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R语言随机森林模型中具有相关特征的变量重要性

p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣的好工具。由于我们通常在随机森林中使用它,因此它看起来非常适合非常大的数据集。...大型数据集的问题在于许多特征是“相关的”,在这种情况下,很难比较可变重要性图的值的解释。...例如,具有两个高度相关变量的重要性函数为 看起来  比其他两个  要  重要得多,但事实并非如此。只是模型无法在  和  之间选择   :有时会    被选择,有时会被选择 。...实际上,我想到的是当我们考虑逐步过程时以及从集合中删除每个变量时得到的结果, apply(IMP,1,mean)} 在这里,如果我们使用与以前相同的代码, 我们得到以下图 plot(C,VI[2,],type...关联度接近1时,与具有相同   ,并且与蓝线相同。 然而,当我们拥有很多相关特征时,讨论特征的重要性并不是那么直观。

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主成分分析PCA在脑科学研究中的应用

一、PCA背景 在脑科学的研究中,我们通常会获得高维度多变量的数据,虽然高维度数据为我们的研究提供了更大的分析和研究自由度,但是也会无形当中为我们的分析增加很多成本和工作量。...我们这里所说的主成分分析PCA正是基于这样的实际需求而发展出来的一种降维算法。 本文中,笔者重点对PCA在脑科学研究中的应用进行论述,使读者先对PCA的应用场景有一个全面了解。...更重要的是,当你再次从硬盘中调取压缩后的数据后,可以把PCA降维后的数据通过矩阵变换恢复原始数据。...3)在机器学习中作为一种降低特征数量的方法 目前,机器学习技术已经渗透到脑科学领域,利用机器学习可以对疾病进行辅助诊断、客观生物标志物寻找、发病机制研究、药物和非药物手段的调控效应研究以及认知状态的解码等方面...4)提取ERP中特定的ERP成分 在脑电ERP研究中,某些ERP成分往往是相互叠加的,这样就会使得成分的幅值和潜伏期的测量不太精准。

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    主成分分析(PCA)在R 及 Python中的实战指南

    为了操作上的理解,我也演示了在R使用这个技术并带有解释。 注意: 要理解本文的内容,需要有统计学的知识。 什么是主成分分析?...在没有规范化的变量上执行主成分分析会导致带有高方差变量近乎疯狂的大量的负荷。反过来,这将导致一个主成分依赖于具有高方差的变量。这不是我们所希望的。...如下图所示,主成分分析在一个数据集上执行了两次(带有未缩放和缩放的预测值)。该数据集有大约40个变量,正如你所见,第一主成分由变量Item_MRP所主导。...这种主导普遍存在是因为变量有相关的高方差。当变量被缩放后,我们便能够在二维空间中更好地表示变量。 在Python & R中应用 主成分分析方法 (带有代码注解) ▼ 要选多少主成分?...让我们在R中做一下: #加上带主成分的训练集 > train.data <- data.frame(Item_Outlet_Sales = train$Item_Outlet_Sales, prin_comp

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    谈谈集群NAS在VDI存储中的应用

    在满足用户现有需求的基础上,如果能提供未来扩展空间(容量/性能)也是一个有吸引力的地方。 在VDI应用中,集群NAS是否比传统单/双控NAS更好?它能够提供那些更多的价值?...它扩展了一个当前由戴尔PowerEdge R720组成的服务器环境。...据synaix首席执行官Stefan Fritz介绍,他们的团队在安装戴尔Compellent之后,看到Cofely Germany的应用有了一个即刻的提高。...员工的虚拟桌面获得更好的响应能力,在Citrix XenDesktop环境中的应用明显运行地更快。“作为迁移到戴尔Compellent存储的一个收益,我们看到20%的应用性能提升”,他表示。...如上图,在业界标准的SPECsfs NFS性能测试中,戴尔FS8600根据设备数量的配置不同,在2控、4控和8控的情况下,分别测得131,684、254,412和494,244每秒文件操作数(OPS)

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    SparkSql中多个Stage的并发执行

    写一篇水水的技术文,总结一下sparksql中不同stage的并行执行相关,也是来自于一位群友的提问: 我们群里有很多技术很棒并且很热心的大佬,哈哈~ Hive中Job并发执行 hive中,同一sql...里,如果涉及到多个job,默认情况下,每个job是顺序执行的。...但如果某些job没有前后依赖关系的话,是阔以并行执行的,这样可能使得整个job的执行时间缩短。...Spark中多个Stage的并发执行 先给结论: 没有相互依赖关系的Stage是可以并行执行的,比如union all 两侧的sql 存在依赖的Stage必须在依赖的Stage执行完成后才能执行下一个Stage...把maxExecutors调大点,就能并行的更多 源码角度的解释 如果一个Stage有多个依赖,会依次递归(按stage id从小到大排列,也就是stage是从后往前提交的)提交父stages,直到到了根节点

