） ymin, ymax: y轴方向位置（竖直方向） ggplot图形中添加table density.p

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R语言统计与绘图：给组合图形添加ABCD小标签

前面我们学习了ggplot2中组合图形的绘制，在科研论文中，组合图形每张子图通常需要加上ABCD等标签，如下图所示。 ? 这种ABCD标签既可以在PS或者AI中添加，也可以在R中直接添加。...今天我们来学习组合图形中怎么添加ABCD标签。 组合图形的标签添加可以使用ggpubr包的ggarrange()函数或annotate_figure()函数。 1....() 3. ggarrange()函数添加标签 在ggarrange()函数中，使用labels参数给每张小图添加标签。...label.x、label.y # 相对于子图，图标签x、y位置的值或向量，x默认为0，y默认为1，也就是左上角； hjust、vjust # 调整每个标签的水平或垂直位置，单个值应用于所有标签，值向量应用于每个标签...widths # 相对列宽度的数值向量；如widths = c(2, 1)表示第1列宽度是第2列宽度的两倍 heights # 同上 legend # 指定图例位置的字符；允许值为"top", "bottom

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    R包：gtable包用于处理ggplot2图像

    很多工具包都可以进行拼图或嵌图， 比如cowplot、patchwork、ggpubr、gridExtra等等，但是gtable是相对底层的进行操纵ggplot2对象的包。...对于ncol、nrow参数而言，它们几乎已经是拼图布局的行列定义的标签了，在多个拼图工具中都能见到，比如ggpubr的ggarrange函数，当然这也不奇怪，毕竟ggarrange就是依赖的cowplot...其实只需要简单修改就可以实现不同比例的拼图，比如让左右两图的宽度是2:1，那么只需要设置好新建gtable的宽度为2null和1null即可。如下图所示。...另外更有意思的是，新建gtable的宽度并非要求整数，gtable(widths = unit(c(1, 0.5), "null"), heights = unit(1, "null"))也是可以的。...这里的0.6是相当于整个绘图区域而言（下图灰色部分），而不是第一张图的坐标轴显示区域， 其值是相对值，最宽最高代表值为1。

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    多子图如何一键绘制标签label?这些技巧推荐收藏~~

    今天小编给大家介绍一个绘图小娇巧-多图汇总时图标签(如A、B (a)、(b)、(I)和(II)等)，这类技巧尤其是在科学文献中经常用到，虽然可以手动添加此类标签，但在绘图过程中自动标记处理则可方便的多。...(R-ggplot2包可通过labs(tag="**") 方法进行添加，这里不多做介绍)，详细内容如下： R-ggpubr包添加 在R-ggpubr包中，你可以通过ggarrange()函数在一个页面中添加多个子图和添加对应的...R-patchwork包添加 R-patchwork包主要用于灵活实现多子图的拼接和位置调整等操作，这里则介绍其添加Tag功能的绘图函数plot_annotation(),如下： p1 ggplot...，如：abcloc、abcbbox、abcborder等。...总结 今天的推文，小编简单介绍了如何使用R和Python在绘图过程中灵活添加子图Tag,这一技巧在绘制多个子图时则十分方便有效。

    1.6K20

    手把手带你复现NC图表之Figure5

    数据和mxIHC分类显示外膜和肌成纤维细胞在胰腺癌、结直肠癌和口腔癌中是保守的，而肺泡成纤维细胞是肺特异性的 R包载入与数据准备 library(Seurat) library(sctransform)...检测这些成纤维细胞表型是否在不同癌症类型中是保守的，分析了PDAC49、HNSCC29和结肠直肠癌（CRC）。...Pancreas", "Oral", "Colon", "Lung", "Skin", "Breast", "Kidney")) names(CoreData_long) #箱形图显示肿瘤或对照组织中外膜成纤维细胞的相对丰度...\n(MxIHC)") + theme(axis.title.x = element_blank(), legend.position = "none") Fig_5E #箱形图显示肿瘤或对照组织中肌成纤维细胞的相对丰度...，对照组中上皮成纤维细胞的丰度明显更高，而肿瘤组织中肌成纤维细胞的丰度更高。

