Gene Ontology, 简称GO, 是最常用的基因功能注释数据库之一。...Disease Ontolog与GO数据库类似，通过参照MeSH, ICD等疾病分类标准，对人类的常见疾病与罕见病进行了归纳整理，提供了一个统一的，标准化的疾病分类系统，对应的文章发表在Nucleic...通过官网的检索框可以对数据库中的信息进行检索，也可以通过左侧的导航栏直接进行浏览，在右侧的页面会显示对应的结果信息。以cancer作为关键词进行检索，结果示意如下 ?...和Gene Ontolgy类似，Disease ontology简称DO, 所有的疾病信息也是采用了一个有向无环图的拓扑结构，所有数据库中的信息存储了一个obo文件中供下载，链接如下 http://www.disease-ontology.org
随着大规模甲基化研究的进行，积累了大量疾病相关的甲基化数据，DiseaseMeth就是一个保存了人类疾病相关的甲基化信息的数据库。...官网地址如下 http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/diseasemeth/ 在DiseaseMeth数据库中，甲基化数据的类型包括两大类别 芯片 对于DNA甲基化芯片，除了...利用这个数据库，我们可以根据疾病或者基因检索相关信息。以基因DEFB119为例，该基因相关疾病的检索结果如下 ?...从检索结果中，我们可以得到该基因相关的疾病，以及在该疾病中，这个基因的甲基化水平是上升还是降低。 对于相关疾病，还有热图数据可以下载 ?...通过这个数据库，我们可以检索已有的对于某种疾病或者某个基因甲基化的研究结果。
类器官技术可与其它生物技术进行有机整合，包括基因编辑、单细胞基因组学、实时成像、微流体技术，从而为了解疾病的发病机制和发展过程以及转化出新的诊断和治疗技术提供一个全新的视角。...十年前，荷兰科学家Hans Clevers 领导的团队成功将人类成体肠干细胞在体外培养成为小肠绒毛结构，证实小肠干细胞能够形成类器官 (Organoids)，开创了类器官研究的时代。...肿瘤治疗学的临床前研究通常需要在培养的肿瘤细胞中检测潜在的抗癌药物，科学家们苦于没有疾病的临床前模型，研发治疗方案无法取得进展。
科研人员为一个名为gnomAD的人类基因组数据库进行了扩展，现在包含了76,156个完整的基因组序列。这个扩展版的数据库使得科学家能够研究基因组中非编码蛋白质区域的变异是如何影响人类健康的。...在《自然》杂志上，Chen等人提出了一个工具，用于分析大量人类基因组，以识别在突变时最有可能导致疾病的非编码区域。...这项工作代表了最新版本的基因组聚合数据库（gnomAD），这是一个公开的人类遗传变异目录。...自那以后，该联盟大大扩展了这个数据库；现在的资源包括了76,156个不同血统个体的完整基因组序列，提供了更深入的人类遗传变异图景。 gnomAD已经改变了人类遗传学领域，尤其是在诊断罕见疾病方面。...与预期相比，变异较少的基因更不耐受——也更可能与疾病相关。为了包含人类基因组的非编码部分，越来越多的努力被投入到扩展不耐受度量指标上。
周一小编为大家分享了一篇circRNA理论知识点的paper（ circRNA在癌症和肿瘤学中的新作用），今天继续分享circRNA研究工具篇：circMine数据库。...circMine是首个旨在系统地整合、分析和可视化特定生理和病理条件下人类circRNA转录组数据的综合数据库。...与其他只提供普通和组织特异性circRNA的基因组学、表达模式、功能和结构注释的数据库相比，circMine可以提供独特的数据和显著的功能，填补一些服务空白。...目前版本的circMine提供了1821448个条目，由来自31个人体部位1107个样本的136871个circRNA、87种疾病和120个circRNA转录组数据集组成。...预测工具来识别/推测circRNA-miRNA相互作用； 2）circRNA IRES预测：根据BLAST、IRESbase和circBase资源，开发了circRNA IRES预测，以确定实验验证的人类