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    DNS在远程调用执行中的应用

    Address一般是服务器本身配置的DNS的外网出口IP,证明的是下部分的命令成功的在icloud.com登录功能所在的服务器成功执行,这个是一个可以执行命令的演示,如果这里的exp是一个echo "...在自己的设备上执行,可以看到我设备本身的DNS的外网递归出口为27.40.22.150的IP地址; image.png image.png 二、实现原理 image.png     当我们在...的权威服务器就能知道,在什么时间,什么IP请求了什么域名,然后做日志回显即可完成该操作;(该网站提供的子域名TTL也是 190,所以在190s之内的请求就记录不了了,要等到下一个TTL周期进行请求。)...dnslog.cn提供的随机子域名的请求打印功能,可以很快的验证远程命令是否正常执行,以便给黑白帽子做判断是否进行下一步操作;  那么基于此原理,还能做什么?...,我还想知道是在什么角色之下,执行下whoami命令,显然是OK的,并且ceye提供的子域名TTL是1s,也就是大部分的请求日志都会记录在权威; image.png image.png    这样带来的可玩性就比较多了

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    R语言随机森林模型中具有相关特征的变量重要性

    p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣的好工具。由于我们通常在随机森林中使用它,因此它看起来非常适合非常大的数据集。...大型数据集的问题在于许多特征是“相关的”,在这种情况下,很难比较可变重要性图的值的解释。 为了获得更可靠的结果,我生成了100个大小为1,000的数据集。...顶部的紫色线是的可变重要性值 ,该值相当稳定(作为一阶近似值,几乎恒定)。红线是的变量重要性函数, 蓝线是的变量重要性函数 。例如,具有两个高度相关变量的重要性函数为 ?...实际上,我想到的是当我们考虑逐步过程时以及从集合中删除每个变量时得到的结果, apply(IMP,1,mean)} 在这里,如果我们使用与以前相同的代码, 我们得到以下图 plot(C,VI[2,]...然而,当我们拥有很多相关特征时,讨论特征的重要性并不是那么直观。

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    【R语言】因子在临床分组中的应用

    前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子(factor) 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL(胆管癌)这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...参考资料: ☞【R语言】R中的因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表...☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

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    关于GCD同步组实现多个异步线程的同步执行中的注意点

    、dispatch_group_t与dispatch_group_notify 组合来实现的 比如这样: 将几个线程加入到group中, 然后利用group_notify来执行最后要做的动作 - (void...它明确的表明了一个 block 被加入到了队列组group中,此时group中的任务的引用计数会加1(类似于OC的内存管理), dispatch_group_enter(group)必须与dispatch_group_leave...(group)配对使用, 它们可以在使用dispatch_group_async时帮助你合理的管理队列组中任务的引用计数的增加与减少。...它明确的表明了队列组里的一个 block 已经执行完成,队列组中的任务的引用计数会减1, 它必须与dispatch_group_enter(group)配对使用,dispatch_group_leave...当返回值不为0时,表示其当前有(一个或多个)线程等待其处理的信号量,并且该函数唤醒了一个等待的线程(当线程有优先级时,唤醒优先级最高的线程;否则随机唤醒)。

    3.3K41

    jQuery中,$.和$().有什么区别以及多个选择器的执行

    $代表jQuery对象,同时也是一个函数对象 $()和jQuery()是jQuery的核心函数,执行这两个元素返回的是一个DOM元素 $()是一个函数,等同于jQuery(),可在括号内传参数,传参后可获取元素...$(“.one”)表示获取class=“one”的元素,返回一个jQuery对象 $(”.one”).onclick表示class=”one”的点击事件 $.post() $.get() $.ajax...() 都是jQuery对象的方法 jQuery中,多个选择器是依次执行的,不是同时执行的 ,是在上一个选择器执行完的基础上,才开始执行下一个。...例如:$(“li:gt(0):lt(2)”) // 选择第二个和第三个li,gt(0)表示下标大于0的,lt(2)表示下标小于2的。...下标大于0为黑色区域,此时,下标为1的蓝色区域下标变为0,下标为3的粉色区域下标变为1,执行过滤选择下标为2后,即为红色框内,也就是最初的下标为1和2的元素,即第二个和第三个li元素(假设所有的颜色框均为

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    NewLife.XCode中如何借助分部抽象多个具有很多共同字段的实体类

    背景: 两个实体类:租房图片、售房图片 这两个表用于存储房源图片记录,一个房源对应多个图片,两个表的差别就在于一个业务关联字段。...租房图片中的RentID记录这个图片属于哪个租房信息; 售房图片中的SaleID记录这个图片属于哪个售房信息。 声明:这是二次开发,表结构不是我设计的。...由于XCode是充血模型,我们可以为这两个实体类做一个统一的基类来达到我的目的,但是这个统一的基类里面无法访问子类的字段,编码上很不方便。 这一次,我们用分部接口!...实际上也不应该修改原有的接口文件,因为原有的接口位于实体类的数据类文件中,那是随时会被新的代码生成覆盖。...这里为了实体接口的精简和独立,实体接口并没有继承IEntity,实际上实体类都继承了这两个接口。 所以,我们可以先转为IHouseImage接口,然后随意操作,当然你也可以在接口中增加各种方法。

