在R中摆弄数据 - 腾讯云开发者社区

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在VSCode中调用Jupyterlab和R

而R终端虽然可以完成一些基本任务，但对于数据分析、画图等高级操作则显得不够便利。因此，我们需要一种能够轻松应对这些任务的IDE。...这个功能强大的工具已经成为了数据分析领域的瑰宝，被广泛应用于各种数据分析、可视化等任务中。而VS Code是一个非常流行的编辑器，而且支持多种编程语言和工具。...这时候我们就需要VScode中的一些插件来方便我们写代码。我们直接在左侧的拓展中搜索R，然后安装即可。...总结总的来说，R语言的IDE中，Rstudio是最为常用和流行的。而JupyterLab则更多地被应用在Python数据分析领域。...在本文中，我们介绍了如何通过安装插件，在VS Code中远程连接服务器，并愉快地开始编写Python和R代码。

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在jupyter notebook中运行R语言

要想在jupyter notebook中运行R语言其实非常简单，按顺序安装下面扩展包即可： install.package('repr','IRdisplay','evaluate','crayon',...devtools','uuid','digest') library(devtools) install_github("IRkernel/IRkernel") IRkernel::installspec() 在R...中执行上述四行代码，重新打开你的jupyternotebook即可看到对于R的支持标志： ?

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「R」ggplot2在R包开发中的使用

尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...在包函数中使用 aes() 和 vars() 为了使用ggplot2创建图形，你很可能至少要使用一次aes()函数。如果你的图形使用了分面操作，你可能也会使用vars()用来指向绘图数据。...常规任务最佳实践使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...= 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法，但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的

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R沟通｜在Rstudio中运行tex文件

简介 R文档沟通前两期内容： R沟通｜舍弃Latex，拥抱Rbeamer吧！ R沟通｜制作个性化ppt！...这期主要介绍下如何在Rstudio中运行和使用.tex文件，并给大家安利一个非常nice的模板和根据该模板制作的案例。...使用教程在ElegantPaper[1]网站中下载整个仓库，可以直接下载到本地github或者下载压缩包。 ?...具体如何下载可以参考TinyTeX 中文文档[2] 具体样例小编研究生一年级期末作业（数据包络分析，复杂网络，回归分析等）就是用这个模板制作的，现在正好出文档沟通系列，就给大家献丑下?。 ? ?...>> 当然该模板也有很多别人使用，制作后的文章和文件都在github中： Risk Awareness（风险意识）文档说明[3] Bank Custody （银行存管）说明[4

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在vscode中配置R的开发环境

更加让笔者惊喜的是，目前vscode-R一直处于开发阶段，并且在最近的1.2.0版本结合了vscode关于web view的API，添加了R session watcher——一个集成的数据可视化构架，...并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...▶ pip install radian 四在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别，R session...6 打开Terminal中输入radian此时就可以运行R script，并且用View()函数浏览数据、环境中的变量以及图片 ?...中运行的话，则会出现R session watcher不启用的状况，data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口，以在windows中选择radian.exe路径为例

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分析R中的Elasticsearch数据

您可以在任何可以安装R和Java的计算机上使用纯R脚本和标准SQL访问Elasticsearch数据。...您可以使用适用于Elasticsearch的CData JDBC驱动程序和RJDBC软件包来处理R中的远程Elasticsearch数据。...通过使用CData驱动程序，您可以利用为经过行业验证的标准编写的驱动程序来访问流行的开源数据R语言。...本文介绍如何使用驱动程序对Elasticsearch执行SQL查询，并通过调用标准R函数可视化Elasticsearch数据。安装R....DBI函数（例如 dbConnect 和dbSendQuery ）提供了用于在R中写入数据访问代码的统一接口。

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【R语言】因子在临床分组中的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor）今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息...☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

