如何在R中使用filter和str_detect筛选部分匹配对的数据？

在R中使用filter和str_detect筛选部分匹配对的数据，可以通过以下步骤实现：

首先，确保已经安装了dplyr和stringr这两个R包。如果没有安装，可以使用以下命令进行安装：

install.packages("dplyr")
install.packages("stringr")

加载dplyr和stringr包：

library(dplyr)
library(stringr)

假设我们有一个数据框df，其中包含一个名为column的列，我们想要筛选出其中包含特定字符串的行。可以使用filter和str_detect函数来实现：

filtered_df <- df %>% filter(str_detect(column, "特定字符串"))

其中，"特定字符串"是你想要筛选的字符串。

filtered_df即为筛选后的数据框，其中只包含column列中包含"特定字符串"的行。

这种方法可以用于筛选出部分匹配对的数据，即使只是包含特定字符串的一部分也可以被筛选出来。

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阿榜的生信笔记7—R语言的综合运用1

2 = str_split(x," ")[1];x2，这段代码将字符串 x 以空格为分隔符分成多个部分，并将第一个部分赋值给变量 x2。然后将 x2 的值返回。...= T)，这行代码是用来从数据框test中筛选出不重复的Species列，并保留所有列数据。...* Sepal.Width)：这段代码使用了mutate函数，将test数据集中新增一个名为new的列，该列的值为Sepal.Length×Sepal.Width。...filter()函数是用于从数据框（data.frame）或数据集（dataset）中筛选出符合特定条件的行。...5列（即最后一列）之外的所有列，然后将结果转换成矩阵（as.matrix），接着再选出前50行（head函数），最后使用pheatmap包中的pheatmap函数绘制热图。

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手把手教你做倾向评分匹配

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十二、R语言的综合应用

1.4.字符检测 str_detect(x2,"h") ### 看x2这个长度为8的向量中的每个元素是否含有h这个关键词，生成的与x2长度相等且一一对应的逻辑值向量 str_starts(x2,"...###没有赋值，所以修改后的test还是5列图片 2.4 连续的步骤 select() 筛选列 filter() 筛选行 2.4.1.多次赋值，产生多个变量 x1 = filter(iris,Sepal.Width...TRUE就替换成“tumor”，是FALSE就替换成“normal”， ####如果samples这个向量中的每个元素含有tumor就是TRUE，就会被替换成“tumor” k2 = str_detect...---- dir() # 列出工作目录下的文件 dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists...Control和Vemurafenib改成全部小写？

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使用 R 语言从 PDF 文档中提取表格

由于一个知识星球的小伙伴急需学习如何从 PDF 文档中提取表格，所以先插这个课，「使用 R 语言处理 netCDF 数据」系列的课程下次再发新的哈。...本课程介绍了如何使用 R 语言从 WHO（世界卫生组织）的官网上下载新冠疫情的每日报告以及如何从这些报告中的表格里面提取数据。.../ 这个非常简单，我的思路是直接获取网页中的所有标签的 href 属性，然后过滤出链接中含 .pdf 的，最后再用一个循环下载所有的 PDF 文件即可。...从 PDF 里面提取表格数据我选择最新的一个 PDF 做演示：20200523-covid-19-sitrep-124.pdf，下面使用 tabulizer 包进行数据提取，不过这个包依赖于 rJava...包，因此在使用这个包之前你需要在电脑上安装 Java 和在 R 里面安装 rJava 包。

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生信学习-Day6-学习R包

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Day07 生信马拉松-数据整理中的R

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Learn R 专题1-3

() > str_detect(x2,"h") #看看x2中是否含有“h” [1] TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE > str_starts...-------注意：R语言中的修改，都要赋值，没有赋值就没有发生过------- 补充 select()、filter()筛选列、行优秀的管道符号 x1 = filter(iris,Sepal.Width...>3) #从iris出发先筛选行 x2 = select(x1, Sepal.Length,Sepal.Width) #再筛选列 x3 = arrange(x2,Sepal.Length) #再进行排序...# 2.管道符号传递，简洁明了 x = iris %>% #control+shift 代表把前面的数据传递给后面的函数的第一个参数省掉多次赋值 filter(Sepal.Width>3) %...() names() ifelse和str_detect() #分组 arrange() # 排序 distinct() #去重-数据框 merge() #连接图片