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    温故而知新，ggplot2 饼图的几点笔记

    对于为什么 ggplot2 中没有专门用于饼图绘制的函，有人说：“柱状图的高度，对应于饼图的弧度，饼图并不推荐，因为人类的眼睛比较弧度的能力比不上比较高度（柱状图）。”...在角度制中，我们把周角的 1/360 看作 1 度，那么，半周就是 180 度，一周就是 360 度。由于 1 度的大小不因为圆的大小而改变，所以角度大小是一个与圆的半径无关的量。...饼图中添加文字的位置控制 - 借助公式 绘制饼图的过程中，利用 ggplot2 的 geom_bar 结合 coord_polar 实现。...虽然在 dat 数据框中设置是顺序一致方向相同的对应，但图片分布中会改变。...，"A" 在前，而 "A" 在原始数据 dat$Num 中对应的数据也在前 90，这样计算位置就会发生改变了，这时候 "A" 文字应该对应 90-90/2，文字 "B" 将对应 90+34-34/2，…

    1.4K10

    跟着Nature microbiology学画图~堆积柱形图+箱线图以及组合图

    image.png 重复的图片是Figure1中的堆积柱形图和箱线图，然后将其组合 ? 需要的工具及准备 本次可视化基于windows 10系统。...第二列：每个组里的不同物种。第三列：每个分组里的每个物种的相对丰度。 这样分清层次后，我就自己生成了以下数据，并存为CSV格式。 ?...', width =柱子的宽度 , position = 'fill' 则会铺满整个高度，如果删除则会显示如下这种图(复制以下代码再运行就会明白)) ggplot(df,aes(x=Status,y=Relative.abundance...各类检验适用 的情况如下： ? ggsignif主要的一个函数是geom_signif()，使用方法和ggplot2中其他的geom_***()一样，作为图层添加到图形中就可以，他的主要参数为： ?...ggarrange(p0,p1,p2,p3,labels = c("A","B","C","D",ncol=2,nrow=2))#两行两列 去除横坐标再合并的结果是： ?

    4.8K20

    ggThemeAssist｜鼠标调整主题，并返回代码

    R语言中的ggplot2是最美的绘图包之一。但调整主题的细节需要写大量代码，而且还要反复修改、预览，很是费时费力。...Vjust：Y轴刻度值垂直位置调整，默认0.5为相对刻度线居中对齐，0为相对刻度线下对齐；1为相对刻度线上对齐 Angle：坐标轴角度，如标签过长，可调为30度或45度旋转，避免文字重叠的同时还可以节约空间...仅用于y轴属性需单独设置时修改，解释同上 坐标轴线属性 Axis line 主要修改X/Y轴的线型Type、宽度Size和颜色Colour 刻度线 Axis ticks 同坐标轴线，可修改X/Y轴的线型...可以修改子标题(Subtitle)和图注(Caption)中的内容。...同时还可以修改文字的属性，如字体家族、样式、大小、颜色和水平位置 编辑结果导出绘图代码 以上面板中可修改上百个参数，并提供几百个属性值的选择。这些要是靠自己记住，那可真是太难了。

    3.8K10

    数据分析-cuttag分析流程分享2-R代码可视化流程处理

    ，由于我是在服务器上调用的R，所以选用了ggplot2的包来保存pdf图片的结果，如果是在windows的R下面操作，可以直接看图片进行保存。...评估样本之间的重复性 在前面的linux分析中，对样本分成了500个bin来进行样本之间的相关性进行评估，主要是为了保证样本之间是可重复的，表明我们的数据是可以用的，我一般是按照大于0.7这个阈值，如果低于这个阈值...，这个样本的数据有可能就相对悬了，有可能需要补样本了。...rbind(peakWidth, .) } } } peakN %>% select(Histone, Replicate, peakType, peakN) [图片.png] 查看每个重复中peak...我觉得这些文件中最重要的几个文件就是前面的mapping率、测序深度、peak数目、重复之间peak的重复数、frips值（可参考），因为我是做植物的，大肠杆菌基因组的比对率相对很低，如果是做动物的，有可能还是需要相对重视一下这些内容

    2.9K41

    Alluvial plot 冲积图绘制

    这种图表特别适用于展示数据中的分类如何从一个组别流向另一个组别，例如在分析不同子类型样本中的细胞如何在不同聚类中分布，或者在不同数据集中的细胞如何在不同聚类中分布的情况。...Alluvial plot 通过水平或垂直的流带（ribbons）来表示数据流，这些流带的宽度可以表示数据量或者数据的比例。在R语言中，可以通过ggalluvial包来创建这种图表。...今天在工作中需要绘制这么一张冲积图：将表格形式改成冲积图形式，即菌-代谢产物-基因的联系，其中这张表格展示了不同的肠道菌群（乳杆菌属、埃希氏菌属、梭菌属等）及其相关菌种，并列出了与这些菌群相关的基因或代谢标志物...如：乳杆菌属 (Lactobacillus)：菌种列出了三个乳杆菌属的菌种：Lactobacillus ruminisLactobacillus plantarumLactobacillus paracasei...panel.grid = element_blank(), panel.background = element_rect(fill = "white", color = NA), # 设置面板背景为纯白