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「R」R检验中的“数据是恆量”问题

这是一般做基因差异表达分析在使用t检验或者其他统计检验中常出现的一个问题。...之前我学习和自己分析时就遇到过，尝试使用判断的方式事先检查它是不是数据存在问题（这类数据明显不服从正态分布），可以使用正态性检验，或者直接判断是不是样本组内的数据是完全一样的，如果一样就不要这个了。...假设有两万个基因的表达，我手头没数据，所以写个伪代码：下面用geneExpr1与geneExpr2表示两组数据： for循环1(geneExpr1, geneExpr2): 组合某基因表达 - c...else：统计检验在使用t检验前尽量使用方差分析检验方差同质性。...9508518/why-are-these-numbers-not-equal https://stackoverflow.com/questions/23093095/t-test-failed-in-r

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常见概率分布及在R中的应用

概率函数为f(k;r,p)=choose(k+r-1,r-1)*p^r*(1-p)^k, 当r=1时这个特例分布是几何分布 rnbinom(n,size,prob,mu) 其中n是需要产生的随机数个数，...size是概率函数中的r，即连续成功的次数，prob是单词成功的概率，mu未知.....mean+3sd)几乎是在肯定的。...10.卡方分布(non-central)Chi-Squared Distribution，chisq 它广泛的运用于检测数学模型是否适合所得的数据，以及数据间的相关性。...数据并不需要呈正态分布 k个标准正态变量的平方和即为自由度为k的卡方分布。

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在VScode中对R语言进行环境配置

一天，他听说了一个强大的编程语言——R语言，它在数据分析和统计学领域非常流行。阿磊决定要在他的VSCode编辑器中安装并配置R语言，以便他可以开始探索数据科学的奥秘。...于是他开始在浏览器中输入“R语言下载”，结果不小心输入成了“R语言美餐”，网页上出现了各种美食图片，阿磊看得直流口水，完全忘记了下载R语言的事情。...过了一会儿，阿磊终于意识到自己走神了，他重新输入了正确的关键词，找到了R语言的官方网站，下载并安装了R语言。接下来，教程告诉他需要在VSCode中安装R扩展。...设置中搜索 r.rterm.windows 填写radian的路径设置里搜索 r.br，选Radian为终端在设置里搜索 httpgd 打勾此外也可以用shell wind选取输出图像的终端样子...下载完后新建文件夹选择第三个新建一个R终端，找到位置，并复制打开R的扩展，找到添加window的路径，粘贴 6.测试 # 加载内置数据集 data(mtcars) # 绘制散点图，显示马力和每加仑英里数的关系

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使用R中merge()函数合并数据

使用R中merge()函数合并数据在R中可以使用merge()函数去合并数据框，其强大之处在于在两个不同的数据框中标识共同的列或行。...SQL,你可能想merge()和数据库中JOIN功能很相似。...但他们都几中类型参数有关： x: 第一个数据框. y: 第二个数据框. by, by.x, by.y: 指定两个数据框中匹配列名称。缺省使用两个数据框中相同列名称。...，所以R基于两者state的name进行匹配。...Frost来自cold.states数据框，Area来自large.states. 上面代码执行了完整合并，填充未匹配列值为NA。总结本文详细介绍R中merge()函数参数及合并数据类型。

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【译文】R分析快速手册：R中数据可视化

简介数据可视化已经成为数据科学工作流程中一个不可或缺的部分。因此，你的主要工具需要有很强的能力来处理这两方面的操作—数据分析和数据可视化。...随着这些景象的变化，R之所以能变成当今的主流语言就是因为它有很强大的数据可视化处理能力。只需要几行的代码，你可以创造一个美丽的图表和数据的故事了。...R有一个很好的资源库来创造一个基本和创新的数据可视化，如条形图、直方图、散点图、热点图、马赛克图以及其它各种可视化操作。这里是一份常用的可视化操作快速手册以用于展现数据。...你可以把这份手册随身带，以便你在需要的时候使用。那些相要拷贝相关代码的人，你可以在这里下载PDF格式的备忘录。想要获得完整的内容，访问R中数据分析的综合指南。...原文链接：http://www.analyticsvidhya.com/blog/2015/08/cheat-sheet-data-visualization-r/ 何品言译陆勤审核 PPV课原创翻译文章