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在学术不端的数据取舍上面反复横跳

，在普通bulk转录组和单细胞转录组两个数据集里面，如下所示：普通bulk转录组和单细胞转录组两个数据集首先是单细胞转录组数据集，因为是两个分组所以作者进行了两次独立的降维聚类分群，然后看了看自己的目标基因...而且去普通bulk转录组验证，但是作者使用的是GEO2R这样的网页工具（小声比比，这里并没有说网页工具不好的意思哈），也顺利的说明了NECTIN2的高表达这个现象啦： NECTIN2的高表达我就随手把这个图表复现安排给了这一期的马拉松授课学员...简单的芯片表达量差异分析我们这里不使用GEO2R这样的网页工具，直接开始敲代码啦！...挑选样品前面我们提到了，这个GSE28829数据集一共29个样本，但是文献筛选了14个样本。。。（这里我们看不出来筛选的依据！...所以，如果我们看到了这样的三张图有问题的实验设计项目的公共数据集，理论上我们需要根据很多实际情况进行样品的筛选。但是又容易在在学术不端的数据取舍上面反复横跳。。。

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数据处理第3部分：选择行的基本和高级的方法

在这篇文章中，我们将介绍如何挑选您的数据。除了filter的基础知识外，它还介绍了一些更好的方法，用near（）和between（）挑选数字列，或用正则表达式过滤字符串列。...---- The data 根据之前的博客文章，为了方便人们复制粘贴代码和实验，我使用的是内置数据集。此数据集内置于ggplot2中，因此如果您加载tidyverse，您将获得它。...Basic row filters 在许多情况下，您不希望在分析中包括所有行，而只包括选择的行。仅使用特定行的函数在dplyr中称为“filter（）”。...这有两个主要选项：base R的grepl（）函数，或stringr包中的str_detect（）。无论何时寻找部分匹配，重要的是要记住R是区分大小写的。...filter_all（any_vars（is.na（。）））将是非常无用的，因为它将返回27行，其中许多是测量部分中缺少的数据。在这种情况下：filter_if（）派上用场。

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DETR解析第二部分：方法和算法

这是DETR解析系列的第 2 部分。在之前的文章中，我们了解了哪些因素导致了DETR的诞生，添加了哪些部分，以及到底什么使得DETR 成为当今的超级目标探测器。...在预测和GT目标之间产生最佳二分匹配的损失优化特定目标的边界框损失最优二分匹配这里让我们暂停一下来理解什么是二分匹配。二分匹配是图论中的一个数学概念，经常用于计算机科学和优化问题。...二分匹配是对两个集合中的顶点进行配对的过程，以便每个顶点与另一集合中的至多一个顶点配对，并且配对顶点的总数最大化。将其视为寻找匹配两个类别中的项目的最佳方式，例如将工人与工作或学生与项目联系起来。...一个类别中的每个项目最多与另一类别中的一个项目配对，并且配对的成本是最优的。如下图的演示。...优化特定目标损失现在我们已经将预测与GT相匹配，我们对所有匹配对应用匈牙利损失。注意这里的使用，表示预测的最优排列。论文注释：在实践中，当时，我们将对数概率项降低10倍来平衡类别的不均衡。

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Learn R GEO

·输入数据是一个连续型向量和一个有重复值的离散型向量—横坐标； ·上下五条线的意思中间的又黑又粗的—中位数；上下两条线是最大值和最小值；方框的上下两条线是75%和25%（四分位数）；在外面的点-离群点...背景介绍+芯片分析思路实验设计有差异的材料->差异基因->找功能/找关联->解释差异，缩小基因范围数据库介绍 GEO GEO网页工具GEO2R 给代码需修改图片图片基因表达芯片的原理，探针的表达量代表基因的表达量...),pd(临床信息),exp(表达矩阵),gpl_number(芯片编号) 图片 Group(实验分组)和ids(探针注释) # 从临床样本中获得实验分组（在表格中慢慢找，代码如何实现看下） rm(list...图片仿制实例数据列—两个部分（前四列是用于求PCA的值-探针/基因；最后一列为分组信息）行—样本名称需要对原始数据进行转换（如图a）图片图片 PCA代码 #仿制的前四列 dat=as.data.frame...，所以需对基因进行去重 ####方法1：随机去重 ####方法2：保留行和/行平均值最大的探针 ####方法3：取多个探针的平均值 #其他去重方式在 “zz.去重方式.R”这个文件里 deg <-

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