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片段分子化合物在新药研发中的作用 | MedChemExpress

FBDD 方法的优势 在医药领域,探索先导化合物发现方法与新药研发具有同等重要的地位。...基于片段化合物的药物开发 (Fragment-based drug design, FBDD) 已经有 20 多年的历史,在这 20 多年的实践及优化中,FBDD 已经成为新药开发的主流方法。...3、对命中片段进行优化和连接 筛选出具有活性的片段化合物之后,就要对片段化合物进行结构延伸得到高活性先导化合物,目前最主要的片段延伸方式包括: ◑片段连接 (Fragment-linking),即与受体结合的相邻的两个片段经链接成活性较强的较大分子...◑片段生长 (Fragment-growing),即以受体结合的第一个片段为核心,经理性设计,在邻近处逐渐生长成活性比较强的较大分子。...FBDD 自身局限性及面临的挑战 FBDD 方法相比高通量筛选具有很多优势,但在使用上也存在一定局限性。

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在 Visual Studio Code 中添加自定义的代码片段

那么现在按下 F1 打开快捷命令输入框进入 Insert Snippet 命令,输入 toc 可以看到我们刚刚加入的代码片段: 或者,在带有智能感知提示的文件中,可以直接通过智能感知提示插入:...在插入的代码片段中,${1:walterlv 的目录} 会成为我们的第一个占位符,而且默认文字就是 walterlv 的目录。...在前面的博客代码片段中,${2|dotnet,csharp,uwp|} 就是一个下拉选框,帮助我选择常用的一些博客类别。 变量 使用 变量名 或者 {变量名:变量的默认值} 可以创建变量。...在 Visual Studio Code 中,你有这些变量可以使用: -TM_SELECTED_TEXT - 在插入代码片段的时刻选中的文本 -TM_CURRENT_LINE - 在插入代码片段的时刻光标所在的行...这个时间我之前也在输入法中调过:常用输入法快速输入自定义格式的时间和日期(搜狗/QQ/微软拼音)。

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    在 Visual Studio Code 中为代码片段(Code Snippets)添加快捷键

    那么在没有智能感知提示的情况下如何快速插入代码片段呢? 可以使用快捷键! 本文介绍如何为代码片段绑定快捷键。...---- 代码片段本没有快捷键相关的字段可供设置的,不过在快捷键设置中可以添加代码片段相关的设置。 首先,在 Visual Studio Code 中打开快捷键设置: ?...在配置文件中添加这些代码即可关联一个代码片段: [ { "key": "alt+p", "command": "editor.action.insertSnippet", "...这个名称是我在 在 Visual Studio Code 中添加自定义的代码片段 中做的代码片段的名称。 保存,现在按下 alt+p 后就会插入指定的代码片段了。...本作品采用 知识共享署名-非商业性使用-相同方式共享 4.0 国际许可协议 进行许可。

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    优秀代码摘录片段一:LinkedList中定位index时使用折半思想

    在LinkedList有一段小代码,实现的功能是,在链表中间进行插如,所以在插如的过程中会需要找到对应的index位置的node元素; 如果放在平时只为了实现功能而进行遍历查找,很多人会直接使用一个while...进行从前到后的查找,也不是说这种有问题,只是在 数据量相当大的情况下,如果还继续这样的查找,那么效率很定是很低的, 所有我们展示一个优秀的底层源码实现: Node node(int index)...grow(minSize); } public boolean ensureCapacityInternal(int minSize) { //在创建...arraylist实例时,如果无参构造函数,则使用10作为初始大小 if (this.array == DEFAULTCAPACITY_EMPTY_ELEMENTDATA)...public boolean add(E e) { //判断是否需要进行扩容 ensureCapacityInternal(size+1); //在不需要扩容的情况下进行插入操作

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    哲思片段 | 设计中的变与不变

    在面向对象设计中,默认情况下并没有约束类的实例是否为可变,这意味着我们可以通过某种方式改变实例的状态。这体现了实例的可变特征。然而,若是站在内存的角度观察实例,则又不然。...在DDD中,强调将领域对象严格区分为实体和值对象。一个指导原则是,当你无法分辨某个领域对象究竟是实体还是值对象时,应优先将其建模为值对象。这有助于我们更好地利用值对象的不可变性。...物质是否永恒不变,在哲学中一直是引人深思的命题或假设;但在函数式编程中,它几乎被证明了。...例如,在Haskell中,对List的任何操作,即使调用++对List进行合并,返回的都是全新的List对象,原有对象不会有任何变化。...罗素在《西方哲学简史》中写道: 有的神秘主义者认为永恒并不是指时间上的永久,它是独立于时间之外的,无前无后、无因无果,也没有逻辑可循。 我觉得函数式编程追求的不变性,可以划入这个范畴。

