标签绘制 library(ggplot2) head(mtcars) p ggplot(mtcars,aes(wt,mpg,label=rownames(mtcars))) p+geom_text...() #使用geom_text绘制标签散点图 使用geom_label绘制标签散点图 p+geom_label() 绘制点,并通过nudge参数对标签进行x轴和y轴上的平移 p+geom_point(...图例绘制 2.1 guide_legend函数(主要参数:color, shape, size) 图例调整函数也属于标度函数的一类,但不可以直接使用加号来连接,必须放在函数中,作为一个参数。...scale_xxx_continous(),对于分类型变量,使用的是scale_xxx_discrete()。...标题绘制 标题主要有五种:主标题,副标题,角注,x轴标签和y轴标签 p ggplot(mtcars,aes(mpg,wt,color=factor(cyl)))+geom_point() p+ggtitle
> install.packages("ggplot2") > library(ggplot2) > R0_vs_R3_isoforms_fitter <- read_excel("~/Downloads.../R0-vs-R3.isoforms.fitter.xlsx") > data <- R0_vs_R3_isoforms_fitter > r03 ggplot(data,aes(log2FC,-1
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近交流群内看到有朋友询问大脑图谱相关的图,本节来介绍如何使用ggseg包来绘制此类图,该包内容十分丰富案例众多同时也兼容ggplot,详细内容请参考官方文档。...fill = region), show.legend = FALSE, color = "black", position = "stacked") 案例 3 ggplot
直接绘制 library(mapdata) library(maptools) library(ggplot2) library(plyr) library(mapproj) library(...Beautiful-Visualization-with-R-master/map/bou2_4p.shp") plot(china_map) #直接画出来的话地图是扁平的,默认吧进度和纬度作为普通数据,均匀平等对待,绘制在笛卡尔坐标系中...#因此需要用稿ggplot2提供的coord_map()映射转换坐标系 #bou2表示我们读取的是省级地图,1表示国家层面,数值也大划分越细 image.png 使用ggplot的坐标轴映射函数coord_map...", fill = NA) + theme_grey()+ coord_map() image.png 提取上海单独绘制 names(china_map) #可以发现china_map中有925...group = id), colour = "black", fill = NA) + theme_grey() image.png 根据统计值大小对不同省份着色 #绘制整个中国地图
今天只讲图例系统,这一块是大部分学习者非常容易忽视的东西(有木有学会ggplot()+geom_xxx就觉得超神了然后自我感慨,哇塞ggplot2原来这么简单,远远没有传说中的那么难耶)。...这样只能打60份,因为图表质量不够,这样使用ggplot2并无法发挥其百分百的功力。...真的任重而道远呀哈哈 本篇只分享图例系统: guides() ggplot2的图例系统函数比较分散,在所有标度调整函数(轴标度除外)内部留有guide参数,可以通过guide_colorbar()、guide_legend..., shape = guide_legend(), linetype = guide_legend(), alpha = guide_legend() ) 假设你的图表中使用了这么多的图层...好了,关于图例就分享这么多了,下一次分享一下主题系统。 墙裂推荐大家看源文档学ggplot2,源文档才是精品,没有之一~ http://ggplot2.tidyverse.org/reference/
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近VIP群内有朋友询问火山图的绘制方法,那么本节就来详细介绍在R中如何使用「ggplot2绘制火山图」,小编添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢。...("data.xls", header = TRUE, sep = "\t") 数据清洗 plot_data % janitor::clean_names() %>% # 使用..."Slc22a3") down_genes % filter(symbol %in% c("Il15", "Il34")) 数据可视化 plot_data %>% ggplot...labs(x = "log2(fold change)", y = "-log10(adjusted P-value)", colour = "Expression change") + # 调整图例外观...,将图例大小设为 5,位置设置为右上角 guides(color = guide_legend(override.aes = list(size = 5))) + theme_bw() + #
