import leidenalg as la
ig.save(G,'ttt.gml') 一切都很好，但是ig.save不包含集群信息，只包含节点和边。需要将群集信息添加到ttt.
浏览 70提问于2021-01-26得票数 0
回答已采纳
1回答
我有一个.gml文件(或graphML)，它包含我的节点和边缘的详细信息。我是通过以下代码在python中导入图形的，并使用igraph：我在我的.gml文件中给出了边的值：[target0]graph directed 0
浏览 3提问于2014-02-16得票数 1
回答已采纳
最后，我希望使用RNetLogo将一个NetLogo网络传递给R，这样R就可以使用包或influenceR进行一些网络分析，然后将结果传回给NetLogo。我目前正在分别运行NetLogo和R，以便在将R代码放入RNetLogo所需的格式之前确保其工作正常。最好的传输格式似乎是gml，但是用于保存gml的NetLogo网络扩展并不能满足igraph的要求。gg <- read_graph(file = "temp.<e
浏览 1提问于2016-01-12得票数 2
回答已采纳
2回答
我导入了一个GML文件。现在，我的所有行都有了数字，后面跟着一个,。我想不出怎么去掉数字并使之成为数字。我已经尝试了as.numeric和gsub，但当我计算邻接矩阵时，我得到了以下输出：games[0] <- as.numeric(gsub("[^[:digit:]]","",games[0]))E
浏览 0提问于2014-02-04得票数 0
1回答
我有一个大型igraph，它有几个边缘和顶点属性，我需要将这些属性写到文件中，然后稍后再加载(可能是通过另一个程序，比如python)。> g+ attr: name (v/c), numeric_var (e/n), binary_outcome1 (e/x), binary_outcome2(e/x)
那么，我应该使用什么格式才能将所有边缘属性写入文件格式呢？
浏览 0提问于2014-03-14得票数 3
回答已采纳
1回答
我使用的是R编程语言和"igraph“库。假设我有一些数据，我把它做成一个无向图，并执行社区检测(图聚类) # undirected graph
"node_a然而:当我使用相同的数据，创建一个有向图，然后运行社区检测时，我得到以下警告消息(但代码仍然运行)： #directed graph (warning messages) 库(字形) my_data &
浏览 26提问于2020-12-09得票数 1
回答已采纳
1回答
我的问题涉及图聚类算法的应用。大多数情况下，我看到图形是通过使用数据中的节点和边来创建的。例如，假设我们有社交媒体数据:数据中的每个个体都可以表示为一个节点，而个体之间的关系可以表示为边。使用这些信息，我们可以构建一个图，然后在该图上执行图聚类算法(例如，Louvain聚类)。
有时，也可以使用点之间的距离来绘制图形。点之间的距离可以看作是边。例如，在谱聚类算法中，从数据中生成一个
浏览 5提问于2020-08-25得票数 2
我是一个非常非常平庸的程序员，但我的目标仍然是使用 python库来确定用户在给定论坛中的中心地位的影响，以预测他将来对该论坛的贡献。我与其他人取得了联系，他们使用库做了类似的事情，但考虑到当前论坛的规模，计算准确的中心性指数实际上是不可能的--它只是需要太多时间。我试着用igraph库写一些类似的东西(它允许快速估计而不是精确计算)，但我似乎不能将数据写入CSV文件。我的代码：import sys, csv
g
浏览 2提问于2011-11-20得票数 3
回答已采纳
2回答
igraph不能使用GLPK
、、、、
我刚刚写了一个python脚本来使用igraph模块来做optimal_modularity，这个函数使用了GLPK库，但是即使在安装了python-glpk和几乎所有与glpk相关的包之后，我也得到了这个错误49, in <module> File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/igraphError at
浏览 2提问于2015-02-12得票数 0
1回答
我在igraph中使用igraph算法在一段时间内检测同一组节点之间的社区(即为同一组节点生成多个和可能不同的聚类)。关于检测算法的输出(也可以适用于igraph中的其他检测算法)，我有两个问题：
