温馨提示：要看高清无码套图，请使用手机打开并单击图片放大查看。...本文档主要讲述如何在CDSW中使用R语言绘制直方图和饼图，并使用Hive数仓作为数据源。...[513wpbc23f.jpeg] [o7z3kp7h2k.png] [xss6nl7z7g.jpeg] 3.编写R绘制直方图代码 ## 加载R运行依赖包 library(ggplot2) library...---- 编写R绘制饼图代码 ## 加载R运行依赖包 library(ggplot2) library(gcookbook) library(data.table) library(DBI) library...other") myLabel = paste(myLabel, "(", round(VDT$count / sum(VDT$count) * 100, 2), "%)", sep = "") ## 绘制销售额区间分布饼图
前面给大家介绍过 1.超详细的热图绘制教程(5000余字)，真正的保姆级教程 2.R语言绘制基因表达热图（简易版） 3.一个R函数搞定风险评估散点图，热图 4.R绘制甲基化和表达谱联合分析热图...下面我们结合一个具体的例子来讲解如何使用R的heatmap函数绘制热图 #读取所有miRNA的表达矩阵 expr=read.table("miRNA_expr.txt",header=T,row.names...，前面我给大家介绍过 R语言中的颜色(一) 里面提到过 R自带了5个跟颜色相关的函数，即： rainbow heat.colors terrain.colors topo.colors cm.colors...接下来我们就使用其他几种配色方案来绘制热图 heatmap(data, cexCol = 1,scale="row",col = cm.colors(256)) heatmap(data, cexCol...(5000余字)，真正的保姆级教程 2.R语言绘制基因表达热图（简易版） 3.一个R函数搞定风险评估散点图，热图 4.R绘制甲基化和表达谱联合分析热图 5.R语言中的颜色(一)
2017.12.15日厦大生命科学前沿课上，一位博士师姐分享的一篇论文中，多次应用韦恩图，看起来特别美，于是特地去R语言官网阅读关于Venn Diagram的使用。...从网上高手博客中看到一些例子，故敲一遍代码以熟悉Venn Diagram包的使用。...接下来利用draw.triple.venn绘制三个集合的韦恩图 > draw.triple.venn(area1=Length_A, area2=Length_B, area3=Length_C,n12...=c(-0.07, -0.07, -0.05), cat.pos=c(300, 60, 180), cat.cex=0.45) #height、width、resolution等的含义参考help()函数即可了解
R语言绘制基因表达基因的“对称散点图 转录组分析中，计算了两组间差异表达的基因后，通常怎样表示？您可能第一时间想到可以使用火山图。...接下来通过该示例文件，展示使用R语言绘制差异基因表达“对称散点图”过程。 2 数据预处理 首先对数据做一些预处理。...，颜色表示差异基因 下来就可以使用预处理后的数据作图了。...我们使用ggplot2的方法绘制差异基因散点图。...同样使用ggplot2的方法绘制，和上述过程相比仅在颜色指定上存在区别。
森林图常见于元分析，但其使用绝不仅如此，比如我现在想要研究的对象有诸多HR结果，我想要汇总为一张图，森林图就是个非常好的选择。...ggpubr包提供的森林图是针对变量分析绘图，我也尝试使用了metafor包的forest画图函数，但太灵活了，我除了感觉文档画的不错，但实际使用却很难得到想要的结果。...文本表 下面是一个使用文本表的例子： library(forestplot) #> 载入需要的程辑包：grid #> 载入需要的程辑包：magrittr #> 载入需要的程辑包：checkmate #...使用表达式 data(HRQoL) clrs <- fpColors(box="royalblue",line="darkblue", summary="royalblue") tabletext <
Y叔的厉害之处在于它对于ggplot2包的理解非常深，写出包和结果对象基本都直接可以用ggplot展示，或者直接用plot绘制可以得到类似的显示效果。...检索返回的结果可以直接用plot绘制，这里因为我需要添加bw主题，所以导入了ggplot2包，不然可以不使用该包 注意纵坐标是一个比例，该关键字发表文章数与当年文章总数的比例值，我们也可以灵活一点，只绘制发表文章数目