约翰·霍普金斯大学提供了一份数据集,使用这份数据集我们可以绘制一幅气泡地图展示这些确诊患者的分布,代码比较简单: 首先导入我们需要的几个 R 包: library(ggplot2) library(sf...worldmap % st_transform(crs = 4326) 把疫情数据读取进来并根据经纬度坐标把这个数据框转换成 sf 对象,同样使用...colnames% st_as_sf(coords = c("long", "lat"), crs = 4326) -> con_df 最后绘制地图...: mybreaks <- c(1, 20, 100, 1000, 50000) ggplot(worldmap) + geom_sf(size = 0.1, color = "white", fill...Novel Coronavirus (COVID-19) Cases, provided by JHU CSSE\nhttps://github.com/CSSEGISandData/COVID-19\n绘制
Xenium、Visium、VisiumHD、CellDive、Akoya等空间组学数据是包含细胞的坐标信息的,这些信息可以用于绘制空间原位图。...image_wh_ratio <- diff(range(coords_xenium p_xenium_boundary <- coords_xenium_sub %>% ggplot...theme(panel.background = element_rect(fill = "black")) p_xenium_boundary | p_xenium_boundary2 使用...geom_polygon绘制细胞边界空间图,指定group为cell_id即可,fill可以指定为细胞类型或者基因表达量。...另一个选择是使用geom_tile图层,它可以指定点的height和width,height和width的大小和使用的数据有关系,在调试出图时只需要指定好了它们的值,则点的遮挡关系就不会因为导出图片的大小而出现改变
绘制条形图,简单调整柱子的宽度以及加上 x,y 轴标题。...ggplot(df1, aes(p.val, term)) + geom_col(width = 0.6) + labs(x = '-log(BH p value)', y =...填充的 legend 没有实际含义,所以将图例去除(legend.position = 'none')。 注意:这里将柱子按照类别进行填充,当然你也可以使用另一个变量进行填充(下面会给例子)。...ggplot(df1, aes(p.val, term)) + geom_col(aes(fill = term), width = 0.6) + geom_rangeframe(data =...主要细节调整:geom_col() 中的 aes(fill = score),连续性变量填充使用 scale_fill_gradient2() 以及加上了图例。
1绘制 ggplot(mydata) + + geom_bar(aes(x=a, y=b),width = 1,stat="identity", + colour = "black...(size=0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) 4.png 2绘制不带空心的玫瑰图...ggplot(diamonds,aes(x=clarity,fill=color))+ + geom_bar(width=1.0,colour...size=0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) image.png 3绘制带空心的玫瑰图...> ggplot(diamonds,aes(x=clarity,fill=color))+ + geom_bar(width=1.0,colour="black",size=0.25)+ +
本节来介绍ggplot2绘制中图例设置方面的问题,通过一个热图的案例进行阐述。整个过程仅参考,希望对各位观众老爷能有所帮助。...ggplot2中的图例体系 ❝在ggplot2中针对图例的自定义设置可通过guide与guides函数来完成,二者虽只有一字之差具体参数上也基本一致,但是使用时却也有些许不同。...❞ guide函数作为scale_类函数中的一个内函数,通常配合比例尺函数一起使用,但是由于取其内含有众多的参数,因此在比例尺中使用则会显得代码比较臃肿,因此小编比较推荐单独使用guides函数来进行图例自定义...「guides函数中常使用的主要有 guide_legend 和 guide_colourba」两类 guide_legend:用于定义离散型数据图例 guide_colourba:用于定义连续型数据图例...❝因此在使用前需针对图例所对应的几何对象来选择正确的函数,同时在实际绘图过程中图例绘制还存在一种情况,即数据为连续型但是在绘制图例将其定义为离散型。
fontproperties='STKAITI', fontsize=24) #图形标题 pl.title('sin-cos函数图像', fontproperties='STKAITI', fontsize=32) #设置图例
