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    ROC曲线的理解

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 ROC曲线的理解和python绘制ROC曲线 ROC曲线的理解 考虑一个二分问题,即将实例分成正类(positive)或负类(negative)。...ROC曲线 对于一个特定的分类器和测试数据集,显然只能得到一个分类结果,即一组FPR和TPR结果。...AUC值 AUC(Area Under Curve)被定义为ROC曲线下的面积,显然这个面积的数值不会大于1。又由于ROC曲线一般都处于y=x这条直线的上方,所以AUC的取值范围在0.5和1之间。...ROC曲线的优势 ROC曲线有个很好的特性:当测试集中的正负样本的分布变化的时候,ROC曲线能够保持不变。...可以明显的看出,ROC曲线基本保持原貌,而Precision-Recall曲线则变化较大。 计算AUC 第一种方法:AUC为ROC曲线下的面积,那我们直接计算面积可得。面积为一个个小的梯形面积之和。

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    roc曲线的意义_【科研助手】ROC曲线在医学诊断类稿件中的应用「建议收藏」

    ROC曲线,即受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve),是以灵敏度为纵坐标,1-特异度为横坐标绘制而成的曲线,其在临床医学诊断类稿件中受到人们的广泛关注且应用逐渐深入...而稿件中的ROC曲线应用是否合理及数据逻辑能否行得通,还需认真分析。今天,小编就跟大家聊一聊ROC曲线在医学诊断类稿件中的应用。...首先,我们应该明确ROC曲线的绘制包括参数法和非参数法2种;非参数法没有条件限制,适用于任何诊断试验的ROC曲线绘制,常见的软件有SPSS、SAS,绘制出来的曲线为顶点较多的折线;参数法是假设患者和非患者的试验结果属于正态分布...,常见于一些专业的ROC分析软件,如ROCKIT,绘制出来的是光滑的曲线。...参考文献 [1]赵瑞珩.ROC曲线评价血清CA125、CA199和CEA对卵巢癌的诊断价值[J].中国实验诊断学,2015(11):1954-1955.[2]冯广龙,姜慧杰.ROC曲线分析在医学影像学诊断中的价值

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    统计学中ROC曲线的认识

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 ROC曲线标识了为了达到某个TPR(识别率),伴随而来的该分类器的FPR(误判率)是多少,体现了这两者的关系。...与ROC曲线类似的还有一个上升图,表示为了达到相应的识别率,需要投入的成本是多少(这个成本可以是样本数量)。...ROC 曲线的横坐标表示 一个负的实例被当作正实例的概率(FPR),纵坐标表示一个正的实例被当作正的实例的概率(TPR)。...当把所有的实例都分类成正的以后,TPR为100%,FPR也是100%,这解释了为什么ROC曲线必然过点(100%,100%)。...ROC曲线的生成:可以通过将实例依照 肯定的(Positive)的概率从大到小排序,然后挨个分类,根据分类结果和真实结果从原点出发调整ROC曲线的前进方向完成绘制。

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    R语言计算AUC(ROC曲线)的注意事项

    之前的推文中介绍了ROC曲线的本质以及两面性: ROC阳性结果还是阴性结果?...并详细介绍了如何手动计算真阳性率/假阳性率,以及怎样计算多个,并把点连接成线,变成ROC曲线:ROC曲线纯手工绘制 这些现在都有成熟的R包可以帮我们搞定,不需要我们手动计算。...如果是无序因子、数值、字符、逻辑型变量,会按照R语言的默认排序,比如按照数字大小、首字母顺序等,也是计算排序靠后的类别的AUC。...(比如这里我们想计算癌症的AUC,而不是非癌症)的AUC,所以我建议大家在使用R包计算AUC或者画ROC曲线时,手动指定顺序!...ROC曲线R包都有这样的潜规则,大家在使用的时候一定要注意~ 示例数据还提供了用数值表示的结果变量class,感兴趣的可以试试看,是不是和我说的一样!

    1.5K10

    R语言ROC曲线下的面积-评估逻辑回归中的歧视

    p=6310 在讨论ROC曲线之前,首先让我们在逻辑回归的背景下考虑校准和区分之间的区别。 良好的校准是不够的 对于模型协变量的给定值,我们可以获得预测的概率。...它将具有良好的校准 - 在未来的样品中,观察到的比例将接近我们的估计概率。然而,该模型并不真正有用,因为它不区分高风险观察和低风险观察。这种情况类似于天气预报员,他每天都说明天下雨的几率为10%。...在R中绘制ROC曲线 set.seed(63126) n < - 1000 x < - rnorm(n) pr < - exp(x)/(1 + exp(x)) y ROC曲线,其中预测因子与结果无关 ROC曲线下面积 总结模型辨别能力的一种流行方式是报告ROC曲线下的面积。...我们已经看到具有辨别能力的模型具有更接近图的左上角的ROC曲线,而没有辨别能力的模型具有接近45度线的ROC曲线。因此,曲线下面积从1(对应于完美辨别)到0.5(对应于没有辨别能力的模型)。

