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我有一个SummarizedExperiment (但我们可以把它当作GRanges)。我想要的是减少间隔的数量，为每个相同的相邻mcol(gr)只保留一行，重要的是还要跟踪新的扩展间隔。gr <- GRanges(ranges = IRanges(1:12*10, end = 1:12*10+5),state2 = c(1,1,1,2,2,2,5,5,6,6,1,1))
生成的GR
浏览 15提问于2016-09-09得票数 1
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web应用程序中的大数据分析
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例如，我将非常庞大的数据存储在像Google BigTable这样的存储中。我可以非常快地从存储中查询和获取数据。这样我就可以处理存储问题了。到目前为止，这个过程是非常有效的。我想分析存储在BigTable中的大型时间序列，并将结果可视化。我想对超过一百万个点的时间序列做一个统计评估。所以我有一个解决方案来存储时间序列，我可以从存储中获得正确的时
浏览 4提问于2015-07-20得票数 1
我正在看微软给出的这个例子，我完全理解他们想要做的事情：
我的问题是:在进行分页或处理大型数据集(数百万条或更多记录)时，如何有效地实现这一点？根据我对这段代码的理解，每次从存储库调用GetStudents时，它都会对整个数据集执行ToLists操作。如何使用存储库高效地实现搜索、排序和分页(我的定义是高效的，因为应用程序不需要查询所有行就可以执行筛选/分页/排序操作)？在我的特殊情况下，我谈论的是实体框架。我过去
浏览 2提问于2016-03-22得票数 0
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我们目前有12个节点运行在Cassandra集群中。最终，即使有几个节点出现故障，我们仍然处于正常运行状态。我心中的妄想者希望每天至少备份一次，并将其存储在亚马逊S3上。如果在某一时刻需要还原，我们是否必须从单个节点备份备份，或者是否有一种方法“聚合”备份(假设您需要从每个节点单独将它们)“聚合”到一个大型还原过程中？
被这些文档弄糊涂了。只想在我的Cassandra集群上得到一个高效的备份过程。
浏览 0提问于2013-04-11得票数 4
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在代码中，它看起来如下(红宝石代码)： attr_reader :tags attr_reader :textend但是我应该如何为post实现存储库呢？我发现了两个变体：2.为标记创建单独的存储库。但是，为值对象创建单独的存储库好吗？UPD:在</e
浏览 3提问于2017-04-14得票数 1
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我在研究反应专家。它是一个新的存储库，用于高效地呈现大型组件列表。这是很新的。我对它的工作方式感到困惑。为什么可以克服反应虚拟化的问题？
非常感谢<3。
浏览 11提问于2022-04-07得票数 0
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我正在AWS (RDS m4.large)上使用一个非常大(59亿行)的表，我在将数据获取到可以有效使用和查询的点上遇到了一些问题。数据从记录的开始有一个以秒为单位的时间变量(类型: bigint)，但我希望能够在每日级别聚合数据(即按天分组)。( 90天记录的前10天)，但可能出乎意料的是，它在整个50亿行数据集上不能很好地工作。在这个过程中尝试了几次之后，我意识到我之前创建的索引大大减慢了这个过程(update查询从未完成)。从那以后，我删除了所有索引，并再次尝试更新。有没有一种不同的方法可以更有效<
浏览 3提问于2018-11-07得票数 2
每个基因型的RNA seq覆盖率(资料来源: pickrell等人，自然，2010年)为此，我有来自100个个人的大型文件，其中包含来自RNA-seq数据的覆盖信息(在特定区域)，并且我在R中以GenomicRanges对象的形式读取这些信息。这给了我一些GRanges对象，比如在下面的玩具示例中获得的对象：
gr1=GRanges(seqname=1，range=IRanges(start=c(1,5,10,15,30,55)，end=c(4，9，14，
浏览 3提问于2017-02-22得票数 1
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你能帮我找出如何用预聚合数据绘制直方图吗？我的意思是，我已经将数据分组到存储箱中，以便从SQL Server加载它们并保存到xls文件。现在我有两个变量:频率和bin变量(价格)。例如，我有一个0- 10美元的价格箱。这里有120个实例。然后我有10 - 20美元的价格箱，里面有500个实例，等等。
问题是我有太多的预聚合箱。因为价格在0到50000之间变化，步长为10。我能否以某种方式在熊猫中绘制
浏览 0提问于2016-03-16得票数 3