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R中的数据导入与导出

1、数据的导入导入文本文件使用read.table函数导入普通文本文件 read.table(file,header=FALSE,sep="",...)...read.csv("3.xxx", header=FALSE, sep=","); #指定分隔符 data3 <- read.csv("3.xxx", header=FALSE, sep="\t") 2、数据的导出

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深度 | 在 R 中估计 GARCH 参数存在的问题

在原假设下，滚珠轴承的平均直径不会改变，而在备择假设中，在制造过程中的某些未知点处，机器变得未校准并且滚珠轴承的平均直径发生变化。然后，检验在这两个假设之间做出决定。...特别是，函数 garchFit() 用于从数据中估计 GARCH 模型。但是，当我们尝试在我们的检验中使用此函数时，我们得到了明显病态的数值（我们已经完成了模拟研究以了解预期的行为）。...我在本文中强调的问题让我更加意识到选择在优化方法中的重要性。我最初的目标是编写一个函数，用于根据 GARCH 模型中的结构性变化执行统计检验。...这是一个我自认知之甚少的主题，如果 R 社区中的某个人已经观察到了这种行为并且知道如何解决它，我希望他们会在评论或电子邮件中告诉我。...今后在处理其他统计模型的参数估计问题时，务必首先用模拟数据检验一下相关软件的结果稳健性。

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【推荐】在R中无缝集成Github云端代码托管

平时出门去图书馆只带Surface，一些轻便的任务也在Surface上完成，需要处理繁重的数据就在实验室的机器上跑；如果在外地或者国外并且远程连不上实验室，那么就把地球人作为移动工作站放在住的公寓，出门仍旧带...在 Visual Studio中建立Github项目在VS中使用Github可以说是一件轻松加愉快的事情，几乎不需要任何多余的设置。...在Damao这个项目中，大猫新建了两个脚本和dt、dt2两个数据集，并且用内置的浏览器同时打开这两个数据集。如下： ? 建立完项目后，接下来的任务就是要把我们的R代码上传到云端了！...在“change”列表中，我们可以看到我们新建了一个叫做01-test.R的脚本和一个叫做02-empirical.R的脚本，并且删除了一个叫做Script.R的脚本。...下图就是一个大猫实际编程中遇到的例子。左边是云端版本，右边是本地已经修改但是还没上传云端更新的版本。可以看到VS用绿色标记出了新增加的行，用红色标记出了删除的行，用斜线标记出了空白部分。

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（数据科学学习手札58）在R中处理有缺失值数据的高级方法

一、简介　　在实际工作中，遇到数据中带有缺失值是非常常见的现象，简单粗暴的做法如直接删除包含缺失值的记录、删除缺失值比例过大的变量、用0填充缺失值等，但这些做法会很大程度上影响原始数据的分布或者浪费来之不易的数据信息...，因此怎样妥当地处理缺失值是一个持续活跃的领域，贡献出众多巧妙的方法，在不浪费信息和不破坏原始数据分布上试图寻得一个平衡点，在R中用于处理缺失值的包有很多，本文将对最为广泛被使用的mice和VIM包中常用的功能进行介绍...中的matshow，VIM包中的matrixplot将数据框或矩阵中数据的缺失及数值分布以色彩的形式展现出来，下面是利用matrixplot对R中自带的airquality数据集进行可视化的效果： rm...如上图所示，通过marginplot传入二维数据框，这里选择airquality中包含缺失值的前两列变量，其中左侧对应变量Solar.R的红色箱线图代表与Ozone缺失值对应的Solar.R未缺失数据的分布情况...: 当只希望从合成出的m个数据框中取得某个单独的数据框时，可以设置action参数，如action=3便代表取得m个数据框中的第3个 mild: 逻辑型变量，当为TRUE时，会输出包含全部m个合成数据框的列表