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    ROC曲线的含义以及画法

    ROC曲线以真正例率TPR为纵轴,以假正例率FPR为横轴,在不同的阈值下获得坐标点,并连接各个坐标点,得到ROC曲线。...ROC曲线 回到刚才那个对图片进行分类的例子,当阈值在[0,0.1]区间时,分类器认为所有的图片都是汉堡,这时我们就能得到一个混淆矩阵以及该混淆矩阵中TPR和FPR的值,同时在二维平面坐标轴中得到一个坐标为...知道阈值取到最大,二维空间中找到了所有与混淆矩阵对应的点,我们把这些点连起来就得到了我们所需要的ROC曲线 由上可知,ROC曲线的横坐标和纵坐标其实是没有相关性的,所以不能把ROC曲线当做一个函数曲线来分析...为什么使用ROC曲线? 因为ROC曲线有个很好的特性:当测试集中的正负样本的分布变化的时候,ROC曲线能够保持不变。测试集中的正负样本的分布变化的时候,ROC曲线能够保持不变。...下图是ROC曲线和Precision-Recall曲线的对比: 在上图中,(a)和( c )为ROC曲线,(b)和(d)为Precision-Recall(P-R)曲线。

    1.2K10

    R完成--决策树分类 一个使用rpart完成决策树分类的例子如下:

    特征A对训练数据D的信息增益g(D, A) = 集合D的经验熵H(D) - 特征A给定情况下D的经验条件熵H(D|A) 特征A对训练数据D的信息增益比r(D, A) = g(D, A) / H(D) 而...## cp全称为complexity parameter,指某个点的复杂度,对每一步拆分,模型的拟合优度必须提高的程度 ct rpart.control(xval=10, minsplit=20,...cp=0.1)## kyphosis是rpart这个包自带的数据集 ## na.action:缺失数据的处理办法,默认为删除因变量缺失的观测而保留自变量缺失的观测。        ..."green",            border.col="blue", split.col="red",            split.cex=1.2, main="Kyphosis决策树")...box.col="green",            border.col="blue", split.col="red",            split.cex=1.2, main="Kyphosis决策树

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    roc曲线的意义_Pre Rec ROC PR「建议收藏」

    首先理解这四个基本指标: ROC曲线中,是以FPR为x轴,TPR为y轴。 PR曲线中,以Recall为x轴,Precision为y轴。...绘制ROC曲线和PR曲线都是选定不同阈值,从而得到不同的x轴和y轴的值,画出曲线。 在 ROC 空间,ROC 曲线越凸向左上方向效果越好,但是,PR 曲线是右上凸效果越好。...所以,PR曲线在正负样本比例悬殊较大时,更能反映分类器的性能。 当正负样本分布发生变化时,ROC 曲线的形状能够基本保持不变,而 P-R 曲线的形状一般会发生较剧烈的变化。...若选择不同的测试集,P-R 曲线的变化就会非常大,而 ROC 曲线则能够更加稳定地反映模型本身的好坏。 所以,ROC 曲线的适用场景更多,被广泛用于排序、推荐、广告等领域。...但需要注意的是,选择 P-R 曲线还是 ROC 曲线是因实际问题而异的,如果研究者希望更多地看到模型在特定数据集上的表现,P-R 曲线则能够更直观地反映其性能。

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    R完成--决策树分类 一个使用rpart完成决策树分类的例子如下:

    特征A对训练数据D的信息增益g(D, A) = 集合D的经验熵H(D) - 特征A给定情况下D的经验条件熵H(D|A) 特征A对训练数据D的信息增益比r(D, A) = g(D, A) / H(D) 而...## cp全称为complexity parameter,指某个点的复杂度,对每一步拆分,模型的拟合优度必须提高的程度 ct rpart.control(xval=10, minsplit=20..., cp=0.1) ## kyphosis是rpart这个包自带的数据集 ## na.action:缺失数据的处理办法,默认为删除因变量缺失的观测而保留自变量缺失的观测。        ..."green",            border.col="blue", split.col="red",            split.cex=1.2, main="Kyphosis决策树")...box.col="green",            border.col="blue", split.col="red",            split.cex=1.2, main="Kyphosis决策树

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    多指标联合诊断的ROC曲线

    关于ROC曲线,前前后后写了很多篇推文,关于二分类数据和生存资料的都有,目前只有多指标联合诊断的ROC曲线还没介绍了,今天就介绍多指标联合诊断的ROC曲线。...多时间点和多指标的ROC曲线 临床预测模型之二分类资料ROC曲线的绘制 临床预测模型之生存资料ROC曲线的绘制 ROC曲线(AUC)的显著性检验 生存资料ROC曲线的最佳截点和平滑曲线 ROC曲线纯手工绘制...R语言计算AUC(ROC曲线)的注意事项 ROC阴性结果还是阳性结果 准备数据 library(pROC) data(aSAH) str(aSAH) ## 'data.frame': 113 obs...曲线了,这个就是多指标联合诊断的ROC曲线。...很简单,只要把predict中的数据集换成测试集即可: # 换成测试集即可 pred 的测试集, type = "response") 剩下的就都一样了