到了2029年左右，人类的寿命将不再是通过出生的日期到活着的时间来进行计算，那时，人类每年所延长的寿命会比已经走完的时间还要长。”...基于此，kurzweil认为 包括人类在内的生物，可以被视为人工智能软件来进行对待，即 利用“编程理念”来重整人体的“组织编程” 对错误“程序”进行修整，比如心血管疾病，癌症等。...人类将能够对所有的身体组织，器官活性进行重新修正，不仅如此，还能够研发出直接应对于某类病症的药物，而且这一切的实现不再需要通过试探性治疗手段进行医治，因为这些药品直接应对于该疾病的整个盛衰过程 这一天...03 疾病，痛苦，失望不再 人类走向终极幸福？ 想象一下：不久的将来，一个个微小的纳米机器人将住在我们的身体里，血管中，替我们的人体方程式正确运行保驾护航。...人类进化，繁衍生息几千万年， 我们面对疾病，痛苦，不幸，挫败...但同样，我们的一生也在经历着欢乐与幸福，最终安然闭上双眼。
有研究表明，长链非编码RNA和许多的生命活动，疾病相关联，比如癌症，心脑血管病，神经退行性疾病等，为了更好的研究lncRNA的功能，开发者收录整理了已经报道的lncRNA和疾病的关联，并整理成了数据库lncrnadisease..., 网址如下 http://www.cuilab.cn/lncrnadisease 最新版的数据库中包含了914个lncRNA, 329种疾病， 将近3000个lncRNA与疾病之间的关联信息，还包含了...对于lncRNA, 会给出名称，染色体位置，物种，转录本编号，序列等基本信息，同时对于相关的疾病，会给出疾病名称，文献等信息。...除了lncRNA相关的疾病，该数据库还提供了lncRNA和其他分子的相互作用信息，通过Interaction可以查看相互作用信息，以HOTAIR为例，结果示意如下 ?...该数据库中的数据是开放下载的，而且是txt或者xls格式的，非常的友好。 该数据库其实就是一个文献整理工作的总结，通过该数据库，我们可以方便的得到已经报导的lncRNA相关疾病信息。
HMDD是一个手工收集整理的miRNA与疾病相关联的数据库，最新版本为V3.0，网址如下 http://www.cuilab.cn/hmdd 共包含1102个miRNA基因，850种疾病，32281个miRNA...与疾病的关联数据，对于每个miRNA与疾病之间的关联，都有对应的文献，会给出pubmed ID。...通过Browse功能，可以从miRNA和disease两个角度出发，查看该数据库中的内容 1. miRNA hsa-let-7的结果示意如下 ?...2. disease Anemia疾病的结果示意如下 ?...该数据库的数据是可以免费下载的，通过该数据库，我们可以快速得到miRNA和疾病之间的关联。 ·end· —如果喜欢，快分享给你的朋友们吧—
既然这么重要，那么今天我们就来给大家介绍一个存储疾病相关ncRNA的数据库：MNDR v3.1(http://www.rna-society.org/mndr/)。...（1）Exact Search 有4种关键词的类型可供选择，以“ncRNA Symbol”为例，搜索miRNA “has-miR-34a-5p”与人类疾病的关系。...miRNA与人类疾病的关系以表格形式呈现。 ? 点击第一个条目的more，进入详细信息页面，我们可以看到MNDR ID，置信度，ncRNA和疾病、药物、RNA相互作用、RNA定位、证据支持和参考信息。...以miRNA-疾病预测工具为例：直接输入或上载一个或多个（最多5个）miRNA的fasta序列，点击运行。注意：目前仅支持预测人类哦。 ?...Statistics 该部分提供MNDR数据库内ncRNA /疾病的分布信息及相关实验方法，其中包含1005312个ncRNA-疾病条目，1614种疾病，11个种属。 ? 5.