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    在vscode中配置R的开发环境

    并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...整体看起来效果还是非常不错的,开发者在整体上还是保留了Rstudio和visual studio中对于View()这个函数的配置,还在此基础上添加了search功能,此外对Rshiny可视化的支持也非常棒...▶ pip install radian 四 在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别,R session...的配置 Path中添加R的执行文件的路径,当然也可以选择radian.exe的路径(该路径存在于python的scripts文件夹中)。...中运行的话,则会出现R session watcher不启用的状况,data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口,以在windows中选择radian.exe路径为例

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    Sql语句在Mysql中的执行流程

    连接建立后,执行查询语句的时候,会先查询缓存,MySQL 会先校验这个 sql 是否执行过,以 Key-Value 的形式缓存在内存中,Key 是查询预计,Value 是结果集。...当然在真正执行缓存查询的时候还是会校验用户的权限,是否有该表的查询条件。             ...MySQL 查询不建议使用缓存,因为查询缓存失效在实际业务场景中可能会非常频繁,假如你对一个表更新的话,这个表上的所有的查询缓存都会被清空。...语句有多个字符串组成,首先要提取关键字,比如 select,提出查询的表,提出字段名,提出查询条件等等。...4) 优化器             优化器的作用就是它认为的最优的执行方案去执行(有时候可能也不是最优,这篇文章涉及对这部分知识的深入讲解),比如多个索引的时候该如何选择索引,多表查询的时候如何选择关联顺序等

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    「R」ggplot2在R包开发中的使用

    尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式,以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行,不得不将依赖包列入Depdens。...由用户指定列名和表达式,而你想要你的函数能够有aes()同样的方式执行非标准计算。 如果你已经像上面的例子一样事先知道了列名,你可以使用来自rlang[2]的代词.data指代你要使用的图层数据。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象(例如,在一个plot()-风格的函数中)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法,但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的

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    SORT命令在Redis中的实现以及多个选项时的执行顺序

    图片SORT命令在Redis中实现了对存储在列表、集合、有序集合数据类型的元素进行排序的功能。SORT命令基本原理如下:首先,SORT命令需要指定一个key来表示待排序的数据。...Redis中的SORT命令可以使用多个选项,这些选项的执行顺序如下:ALPHA选项先于BY选项执行。...GET选项在LIMIT选项之后执行。这个选项用于获取元素的特定属性。ASC和DESC选项在GET选项之后执行。这两个选项用于指定排序的顺序,ASC表示升序排列,DESC表示降序排列。...STORE选项在执行完以上选项之后执行。这个选项用于将排序结果保存到一个新的列表中。...下面是一个示例,说明了多个选项的执行顺序:假设有以下的待排序列表:"users",包含了三个用户信息:1. user:id:1 -> name:John Doe, age:30, salary:500002

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    SQL语句在MySQL中是如何执行的

    修改完成后,只有再重新建立的连接才会使用到新的权限设置。 建立连接的过程通常是比较复杂的,所以我建议你在使用中要尽量减少建立连接的动作,也就是尽量使用长连接。...如果缓存 key 被命中,就会直接返回给客户端,如果没有命中,就会执行后续的操作,完成后也会把结果缓存起来,方便下一次调用。当然在真正执行缓存查询的时候还是会校验用户的权限,是否有该表的查询条件。...优化器 经过了分析器分析,MySQL 知道你要干啥了,在开始执行之前,还要先经过优化器的处理。...优化器的作用就是它认为的最优的执行方案去执行(虽然有时候也不是最优),比如多个索引的时候该如何选择索引,多表查询的时候如何选择关联顺序等。...InnoDB 引擎把数据保存在内存中,同时记录 redo log,此时 redo log 进入 prepare 状态,然后告诉执行器,执行完成了,随时可以提交。

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    在python脚本中执行shell命令的方法

    在python脚本中执行shell命令的方法 最近在写python的一些脚本,之前使用python都是在django中使用,可能大部分内容都是偏向于后端开发方面的,最近在写一些脚本的时候,发现了...aaa.sql的文件,文件中的内容是aaa,然后我们来看测试过程 1[root@ /data ]$python 2Python 2.7.15 (default, Nov 29 2018, 13:37...,然后下面出现的数字0代表上述命令执行成功;如果我们打印bbb.sql则返回值是256,表示执行中出现了问题。...shell命令pwd的时候,commands.getstatusputput返回值是0,也就是执行成功,返回结果是当前的目录;当执行pwddddd的时候,由于不是系统命令,所以返回结果是command...-r-- 1 root root 4 Dec 10 20:36 aaa.sql' 有了上面的基础,我们可以很方便的写出如下的代码,把脚本的执行结果和返回值进行保存,根据脚本执行的结果来确定最终的返回值

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