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    JCIM | 使用片段链接预测网络设计PROTAC药物

    该模型从输入片段中提取结构信息并生成连接器以将它们结合起来。作者在模型中集成了过滤器,以排除通过蛋白质-蛋白质复合物引导的无法药用的结构,同时保留具有强大化学性质的分子。...AIMLinker考虑了结构上的三维信息,最初取两个两侧有预定锚的片段及其角度和距离的结构信息来表示输入片段间的空间位置。网络的核心结构是GGNN,原子和键分别表示为节点和边。...这两个分子片段将作为网络的输入数据,这样,网络能够生成和设计一个连接器库,其中的连接器会受到两个锚点之间的空间的约束。随后准备好的片段分子被送入AIMLinker中。...在AIMLinker中,生成过程是通过迭代生成边缘和从选定的原子库中添加新的原子来实现的,图2展示了使用GGNN为基础的迭代过程。...如表1,生成的最佳分子6BOY_1268具有较高的蛋白质-配体结合能,进一步证明了使用AIMLinker能生成潜在的新型类药物分子。

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    C++中fstream_在使用中

    C++中处理文件类似于处理标准输入和标准输出。类ifstream、ofstream和fstream分别从类 istream、ostream和iostream派生而来。...作为派生的类,它们继承了插入和提取运算符(以及其他成员函数),还有与文件一起使用的成员和构造函数。可将文件 包括进来以使用任何fstream。...如果只执行输入,使用ifstream类;如果只执行输出,使用 ofstream类;如果要对流执行输入和输出,使用fstream类。可以将文件名称用作构造函数参数。...被打开的文件在程序中由一个流对象(stream object)来表示 (这些类的一个实例) ,而对这个流对象所做的任何输入输出操作实际就是对该文件所做的操作。...http://www.cplusplus.com/reference/fstream/fstream/中列出了fstream中可以使用的成员函数。

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    Transformer 在RxJava中的使用

    早在 RxJava1.x 版本就有了Observable.Transformer、Single.Transformer和Completable.Transformer,在2.x版本中变成了ObservableTransformer...其实,在大名鼎鼎的图片加载框架 Glide 以及 Picasso 中也有类似的transform概念,能够将图形进行变换。...RxLifecycle中的LifecycleTransformer trello出品的RxLifecycle能够配合Android的生命周期,防止App内存泄漏,其中就使用了LifecycleTransformer...在我的项目中也使用了知乎的RxLifecycle,根据个人的习惯和爱好,我对LifecycleTransformer稍微做了一些修改,将五个Transformer合并成了一个。....... } 如果你想在RxJava的链式调用中也使用缓存,还可以考虑使用transformer的方式,下面我写了一个简单的方法 /** * Created by Tony Shen on

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    在 ES 中如何使用排序

    在 Elasticsearch 中,排序是一项重要的功能,它允许我们按照特定的字段或条件对搜索结果进行排序。通过合理使用排序,我们可以更方便地找到所需的信息。...最常见的方式是在查询请求中使用`sort`参数。我们可以指定要排序的字段,并指定升序或降序排序。...例如,我们可以设置排序的权重,以确定不同字段在排序中的重要性。 在实际应用中,排序的使用需要考虑以下几个因素: 1. 用户需求:了解用户对搜索结果的期望排序方式,以便提供最相关和有用的结果。 2....为了获得最佳的排序效果,我们还可以采取以下措施: 1.选择合适的字段类型:根据数据的特点选择合适的字段类型,例如,数值类型的字段在排序时效率更 高。...总之,ES 中的排序功能为我们提供了强大的工具,使我们能够根据各种需求对搜索结果进行灵活的排序。通过合理使用排序,我们可以提高搜索的效率和准确性,为用户提供更好的体验。

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    XML 在SQLServer中的使用

    当你用XML数据类型配置这些对象中的一个时,你指定类型的名字就像你在SQLServer 中指定一个类型一样。 XML的数据类型确保了你的XML数据被完好的构建保存,同时也符合ISO的标准。...在定义一个XML数据类型之前,我们首先要知道它的几种限制,如下: 一个实例的XML列不能包含超过2GB的数据。 一个XML的列不能是索引。 XML对象不能使用Group By的子句中。...包括XML的文档和片段。...中,我指定了[1]在Xquery表达式的后面,所以结果集将只返回第一个人的名字。...总结 我们基本上了解了XML在SQLServer 中的简单应用,从定义到使用方法。也看到了query()检索子集,也能使用value()检索独立的元素属性的值。

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