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R8在Android手Q中的应用

R8作为一个新工具，鲁棒性不如proguard，在面对手Q这个庞然大物时，出现了一些问题，本文主要分享一下R8在手Q应用遇到的问题，供后面有需要的同学参考。...也是在Enqueuer中实现，traceMainDex方法中；5、IRConvert , 将class字节码转换为Dex的过程，其中IR(Intermediate Representation)是java...三、R8在手Q应用中遇到的问题3.1 Liveness Analyze过程—根可达性算法在介绍补丁问题前，先简单介绍Liveness Analyze过程，后面的几个问题都和Liveness Analyze...理解根可达性算法前需要先理解四个概念：1、Root: 在proguard 配置文件中明确要keep的对象，算法的输入。...在使用R8过程中，我们发现同样的代码，构建多次，高概率出现不正常的dexDiff，具体表现如下：IDragview 的clinit方法有时候存在，有时不存在，导致生成的补丁不稳定。

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《C 语言与 R 语言在人工智能数据分析中的交融之路》

当我们探索如何将这两种语言在人工智能数据分析中交互和融合时，便开启了一段充满无限可能的创新之旅。在实际的人工智能数据分析项目中，为什么要考虑 C 语言与 R 语言的交互融合呢？...例如，在一个生物信息学的基因数据分析项目中，C 语言负责从基因测序设备读取原始的基因序列数据，并将其映射到共享内存区域，R 语言则可以直接对共享内存中的数据进行基因序列的比对、变异分析等统计操作，大大加快了数据分析的速度...在人工智能数据分析的模型训练和优化过程中，C 语言与 R 语言的交互也有着独特的应用场景。...C 语言与 R 语言在人工智能数据分析中的交互和融合为我们提供了一种强大而灵活的数据分析解决方案。...无论是在科研领域的大数据研究，还是在工业界的智能决策支持系统中，这种跨语言的协同工作模式都将为我们开启新的数据分析之门，助力我们在人工智能的浪潮中更好地挖掘数据的宝藏，推动相关领域的不断发展和进步。

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转义字符r在Python内置函数print()中的妙用

在Python 3.x中，内置函数print()用来实现格式化输出，各参数含义请参考本文末尾的相关阅读。本文重点介绍print()函数的end参数以及转义字符'\r'的妙用。...本文末尾的相关阅读中已经提到，end参数用来确定print()函数在输出全部内容之后以什么结束，默认是转义字符'\n'，也就是换行符，在使用时可以根据需要修改这个参数的值，例如： ?...那么，如果把end参数设置为回车符'\r'，会是什么样的效果呢？...下面的代码 from time import sleep for i in range(1000): print(i, end='\r') sleep(0.01) 运行效果如下面的视频所示：

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在 R 中估计 GARCH 参数存在问题（基于 rugarch 包）

一年前我写了一篇文章，关于在 R 中估计 GARCH(1, 1) 模型参数时遇到的问题。我记录了参数估计的行为（重点是 β ），以及使用 fGarch 计算这些估计值时发现的病态行为。...我在 R 社区呼吁帮助，包括通过 R Finance 邮件列表发送我的博客文章。反馈没有让我感到失望。...他在 2016 年的车祸中丧生。 Dr....他认为，日内数据应优于日间数据，并且模拟数据（包括模拟 GARCH 过程）具有在实际数据中看不到的特质。...正如 Vivek Rao 在 R-SIG-Finance 邮件列表中所说，“最佳”估计是最大化似然函数（或等效地，对数似然函数）的估计，在上一篇文章中我忽略了检查对数似然函数值。

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在VSCode中调用Jupyterlab和R

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