学习文档: https://cran.r-project.org/web/packages/NMF/vignettes/heatmaps.pdf Heatmap引擎 NMF包中的热图引擎是由aheatmap...函数实现，其余的热图函数都是基于它的修改。...而aheatmap函数本身又是pheatmap包pheatmap函数的修改版本。引擎具体的优点作者有在文档是写，我就不唠叨了。...接着，我们使用NMF模型来分解矩阵。 res = nmf(X, 3, nrun = 10) 混合系数矩阵：coefmap NMF结果的混合系数矩阵可以使用coefmap()函数进行绘制。...par(opar) 基底矩阵：basismap 基底矩阵可以使用basismap函数进行绘制，默认的行为是添加basis注释通道，每一行显示主导的基底组分，即每一行有最高负载的基底组分。
本节将从基础统计图形函数的功能、调用方式、参数说明和代码展示来探索统计函数的基本使用方法。由于不可能涉及到所有方面，如果有不全之处，可以评论或者网上查询。...1 bar()函数——柱状图 函数功能：在x轴上绘制定性数据的分布特征 调用方式：plt.bar(x, y) 参数说明： x：标识在x轴上的定性数据类别 y：每种定性数据的数量 代码展示： import...：在极坐标上绘制折线图 调用方式：plt.polar(theta, r) 参数说明： theta：每个标记所在射线与极径的夹角 r：每个标记到原点的距离 代码展示： bar_part = 12 theta...', markerfmt = 'o', basefmt='-') plt.show() 8 boxplot()——箱线图 函数功能：绘制箱线图，可以识别异常值 调用方式：plt.stem(x) 参数说明...xerr：x轴方向数据点的误差计算方法 代码展示： x = np.linspace(0.1, 0.6, 6) y = np.exp(x) xerr = np.random.randn(6)*0.01
绘制分段函数也是很常见的需求，实现分段函数的绘制也有多种方式。以下面 分段函数为例，进行说明。 ---- 方法一：直接根据分段函数的含义，根据x值的不同，相对应的函数值也不同，进行描点连线。...x0=1.75 y0=0.5 hold on plot([0 x0],[y0 y0],'r--') %画线 plot([x0 x0],[0 y0],'r--') hold off 运行效果 ----...方法二：直接根据x判定结果的特性0,1值，把对x的判断巧妙的使用一个公式来实现不同情形要的结果 这样做代码比较简洁，方便 x=0:0.1:5 y=0....*(x>=2) plot(x,y) %函数图像上加一个点 x0=1.75 y0=0.5 hold on plot([0 x0],[y0 y0],'r--') %画线 plot([x0 x0],[0 y0...],'r--') hold off 实现相同的效果： 总之，绘制图像的时候要记得本质是“描点连线” ，可以以不同的实现方式来实现自己的目的。
，以区分每个区域； √ 对数据进行标准化处理，使用[0,1]值，代表颜色的透明度，以控制颜色深浅； ④ 根据颜色进行填色 ⑤ 根据经纬度进行标注地图的名字 那么如何绘制地图呢？...首先绘制地图需要的包： install.packages(“maps”) install.packages(“mapdata”) 地图函数： map(database,fill=FALSE...，col) databae 地图的数据库 fill 是否填充，默认为不填充地图区域 col 填充的颜色，为RGB颜色 地图标注函数： text(x,y,text,cex) x...以区分每个区域； numbers <- data$sales; #将销售额进行标准化 scale <- (numbers-min(numbers))/(max(numbers)-min(numbers)) #使用标准化后的额数据...热力地图绘制函数： symbols(x,y,circles,inches=TRUE,add=FALSE，bg) x x轴的坐标，经度 y y轴的坐标，纬度 circles 圆形的半径