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝2月底ggplot2更新了最新版3.5,本节来介绍一下ggplot2 3.5版更新的内容之「图例操作部分」,使用最新版后定义图例位置将变得异常的简单,更多详细内容请参考作者官方文档...❞ install.packages("ggplot2") # 需要安装ggplot2 3.5 library(ggplot2) 官方文档 https://www.tidyverse.org/blog.../2024/02/ggplot2-3-5-0-legends/ 案例1 按属性定义图例位置 ggplot(mpg, aes(displ, hwy, shape = drv, colour = cty,...alpha = guide_legend(position = "inside")) + theme(legend.position = "left") 案例2 自动设置刻度图长度 ggplot...grey25"), col = NA) ) nc <- sf::st_read(system.file("shape/nc.shp", package = "sf"), quiet = TRUE) ggplot
当使用ggplot2作图的时候如果多个图拼接到一起,图例互相之间有一样的时候,比如如下的情况(我们用R语言内置的鸢尾花的数据集做三个散点图) ?...image.png 还有一种情况是分组过多如何调整图例的布局,比如 代码 df$V6<-sample(LETTERS[1:6],150,replace = T) p4ggplot(df,aes(x=...image.png 图例放到顶部,默认的布局是3行3列,如果要改成1行6列呢?ggplot2里应该有对应的参数可以修改吧?...但是目前还不知道如何使用ggplot2自带的函数来操作,查资料的时候发现了一个R包lemon里有一个reposition_legend()函数 参考资料的链接是 https://cran.r-project.org...如果将ggplot2的图例设置为顶部,默认结果如下 p4ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+ geom_point(aes(color=V6))+ theme_bw()+
首先做一幅简单的散点图,使用的数据集是R语言里自带的iris library(ggplot2) ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width))+ geom_point...第二种方法是使用guides()函数 参考https://stackoverflow.com/questions/14622421/how-to-change-legend-title-in-ggplot...第三种方法直接使用labs()函数来修改 ggplot(iris1,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width))+ geom_point(aes(color=cultivar...image.png 不想要图例的标题可以直接加theme(legend.title="none") 接下来是更改图例的大小 如果更改点的大小,右侧图例的大小也会跟着改变 比如 ggplot(iris1,...接下来是更改三个图例的文字标签 比如我想把 三个品种名分别改成A,B,C 第一种方法还是直接改数据 第二种方法使用factor()函数,原来这个函数还有一个label参数 参考 http://t-redactyl.io
鼠标画矩形: // An example program in which the // user can draw boxes on the screen. ...
1-移除全部/部分图例 使用legend.position = "none" 可以方便我们移除图例,但有时候可能并不需要这么无情,比如移除指定某个类型的图例,通常几何对象可以设置多种分类(color,...,我们可以使用guide 函数: ggplot(chic, aes(x = date, y = temp, color = season, shape = season...3-改变图例标题和子标签 改变图例标题的方法有很多,关于子标签,可以使用scale_xx_discrete 定义 labels : ggplot(chic, aes(x = date, y = temp...(这里我也没有弄清有什么方便的方法),或者使用函数scale_color_manual : ggplot(chic, aes(x = date, y = o3)) + geom_line(aes(color...我们可以不希望显示,在几何对象中使用show.legend = FALSE : ggplot(chic, aes(x = date, y = temp, color = season)) + geom_point
sig <- 0.05 / nrow(gwas) 数据可视化 ggplot(gwas, aes(x = bp_cum, y = -log10(p),color = as_factor(chr), size
_1.5.1 dplyr_1.1.4 purrr_1.0.2 readr_2.1.5 tidyr_1.3.1 [11] tibble_3.2.1 ggplot2...rev()) df1 % filter(name=="WES RNA-seq") %>% dplyr::rename("WES RNA-seq"="value") df %>% ggplot
❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制嵌套圆形图,图形绘制倒也简单主要是细节的调整结果仅供参考❞ 加载R包 library(tidyverse) 导入数据 bytes_total % mutate(x_label = c(0.45, 1.4, -0.57, -1.3)) 数据可视化 ggplot
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