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为了获得更好的性能，可以预先计算数据吗？例如，当玩家赢得一场比赛时，我计算特定玩家的获胜游戏数，并将其写入专用表。然后，当我显示总体评分时，我不需要再次为玩家计算获胜的游戏数量-我已经预先计算好了。或者有其他更“专业”的方法来解决这个问题？
浏览 2提问于2012-09-03得票数 0
下面是我天真地尝试只计算查询中的数字：table_nameuser_id | integer
表中的每一行表示正在记录的用户事件的另一个实例在条目数量急剧增加的情况下，频繁运行这样的查询有什么问题吗？或者这是最常见的方法吗？
浏览 0提问于2020-12-04得票数 0
在我的经验中，人们常说在事件来源中“一个事件必须属于一个聚合”，而且“聚合是您最大的事务边界”。{ aggregates: [1, 2], to: 2,}
它似乎可以被原子地记录下来，在重构一个聚合时高效地查询，并且在</em
浏览 0提问于2019-05-29得票数 0
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我需要将这些数据存储在NoSQL数据库中，并执行按40列过滤的各种选择和映射/还原查询。
我想使用mongodb，所以我有一个确定的问题:这个数据库能够处理这个任务吗?在现有的提供者hetzner.de中，我需要什么来实现它的架构？
浏览 3提问于2012-01-16得票数 0
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什么是最好的数据格式(XML、数据库等)对于大型业务数据，当我们想要高效和轻松地将其全部(导入)加载到.NET中的业务对象中时？
我想一次加载所有数据，并创建所有业务对象。对于大型数据，XML存储的大小成为一个问题。数据库( Server )，利用实体框架创建业务类和映射:在第一次测试中，为了增加数据库大小，EF遇到了严重的麻烦(性能问题和内存不足异常)。我想要实现的(一次性将大型业务数据加载到内存中</em
浏览 7提问于2010-09-09得票数 2
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然而，现在的一个问题是，我使用一个数组来存储大量信息，并且在我的脚本中的某个点上，这个数组被搜索匹配的id并被更新。当数组大小超过200个元素时，数据搜索开始变得相当慢。有没有更有效地搜索数组的方法？我的数组中的每个元素也是一个元组。
浏览 0提问于2018-10-03得票数 0
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Blob存储-直接在其上处理文件
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我希望有一个高效的解决方案来迭代位于C#中blob存储中的大型文件。我想使用blob存储作为本地存储。在我的研究中，我只找到了必须下载或流文件的解决方案。是否可以直接迭代blob存储上的文件而不将其下载到本地或流中？
浏览 15提问于2022-04-07得票数 -1
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NOSQL数据库的聚合和统计功能
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使用SQL数据库，可以很容易地完成统计/聚合函数，如协方差、标准差、峰度、偏度、偏差、均值和中间值、求和和积等，而无需将数据输出到应用服务器。这些计算是如何有效地完成(尽可能靠近存储，假设映射/减少“作业”不会是实时的)在NoSql数据库上，特别是对于大型数据集的dynamodb(cassandra)。(MySQL，PostgresSQL，.)不是NoSQL和Amazon (ParAccel) --一个列存储区--有一个SQL接口，而且可能是过分的(6.85美元&#x
浏览 5提问于2013-11-16得票数 1
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Matlab稀疏张量
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Matlab支持大型稀疏张量的高效运算吗？
我意识到我总是可以将张量存储为矩阵的单元数组的组合，但这需要使用循环，我希望避免这种情况。
浏览 2提问于2011-11-22得票数 5
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我知道对于df，我可以很容易地做到：但这似乎不适用于S4对象(我正在处理特定的granges对象，但这并不重要)。有类似于-1的吗？解决办法是：示例：seqnames = Rle(c("chr1", "chr2", "chr1", "chr3"), c(1,
浏览 7提问于2022-02-14得票数 0
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无法在App Engine数据存储中查询聚合结果。示例:我有一个名为"Post“的实体，它有以下字段：我在我的数据存储中有许多不同的昵称和每个昵称对应的许多帖子。select nickname, sum(score) as sumscoregroup by nickname limit 10
这种类型的查询在googleapp engine
浏览 2提问于2010-10-08得票数 6
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