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    R语言模拟保险模型中分类器的ROC曲线不良表现

    因此,我想表明AUC的上限实际上很低!因此,这不是建模问题,而是保险业的基础问题。 我们使用协变量(例如在汽车保险中的汽车驾驶员的年龄或在人寿保险中的保单持有人的年龄等)。然后我们使用它们来训练模型。...然后,我们使用从混淆矩阵获得的ROC曲线来检查我们的模型是否良好。在这里,我不会尝试构建模型。我会预测每次真实基础概率超过阈值! 在这里 p(\ omega_1)表示索赔损失,欺诈等的可能性。...考虑一些带有伯努利变量的数据集 y,用这些概率得出p( omega),p (ω )。然后,我们假设我们能够得到一个完美的模型:我不会基于某些协变量来估计模型,在这里,我假设我完全知道概率。...当然,这里是对称的。在y轴上,我们具有分散性:投资组合中的异质性越低,其混合性就越小。...例如,平均有30%的机会要求损失,分散度为20%(这意味着在投资组合中,90%的被保险人有20%至40%的机会主张损失),我们平均有60%的AUC。

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    生存资料ROC曲线的最佳截点和平滑曲线

    二分类变量的最佳截点直接使用pROC包就可以直接得到,前面也介绍过,今天主要说一下生存资料ROC曲线的最佳截点,以及生存资料的ROC曲线如何变得平滑。...平滑曲线 加载R包和数据 多个时间点ROC 画平滑曲线 找最佳截点 平滑曲线 不考虑时间因素的ROC曲线可以使用pROC包中的smooth参数实现平滑版的曲线。...time dependent ROC目前还没发现比较好的方法可以直接实现,只能使用ggplot2曲线救国了。...找最佳截点 找了好久也没发现一个R包可以完成time-dependent ROC的所有分析,timeROC是比较全能的了,但是不能计算最佳截点,survavalROC可以计算最佳截点,但是又不能同时计算多个时间点的...ROC曲线。

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    R语言统计与绘图:可视化ROC曲线的置信区间

    ROC曲线是临床中常用的统计分析之一,R中可以绘制ROC曲线的包也有很多,pROC包就是其中的佼佼者。 pROC包可以计算AUC和95%置信区间,可以可视化、平滑和比较ROC曲线。...pROC包中的常用缩写: 缩写 解释 ROC曲线 受试者操作特征曲线 AUC ROC曲线下面积 pAUC 部分ROC曲线下面积 CI 置信区间 SP 特异度specificity SE 灵敏度sensitivity...建立拟合曲线 在pROC包中,使用roc()函数来建立ROC对象。默认情况下roc()函数会输出AUC的值。...no.roc # 逻辑词,如果为FALSE,则将ROC曲线重新添加到该形状上; # 如果为TRUE,则只绘制形状;在type=bars则忽略 ROC曲线外观参数的修改参考《R语言统计与绘图:pROC包绘制...总结绘制ROC曲线的R包的区别 pROC包是目前功能最全面的ROC曲线专业绘制包,可以多探索探索。

    9.3K23

    用R语言实现对不平衡数据的四种处理方法

    ROC曲线之所以有用是因为它提供了分类数据收益(TP)和损失(FP)的可视化信息。ROC曲线下方区域的面积(AUC)越大,整体分类精度就越高。...特别地,代价曲线被认为有以图形方式描述分类器误分类代价的能力。但在90%的场合中,ROC曲线已经足够好。 在R中进行不平衡数据分类 我们已经学习了不平衡分类的一些重要理论技术。是时候来应用它们了!...我们先建立一个简单的决策树模型: library(rpart) treeimb rpart(cls ~ ., data = hacide.train) pred.treeimb 的ROC曲线,它会给我们提供这个模型分类能力的直观评价。...# 训练决策树 tree.rose rpart(cls ~ ., data = data.rose) tree.over rpart(cls ~ ., data = data_balanced_over

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    小白也能看懂的 ROC 曲线详解

    ROC 曲线是一种坐标图式的分析工具,是由二战中的电子和雷达工程师发明的,发明之初是用来侦测敌军飞机、船舰,后来被应用于医学、生物学、犯罪心理学。...坐标系中纵轴为 TPR(真阳率/命中率/召回率)最大值为 1,横轴为 FPR(假阳率/误判率)最大值为 1,虚线为基准线(最低标准),蓝色的曲线就是 ROC 曲线。...以下面表格中的 20 个点为例,介绍如何人工画出 ROC 曲线,其中正样本和负样本都是 10 个,即 \#P = \#N = 10。...四、联邦学习中的 ROC 平均 如果将上面的内容比作“正餐”,那这里就是妥妥干货了,打起精神冲鸭! 顾名思义,ROC 平均就是将多条 ROC 曲线“平均化”。那么,什么场景需要做 ROC 平均呢?...例如:横向联邦学习中,由于样本都在用户本地,服务器可以采用 ROC 平均的方式,计算近似的全局 ROC 曲线。

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