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    用R来拼图和排版，告别AI和PS(二)：调节宽度和高度

    前面我们简单给大家介绍了如何使用R包patchwork来拼图和排版，今天我们接着来探讨，如何在拼图和排版的时候调节图片的宽度和高度，使最后的图片层次鲜明，重点突出。...#加载ggplot2和patchwork library(ggplot2) library(patchwork) #图A 散点图 p1 ggplot(mtcars) + geom_point...接下来我们就来看看，四张图，两行两列排布，我们来改变宽度。...调节高度 如果你搞清楚了宽度的调节，那么高度的调节就很容易理解了 p1/p2+plot_layout(heights = c(2, 1)) 来看看两行两列的时候，改变高度是什么效果 p1+p2+p3...+p4+plot_layout(height=c(2,1)) 同样的道理，这里改变的是第一行和第二行的高度。

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    Day7：R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    但可以添加参数theme()手动改变它。由于我们将此图层添加到最上层（即代码的最后），因此更改的任何细节都会覆盖在theme_bw()中的设置的。...在这里，将轴标签和轴刻度标签的大小增加到默认大小的1.5倍。修改文本大小使用rel()函数。指定的大小是相对于默认值（类似于基础绘图cex）。...可以将它与ggplot2中可用的任何不同几何对象图层一起使用，轻松学习修改图形！...将图片导出到文件 有两种方法可以将图输出到文件中（而不是简单地在屏幕上显示）。第一种（也是最简单的）是直接从RStudio“Plots”面板导出，点击绘图面板上方的Export。...首先，你需要使用一个函数，指定希望创建的图形格式（初始化），例如pdf()，png()，tiff()等等。再函数内部为你的图像指定名称，宽度和高度（可选）。

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    「R」ggplot2数据可视化

    几何对象是用以呈现数据的几何图形对象，如条形、线条和点。 图形属性是几何对象的视觉属性，如x坐标和y坐标、线条颜色、点的形状等。 数值的值和图形属性之间存在着某类映射。...用几何函数指定图的类型 ggplot()函数指定要绘制的数据源和变量，几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示。目前，有37个几何函数可供使用。以下列出常用的函数。...width 箱线图的宽度 下面举个例子来验证一下以上参数的使用: data(Salaries, package='car') library(ggplot2) ggplot(Salaries, aes...遗憾的是，这些对ggplot2图形没有影响，该包提供了特定了函数来改变其图形的外观。 坐标轴 ggplot2包会自动生成基本所需要的图形参数。当我们需要更大程度定制时，需要了解相应函数的用法。...当更改图例的标题时，必须综合考虑颜色、填充、尺寸等等。可以通过fill="mytitle"加到labs()函数中来改变标题。 标题的位置由theme()函数中的legen.position选项控制。

    7.4K10

    ggplot2中的position参数解析

    ❝本节来回答一个老爷的问题，介绍常见绘图案例中几个基本参数的设置问题，主要用在柱状图与箱线图中。下面小编通过两个案例来进行展示，图形仅供展示用过程仅参考，希望各位观众老爷能够喜欢。...position_dodge(), position = "dodge"和position_dodge2()这三个参数，该系统参数都用于调整图层元素（如柱子或点）的位置，以避免重叠。...2. position_dodge() 相对于position="dodge"更为灵活，允许通过width参数来设置dodge的宽度。...preserve="total"：保持整个组的宽度不变（这与position_dodge()相同）。...使用position_dodge2(preserve="single")，如果A=1和A=2的柱子高度不同，那么A=1的两个柱子会比A=2的两个柱子更接近，因为它们的宽度被保留了。

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    【愚公系列】2023年11月 Winform控件专题 SplitContainer控件详解

    一、SplitContainer控件详解SplitContainer控件是Windows Forms中的一个容器控件，它允许用户通过拖动分隔条来改变两个子控件的大小比例，并且可以选择在水平或者垂直方向上分隔...1.属性介绍1.1 FixedPanelSplitContainer控件的FixedPanel属性用于指定哪个面板是固定的（不会改变大小），而另一个面板可以根据分隔条的位置动态调整大小。...，用户可以通过拖动分割线来改变两个面板的大小。...例如，如果希望用户可以灵活地调整两个子控件的相对大小，可以设置SplitterIncrement属性为1，以便用户每次移动分隔栏时都可以精细调整大小。...```在panel1面板中添加一个Label标签控件，设置Text属性为"左侧面板"。在panel2面板中添加一个Label标签控件，设置Text属性为"右侧面板"。

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