算法是如何决定成员分配的？
浏览 3提问于2014-01-02得票数 0
回答已采纳
1回答
我正在尝试使用R将XML/GML中的Web功能服务层转换为一个shapefile，我并不完全在那里，希望得到任何帮助。WFS链接是：'‘library(XML)site <- 'http://sdi.fish.govt.nz/fme" xmlns:gml="http://www.opengis.net&
浏览 1提问于2016-03-20得票数 1
回答已采纳
我需要使用NetLogo中的R扩展来做一些网络计算。我正在NetLogo中创建网络，将其导出到文本文件中，让R读取文本文件并构造一个图表并计算属性，然后得到计算结果。导出、读取、计算和获取由NetLogo通过R扩展控制。我的新方法不是更改R工作目录，而是提供导出文件的R的完整路径。\
浏览 1提问于2016-01-23得票数 1
1回答
cor.vector包含：[1,] 2 1 [3,] 3 2 这意味着，正如预期的那样，向量1、2和3之间以及4和5之间存在关联。我需要的是获得两个向量c(1,2,3)和c(4,5)作为最终结果。
这是一个简单的例子，我正在处理大的矩阵。
浏览 0提问于2013-04-25得票数 5
回答已采纳
1回答
据我所知，先验地为你的数据选择可能的最佳聚类方法通常是困难的，我们可以使用聚类有效性来比较不同聚类算法的结果，并选择具有最佳验证分数的算法。我在集群结果上使用了R stats包的内部验证函数(对于集群方法，我使用了R igraph、fast.greedy和walk.trap)。结果是许多验证分数的列表。我可以使用这个验证结果列表作为我的原因之一来向其他人解释为什么我选择快速贪婪方法
浏览 0提问于2018-01-02得票数 0
我根据基因微阵列数据创建了一个热图，然后使用pheatmap对数据进行聚类并输出热图。
有没有办法将热图的聚类数据以矩阵形式输出到excel文件中？
浏览 2提问于2015-09-25得票数 0
2回答
我有两个包含多个变量的数据集(data_A和data_B)。有两种可能的输出(pheno_1和pheno_2)。我正在寻找一种聚类或分类算法，它能以一种与预期结果相匹配的方式对我的数据进行聚类。然后，我将使用聚类来预测不同数据集的输出。到目前为止，我正在使用K-Means，并尝试不同的变量集和不同的归一化方法，以获得我正在寻找的最终结果。我想找出
浏览 0提问于2019-07-01得票数 0
1回答
在这个介绍之后，这里有一个最初的问题：游戏将通过使用c++的虚幻引擎开发。这个想法是让引擎读取一个文件并转换成一个网格(坐标点)，其中每个方块都有关联的地形类型，比如在场景编辑器的图像中。另一个网站产生的文件是全球特定位置的GML (地理标记语言)。GML是一个XML扩展。
我面临的问题是将给定位置的GML转换为我的游戏可以使用的数据，比如位置数组
浏览 15提问于2016-12-20得票数 0
我在iGraph中创建了两个相关的图，A和G。我使用infomap或label_propagation方法在G中找到了结构中的社区(因为它们是两个允许加权的定向链接)。
浏览 0提问于2016-08-23得票数 0
我已经使用它通过K-means聚类对我的样本数据进行了聚类。我的疑问是，如果我使用一个excel原始数据文件进行聚类，我如何在excel文件中得到我的excel数据输出数据拆分成K个聚类。我知道如何创建集群并在设计和结果屏幕之间切换。
提前谢谢。
浏览 3提问于2016-01-29得票数 0
2回答
显示图像中的相互作用簇
、、、
我有一个交互网络，我使用以下代码创建一个邻接矩阵，然后计算网络节点之间的不同，然后将它们聚在一起形成模块：dissADJ1<-1-ADJ1现在，我希望这些模块出现在我绘制igraph时。g<-simplify(graph_from_adjacency_matrix(adjacent-mat, weighted=T))
plot.igraph(
浏览 6提问于2016-07-02得票数 2
回答已采纳
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
腾讯会议
云直播活动推荐
腾讯云开发者