相较于其他单细胞的很多分析，这个数据库只要还是用来分析疾病当中的细胞和正常细胞哪些基因有差异的。因此有这个方面需求的可以使用哈。 ?...所以这个数据库目前还没有做到分析作用疾病或者组织的细胞。目前这个数据库纳入的疾病只有这些。所以有研究这些疾病的童鞋可以尝试使用一下。 ?...最后就可以 获得基因在不同的疾病细胞以及正常细胞当中的表达情况了。相对于于我们而言，就是使用这个数据库来检索这些结果了。...因此这个数据库提供了两个主要的功能 浏览：可以一下子观察数据库所有数据的结果 检索：可以基于自己想要的基因、疾病以及细胞类型来进行检索 ? 数据下载 除了以上两个功能，数据库还提供了数据下载的功能。...数据库使用场景 以上就是这个数据库的主要功能了，首先如果自己研究的疾病在这个数据库里面包含的话，想要更进一步查看肿瘤细胞当中对于某一个基因的表达情况的话，可以使用这个数据库进行查询。
在这些数据库里面可以分析多个不同的疾病和这个生物学特征的关系。那既然有这样的数据库。反过来也就会有某一个疾病和多个生物学特征关系的数据库。...其中就有比如 [[malacards-疾病相关信息查询数据库]] 这样综合性疾病查询的数据库。...今天来介绍一个和脑部疾病有关的综合性数据库 : BrainBase: https://ngdc.cncb.ac.cn/brainbase/index 背景数据集介绍 BrainBase 是集中分析疾病...---- 数据库使用 在 BrainBase 当中只需要输入想要查询的基因/疾病即可。例如这里输入TP53基因。...随着公共数据的增多一些基于某一类疾病的数据库也是一种新的数据库方式。这类的数据库可以快速的了解某一个方面的全部信息。至于 BrainBase 而言，目前来说高通量表达数据只包括了类似胶质瘤这个方面的。
3.20号ISME online了又一新作，本文章研究人类微生物相关疾病中微生物多样性与疾病之间的关系。...然而，人类微生物群落的总体物种多样性并不是疾病的可靠指标。 20世纪80年代首次提出了微生物群落的物种多样性是否在人类疾病中发挥重要作用的问题。...此外，多样性变化是导致微生物相关疾病的原因还是结果还不清楚。 本文使用微生物组相关疾病(MAD)这个术语来指那些与人类微生物组改变所改变的相关疾病。...讨论 目前有明确的经验证据表明，生物多样性的丧失与植物、野生动物和人类的多种重要病原体的传播或疾病严重程度的上升有关。...未来需要进行进一步的研究，包括动物模型的实验研究，以确定人类的DDR模式是否不典型，或与人畜共患病或作物和森林疾病(害虫)的DDR模式是否不同。 人类MAD系统可能和其他生物差别很大。
CNV作为一种重要的基因组结构变异形式，与很多疾病的发生发展密切相关，疾病相关CNV的文献报导很多，但是缺少一个综合性的数据库。...CNVD全称如下 copy bumber variation in Diesease 对已发表的疾病相关的CNV文献进行人工整理，整合出了一个综合性的疾病相关CNV的数据库，对应的文章链接如下 https...://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/humu.22163 数据库网址如下 http://210.46.80.7/CNVD/ 通过官网的search菜单...该数据库中文件是可以免费下载的，示意如下 ? 作为一个高质量的疾病相关CNV数据库，通过CNVD可以为CNV提供相关的疾病注释。
环状RNA具有重要的转录调控功能，越来越多的研究表明，环状RNA在许多疾病的发生与发展中扮演重要角色，circad是一个疾病相关的环状RNA数据库，网址如下 http://clingen.igib.res.in.../circad/ 该数据库中，共收录了122种疾病和相关的1000个环状RNA,包含了618个基因，是目前最为全面的疾病相关的环状RNA数据库。...对于每种疾病，提供了国际疾病分类系统ICD-10对应的编码，来唯一标识，同时还提供了对应的文献，方便研究者查阅和参考。...第一列是环状RNA的名字，第二列是别名，第三列是环状RNA来源基因的名字，第四列为环状RNA的基因组位置，第五列为物种，第六列为疾病对应的ICD-10编码，第七列为疾病的名称。...目前数据库对应的文献还没有正式发表，发表之后这数据库就会公开下载链接。 ·end· —如果喜欢，快分享给你的朋友们吧— 扫描关注微信号，更多精彩内容等着你！