那么如何绘制树图呢？...首先绘制树图需要的包： install.packages(“treemap”) 树图函数： treemap(x,index,vSize,vColor,palette,range,border.col...设置边框的颜色值 type 设置统计数据的大小的类型，一般选择value，也就是值类型 代码实现： install.packages("treemap", repos='http://cran.r-project.org
云雨图介绍 我们使用r语言中ggplot2包绘制云雨图，云雨图可以看做是核密度估计曲线图、箱线图和抖动散点图的组合图表。...我们可以使用自定义的半小提琴函数geom_flat_volin()、箱型图函数geom_boxplot和抖动散点图函数geom_jitter()叠加实现。...设置工作路径和导包并且导入数据 setwd('你的工作路径') #导包 library(ggplot2) #导入数据 data <- read.csv('data1.csv') 2.3 ggplot2库实现图形绘制...2.3.1绘制半提琴图 2.3.2绘制抖动散点图 2.3.3叠加箱线图 2.3.4实现坐标翻转 2.3.5去除边框调整字体等微调 theme_bw()+ theme(panel.grid.major...大家以后有需要可以使用云雨图。
STRINGdb R软件包，以方便用户访问STRING中的数据库。在本指南中，以示例说明了该软件包的大多数功能。此外，iGraph包作为代表蛋白质-蛋白质相互作用网络的数据结构。...首先，首先知道所拥有生物的NCBI分类标准标识符（例如，人类使用9606，小鼠使用10090）。...toType = "ENTREZID", OrgDb = "org.Hs.eg.db", drop = T) 绘制...- igraph::graph_from_data_frame(d=links,vertices=nodes,directed = F) # 添加一些参数信息用于后续绘图 # V和E是igraph包的函数...但是个人感觉绘制出来的图片依然没有cytoscape软件功能强大，建议还是string网页+cytoscape的方法来绘制。
所以不用装了，当然也可以独立安装： 图片 安装pandas： pip install numpy 2 实现思路 数据存放在excel中，对指定数据进行分析，所以需要用到pandas； 对指定数据分析后绘制饼形图...，需要用到Matplotlib模块的pie()函数； 对以下指定excel内容进行分析； 分析用户购买区域情况占比，以下数据仅为参考，无真实意义，把以下内容保存为data.xlsx: 用户 金额...实现这个功能，主要使用了matplotlib 中 pyplot里的pie()函数； pie()函数部分源码： Autogenerated by boilerplate.py....self.content02'金额'.values.tolist() 设置饼形图每块的颜色： colors = 'cyan','darkorange','lawngreen','pink','gold' 饼图绘制...') 5 完整源码 # -*- coding:utf-8 -*- # 作者：虫无涯 # 日期：2023/11/15 # 文件名称：test_pie.py # 作用：Matplotlib模块的pie()函数绘制饼形图
这部分我会通过一个实战案例，教会你如何使用Excel来绘制甘特图，从而来管理项目，并自动生成项目进度报表。 我们可以根据项目需求用Excel做下面的项目管理文档。...整个文档做起来难度并不是很大，做完之后能够多次重复使用，大大的提升了使用的愉悦度和效率。 下面我教你如何用Excel做出这样的项目管理文档。 4.如何用Excel做甘特图？ 1）如何制作项目计划表？...上图中红框里的内容是增加的几个辅助列，里面的数据是利用Excel里的函数计算出来的，这里看不懂也没关系。我会在最后把这个项目文档发出来，你可以直接使用我给的项目文档。...2）甘特图如何制作？...5.模板下载 前面我们学习了面对复杂问题，如何使用Excel制作甘特图和自动报表来推进项目进度。 我希望你也能亲自跟着前面的步骤实践一遍。 怎样用 Excel 做数据分析？
在《如何用Python从海量文本抽取主题？》一文里，我给你展示过如何绘制主题挖掘图形。 ? 而《如何用Python和R对故事情节做情绪分析？》一文中，我给你介绍了如何绘制故事情绪时间序列。 ?...本文中，我用一个更简单的例子，给你展现如何用 R 绘制动态统计图。 有了它作为基础，结合我给你推荐的相关学习资源，你也能很快做出更为实用，甚至是令人惊艳的动图。 环境 你不需要安装任何软件。...lubridate 是用来处理时间数据的 R 软件包。如果没有这东西，你每次操作时间数据，都会麻烦许多。 gganimate 顾名思义，后面我们绘制动态图形，需要用到。 下面看看我们这次使用的数据。...小结 本文给你展示了 R 环境绘制动态统计图的方法，具体包含以下知识点： 如何读入 .RData 格式的数据文件； 如何利用 ggplot 命令映射变量，选择统计图类型（包括柱状图、散点图和折线图等）；...如何使用 gganimate 的 transition_time() 方法绘制基于时间数据的动态图； 如何通过 labs 设置，动态显示时间，以便于和图像的变化对应。
前面给大家介绍了，自己不会写R函数如何去“抄”高手写好的函数，我们直接“拿来”用就可以了。有读者反映为什么不直接用gdcVolcanoPlot这个函数，既然人家都已经写好了。...原因有两个 要想直接用gdcVolcanoPlot这个函数，首先你必须在你的R环境里安装GDCRNATools这个包，因为这个函数是这个包里面的。...小编在使用的时候，发现了一些小问题。今天小编就会给大家展示一下，如何站在巨人的肩膀上看（niao）的更远。即使是“抄”也要“抄”出水平来。...如何生成和使用rda文件可以参考R的save，load函数和 .rda文件 ls() #[1] "DEGAll" "DEGMIR" DEGAll里面存放的是所有mRNA差异表达分析的结果...R的save，load函数和 .rda文件 R函数不会写，"抄"总会吧！
热图是我们展示数据时常用的图形，今天小编教大家使用"pheatmap" 快速绘制热图。 首先，我们需要准备输入文件。比如，我想绘制热图来比较30个基因在6个组织里的表达情况。 ?...## 安装R包 install.packages("pheatmap") ## 加载R包 library("pheatmap") ## 输入文件 exp <- read.table("input.txt...",sep="\t",header=T,row.names = 1) ## 绘制热图 pheatmap(exp,cellwidth=20, cellheight=10,cluster_cols=T,cluster_rows...## 对表达量取对数绘制热图 pheatmap(log((exp+1),2),cellwidth=20, cellheight=10,cluster_cols=F,cluster_rows=T) ?...pheatmap还有许多其他功能，具体使用方法大家可以参考： https://www.jianshu.com/p/1c55ea64ff3f 参考资料： https://cran.r-project.org
例如，做差异表达分析时需要用到的分组变量，绘制ceRNA网络的节点文件中的RNA type列等等。今天小编就来给大家介绍一下R中生成重复序列的函数rep。...函数形式：rep(x, time = , length = , each = ,) 参数说明： x：代表的是你要进行复制的对象，可以是一个数字，一个字符，或者是一个向量。...跟each=2的效果是一样 [1] 1 1 2 2 3 3 4 4 rep(1:4, times=c(2,1,2,1)) [1] 1 1 2 3 3 4 我们还可以each和times两个参数同时使用
1 问题 在对复杂的二元函数进行绘图的时候，往往无法手动绘制出图像。那么该如何通过Python绘制出二元函数图像呢？...2 方法 在这里可以用到两个库：一个是matplotlib库，它是Python中的绘图库，使用它来绘制图像；另一个是NumPy库，它是Python中科学计算的基础包，提供多维数组对象，各种派生对象（如掩码数组和矩阵...使用上述的两个库，即可通过Python绘制出简单的二元函数图像。...代码清单 1 # 示例：绘制函数 F(X,Y)=sin(X)*sin(Y)/(X*Y) from matplotlib import pyplot as plt import numpy as np from...3D图，后面的参数为调节图像的格式 plt.show() # 展示图片 3 结语 对于如何使用Python绘制出二元函数图像的问题，经过测试，发现使用Matplotlib库和NumPy库是有效的，可以绘制出所需的二元函数图像
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
云直播
对象存储
实时音视频