是一个由200多个临床中心和1600多个遗传学家和实验室构成的联盟，从各种生物信息资源中进行数据整合，提供了一套全面的工具来识别与患者表型相关的基因组结构变异，挖掘潜在的致病基因，所有的成果存在在一个在线数据库中...方便科学家查看和利用，对应的文章发表在Nucleic Acids Research上，文章链接如下 https://academic.oup.com/nar/article/42/D1/D993/1068216 数据库网址如下...Genes 以基因为单位，展示了与疾病表型相关的基因组变异所在的基因，结果示意如下 ? 4....Gene Disorders 展示了clinvar数据库中与表型相关的基因变异信息，结果示意如下 ? 通过该数据库，可以查看已知的疾病相关的CNV信息，在筛选致病性CNV时，可以作为一个过滤条件。
lncRNA在细胞周期调控， 细胞分化调控，疾病的发生与发展等多种生命活动中发挥着重要作用，是研究的热点之一。...不像起步很早的miRNA, lncRNA在最近十几年年才逐渐兴起，目前的现状是数据库很多，不同数据库对于lncRNA的命名方式不统一，这种混乱的命名模式，增加了研究的难度。...LNCipedia是一个综合性的人类lncRNA数据库，整合了多个数据库中，多篇文章中的lncRNA记录，并赋予了它们统一的ID, 网址如下 https://lncipedia.org/ 该数据库中的lncRNA...信息来源于以下几个数据库 LncRNAdb Broad Institute Ensembl Gencode Refseq NONCODE FANTOM 同时也包含了Nielsen, Hangauer...，可以避免不同数据库中命名方式不同带来的不便。
circRNA在生命活动中发挥着调控作用,在肿瘤等疾病中更是扮演着重要角色。...circRNADisease是一个手工整理的疾病相关的环状RNA数据库,网址如下 http://cgga.org.cn:9091/circRNADisease/ 目前该数据库中收录了330个circRNA...,48种疾病,354个circRNA和疾病之间的关联数据。...该数据库中的环状RNA包括circBase id和circRNA name两种,对于每个环状RNA和疾病的关联数据,给出了检测的方式，环状RNA在患病者中的表达趋势，相关文献的pubmed id,点击details...通过该数据库，可以方便得到已经报导的环状RNA与疾病的关联数据。
近日，美国食品及药品管理局（FDA）就批准了这样一个无需人类医生把关的检测眼底的AI系统。这是一个叫IDx-DR的AI软件，能够通过视网膜图片检测眼疾。...没错，AI独立诊断人类眼疾的时代已经到来，从此可以无需人类医生指导了。 ? 人类只需上传图像 IDx-DR的使用方法非常简单。...想解救专家号长龙 无需人类医生干涉是这个软件最特殊的地方，它“无需有个医生在这个算法之上再进行审核，”IDx-DR的创始人Michael Abràmoff在接受采访时说，“它能够自己做出诊断结果。”
HEDD是一个人类增强子和疾病相关的数据库，收集整理ENCODE, FANTOM, RoadMap项目中鉴定到的增强子，并通过增强子与靶基因的调控关系，靶基因与疾病的关联，建立起增强子与疾病之间的关系，...对应的文章发表在Nucleic Acids Research上，链接如下 https://academic.oup.com/nar/article/46/D1/D113/4564801 该数据库的网址如下...从MalaCards,DISEASES,DisGeNET疾病数据库中获取基因与疾病之间的关联信息 从GWAS Catalog,GWASdb,CADD数据库中获取SNP位点与疾病之间的关联信息 以靶基因和位于靶基因内的...SNP位点为桥梁，构建出增强子和疾病之间关联网络。...该数据库中的信息是可以免费下载的，不同于其他的增强子数据库，HEDD不仅提供了增强子的基因组区域等基本注释信息，更进一步通过靶基因建立起增强子与疾病之间的调控网络，对开展疾病中的增强子研究具有很大的参考意义
mir2disease是由哈尔滨工业大学开发的miRNA相关疾病数据库，网址如下 http://www.mir2disease.org/ 该数据库包含了349个miRNA, 163种疾病，3273个miRNA...与疾病之间的关联信息。...对于miRNA在疾病组织中的失调，给出了以下3种模型 miRNA位于致病的基因组位点，比如杂合性缺失LOH区域等，有研究发现，miR-15和miR-16位于13号染色体的13q14区域，在慢性淋巴B细胞白血病中...对于miRNA与疾病关联的每条记录，会给出miRNA ID, 疾病名称，检测方法，miRNA靶基因信息和对应的文献，和HMDD数据库的整体架构非常类似。 支持通过以下3种方式对数据库进行检索 ?...该数据库是免费下载的，提供了miRNA靶基因，相关疾病等信息，示意如下 ? 相比HMDD, 该数据库中收录的miRNA与疾病的关联信息会少一点，但是仍然是一个非常实用的数据库。
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